BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-044P15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 22,777,462 - 22,902,602
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700025O08Rik
Upstream gene4930528A17Rik, 5730406M06Rik, Coq3, 6230409E13Rik, LOC100040379, Fbxl4, Pou3f2, LOC664911
Downstream geneLOC625462, LOC383998, LOC100040464, LOC623873
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-044P15.bB6Ng01-044P15.g
ACCDH870573DH870574
length1,1491,142
definitionDH870573|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-044P15, 5' end.DH870574|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-044P15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,777,462 - 22,778,612)(22,901,451 - 22,902,602)
sequence
gaattcctgagaacagattcacaggaaaacttctagaattgaggcatcaa
gcagcagtgcatgtggactagggacttatttccaggcttgatacctcaac
agccaggcacattcaagatgaacaaatagcaatatggattcctcataccc
tcaacactccaagatgtcctataaggaaaagctttgtaattaactagaac
tgtaattgatttagacaagggaatacatctagggcacattggggtctgtg
tttgttctgcagtgcagatctgctgggatgaaatacaatgtccctgaaaa
ggaaagctactacagtgggaaagcactcagttataatggtacttgttggc
agtacccaggttagtagcctaggcagggccattcaaatttcaatgctgtc
ttcaggttgatgctctcatttccatcctagtttcttctttgttttcctgt
tcttaataagtgagagtaggtagcatttatcataatttctctttctgtgt
gatggtgaagacatgtgatgaccagtcttaaccatgggagtagggctgag
atgagactttgggtggatggttctatattctgtaactttggataggacag
agtagggatgaaaaaaaaaaggagcagagatctacggtggggcttcacac
tgcttcttgcccactctggtctagcctgcccttttctgcagactcactgg
aatctgtagctggattggtgctgatccatatgcacattagtgcattatta
gagcggagatctagggaatcattttcctccctgaaatcttagtctcagtt
cactgtttgtctccaacctgtttaattccatgggttctgggccatgctgc
cttctatgtttctttccttgtttccttgagttacagacatgtgatatgca
ggaagcagagccagagtgcttcctgatttttctctgctcccactcctgct
gggcattgaacagctccataaactttactctgcacactttcatcagcagc
tgagtgactttttattctcttggcttctttcttgtctactctatcatcac
tcatcatccaagttcataatccagaattgtactacaccgatatgcactga
gaatgagccctgtgcatgttagtattggaaccctagacttcttgtatgt
gggtactaaatgaaaagtttttgtattaacaggcaaaagttgattgagtc
ttataaaagatgctcaaagaaacatgagcaattgcaaaataaagttggag
ttagtgacaagactttctgataaattgggaatgtggagtgttatagtaca
atcatttgtgaatggtaatttaatagaagcaaatatgcacaaagtcatga
tagggataaactcattcaggtatctgtgttggggtcagtcatggacttga
aacctcattgtgattcccattcattgtcctcagactgtctgtaatttttc
acacaaaacatattcttttttaggatttatttgtttattttatgtatatg
agcacaattagagctgtcttcagacacaccagctgacctaataacgcctg
aaactgttatgttccatgtgtagtattctgcaactactgtactaaacatg
ttgaacaggatcttcactgctatttctactcttctgcagtgttctatggg
acagctatttgtaacaccaatttatagataaggatgtcctctgatgagat
tttagctttcctatgccatagctgaacgttacaacactgaaatctaatca
tggataaaccattgcttaactttgttgtcaaaagcacactgcatgccttg
tctttcaacttcaagtttatttacaaataagttcaatcattttaacacta
ataatttgaattttaaattataattctctaccaaatatctcaaatttttc
ttaaatttgaatttcacctgaattcaatagttaattatatgtatttaaac
tatatagtcaataaaaatacttgttctacagatctatgtaatgagcactc
atcactttatttagtggtgcccaataatatatgtgaatgcattccttggc
ctcacctcaacagtggcctttaagtaaaagatgagaatggggaataagtt
cttaagtaccatgcaaatacagaaagaaaaaaatccttcttacacacaga
agctacattgaaagtaaagtaactacccacatgatttttagcaacactgg
tggctgttaaccacctttacctattttgaattgaatctgctttaaataaa
tggtacttatttatgacctcatttcatgaaagttgaaaccct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_22777462_22778612
seq2: B6Ng01-044P15.b_47_1195

seq1  GAATTCCTGAGAACAGATTCACAGGAAAACTTCTAGAATTGAGGCATCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGAGAACAGATTCACAGGAAAACTTCTAGAATTGAGGCATCAA  50

seq1  GCAGCAGTGCATGTGGACTAGGGACTTATTTCCAGGCTTGATACCTCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGTGCATGTGGACTAGGGACTTATTTCCAGGCTTGATACCTCAAC  100

seq1  AGCCAGGCACATTCAAGATGAACAAATAGCAATATGGATTCCTCATACCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGGCACATTCAAGATGAACAAATAGCAATATGGATTCCTCATACCC  150

