BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-061J10
Chromosome4 (Build37)
Map Location 73,569,676 - 73,730,591
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2310002L09Rik, Frmd3
Upstream geneLOC667713, LOC100039698, OTTMUSG00000001246, LOC100039726, LOC667722, LOC623115, OTTMUSG00000000281, OTTMUSG00000000280, OTTMUSG00000000282, OTTMUSG00000000283, Gm428, Rasef, LOC667768, LOC545637, LOC623272, OTTMUSG00000014862, OTTMUSG00000004010
Downstream geneLOC100039774, Jmjd2c, LOC100040258, LOC100039814
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-061J10.bB6Ng01-061J10.g
ACCDH882223DH882224
length1,0551,128
definitionDH882223|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061J10, 5' end.DH882224|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061J10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,569,676 - 73,570,548)(73,729,451 - 73,730,591)
sequence
gaattcatgcaaagaattagtgactaggtacattgaagggagcctttgag
tggctattggtgaagcctacatatagtagaagtccccagccttttggaga
tgccaatgccatgtgatgaccaacaagaatagcagtaatggagtgtcatt
caccaaagcctagagtactatagagggcagagatgaagaagtgactcaag
tcctatggatgagcccagatgatcatgtgtgggtcccagacattagaaca
agatcctgcaacataaggattcctttcagacttgaggatattagagagac
cagaagcatagataaccagctcagcaaagctcttaacaaagctggtaaca
aacatggagaaccagtatttgttgtctgcacagatgaatttttatcttgc
tttggttcagtatttcttcactataagtttttcaattatgaatatatatt
ctgtgatattggaggtatatgatctgctttgtgattttgattttatacag
cactacacttaagtcattgaatggacattaaactacatgatcagattttt
tcgatttttttttgagagtgttctatagtatggggactttgtcagttaga
ctgcatatttgagcattatgctatagctaggtatagcccatagaatcttg
tgtttgaacaaggggccagggaaaggaatgtggtggtttgagtatgcttg
gctcacagactggctttaggtgacccctttgggagcttcatcaactcaaa
acacatctccccccaaaaacagacaacccctgctctaacctcagttagtg
catgcacttcctagggaggatgataccatgtaggcaatgtagaacttcct
ttttttctgcccttcttgtagacctataacatatatgtatgtcccagaag
agagccctaggtcatgattcatttaaaaataaacactttatggaccttaa
ttagacatagagtgttgtaactgtacaatgtggaatatcagtgcaatata
gatggatactagatacatagatatggggagatatagagaagatgaaagat
agaga
gaattcaagtcttgatgaacacttcatttctttatttctcttacagaata
aaagctacaaaattcacagaagctaaattccctctactggtttacaggat
gaactgagggaacatgggaaaacagaggattattgcttagtgttacttga
aagtaccaggagagaatcagcaactgataaggtcagggttaagcagttgt
cctcattggtattttttaacattgacactaggtagagttacctgtgaagg
ggatgctcaagtgataaatcacttccatcaggttggcctgtaggcaagtc
tatatggcatttctttattaatgagtgatgtaggaggtcccaaaattgtg
aacattgccatttttgggtaaggggtcctcagaggtaaaagtcatgtagt
cgaacataagcctagacagcaagccagtaagcagtgctcttccgtggctt
ctgcttcagttcttacctccaggttactgccttgagttcctgccctgaat
ttagttcatgatggaccacaagtataagttaaagcaagctctttccacac
taggtggcttttaataatagtgtttgcaccataacagatatctaactaag
acaatagtgtttctctttttaggaaagttcctccttggtttattggaatc
tactgtagggcaacctctatagttcactctaccttctgtaagccagtttt
ctttttaaaaatagtgattgactgatacaggaatataaatacctttgcat
gatctccgattcctcagctcccttgtgagataaaagaaaggactttgcct
aaatattatatcaagatattactttactttttttcttttaaggccacaca
agaaagtctttggtgagaggtctaaatataaaagatattttagaatcaat
acaatcaaatcttgaaaataccataactcttttcttagaacacattcatt
ttgacagcaggtaaataatggaggaaaaatagagagaactgaataagaaa
atacagataggatcctcaacttgtctacattgtattttctcactgcactg
aagaaagaaggattgcaacgttgggatagagatgagtgtaagtcttacta
ctgcagtccactctgacctggagttatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_73569676_73570548
seq2: B6Ng01-061J10.b_225_1101

seq1  AGAGATGAAGAAGTGACTCAAGTCCTATGGATGAGCCCAGATGATCATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGAAGAAGTGACTCAAGTCCTATGGATGAGCCCAGATGATCATGT  50

