BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032G11
Chromosome4 (Build37)
Map Location 78,426,035 - 78,574,190
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039974, LOC100039996
Downstream geneLOC100040026, LOC100040036, LOC667922
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032G11.bB6Ng01-032G11.g
ACCDH861753DH861754
length575781
definitionDH861753|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032G11, 5' end.DH861754|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032G11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(78,573,616 - 78,574,190)(78,426,035 - 78,426,813)
sequence
gaattctggaccttcggaagagcagtcgggtgctcttacccactgagcca
tctcaccagcccctaactatgtcaatttataaaacaatattatactcatg
tttcacctgcaatggtgacaaccctctttgctcactggactgctacccgt
gattctttggtatagacatccaagcttcattcagtgttattatagaccat
tttggataaggcaaagctaataactattctcagagtttcgcatatcagaa
gaattaaaatcttgtcttaggttgattccaacatacttcataggaattca
aacgtcaatttgaacacaggaggttatttgagatggaatatatcatcagt
tttaatttctaaccaactactgtctttcagacatctgtctttcagatttg
aaggcctaagaataatagagtttaagacagtcacctgagtccaaatcaaa
caatcaattaaatatgtacaatttgctgatagtgagttatcttgtttata
tataaaatacatgttttatttgaaggtggatattatatatatatatatat
atatatatatatatatatatatata
gaattcaacaaaatagttaaagaggattcggtgctcaagtgcagctttct
gaaagcaagaacataaagctgacatagatgtagagaccattgatgcaggc
aagtgtttaggtatgatgttaaggaatctgccaaagtgtttctctgagaa
gtgatcagatctcattcaatcagcaagagagggtgcatcaaaacttcaca
ctcatctcagcaggccgaggaggaccctaatctcgtagagaccttgactg
agacaaatctataactttgacacagaaaataatttcaggactagctagta
tgaagaaatttgagatttggtggaagttgttcaaaaggcactcaggaaga
aaataaaagcacacccaagaatacagctacagatgtcgccaagagagtgc
tgtaaaaaattatattcttgtttaggggcgtgggctacttatgggaagtc
cagagttagaataatggtttaactacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacacacatacacacggtatgtcttcaggattcat
tgtatgagtagctcaaagttatatcacaaaagacatttattttattttct
ctctgattaaaaaatgttatagattattctggggatttgtttgcttggaa
ttataatctgatatagtgaaaccagaagatattggggttgtataatgggt
tgtggacatatccttttctatagtggtgtctccagtgagattttctagaa
aagtcaaatttgatatctagaaagtcaaaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_78573616_78574190
seq2: B6Ng01-032G11.b_47_621 (reverse)

seq1  TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATATCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATATCCAC  50

seq1  CTTCAAATAAAACATGTATTTTATATATAAACAAGATAACTCACTATCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAATAAAACATGTATTTTATATATAAACAAGATAACTCACTATCAG  100

seq1  CAAATTGTACATATTTAATTGATTGTTTGATTTGGACTCAGGTGACTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTGTACATATTTAATTGATTGTTTGATTTGGACTCAGGTGACTGTC  150

seq1  TTAAACTCTATTATTCTTAGGCCTTCAAATCTGAAAGACAGATGTCTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTCTATTATTCTTAGGCCTTCAAATCTGAAAGACAGATGTCTGAA  200

seq1  AGACAGTAGTTGGTTAGAAATTAAAACTGATGATATATTCCATCTCAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGTAGTTGGTTAGAAATTAAAACTGATGATATATTCCATCTCAAAT  250

seq1  AACCTCCTGTGTTCAAATTGACGTTTGAATTCCTATGAAGTATGTTGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCCTGTGTTCAAATTGACGTTTGAATTCCTATGAAGTATGTTGGAA  300

seq1  TCAACCTAAGACAAGATTTTAATTCTTCTGATATGCGAAACTCTGAGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCTAAGACAAGATTTTAATTCTTCTGATATGCGAAACTCTGAGAAT  350

seq1  AGTTATTAGCTTTGCCTTATCCAAAATGGTCTATAATAACACTGAATGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTAGCTTTGCCTTATCCAAAATGGTCTATAATAACACTGAATGAA  400

