BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-098O06
Chromosome4 (Build37)
Map Location 151,678,976 - 151,835,694
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIcmt, Rnf207, Rpl22, Chd5, Kcnab2, LOC100042028
Upstream geneCamta1, LOC100041960, Dnajc11, Thap3, Phf13, Klhl21, Zbtb48, Tas1r1, Nol9, EG666980, Plekhg5, Tnfrsf25, Espn, LOC100043284, Hes2, Acot7, Gpr153, Hes3
Downstream geneNphp4, LOC667039, Gm833, LOC100042089, Ajap1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-098O06.bB6Ng01-098O06.g
ACCDH908841DH908842
length1,095815
definitionDH908841|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098O06, 5' end.DH908842|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098O06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,834,603 - 151,835,694)(151,678,976 - 151,679,789)
sequence
gaattcactttgtgccctggggttccactctgccgggtgcatgctttccc
ctgagaattctgggaatgaggccatgaggcctgtggtcaccagggaaaat
tccctggccctggaaagtgtccctcacacttaggtgtcttgatctggtaa
ctcgcaatgtgagtttgaatcctgggtcccacttcttggttttcagagtc
cctttattcaaggtcactttcattgtttgtgtatttgttttgagaaaggt
gtagccctggctgacctagaattcacgatgtagaccaggctggacttgaa
cccacagagctctttctacctctgtctccaaagtactgggaataaaggcc
tgcaacaccctgcaaagcttgtcaaagttagtttttacaaactattctga
aacaaaacttgcgatccctatagcaaacccagtgttacttgccttccgta
gatggaaactgagaatgtaagtataaatttgagacccttgccagcgagac
caggggtacacgaggtgaggcatgttctgacaaccccagcctggtgggtc
atgggaaccccaggtcaagcactctgctcttttattgggaattctgcccc
tgtcacctcagtcacccccaggtcccttagatgacagttggaatgctggt
tgaaattcaatcatggtattaagaggagagagacagaagagacgggaaac
ccaggttggactgtcagtcacttgtaccctcattggctgagtgaagcatg
gtctcggtgacaaccgggtccccgggcactgggctagcctttcagtatca
aagacttaaataagaaagctgtagcgagcatccctcaaaggtctggtaca
gaatggccagcaactcatgagtagtggtaactttgccctgggaacgcctg
ccccagctcttggttacacaggatgccttttggaagaagcaagtagaaag
gagcattaggaatggaaggtgcagctccctccatgttgctgcccactcaa
aggaagaccaccaggaataatgagagagtccaccagacctggcaaagatg
gtctctatgaggcctgggagcaatggatgttcctgggttcatgga
gaattcagcagaacataagtgctcatgagttctgacttagggcttcgtgt
tggcagtggcagcattggcgtcttcaggaacaatgtgacagttgtgcccc
gatggggggtgctgactttggccactcacagttggctggctgaagcagga
ctgctgttctgtgccacacacagcaaactgctgctgctgctgggcatatt
cagctgccgggtctgcaggtctgtcccaccagtactcagaggtccctggg
aaggaagccgggatggagggtgtggctctggccaagaggatggtgaaggt
taatatgaaggttaatatgagtgagtgctcaatattgagatactgtagga
ccttgtcaggctggagagaacaggcaagtggctggttctgtgttgtaatg
cagccagagttgacagaacctcgggggctgggtaaatgaattctagctta
ttcttgacataatagacaggcattctatcagcagggaggtgaccccagta
ccagttcctccaccaaaactgtgagattccagaagcctcaaagacgtgtg
ccctggtttgtagtaagccagggaaggctccaggagagcctcaggccagt
ccagctggaagtgttccccgggccacccggcccatcgcctctgcagccag
gactccacgatcacttccaaactgcagtggtgctgaccaagggtgaaggt
ggggatgtggccagagcactgctaattaccacgccctcctgtgcttgggc
ctcccatcaggggtcaggatggcctccctcacaggggtgttatgggaaga
tgagctgggtggcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_151834603_151835694
seq2: B6Ng01-098O06.b_47_1141 (reverse)

seq1  TCCATGAA-CCAGGAACAT-CACTGCTCACAGGCCTCATAGAGACCATCT  48
      |||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGAACCCAGGAACATCCATTGCTCCCAGGCCTCATAGAGACCATCT  50