seq1  GTGGGTCCCAGACATTAGAACAAGATCCTGCAACATAAGGATTCCTTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTCCCAGACATTAGAACAAGATCCTGCAACATAAGGATTCCTTTCA  100

seq1  GACTTGAGGATATTAGAGAGACCAGAAGCATAGATAACCAGCTCAGCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGAGGATATTAGAGAGACCAGAAGCATAGATAACCAGCTCAGCAAA  150

seq1  GCTCTTAACAAAGCTGGTAACAAACATGGAGAACCAGTATTTGTTGTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTAACAAAGCTGGTAACAAACATGGAGAACCAGTATTTGTTGTCTG  200

seq1  CACAGATGAATTTTTATCTTGCTTTGGTTCAGTATTTCTTCACTATAAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGATGAATTTTTATCTTGCTTTGGTTCAGTATTTCTTCACTATAAGT  250

seq1  TTTTCAATTATGAATATATATTCTGTGATATTGGAGGTATATGATCTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAATTATGAATATATATTCTGTGATATTGGAGGTATATGATCTGCT  300

seq1  TTGTGATTTTGATTTTATACAGCACTACACTTAAGTCATTGAATGGACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGATTTTGATTTTATACAGCACTACACTTAAGTCATTGAATGGACAT  350

seq1  TAAACTACATGATCAGATTTTTTCGATTTTTTTTTGAGAGTGTTCTATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTACATGATCAGATTTTTTCGATTTTTTTTTGAGAGTGTTCTATAG  400

seq1  TATGGGGACTTTGTCAGTTAGACTGCATATTTGAGCATTATGCTATAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGGACTTTGTCAGTTAGACTGCATATTTGAGCATTATGCTATAGCT  450

seq1  AGGTATAGCCCATAGAATCTTGTGTTTGAACAAGGGGCCAGGGAAAGGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATAGCCCATAGAATCTTGTGTTTGAACAAGGGGCCAGGGAAAGGAA  500

seq1  TGTGGTGGTTTGAGTATGCTTGGCTCACAGACTGGCTTTAGGTGACCCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGGTTTGAGTATGCTTGGCTCACAGACTGGCTTTAGGTGACCCCT  550

seq1  TTGGGAGCTTCATCAACTCAAAACACATCTCCCCCCAAAAACAGACAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGCTTCATCAACTCAAAACACATCTCCCCCCAAAAACAGACAACC  600

seq1  CCTGCTCTAACCTCAGTTAGTGCATGCACTTCCTAGGGAGGATGATACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTCTAACCTCAGTTAGTGCATGCACTTCCTAGGGAGGATGATACCA  650

seq1  TGTAGGCAATGTAGAACTTCCTTTTTTTCTGCCCTTCTTGTAGACCTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGCAATGTAGAACTTCCTTTTTTTCTGCCCTTCTTGTAGACCTATA  700

seq1  ACATATATGTATGTCCCAGAAGAGAGCCCTAGGTCATGATTCATTTAAAA  750
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACATATATGTATGTCCCAGAAGAGAGCCCTAGGTCATGATTCATTT-AAA  749

seq1  AATAAACACTTTATGGACCTTAATTAGACATAGAGTGTTGTAACTGTACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACACTTTATGGACCTTAATTAGACATAGAGTGTTGTAACTGTACA  799

seq1  ATGTGGAATATCAAGTGCAATATAGATGGATACTAGATACATAGATATGG  850
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGAATATC-AGTGCAATATAGATGGATACTAGATACATAGATATGG  848

seq1  GGAGATATAGA------GAAAGATAGAGA  873
      |||||||||||      ||||||||||||
seq2  GGAGATATAGAGAAGATGAAAGATAGAGA  877

seq1: chr4_73729451_73730591
seq2: B6Ng01-061J10.g_67_1194 (reverse)

seq1  CATATACTCCAGGGTCAGAGTGTGGACTGCAGTAGTAAAGGACTCTACAC  50
      |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||
seq2  CATA-ACTCCA-GGTCAGA--GTGGACTGCAGTAGTAA--GACT-TACAC  43

seq1  TCAATCTCCTACTCCCAACGTTGCATCCCTTCCTTCTGTCAGTGCAGGTG  100
      || |||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||| |||
seq2  TC-ATCT-CTA-TCCCAACGTTGCAATCCTTCTTTCT-TCAGTGCA-GTG  88

seq1  AGAAAATTACAATGTAGACAGTTTGGGGATCCTATCTGTATTTTCTTTAT  150
      |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGAAAA-TACAATGTAGACAAGTTGAGGATCCTATCTGTATTTTC-TTAT  136

