BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-084A03
Chromosome4 (Build37)
Map Location 97,454,444 - 97,569,389
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNfia
Upstream geneLOC620883, EG638698
Downstream geneLOC100039459, LOC669426, LOC384106, 0610025J13Rik, Tm2d1, Inadl, L1td1, Ankrd38, LOC100039541
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-084A03.bB6Ng01-084A03.g
ACCDH898100DH898101
length1,2301,124
definitionDH898100|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084A03, 5' end.DH898101|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084A03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,568,153 - 97,569,389)(97,454,444 - 97,455,581)
sequence
gaattctttttaaaaagttactctttaccatggtattcttgtaaaatcaa
gaaaaagttctaaaattataggccactaataagtatatagagagtctgaa
agatgatgtgacttcgctcagagggtgattagctgacttcgccctcctgg
ctgaaaagaaaggggttttgggttggggtgtattcttttccccaatggct
tcctaagtaacttagttgtaacggagttcataagaatcgagtaaagtcag
cattatttagaaaaactttaaaataaccaaggtttaataagcatgtggaa
taagttccgaactggccttttcatgttttgatttttgatgttctaaataa
cagatgagagtccaatgctgcctgcggtgggttccaagttttcaatggag
atacccaatgtccagccagaatgaaaacaaaatctctttaaatcctttaa
agcacaaatctatttaaaaccttaaacatggctcatgatagcagttctat
tgcaaacacttacagtgtgtgctatatgcaaaaccaccagagagtgtgtg
gctgggaaaagtagctcagactagcatctgaccttcatcctttctgatgc
tgatataaagtcactgaagttctttgatctccctcacttatttctctaaa
ggaagcatgaatacgtcttgagcaaagcctaggcattcatgattcagagc
aatgaaataatactctgaacacggtctgaaataaagacatactcagacct
gtcttgagcaccagagttgcttatgttcacacactggacggttagggcag
gtccacaggaactatcaaaatggtttaagggataacaggacttctagaga
gaccactttcttaatgtggaaaataacattaaaactaactttcagcaatc
ctgtgtctgttattatcaatgtttcaagcacaactgacgtgaacataaac
caggtacaaatgtctattatgtgggggaaaatgcctttccagtaaggtag
aacattctaagaacaaaacactctacctcaactcttcaaggtgttatcat
ttcagcctatgtgtcaatcataatgggtccatccagccaacacagtaaga
tttcttcttataaccttccccaatgctgacaggcgaaaaagcatgatcca
gcatttacagtaatttacctaaagtatttgtcaaggtgaaaacaaaagtg
ttatgttgacctggaactttaactgtgctt
gaattcacttcctactgcttgagagcaggtgtaagatggggagtgcctgt
gagtgtgtgctttgtgtgcatgtgtgcacacccaggctgtacccagagtg
ctccttaagcagtagcaatgatttcagtagtattcaaaagatgctatttt
aagtgtggaataattacacataaggttatagtgcatagaaaataatttta
aacattaaaaacaagtcatattattttgttatattttatgattctatgtc
agattaatttttacaatgcactgtcttttaggtgacttagcacatttgct
agagggggtctgcatttctaacatattcagcatgttctgctggcaagtat
atgtgtatatgtgatgtgaatatgtgtttatatccaagactaaggctgta
catatataattaaacttcttaagaagcttaactccctgcagaaacttgtg
cacatagtttctgtgatttgtgatgatagagtatgtttgaaaatgaaggg
ataagactaattaatatatggtgatacttaaaattaagagagacttgtct
tgtatcccaaagtccaatcctgaccttaagccaaattcgtggcaattttt
tttatgaatacattgtaaattattgatacatgtgtacagttttatctctt
aattacataaaggtagttttagcaactagcaaacttgagattaaatatga
cttttagagctttaagtgggctctgcagtaacctgagaatagtaacaata
tccttttccttgaatgtagtaacaaaatccaatgcttaggacatagtaaa
aaagatggaagttcaaaggcagcgcttgcacaggaacagggagcaaagtt
ggttgggaggaagcctttgaatggaggtcagctgtttatggctaagaggt
tgactgtgttggttagaaagtttcccaatgctatggcatggtttgctgtc
ttccttcccaccctgtgatgaatagcattaattaaacctattagctagtg
tgggagaaaccacagctttgttgtggtcagtgctgtacaccagtagactg
ggtaggcctgagctgcttccgaggatacagaaaaagcttgtccgggtttt
acatctctccgaagccaccgctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_97568153_97569389
seq2: B6Ng01-084A03.b_44_1273 (reverse)