seq1  GCTTGGATGTCTATACCAAAGAATCACGGGTAGCAGTCCAGTGAGCAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGATGTCTATACCAAAGAATCACGGGTAGCAGTCCAGTGAGCAAAG  450

seq1  AGGGTTGTCACCATTGCAGGTGAAACATGAGTATAATATTGTTTTATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTGTCACCATTGCAGGTGAAACATGAGTATAATATTGTTTTATAAA  500

seq1  TTGACATAGTTAGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACATAGTTAGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGA  550

seq1  CTGCTCTTCCGAAGGTCCAGAATTC  575
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTTCCGAAGGTCCAGAATTC  575

seq1: chr4_78426035_78426813
seq2: B6Ng01-032G11.g_68_848

seq1  GAATTCAACAAAATAGTTAAAGAGGATTCGGTGCTCAAGTGCAGCTTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAAAATAGTTAAAGAGGATTCGGTGCTCAAGTGCAGCTTTCT  50

seq1  GAAAGCAAGAACATAAAGCTGACATAGATGTAGAGACCATTGATGCAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAAGAACATAAAGCTGACATAGATGTAGAGACCATTGATGCAGGC  100

seq1  AAGTGTTTAGGTATGATGTTAAGGAATCTGCCAAAGTGTTTCTCTGAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTTAGGTATGATGTTAAGGAATCTGCCAAAGTGTTTCTCTGAGAA  150

seq1  GTGATCAGATCTCATTCAATCAGCAAGAGAGGGTGCATCAAAACTTCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCAGATCTCATTCAATCAGCAAGAGAGGGTGCATCAAAACTTCACA  200

seq1  CTCATCTCAGCAGGCCGAGGAGGACCCTAATCTCGTAGAGACCTTGACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCTCAGCAGGCCGAGGAGGACCCTAATCTCGTAGAGACCTTGACTG  250

seq1  AGACAAATCTATAACTTTGACACAGAAAATAATTTCAGGACTAGCTAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAATCTATAACTTTGACACAGAAAATAATTTCAGGACTAGCTAGTA  300

seq1  TGAAGAAATTTGAGATTTGGTGGAAGTTGTTCAAAAGGCACTCAGGAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAAATTTGAGATTTGGTGGAAGTTGTTCAAAAGGCACTCAGGAAGA  350

seq1  AAATAAAAGCACACCCAAGAATACAGCTACAGATGTCGCCAAGAGAGTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAAGCACACCCAAGAATACAGCTACAGATGTCGCCAAGAGAGTGC  400

seq1  TGTAAAAAATTATATTCTTGTTTAGGGGCGTGGGCTACTTATGGGAAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAAAATTATATTCTTGTTTAGGGGCGTGGGCTACTTATGGGAAGTC  450

seq1  CAGAGTTAGAATAATGGTTTAACTACACACACACACACACACACACACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTAGAATAATGGTTTAACTACACACACACACACACACACACACAC  500

seq1  ACACACACACACACACACACACATACACACGGTATGTCTTCAGGATTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACATACACACGGTATGTCTTCAGGATTCAT  550

seq1  TGTATGAGTAGCTCAAAGTTATATCACAAAAGACATTTATTTTATTTTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGAGTAGCTCAAAGTTATATCACAAAAGACATTTATTTTATTTTCT  600

seq1  CTCTGATTAAAAAATGTTATAGATTATTCTGGGGATTTG-TTGCTTGGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CTCTGATTAAAAAATGTTATAGATTATTCTGGGGATTTGTTTGCTTGGAA  650

seq1  TTATAATCTGATATAGTGAAACCAGAAGATATTGGGGTTGTATAATGGGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATCTGATATAGTGAAACCAGAAGATATTGGGGTTGTATAATGGGT  700

seq1  TGTGGACATATCCTTTTCTATAAGTGGTGTCTCCAGTGAGA-TTTCTAG-  747
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| 
seq2  TGTGGACATATCCTTTTCTAT-AGTGGTGTCTCCAGTGAGATTTTCTAGA  749

seq1  AAAGTCAAAATTGATATCTAGAAAGTCAAAAT  779
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCAAATTTGATATCTAGAAAGTCAAAAT  781