BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-084A16
Chromosome4 (Build37)
Map Location 21,121,478 - 21,122,061
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneE130310K16Rik
Downstream genePrdm13, Ccnc, 2610029I01Rik, Usp45, 4930528A17Rik, 5730406M06Rik, Coq3, 6230409E13Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-084A16.bB6Ng01-084A16.g
ACCDH898122DH898123
length1,169982
definitionDH898122|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084A16, 5' end.DH898123|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084A16, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctttgtttagctctgagccccatttttttaatgttttttttattt
tattttctggagtccaccttcttgagttctttatatatattagatattag
tcccctttagggttggaaaagatcctttcgcaatctgttggtggccattt
tgtcttattgacagtgtcttttgccttacagaagctttgtaattttatga
gatcccatttgttgattctcaatcttacagcacaagtcattgctgttcta
tttaggaatttatcccctgtgcccatatcttcgaggcttttgcccacttt
ctcctctataagtttcagtgtctctggtttttttttagagttccttaatc
cactttgatttgaccttagtacaaggagataggaatggatcaattcgcat
tcttctacatgatatccgccagttgtgccagcaccatttgttgaaaatgc
tgtcttttttttctctggatggttttagctcccttgtcaaagatcaagtg
accataggtgtgtgcattcatttctgggtcttcaattctattccattggt
ctacttgtctgtcgctataccagtaccatgcagtttttatcagaattgct
ctgtagtacagctttaggtcaggcatggtgattctaccagaggttctttt
atccttgagaagagtttttgctatcctaggttttttgttcttccagattt
atttgcaaattgccctttgtaattcattgaagaattgagttggaattttg
atgagtcacgccaaggtattttatattatttgtgagtattgtgaagagtg
ttgtttccctaatttctttctcagtctttttatcctttgtgtagagaaag
gccatttgacttgtttgagttaagtttatatctagttacttcactgaagc
tgtttatcaggtttaggagttctctggtggaatttttagggtcacttaca
tatactatcatatcatctgcaaaagtgatatttgacttcttcttttccaa
tttgtatctcttgactccttttgttgtcaatgctctggcctagacttcaa
gtctatgtgattaggtagggagaaagtggcagcttgtcagtcctgattta
tggggatgctttcacttccactatttacttgaagttggctaccggtttgc
gtcgaatggctttatcagg
gaattcttttctttccctattccttaactaatgatccagcctccatttgt
ttatatatgggaacccaggttaagaactccagattcatattgaaaagata
gaatgatagagtgatacatgtactgtggaaaggagaagaaatggaaatat
gtcagggataaagagtagtctagtgtgaatgacctatgccttcactcgag
gccatggttatatctggatctttgctgcctcagagactcatatccggttc
tgaagtcctactgcagctagaatctgtgttgatgtccatggtctgaactg
cagactgaagctatgttgatgtttgtgtgacacgatactgccagtagcca
tactgatactaaggtcctaaactgacacctgggtttgtggtcatgctcag
agctaagtctggggctgaggtcctattgcagccaaggtctatgtcccata
ttcccaccaaaggccatgcagctatccttggtctggactgtagactgaaa
ccatgttgatgttcatggactctactgcaactgaatgtatgctggtgtga
gtagcatgagctgctacctgaggccatgatgatgttcatcgtgtgctgcc
acccagggcaatgtctgagcccatggtcctaaccaagatgaggtctaggc
tgatataccagccctggtctatgttgatatctgtggcccatgatatcact
gggttgcctccacaggccttgtctgggctcaaggtactgctgtagctgtg
gaccacgttttatggtatgtgctgttgccaaaagcatgtgaatattcatt
atctgtgtttccatttttctgtgaagagcgaagatgcaatatttgaagtg
atattggtaattgcagatgcatagttaagaaagtatatggaagatttaaa
tgacaaccttagccctcatccacccaaaagtagcagccttcaaagagaga
gaactgtttaaaaaaaaaaagcatgaaaagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_21121478_21122061
seq2: B6Ng01-084A16.g_69_652

seq1  GAATTCTTTTCTTTCCCTATTCCTTAACTAATGATCCAGCCTCCATTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTCTTTCCCTATTCCTTAACTAATGATCCAGCCTCCATTTGT  50

seq1  TTATATATGGGAACCCAGGTTAAGAACTCCAGATTCATATTGAAAAGATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATATGGGAACCCAGGTTAAGAACTCCAGATTCATATTGAAAAGATA  100

seq1  GAATGATAGAGTGATACATGTACTGTGGAAAGGAGAAGAAATGGAAATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGATAGAGTGATACATGTACTGTGGAAAGGAGAAGAAATGGAAATAT  150

seq1  GTCAGGGATAAAGAGTAGTCTAGTGTGAATGACCTATGCCTTCACTCGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGGATAAAGAGTAGTCTAGTGTGAATGACCTATGCCTTCACTCGAG  200

seq1  GCCATGGTTATATCTGGATCTTTGCTGCCTCAGAGACTCATATCCGGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGTTATATCTGGATCTTTGCTGCCTCAGAGACTCATATCCGGTTC  250

seq1  TGAAGTCCTACTGCAGCTAGAATCTGTGTTGATGTCCATGGTCTGAACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTCCTACTGCAGCTAGAATCTGTGTTGATGTCCATGGTCTGAACTG  300

seq1  CAGACTGAAGCTATGTTGATGTTTGTGTGACACGATACTGCCAGTAGCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTGAAGCTATGTTGATGTTTGTGTGACACGATACTGCCAGTAGCCA  350

seq1  TACTGATACTAAGGTCCTAAACTGACACCTGGGTTTGTGGTCATGCTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGATACTAAGGTCCTAAACTGACACCTGGGTTTGTGGTCATGCTCAG  400

seq1  AGCTAAGTCTGGGGCTGAGGTCCTATTGCAGCCAAGGTCTATGTCCCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAAGTCTGGGGCTGAGGTCCTATTGCAGCCAAGGTCTATGTCCCATA  450

seq1  TTCCCACCAAAGGCCATGCAGCTATCCTTGGTCTGGACTGTAGACTGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCACCAAAGGCCATGCAGCTATCCTTGGTCTGGACTGTAGACTGAAA  500

seq1  CCATGTTGATGTTCATGGACTCTACTGCAACTGAATGTATGCTGGTGTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTGATGTTCATGGACTCTACTGCAACTGAATGTATGCTGGTGTGA  550

seq1  GTAGCATGAGCTGCTACCTGAGGCCATGATGATG  584
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCATGAGCTGCTACCTGAGGCCATGATGATG  584