BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-123K22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 95,287,540 - 95,417,789
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2310009E04Rik
Upstream geneLrrc19, Ift74, Tek, 4930579C15Rik, LOC100039252, Mysm1, LOC100039265, LOC665029, Jun, LOC100042411
Downstream geneHook1, Cyp2j13, LOC242546, LOC546837, Cyp2j11, LOC665095, Cyp2j6, Cyp2j9, Cyp2j5, LOC100039415, LOC620779
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-123K22.bB6Ng01-123K22.g
ACCDH926783DH926784
length1,1741,002
definitionDH926783|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-123K22, 5' end.DH926784|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-123K22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,287,540 - 95,288,721)(95,416,790 - 95,417,789)
sequence
gaattcatggcattttttcattaagtgttgatatgttcctcaataaataa
atattacctgtgtagtctttctgatgttccttgtaaagatgcctgatcct
tcctagcatgttagctctggtacttcattctatgcagaagatgcctgggg
tctctgatttggattcacaaggctgggatgagctctggaggaagtgctcc
tgggctcctcacccctactctcaggacacaacagagctttctcagagatg
tgctgctcagatatctttgtccacagcagctattggaatgtctccaggga
gaagattgccatcatgtacggcctttagtaaccttacataaaacctaaca
gaagcagttgttttctcagctcagggtgattgtttggctttgactagaag
tagtggttgttctgtagtggtttggcctttgatgcctggtgactggcctt
gcatttttgaaatgaaggaaggaggctgccttttccatgaccgccaactg
ccgcaaccacaaggcacatggaaataggtttttcagactatccaaaaggc
atactgctagtttgactcacataatatcaaaggctactactttctagatg
tcacttgttaagtgttcagggttatacaagttcatagctctgttaggaat
gttttgtaaatcataagctctgatttatttgatgttaaaatgtatgaata
tctaaagagaaatttgggactcatttccttctcaacagaggcttgtcaca
tacacggtaacagaatggttgtaatactttggcttttatgcttgagtctt
tgatgtcctcattgcactagaaccctgtacttaagacagtgtgtggactt
ggatttatgtgctaaagcagaatttcagggacagtaagtagcaaaaatct
ggaatttgagaatacaaacatgtataaactaggtaagtgtctgtcaaact
gatgtaataactgctagctcttttgcattcccggagaaggcaagccacac
aggtggagtcattgtaccatgacagatccctgtcacagcagagagactga
agggcatttaagcagttgtttagtaggtcagttagatttgatttgttcca
caaggcataatatggttcttgtggagtctgcaccgtgtgcctttagttcg
gaaacctggattatggataaattc
gaattcatttactgtgactaattgggagttatctaaataactgattctcc
tcctgtcccttcaggcattttccagtctctgtctccagtaaataataatt
tctaagtaaggcagagggtggaggaagtcatgatggaggtggggagtaat
ttgtcattgtcacccacaaaatgaagatgggaacactaagtatgagtcaa
gaaacagctcacacaacacaaccatgaaccatctctacatttctgtttgg
atttcaagaacagtacaagaaaatagggtgaggaactaaaggggaaagaa
aatgggacagagaaagttctttccccaagagaccgtgtgtggggtcaggt
gtggcaatgcaggtggtaagagtcagcactgcccactctcaggtgaggca
tctagagacagggccgttgagtgcttgaggtgagagacatggacactgag
cagcctggcaaggcaccatcctcagctcagggaggctgcaagtctcaggc
actaagcattggctgggatggtcattcctacattcagagcctgtcagatc
tgctactccacataagtgcattttgctctgaggttaaatgagatggcatc
ctcttgacggctttaaccactgcctcattgctgatgttagaatggatagc
tgcacctccaaagacacacacacactccatgcagaacattccacacgtca
tcgcttgtgtcacaatcaccactgtggagactactgaaatagctgattcg
ggtttgtttaacatccacctctttggctcaaaattccaggcttttccaca
tgcagactgacatttccacagactgtcatggcttaatctgctcacacccc
cccacctcagtgttgttaggagaggggtctgtaccgtcaccccaggaaag
tagtcttctcatcctcactgatagaaggaaaatcagggcacagaagcagt
tatgctccatgaaccattagacgaccccagcccttgggctgaatgctcag
gc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_95287540_95288721
seq2: B6Ng01-123K22.b_46_1219