seq1  TCAACACTCCAAGATGTCCTATAAGGAAAAGCTTTGTAATTAACTAGAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACACTCCAAGATGTCCTATAAGGAAAAGCTTTGTAATTAACTAGAAC  200

seq1  TGTAATTGATTTAGACAAGGGAATACATCTAGGGCACATTGGGGTCTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATTGATTTAGACAAGGGAATACATCTAGGGCACATTGGGGTCTGTG  250

seq1  TTTGTTCTGCAGTGCAGATCTGCTGGGATGAAATACAATGTCCCTGAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTCTGCAGTGCAGATCTGCTGGGATGAAATACAATGTCCCTGAAAA  300

seq1  GGAAAGCTACTACAGTGGGAAAGCACTCAGTTATAATGGTACTTGTTGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCTACTACAGTGGGAAAGCACTCAGTTATAATGGTACTTGTTGGC  350

seq1  AGTACCCAGGTTAGTAGCCTAGGCAGGGCCATTCAAATTTCAATGCTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCCAGGTTAGTAGCCTAGGCAGGGCCATTCAAATTTCAATGCTGTC  400

seq1  TTCAGGTTGATGCTCTCATTTCCATCCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGTTGATGCTCTCATTTCCATCCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCCTGT  450

seq1  TCTTAATAAGTGAGAGTAGGTAGCATTTATCATAATTTCTCTTTCTGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAATAAGTGAGAGTAGGTAGCATTTATCATAATTTCTCTTTCTGTGT  500

seq1  GATGGTGAAGACATGTGATGACCAGTCTTAACCATGGGAGTAGGGCTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTGAAGACATGTGATGACCAGTCTTAACCATGGGAGTAGGGCTGAG  550

seq1  ATGAGACTTTGGGTGGATGGTTCTATATTCTGTAACTTTGGATAGGACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACTTTGGGTGGATGGTTCTATATTCTGTAACTTTGGATAGGACAG  600

seq1  AGTAGGGATGAAAAAAAAAAGGAGCAGAGATCTACGGTGGGGCTTCACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGGATGAAAAAAAAAAGGAGCAGAGATCTACGGTGGGGCTTCACAC  650

seq1  TGCTTCTTGCCCACTCTGGTCTAGCCTGCCCTTTTCTGCAGACTCACTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTTGCCCACTCTGGTCTAGCCTGCCCTTTTCTGCAGACTCACTGG  700

seq1  AATCTGTAGCTGGATTGGTGCTGATCCATATGCACATTAGTGCATTATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTAGCTGGATTGGTGCTGATCCATATGCACATTAGTGCATTATTA  750

seq1  GAGCGGAGATCTAGGGAATCATTTTCCTCCCTGAAATCTTAGTCTCAGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GAGCGGAGATCTAGGGAATCATTTTCCTCCCTGAAATCTTAGTCTCA-GT  799

seq1  TCACTGTTTGTCTCCAACCTGTTTAATTCCATGGGTTCTGGGCCATGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTTTGTCTCCAACCTGTTTAATTCCATGGGTTCTGGGCCATGCTG  849

seq1  CCTTCTATGTTTCTTTCCTTGTTTCCTTGAGTTACAGACATGTGATATGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTATGTTTCTTTCCTTGTTTCCTTGAGTTACAGACATGTGATATGC  899

seq1  AGGAAGCAGAGCCAGAGTGCTTCCTGATTTTTCTCTGCTCCCACTCCTGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCAGAGCCAGAGTGCTTCCTGATTTTTCTCTGCTCCCACTCCTGC  949

seq1  TGGGCATTGAACAGCTCCATAAACTTTACTCTGCACACTTTTCATCAGCA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGGGCATTGAACAGCTCCATAAACTTTACTCTGCACAC-TTTCATCAGCA  998

seq1  GCTGAGTGACTTTTTATTCTCTTGGCTTCTTTTCTTGTCTACTCTATCAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| 
seq2  GCTGAGTGACTTTTTATTCTCTTGGCTTC-TTTCTTGTCTACTCTATCA-  1046

seq1  TCACTCATTCATCCAAAGTTCAT-ATCCAGAA-TGTACTACA-CGATAGG  1097
      ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |
seq2  TCACTCA-TCATCC-AAGTTCATAATCCAGAATTGTACTACACCGATATG  1094

seq1  CACTGAG-ATGAGCACTGTGCATG-TAGTATTGGAAACACTAAGACTTC-  1144
      ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| 
seq2  CACTGAGAATGAGCCCTGTGCATGTTAGTATTGG-AACCCT-AGACTTCT  1142

seq1  TGTATGT  1151
      |||||||
seq2  TGTATGT  1149

seq1: chr4_22901451_22902602
seq2: B6Ng01-044P15.g_75_1216 (reverse)

seq1  AGGGTTTCCAACTTTCATGAAATGAGGTCATAAAATAAATTACATTTATT  50
      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |
seq2  AGGGTTT-CAACTTTCATGAAATGAGGTCAT-AAATAAGTACCATTTA-T  47

