BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087O13
Chromosome4 (Build37)
Map Location 56,610,471 - 56,760,875
singlet/doubletdoublet
Overlap geneActl7b, Actl7a
Upstream genenone
Downstream geneIkbkap, BC026590, Ctnnal1, D730040F13Rik, 6430704M03Rik, Epb4.1l4b, Ptpn3, LOC100041460, 1700042G15Rik, LOC100041342, LOC619973, LOC667049, Palm2, LOC100041513
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087O13.bB6Ng01-087O13.g
ACCDH900906DH900907
length1,1431,132
definitionDH900906|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O13, 5' end.DH900907|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,759,743 - 56,760,875)(56,610,471 - 56,611,600)
sequence
gaattctcattgttattttgtggtgctgggcaatgaaccccttctgggca
ctgtacatgcagatcaagctggtgtggaccttgctgtaggccttacccca
gtcagaagggcattttgaaacaaaacccaaaaacctggcacttcttagta
attgaaggtgactgcacgttgggaagcacagtctatgttttattttcctc
cttgtcttagttattctactgctgtgaggaccccatgaccaaggcagctc
ttagagaaggcagcacttctttcttgtttacgttcagaggcttgcatcac
tgtgatcatcatagtaggtagcatgcggcgtgtaggcaggcaggcgtggt
gctggagaagtggtcgcaggcttcacatctggttccacaggcagaggggg
agaatgaaaatggttcatatgctgggcctggcatgggcttttgaaacctc
cgagttcactcccagtgacatgcgtcccacacggccacattcttagtcct
tctcaaacagttctgttccctggtgactaagcattggagcatatgaacca
ttttcattgaaatcactactcctgttttgctagtccatactgtagaagct
catgggggtcttcagctgttgttcgtggggcgaggagggaatcagcacag
gtgactaaatgttcaagatcagtggttctcaacctttaatacaattcctc
atgttgtgaccccaaccataagatttggttgctacatcataactgtgatt
ttgctagttatgaaattgtaaatacctgatatacagggtatctgatgtgt
gacctcccaagggagccacccacaagtttgagaatctctgtttcaagagg
ctggtaatcagttaaggcgcccttggtgctgatggcaacagtaaacgggt
gtgctcgtgagtcctgagccttctgtgctctctgagctctttctgtgctc
tgtacccatctttactctggttttttgagacagggtttctctgtgtcctg
ggactcaccaatgtagaccaggctggtctcaaactcaaatccacctgcct
ctgcctcccaagtgcttgggatttaaggcatgtgtcacccactgcccaat
ctcccatctttacaccttggaccctgaagttcccaaaacttca
gaattctgggaaacaaaatatgtacttgtgtccacctaaaacaggaaggt
ggtaaaaaggtataggaagactctaaggatctgctacaaggtatggacat
ctgctcatgagtaccagtcaactgcaaaccagaaagaaataaagaagaca
tcagctattgcaggtgtgggttttctacattaatgttcctatctagtgta
caatgaaatatcaaggtcccaaagttgtattcatatgcaaagttgtgctc
cagttagctaaaaaataataaaaataaaattgcttctttcaggtaccaac
catggctaaaagaattcatggaaaattcagaaatttagaaatgcagataa
gctaattgcaagctgttagtgaagctaaatgactaaggagatggctacat
tggactcttagttattaaatggatgaatgctggcaggcttttaccaaaat
aaagcacattttttcctgggatagttggtcttgggccattctttctggca
gccattagatgacagcattggtttatttgctaagacattctcagatggat
gcaaaatgatgatgtcagcataatgttattctctctgctgagtgaggtag
aaagcacacacccatcatgtctaaaatgatagtcccactcatatttatga
aaatggagcatggagataatacacacacacacacacacacacacacacac
acacaccacaaaaaaatattttaaaaagagaaaagaaagaaaagaaaaca
aaactgttaaagaaaaaaacaagttatagctcttggttctctccctccct
gctcccatgcaccctccttcttctcctctctcctctacaggaggtaaaga
tataataatggccaaccatattcaaaatatataatagatttagtccaaga
agcccacataatgcactctgtcaaatgggtattttatttagacatcaagt
tggcaagcaggcagtccacggctcaggagaaatagatgactgctctgttg
aatatggagagattccagcctatcatcagtgggcatgcctccaagatcta
gagggagcagccactggcaactctgagcaatttgccttgaagcagaatgg
atcctcttccgggggtgattccccaaatgggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_56759743_56760875
seq2: B6Ng01-087O13.b_48_1190 (reverse)

seq1  TGAAGTTTTGGG-ACTTCAGTGTCAAAAGAGTAAAGAT-GGAGA-TGGGC  47
      |||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||| ||||| |||||
seq2  TGAAGTTTTGGGAACTTCAGGGTCCAAGGTGTAAAGATGGGAGATTGGGC  50

seq1  AGT-GGTGACACATGCCTTTAATCCC-AGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGG  95
      ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGTGACACATGCCTTAAATCCCAAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGG  100