seq1  AAGCACAGTTAAAAGTCCCAGGGGTCAACAATTAATACATTTTGTTTTCC  50
      |||||||||| ||||| |||  ||||||||  ||| || ||||||||| |
seq2  AAGCACAGTT-AAAGTTCCA--GGTCAACA--TAACAC-TTTTGTTTT-C  43

seq1  ACCTTG-CAAATAACTCTAATGTAAA-TACTGTAAATTGCTGGGTCATGC  98
      |||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||||| |||||| ||||||
seq2  ACCTTGACAAAT-ACT-TTAGGTAAATTACTGTAAA-TGCTGGATCATGC  90

seq1  TTTTCTGCTGGTCAGCAATGGGGA--GGTATAAGAAGATATCTTACTGTG  146
      ||||  ||  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||
seq2  TTTTTCGCCTGTCAGCATTGGGGAAGGTTATAAGAAGAAATCTTACTGTG  140

seq1  TT-GCTGGATGGACCCATTATGATTGACACATAGGCTGAAATGATAACAC  195
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGGATGGACCCATTATGATTGACACATAGGCTGAAATGATAACAC  190

seq1  CTTG-AGAGTTGGAGGTAGAGTGTTTTTGTTCTTAGAATGTCTAACCTTA  244
      |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||
seq2  CTTGAAGAGTT-GAGGTAGAGTG-TTTTGTTCTTAGAATGTTCTACCTTA  238

seq1  CTGGAAAGGCATTTTCCCCAACATAATAGACATTTTGTACCTGGTTTATG  294
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTGGAAAGGCATTTTCCCCCACATAATAGACA-TTTGTACCTGGTTTATG  287

seq1  TTCACGTCAGTTGTGCTTGAAACATTGATAATAACAGACACAGGATTGCT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACGTCAGTTGTGCTTGAAACATTGATAATAACAGACACAGGATTGCT  337

seq1  GAAAGTTAGTTTTAATGTTATTTTCCACATTAAGAAAGTGGTCTCTCTAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTTAGTTTTAATGTTATTTTCCACATTAAGAAAGTGGTCTCTCTAG  387

seq1  AAGTCCTGTTATCCCTTAAACCATTTTGATAGTTCCTGTGGACCTGCCCT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCTGTTATCCCTTAAACCATTTTGATAGTTCCTGTGGACCTGCCCT  437

seq1  AACCGTCCAGTGTGTGAACATAAGCAACTCTGGTGCTCAAGACAGGTCTG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGTCCAGTGTGTGAACATAAGCAACTCTGGTGCTCAAGACAGGTCTG  487

seq1  AGTATGTCTTTATTTCAGACCGTGTTCAGAGTATTATTTCATTGCTCTGA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGTCTTTATTTCAGACCGTGTTCAGAGTATTATTTCATTGCTCTGA  537

seq1  ATCATGAATGCCTAGGCTTTGCTCAAGACGTATTCATGCTTCCTTTAGAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGAATGCCTAGGCTTTGCTCAAGACGTATTCATGCTTCCTTTAGAG  587

seq1  AAATAAGTGAGGGAGATCAAAGAACTTCAGTGACTTTATATCAGCATCAG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGTGAGGGAGATCAAAGAACTTCAGTGACTTTATATCAGCATCAG  637

seq1  AAAGGATGAAGGTCAGATGCTAGTCTGAGCTACTTTTCCCAGCCACACAC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGATGAAGGTCAGATGCTAGTCTGAGCTACTTTTCCCAGCCACACAC  687