seq1  TTAAAGCAGATTCACATTCAAAAATAGGTAAAGGTGGTTAACAGCCA-CA  99
      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTAAAGCAGATTCA-ATTC-AAAATAGGTAAAGGTGGTTAACAGCCACCA  95

seq1  GTGTTTGCTTAAAAATCAATTGTGTGTAGTTACTTTTACTTTCAATGTAG  149
      ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTG-TTGC-TAAAAATCA--TGTGGGTAGTTAC-TTTACTTTCAATGTAG  140

seq1  CTTCTGTGTGTAAGAAGGATTTTTTTCTTTCTGTATTTGCATGGTACTTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGTGTGTAAGAAGGATTTTTTTCTTTCTGTATTTGCATGGTACTTA  190

seq1  AGAACTTATTCCCCATTCTCATCTTTTTACTTAAAGGCCACTGTTGAGGT  249
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTTATTCCCCATTCTCATC-TTTTACTTAAAGGCCACTGTTGAGGT  239

seq1  GAGGCCAAGGAATGCATTTCACATATATTATTGGGCACCACTAAATAAAG  299
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCAAGGAATGCA-TTCACATATATTATTGGGCACCACTAAATAAAG  288

seq1  TGATGAGTGCTCATTACATAGATCTGTAGAACAAGTATTTTTATTGACTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAGTGCTCATTACATAGATCTGTAGAACAAGTATTTTTATTGACTA  338

seq1  TATAGTTTAAATACATATAATTAACTATTGAATTCAGGTG-AATTCAAAT  398
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TATAGTTTAAATACATATAATTAACTATTGAATTCAGGTGAAATTCAAAT  388

seq1  TTAAGAAAAATTTGAGATATTTGGTAGAGAATTATAATTTAAAATTCAAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAAAAATTTGAGATATTTGGTAGAGAATTATAATTTAAAATTCAAA  438

seq1  TTATTAGTGTTAAAATGATTGAACTTATTTGTAAATAAACTTGAAGTTGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAGTGTTAAAATGATTGAACTTATTTGTAAATAAACTTGAAGTTGA  488

seq1  AAGACAAGGCATGCAGTGTGCTTTTGACAACAAAGTTAAGCAATGGTTTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAAGGCATGCAGTGTGCTTTTGACAACAAAGTTAAGCAATGGTTTA  538

seq1  TCCATGATTAGATTTCAGTGTTGTAACGTTCAGCTATGGCATAGGAAAGC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGATTAGATTTCAGTGTTGTAACGTTCAGCTATGGCATAGGAAAGC  588

seq1  TAAAATCTCATCAGAGGACATCCTTATCTATAAATTGGTGTTACAAATAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCTCATCAGAGGACATCCTTATCTATAAATTGGTGTTACAAATAG  638

seq1  CTGTCCCATAGAACACTGCAGAAGAGTAGAAATAGCAGTGAAGATCCTGT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCCATAGAACACTGCAGAAGAGTAGAAATAGCAGTGAAGATCCTGT  688

seq1  TCAACATGTTTAGTACAGTAGTTGCAGAATACTACACATGGAACATAACA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACATGTTTAGTACAGTAGTTGCAGAATACTACACATGGAACATAACA  738

seq1  GTTTCAGGCGTTATTAGGTCAGCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTCTAATTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGGCGTTATTAGGTCAGCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTCTAATTG  788

seq1  TGCTCATATACATAAAATAAACAAATAAATCCTAAAAAAGAATATGTTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCATATACATAAAATAAACAAATAAATCCTAAAAAAGAATATGTTTT  838

seq1  GTGTGAAAAATTACAGACAGTCTGAGGACAATGAATGGGAATCACAATGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAAAAATTACAGACAGTCTGAGGACAATGAATGGGAATCACAATGA  888

seq1  GGTTTCAAGTCCATGACTGACCCCAACACAGATACCTGAATGAGTTTATC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCAAGTCCATGACTGACCCCAACACAGATACCTGAATGAGTTTATC  938

seq1  CCTATCATGACTTTGTGCATATTTGCTTCTATTAAATTACCATTCACAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCATGACTTTGTGCATATTTGCTTCTATTAAATTACCATTCACAAA  988

seq1  TGATTGTACTATAACACTCCACATTCCCAATTTATCAGAAAGTCTTGTCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTGTACTATAACACTCCACATTCCCAATTTATCAGAAAGTCTTGTCA  1038

seq1  CTAACTCCAACTTTATTTTGCAATTGCTCATGTTTCTTTGAGCATCTTTT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTCCAACTTTATTTTGCAATTGCTCATGTTTCTTTGAGCATCTTTT  1088

seq1  ATAAGACTCAATCAACTTTTGCCTGTTAATACAAAAACTTTTCATTTAGT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACTCAATCAACTTTTGCCTGTTAATACAAAAACTTTTCATTTAGT  1138

seq1  ACCC  1152
      ||||
seq2  ACCC  1142