seq1  TGGATTTGAGTTTGAGACCAGCCTGGTCTACATT-GTGAGTCCCAGGACA  144
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGGATTTGAGTTTGAGACCAGCCTGGTCTACATTGGTGAGTCCCAGGACA  150

seq1  CAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAGAGTAAAGATGGGTACAGAGCACA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAGAGTAAAGATGGGTACAGAGCACA  200

seq1  GGAAAGAGCTCAGAGAGCACAGAAGGCTCAGGACTCACGAGCACA-CCGT  243
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  -GAAAGAGCTCAGAGAGCACAGAAGGCTCAGGACTCACGAGCACACCCGT  249

seq1  TTACTGTTGCCATCAGCACCAAGGGCGCCTTAACTGATTA-CAGCCTCTT  292
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTACTGTTGCCATCAGCACCAAGGGCGCCTTAACTGATTACCAGCCTCTT  299

seq1  G-AACAGAGGTTCTC-AACTTGTGGGTGGCTCCCTTGGGAGGTCACACAT  340
      | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGAGATTCTCAAACTTGTGGGTGGCTCCCTTGGGAGGTCACACAT  349

seq1  CAGATACCCTGTATATCAGGTATTTACAA-TTCATAACTAGCAAAATCAC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CAGATACCCTGTATATCAGGTATTTACAATTTCATAACTAGCAAAATCAC  399

seq1  AGTTATGATGTAGCAACCAAATCTTATGGTTGGGGTCACAACATGAGGAA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATGATGTAGCAACCAAATCTTATGGTTGGGGTCACAACATGAGGAA  449

seq1  TTGTATTAAAGGTTGAGAACCACTGATCTTGAACATTTAGTCACCTGTGC  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTAAAGGTTGAGAACCACTGATCTTGAACATTTAGTCACCTGTGC  499

seq1  TGATTCCCTCCTCGCCCCACGAACAACAGCTGAAGACCCCCATGAGCTTC  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCCCTCCTCGCCCCACGAACAACAGCTGAAGACCCCCATGAGCTTC  549

seq1  TACAGTATGGACTAGCAAAACAGGAGTAGTGATTTCAATGAAAATGGTTC  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTATGGACTAGCAAAACAGGAGTAGTGATTTCAATGAAAATGGTTC  599

seq1  ATATGCTCCAATGCTTAGTCACCAGGGAACAGAACTGTTTGAGAAGGACT  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTCCAATGCTTAGTCACCAGGGAACAGAACTGTTTGAGAAGGACT  649

seq1  AAGAATGTGGCCGTGTGGGACGCATGTCACTGGGAGTGAACTCGGAGGTT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATGTGGCCGTGTGGGACGCATGTCACTGGGAGTGAACTCGGAGGTT  699

seq1  TCAAAAGCCCATGCCAGGCCCAGCATATGAACCATTTTCATTCTCCCCCT  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAGCCCATGCCAGGCCCAGCATATGAACCATTTTCATTCTCCCCCT  749

seq1  CTGCCTGTGGAACCAGATGTGAAGCCTGCGACCACTTCTCCAGCACCACG  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGTGGAACCAGATGTGAAGCCTGCGACCACTTCTCCAGCACCACG  799

seq1  CCTGCCTGCCTACACGCCGCATGCTACCTACTATGATGATCACAGTGATG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCTGCCTACACGCCGCATGCTACCTACTATGATGATCACAGTGATG  849

seq1  CAAGCCTCTGAACGTAAACAAGAAAGAAGTGCTGCCTTCTCTAAGAGCTG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCTCTGAACGTAAACAAGAAAGAAGTGCTGCCTTCTCTAAGAGCTG  899

seq1  CCTTGGTCATGGGGTCCTCACAGCAGTAGAATAACTAAGACAAGGAGGAA  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGTCATGGGGTCCTCACAGCAGTAGAATAACTAAGACAAGGAGGAA  949

seq1  AATAAAACATAGACTGTGCTTCCCAACGTGCAGTCACCTTCAATTACTAA  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAACATAGACTGTGCTTCCCAACGTGCAGTCACCTTCAATTACTAA  999

seq1  GAAGTGCCAGGTTTTTGGGTTTTGTTTCAAAATGCCCTTCTGACTGGGGT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGCCAGGTTTTTGGGTTTTGTTTCAAAATGCCCTTCTGACTGGGGT  1049

seq1  AAGGCCTACAGCAAGGTCCACACCAGCTTGATCTGCATGTACAGTGCCCA  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCTACAGCAAGGTCCACACCAGCTTGATCTGCATGTACAGTGCCCA  1099

seq1  GAAGGGGTTCAATGCCCAGCACCACAAAATAACAATGAGAATTC  1133
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGGTTCATTGCCCAGCACCACAAAATAACAATGAGAATTC  1143

seq1: chr4_56610471_56611600
seq2: B6Ng01-087O13.g_73_1204

seq1  GAATTCTGGGAAACAAAATATGTACTTGTGTCCACCTAAAACAGGAAGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGAAACAAAATATGTACTTGTGTCCACCTAAAACAGGAAGGT  50