seq1  TCTCTGGTGGTTTTGCATATAGCACACACTGTAAGTGTTTGCAATAGAAC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGTGGTTTTGCATATAGCACACACTGTAAGTGTTTGCAATAGAAC  737

seq1  TGCTATCATGAGCCATGTTTAAGGTTTTAAATAGATTTGTGCTTTAAAGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATCATGAGCCATGTTTAAGGTTTTAAATAGATTTGTGCTTTAAAGG  787

seq1  ATTTAAAGAGATTTTGTTTTCATTCTGGCTGGACATTGGGTATCTCCATT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAGAGATTTTGTTTTCATTCTGGCTGGACATTGGGTATCTCCATT  837

seq1  GAAAACTTGGAACCCACCGCAGGCAGCATTGGACTCTCATCTGTTATTTA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACTTGGAACCCACCGCAGGCAGCATTGGACTCTCATCTGTTATTTA  887

seq1  GAACATCAAAAATCAAAACATGAAAAGGCCAGTTCGGAACTTATTCCACA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATCAAAAATCAAAACATGAAAAGGCCAGTTCGGAACTTATTCCACA  937

seq1  TGCTTATTAAACCTTGGTTATTTTAAAGTTTTTCTAAATAATGCTGACTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTATTAAACCTTGGTTATTTTAAAGTTTTTCTAAATAATGCTGACTT  987

seq1  TACTCGATTCTTATGAACTCCGTTACAACTAAGTTACTTAGGAAGCCATT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCGATTCTTATGAACTCCGTTACAACTAAGTTACTTAGGAAGCCATT  1037

seq1  GGGGAAAAGAATACACCCCAACCCAAAACCCCTTTCTTTTCAGCCAGGAG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAAAGAATACACCCCAACCCAAAACCCCTTTCTTTTCAGCCAGGAG  1087

seq1  GGCGAAGTCAGCTAATCACCCTCTGAGCGAAGTCACATCATCTTTCAGAC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAAGTCAGCTAATCACCCTCTGAGCGAAGTCACATCATCTTTCAGAC  1137

seq1  TCTCTATATACTTATTAGTGGCCTATAATTTTAGAACTTTTTCTTGATTT  1194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATATACTTATTAGTGGCCTATAATTTTAGAACTTTTTCTTGATTT  1187

seq1  TACAAGAATACCATGGTAAAGAGTAACTTTTTAAAAAGAATTC  1237
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGAATACCATGGTAAAGAGTAACTTTTTAAAAAGAATTC  1230

seq1: chr4_97454444_97455581
seq2: B6Ng01-084A03.g_69_1192

seq1  GAATTCACTTCCTACTGCTTGAGAGCAGGTGTAAGATGGGGAGTGCCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTCCTACTGCTTGAGAGCAGGTGTAAGATGGGGAGTGCCTGT  50

seq1  GAGTGTGTGCTTTGTGTGCATGTGTGCACACCCAGGCTGTACCCAGAGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGTGCTTTGTGTGCATGTGTGCACACCCAGGCTGTACCCAGAGTG  100

seq1  CTCCTTAAGCAGTAGCAATGATTTCAGTAGTATTCAAAAGATGCTATTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTAAGCAGTAGCAATGATTTCAGTAGTATTCAAAAGATGCTATTTT  150

seq1  AAGTGTGGAATAATTACACATAAGGTTATAGTGCATAGAAAATAATTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGGAATAATTACACATAAGGTTATAGTGCATAGAAAATAATTTTA  200

seq1  AACATTAAAAACAAGTCATATTATTTTGTTATATTTTATGATTCTATGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTAAAAACAAGTCATATTATTTTGTTATATTTTATGATTCTATGTC  250

seq1  AGATTAATTTTTACAATGCACTGTCTTTTAGGTGACTTAGCACATTTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTAATTTTTACAATGCACTGTCTTTTAGGTGACTTAGCACATTTGCT  300