seq1  ATTCCAGGTCTGGGTGGACTCTCTCATTATTCCTGGTGGTC-TCCTTTGA  97
       | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTGCCAGGTCT-GGTGGACTCTCTCATTATTCCTGGTGGTCTTCCTTTGA  99

seq1  GTGGGCAGCAACATGGAGGGAGCTGCACCTTCCATTCCTAATGCT-CTGT  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
seq2  GTGGGCAGCAACATGGAGGGAGCTGCACCTTCCATTCCTAATGCTCCTTT  149

seq1  CTACTTGCTTCTTCCAAAAGGCATCCTGTGTAACCAAGAGCTGGGGCAGG  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTGCTTCTTCCAAAAGGCATCCTGTGTAACCAAGAGCTGGGGCAGG  199

seq1  CGTTCCCAGGGCAAAGTTACCACTACTCATGAGTTGCTGGCCATTCTGTA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCCCAGGGCAAAGTTACCACTACTCATGAGTTGCTGGCCATTCTGTA  249

seq1  CCAGACCTTTGAGGAATGCTCGCTACAGCTTTCTTATTTAAGTCTTTGAT  296
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACCTTTGAGGGATGCTCGCTACAGCTTTCTTATTTAAGTCTTTGAT  299

seq1  ACTGAAAGGCTAGCCCAGTGCCCGGGGACCCGGTTGTCACCGAGACCATG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAAGGCTAGCCCAGTGCCCGGGGACCCGGTTGTCACCGAGACCATG  349

seq1  CTTCACTCAGCCAATGAGGGTACAAGTGACTGACAGTCCAACCTGGGTTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACTCAGCCAATGAGGGTACAAGTGACTGACAGTCCAACCTGGGTTT  399

seq1  CCCGTCTCTTCTGTCTCTCTCCTCTTAATACCATGATTGAATTTCAACCA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGTCTCTTCTGTCTCTCTCCTCTTAATACCATGATTGAATTTCAACCA  449

seq1  GCATTCCAACTGTCATCTAAGGGACCTGGGGGTGACTGAGGTGACAGGGG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTCCAACTGTCATCTAAGGGACCTGGGGGTGACTGAGGTGACAGGGG  499

seq1  CAGAATTCCCAATAAAAGAGCAGAGTGCTTGACCTGGGGTTCCCATGACC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATTCCCAATAAAAGAGCAGAGTGCTTGACCTGGGGTTCCCATGACC  549

seq1  CACCAGGCTGGGGTTGTCAGAACATGCCTCACCTCGTGTACCCCTGGTCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGCTGGGGTTGTCAGAACATGCCTCACCTCGTGTACCCCTGGTCT  599

seq1  CGCTGGCAAGGGTCTCAAATTTATACTTACATTCTCAGTTTCCATCTACG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGGCAAGGGTCTCAAATTTATACTTACATTCTCAGTTTCCATCTACG  649

seq1  GAAGGCAAGTAACACTGGGTTTGCTATAGGGATCGCAAGTTTTGTTTCAG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCAAGTAACACTGGGTTTGCTATAGGGATCGCAAGTTTTGTTTCAG  699

seq1  AATAGTTTGTAAAAACTAACTTTGACAAGCTTTGCAGGGTGTTGCAGGCC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTTTGTAAAAACTAACTTTGACAAGCTTTGCAGGGTGTTGCAGGCC  749

seq1  TTTATTCCCAGTACTTTGGAGACAGAGGTAGAAAGAGCTCTGTGGGTTCA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCCCAGTACTTTGGAGACAGAGGTAGAAAGAGCTCTGTGGGTTCA  799

seq1  AGTCCAGCCTGGTCTACATCGTGAATTCTAGGTCAGCCAGGGCTACACCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAGCCTGGTCTACATCGTGAATTCTAGGTCAGCCAGGGCTACACCT  849

seq1  TTCTCAAAACAAATACACAAACAATGAAAGTGACCTTGAATAAAGGGACT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAAAACAAATACACAAACAATGAAAGTGACCTTGAATAAAGGGACT  899

seq1  CTGAAAACCAAGAAGTGGGACCCAGGATTCAAACTCACATTGCGAGTTAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAACCAAGAAGTGGGACCCAGGATTCAAACTCACATTGCGAGTTAC  949

seq1  CAGATCAAGACACCTAAGTGTGAGGGACACTTTCCAGGGCCAGGGAATTT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCAAGACACCTAAGTGTGAGGGACACTTTCCAGGGCCAGGGAATTT  999