seq1  GGTAAAAAGGTATAGGAAGACTCTAAGGATCTGCTACAAGGTATGGACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAAAGGTATAGGAAGACTCTAAGGATCTGCTACAAGGTATGGACAT  100

seq1  CTGCTCATGAGTACCAGTCAACTGCAAACCAGAAAGAAATAAAGAAGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCATGAGTACCAGTCAACTGCAAACCAGAAAGAAATAAAGAAGACA  150

seq1  TCAGCTATTGCAGGTGTGGGTTTTCTACATTAATGTTCCTATCTAGTGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTATTGCAGGTGTGGGTTTTCTACATTAATGTTCCTATCTAGTGTA  200

seq1  CAATGAAATATCAAGGTCCCAAAGTTGTATTCATATGCAAAGTTGTGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAAATATCAAGGTCCCAAAGTTGTATTCATATGCAAAGTTGTGCTC  250

seq1  CAGTTAGCTAAAAAATAATAAAAATAAAATTGCTTCTTTCAGGTACCAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAGCTAAAAAATAATAAAAATAAAATTGCTTCTTTCAGGTACCAAC  300

seq1  CATGGCTAAAAGAATTCATGGAAAATTCAGAAATTTAGAAATGCAGATAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCTAAAAGAATTCATGGAAAATTCAGAAATTTAGAAATGCAGATAA  350

seq1  GCTAATTGCAAGCTGTTAGTGAAGCTAAATGACTAAGGAGATGGCTACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATTGCAAGCTGTTAGTGAAGCTAAATGACTAAGGAGATGGCTACAT  400

seq1  TGGACTCTTAGTTATTAAATGGATGAATGCTGGCAGGCTTTTACCAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTCTTAGTTATTAAATGGATGAATGCTGGCAGGCTTTTACCAAAAT  450

seq1  AAAGCACATTTTTTCCTGGGATAGTTGGTCTTGGGCCATTCTTTCTGGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCACATTTTTTCCTGGGATAGTTGGTCTTGGGCCATTCTTTCTGGCA  500

seq1  GCCATTAGATGACAGCATTGGTTTATTTGCTAAGACATTCTCAGATGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTAGATGACAGCATTGGTTTATTTGCTAAGACATTCTCAGATGGAT  550

seq1  GCAAAATGATGATGTCAGCATAATGTTATTCTCTCTGCTGAGTGAGGTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAATGATGATGTCAGCATAATGTTATTCTCTCTGCTGAGTGAGGTAG  600

seq1  AAAGCACACACCCATCATGTCT-AAATGATAGTCCCACTCATATTTATGA  649
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCACACACCCATCATGTCTAAAATGATAGTCCCACTCATATTTATGA  650

seq1  AAATGGAGCATGGAGATAATACACACACACACACACACACACACACACAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGAGCATGGAGATAATACACACACACACACACACACACACACACAC  700

seq1  ACACACCACAAAAAAATATTTT-AAAAGAG-AAAGAAAG-AAAGAAAACA  746
      |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||
seq2  ACACACCACAAAAAAATATTTTAAAAAGAGAAAAGAAAGAAAAGAAAACA  750

seq1  AAACTGTTAAAGAAAAAAACAAGTTATAGCTCTTGGTTCTCTCCCTCCCT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTTAAAGAAAAAAACAAGTTATAGCTCTTGGTTCTCTCCCTCCCT  800

seq1  GCTCCCATGCACCCTCCTTCTTCTCCTCTCTCCTCTACAGGAGGTAAAGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCTCCCATGCACCCTCCTTCTTCTCCTCTCTCCTCTACAGGAGGTAAAG-  849

seq1  ATATAATAATGGCCAACCATATTCAAAATATATAATAGATTTAGTCCAAG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATAATGGCCAACCATATTCAAAATATATAATAGATTTAGTCCAAG  899

seq1  AAGCCCACAT-ATGCACTCTGTCAAATGGGTA-TTTATTTAGACATCAAG  944
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAGCCCACATAATGCACTCTGTCAAATGGGTATTTTATTTAGACATCAAG  949

seq1  TTGGCAAGCAGGCAGTCTACGGCTCAAGAGAAATAGATGACTGCTCTGTT  994
      ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCAAGCAGGCAGTCCACGGCTCAGGAGAAATAGATGACTGCTCTGTT  999

seq1  GAATATGGAGTAGATTCCAGCCTATCAATCAGTGGGCATGCCTCCAAGAT  1044
      |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATGGAG-AGATTCCAGCCTATC-ATCAGTGGGCATGCCTCCAAGAT  1047

seq1  CTAGAGTGAGCAGCCACTGGCAACCCTGAGCAATTTGCCTTG-AGCATGA  1093
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||
seq2  CTAGAGGGAGCAGCCACTGGCAACTCTGAGCAATTTGCCTTGAAGCA-GA  1096

seq1  ATTGATGCTCTTCCGGGTGTGATTTCCCCAAATGTGT  1130
      || ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||
seq2  ATGGATCCTCTTCCGGGGGTGA-TTCCCCAAATGGGT  1132