seq1  AGAGGGGGTCTGCATTTCTAACATATTCAGCATGTTCTGCTGGCAAGTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGGGTCTGCATTTCTAACATATTCAGCATGTTCTGCTGGCAAGTAT  350

seq1  ATGTGTATATGTGATGTGAATATGTGTTTATATCCAAGACTAAGGCTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTATATGTGATGTGAATATGTGTTTATATCCAAGACTAAGGCTGTA  400

seq1  CATATATAATTAAACTTCTTAAGAAGCTTAACTCCCTGCAGAAACTTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATATAATTAAACTTCTTAAGAAGCTTAACTCCCTGCAGAAACTTGTG  450

seq1  CACATAGTTTCTGTGATTTGTGATGATAGAGTATGTTTGAAAATGAAGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAGTTTCTGTGATTTGTGATGATAGAGTATGTTTGAAAATGAAGGG  500

seq1  ATAAGACTAATTAATATATGGTGATACTTAAAATTAAGAGAGACTTGTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACTAATTAATATATGGTGATACTTAAAATTAAGAGAGACTTGTCT  550

seq1  TGTATCCCAAAGTCCAATCCTGACCTTAAGCCAAATTCGTGGCAATTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCCCAAAGTCCAATCCTGACCTTAAGCCAAATTCGTGGCAATTTTT  600

seq1  TTTATGAATACATTGTAAATTATTGATACATGTGTACAGTTTTATCTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGAATACATTGTAAATTATTGATACATGTGTACAGTTTTATCTCTT  650

seq1  AATTACATAAAGGTAGTTTTAGCAACTAGCAAACTTGAGATTAAATATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACATAAAGGTAGTTTTAGCAACTAGCAAACTTGAGATTAAATATGA  700

seq1  CTTTTAGAGCTTTAAGTGGGCTCTGCAGTAACCTGAGAATAGTAACAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAGAGCTTTAAGTGGGCTCTGCAGTAACCTGAGAATAGTAACAATA  750

seq1  TCCTTTTCCTTGAATGTAGTAACAAAATCCAATGCTTAGGACATAGTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTCCTTGAATGTAGTAACAAAATCCAATGCTTAGGACATAGTAAA  800

seq1  AAAGATGGAAGTTCAAAGGCAGCGCTTGCACAGGAACAGGGAGCAAAGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGGAAGTTCAAAGGCAGCGCTTGCACAGGAACAGGGAGCAAAGTT  850

seq1  GGTTGGGAGGAAGCCTTTGAATGGAGGTCAGCTTGTTTATGGCTAAGAGG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GGTTGGGAGGAAGCCTTTGAATGGAGGTCAGC-TGTTTATGGCTAAGAGG  899

seq1  TTTGACTGTGTTGGTTAGAAAGTTTCCCAATGCTATTGGCATGGTTTGCT  950
       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  -TTGACTGTGTTGGTTAGAAAGTTTCCCAATGCTA-TGGCATGGTTTGC-  946

seq1  TGTCTTCCTTCCCACCCTGTGATGAATAGCATTAATTTAAACCTATTTAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   
seq2  TGTCTTCCTTCCCACCCTGTGATGAATAGCATTAA-TTAAACCTATT---  992

seq1  GGCTAGTGTGGGAGAAACCACAGCTTTTGTTGTGGTCAGTGCTGTACA-C  1049
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
seq2  AGCTAGTGTGGGAGAAACCACAGC-TTTGTTGTGGTCAGTGCTGTACACC  1041

seq1  AGTAGGACTGGGTTAGGGCCTGGAGCTGCTTCCAGAGGATACAG-AACAG  1098
      |||| ||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||
seq2  AGTA-GACTGGGT--AGGCCT-GAGCTGCTTCC-GAGGATACAGAAAAAG  1086

seq1  CCTGTCGGGTTTTTACATCTCTCACAGAAGCAACCGCTCC  1138
      | |||| || ||||||||||||  | ||||| ||||||||
seq2  CTTGTCCGGGTTTTACATCTCT--CCGAAGCCACCGCTCC  1124