seq1  TCCCTGGTGACCACAGGCCTCATGGCCTCATTCCCAGAATTCTCAGGGGA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGTGACCACAGGCCTCATGGCCTCATTCCCAGAATTCTCAGGGGA  1049

seq1  AAGCATGCACCCGGCAGAGTGGAACCCCAGGGCACAAAGTGAATTC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATGCACCCGGCAGAGTGGAACCCCAGGGCACAAAGTGAATTC  1095

seq1: chr4_151678976_151679789
seq2: B6Ng01-098O06.g_68_882

seq1  GAATTCAGCAGAACATAAGTGCTCATGAGTTCTGACTTAGGGCTTCGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCAGAACATAAGTGCTCATGAGTTCTGACTTAGGGCTTCGTGT  50

seq1  TGGCAGTGGCAGCATTGGCGTCTTCAGGAACAATGTGACAGTTGTGCCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGTGGCAGCATTGGCGTCTTCAGGAACAATGTGACAGTTGTGCCCC  100

seq1  GATGGGGGGTGCTGACTTTGGCCACTCACAGTTGGCTGGCTGAAGCAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGGGGTGCTGACTTTGGCCACTCACAGTTGGCTGGCTGAAGCAGGA  150

seq1  CTGCTGTTCTGTGCCACACACAGCAAACTGCTGCTGCTGCTGGGCATATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTTCTGTGCCACACACAGCAAACTGCTGCTGCTGCTGGGCATATT  200

seq1  CAGCTGCCGGGTCTGCAGGTCTGTCCCACCAGTACTCAGAGGTCCCTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGCCGGGTCTGCAGGTCTGTCCCACCAGTACTCAGAGGTCCCTGGG  250

seq1  AAGGAAGCCGGGATGGAGGGTGTGGCTCTGGCCAAGAGGATGGTGAAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGCCGGGATGGAGGGTGTGGCTCTGGCCAAGAGGATGGTGAAGGT  300

seq1  TAATATGAAGGTTAATATGAGTGAGTGCTCAATATTGAGATACTGTAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATGAAGGTTAATATGAGTGAGTGCTCAATATTGAGATACTGTAGGA  350

seq1  CCTTGTCAGGCTGGAGAGAACAGGCAAGTGGCTGGTTCTGTGTTGTAATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTCAGGCTGGAGAGAACAGGCAAGTGGCTGGTTCTGTGTTGTAATG  400

seq1  CAGCCAGAGTTGACAGAACCTCGGGGGCTGGGTAAATGAATTCTAGCTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGAGTTGACAGAACCTCGGGGGCTGGGTAAATGAATTCTAGCTTA  450

seq1  TTCTTGACATAATAGACAGGCATTCTATCAGCAGGGAGGTGACCCCAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGACATAATAGACAGGCATTCTATCAGCAGGGAGGTGACCCCAGTA  500

seq1  CCAGTTCCTCCACCAAAACTGTGAGATTCCAGAAGCCTCAAAGACGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTCCTCCACCAAAACTGTGAGATTCCAGAAGCCTCAAAGACGTGTG  550

seq1  CCCTGGTTTGTAGTAAGCCAGGGAAGGCTCCAGGAGAGCCTCAGGCCAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGTTTGTAGTAAGCCAGGGAAGGCTCCAGGAGAGCCTCAGGCCAGT  600

seq1  CCAGCTGGAAGTGTTCCCCGGGCCACCCGGCCCATCGCCTCTGCAGCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTGGAAGTGTTCCCCGGGCCACCCGGCCCATCGCCTCTGCAGCCAG  650

seq1  GACTCCACGATCACTTCCAAACTGCAGTGGTGCTGACCAAGGGTGAAGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCACGATCACTTCCAAACTGCAGTGGTGCTGACCAAGGGTGAAGGT  700

seq1  GGGGATGTGGCCAGAGCACTGCTAATTACCACGCCCTCCTGTGCTTGGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATGTGGCCAGAGCACTGCTAATTACCACGCCCTCCTGTGCTTGGGC  750

seq1  CTCCCATCA-GGGTCAGGATGGCCTCCCTCACAGGGGTGTTATGGGAAGA  799
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCATCAGGGGTCAGGATGGCCTCCCTCACAGGGGTGTTATGGGAAGA  800

seq1  TGAGCTGGGTGGCAT  814
      |||||||||||||||
seq2  TGAGCTGGGTGGCAT  815