seq1  TCAGTTCTCTTCTATTTTTCCTCCATTTATTTAACCTGCTGTCAAAATGA  200
      ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCTC-TCTATTTTTCCTCCA-TTATTT-ACCTGCTGTCAAAATGA  183

seq1  ATGTGTTCTAAGAAAGGGTTTATGGTATTTTC-AGGTTTGATTGTATTGA  249
      ||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||
seq2  ATGTGTTCTAAGAAAAGAGTTATGGTATTTTCAAGATTTGATTGTATTGA  233

seq1  TTCTAAAATATCTTTTATATTTGGACCTCTCACC-AAGGCTTTCTTGTGT  298
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  TTCTAAAATATCTTTTATATTTAGACCTCTCACCAAAGACTTTCTTGTGT  283

seq1  GGCCTTAAAAG-AAGGAAGTAAAGTAATATCTTGATATAATA-TTGGGCA  346
      ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||
seq2  GGCCTTAAAAGAAAAAAAGTAAAGTAATATCTTGATATAATATTTAGGCA  333

seq1  AAGTCCTTTCTTTTATCTCACAAGGGAGCTGAGGAATCGGAGATCATGCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCTTTCTTTTATCTCACAAGGGAGCTGAGGAATCGGAGATCATGCA  383

seq1  AAGGTATTTATATTCCTGTATCAGTCAATCACTATTTTTAAAAAGAAAAC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTATTTATATTCCTGTATCAGTCAATCACTATTTTTAAAAAGAAAAC  433

seq1  TGGCTTACAGAAGGTAGAGTGAACTATAGAGGTTGCCCTACAGTAGATTC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTACAGAAGGTAGAGTGAACTATAGAGGTTGCCCTACAGTAGATTC  483

seq1  CAATAAACCAAGGAGGAACTTTCCTAAAAAGAGAAACACTATTGTCTTAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAACCAAGGAGGAACTTTCCTAAAAAGAGAAACACTATTGTCTTAG  533

seq1  TTAGATATCTGTTATGGTGCAAACACTATTATTAAAAGCCACCTAGTGTG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATATCTGTTATGGTGCAAACACTATTATTAAAAGCCACCTAGTGTG  583

seq1  GAAAGAGCTTGCTTTAACTTATACTTGTGGTCCATCATGAACTAAATTCA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGCTTGCTTTAACTTATACTTGTGGTCCATCATGAACTAAATTCA  633

seq1  GGGCAGGAACTCAAGGCAGTAACCTGGAGGTAAGAACTGAAGCAGAAGCC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGGAACTCAAGGCAGTAACCTGGAGGTAAGAACTGAAGCAGAAGCC  683

seq1  ACGGAAGAGCACTGCTTACTGGCTTGCTGTCTAGGCTTATGTTCGACTAC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGAAGAGCACTGCTTACTGGCTTGCTGTCTAGGCTTATGTTCGACTAC  733

seq1  ATGACTTTTACCTCTGAGGACCCCTTACCCAAAAATGGCAATGTTCACAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTTTTACCTCTGAGGACCCCTTACCCAAAAATGGCAATGTTCACAA  783

seq1  TTTTGGGACCTCCTACATCACTCATTAATAAAGAAATGCCATATAGACTT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGGACCTCCTACATCACTCATTAATAAAGAAATGCCATATAGACTT  833

seq1  GCCTACAGGCCAACCTGATGGAAGTGATTTATCACTTGAGCATCCCCTTC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTACAGGCCAACCTGATGGAAGTGATTTATCACTTGAGCATCCCCTTC  883

seq1  ACAGGTAACTCTACCTAGTGTCAATGTTAAAAAATACCAATGAGGACAAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTAACTCTACCTAGTGTCAATGTTAAAAAATACCAATGAGGACAAC  933

seq1  TGCTTAACCCTGACCTTATCAGTTGCTGATTCTCTCCTGGTACTTTCAAG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAACCCTGACCTTATCAGTTGCTGATTCTCTCCTGGTACTTTCAAG  983

seq1  TAACACTAAGCAATAATCCTCTGTTTTCCCATGTTCCCTCAGTTCATCCT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACTAAGCAATAATCCTCTGTTTTCCCATGTTCCCTCAGTTCATCCT  1033

seq1  GTAAACCAGTAGAGGGAATTTAGCTTCTGTGAATTTTGTAGCTTTTATTC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACCAGTAGAGGGAATTTAGCTTCTGTGAATTTTGTAGCTTTTATTC  1083

seq1  TGTAAGAGAAATAAAGAAATGAAGTGTTCATCAAGACTTGAATTC  1141
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGAGAAATAAAGAAATGAAGTGTTCATCAAGACTTGAATTC  1128