seq1  GAATTCATGGCATTTTTTCATTAAGTGTTGATATGTTCCTCAATAAATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGGCATTTTTTCATTAAGTGTTGATATGTTCCTCAATAAATAA  50

seq1  ATATTACCTGTGTAGTCTTTCTGATGTTCCTTGTAAAGATGCCTGATCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTACCTGTGTAGTCTTTCTGATGTTCCTTGTAAAGATGCCTGATCCT  100

seq1  TCCTAGCATGTTAGCTCTGGTACTTCATTCTATGCAGAAGATGCCTGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGCATGTTAGCTCTGGTACTTCATTCTATGCAGAAGATGCCTGGGG  150

seq1  TCTCTGATTTGGATTCACAAGGCTGGGATGAGCTCTGGAGGAAGTGCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGATTTGGATTCACAAGGCTGGGATGAGCTCTGGAGGAAGTGCTCC  200

seq1  TGGGCTCCTCACCCCTACTCTCAGGACACAACAGAGCTTTCTCAGAGATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTCCTCACCCCTACTCTCAGGACACAACAGAGCTTTCTCAGAGATG  250

seq1  TGCTGCTCAGATATCTTTGTCCACAGCAGCTATTGGAATGTCTCCAGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTCAGATATCTTTGTCCACAGCAGCTATTGGAATGTCTCCAGGGA  300

seq1  GAAGATTGCCATCATGTACGGCCTTTAGTAACCTTACATAAAACCTAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTGCCATCATGTACGGCCTTTAGTAACCTTACATAAAACCTAACA  350

seq1  GAAGCAGTTGTTTTCTCAGCTCAGGGTGATTGTTTGGCTTTGACTAGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAGTTGTTTTCTCAGCTCAGGGTGATTGTTTGGCTTTGACTAGAAG  400

seq1  TAGTGGTTGTTCTGTAGTGGTTTGGCCTTTGATGCCTGGTGACTGGCCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGTTGTTCTGTAGTGGTTTGGCCTTTGATGCCTGGTGACTGGCCTT  450

seq1  GCATTTTTGAAATGAAGGAAGGAGGCTGCCTTTTCCATGACCGCCAACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTTTGAAATGAAGGAAGGAGGCTGCCTTTTCCATGACCGCCAACTG  500

seq1  CCGCAACCACAAGGCACATGGAAATAGGTTTTTCAGACTATCCAAAAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCAACCACAAGGCACATGGAAATAGGTTTTTCAGACTATCCAAAAGGC  550

seq1  ATACTGCTAGTTTGACTCACATAATATCAAAGGCTACTACTTTCTAGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGCTAGTTTGACTCACATAATATCAAAGGCTACTACTTTCTAGATG  600

seq1  TCACTTGTTAAGTGTTCAGGGTTATACAAGTTCATAGCTCTGTTAGGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTGTTAAGTGTTCAGGGTTATACAAGTTCATAGCTCTGTTAGGAAT  650

seq1  GTTTTGTAAATCATAAGCTCTGATTTATTTGATGTTAAAATGTATGAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGTAAATCATAAGCTCTGATTTATTTGATGTTAAAATGTATGAATA  700

seq1  TCTAAAGAGAAATTTGGGACTCATTTCCTTCTCAACAGAGGCTTGTCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGAGAAATTTGGGACTCATTTCCTTCTCAACAGAGGCTTGTCACA  750

seq1  TACACGGTAACAGAATGGTTGTAATACTTTGGCTTTTATGCTTGAGTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACGGTAACAGAATGGTTGTAATACTTTGGCTTTTATGCTTGAGTCTT  800

seq1  TGATGTCCTCATTGCACTAGAACCCTGTACTTAAGACAGTGTGTGGACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTCCTCATTGCACTAGAACCCTGTACTTAAGACAGTGTGTGGACTT  850

seq1  GGATTTATGTGCTAAAGCAGAATTTCAAGGGACAGTAAGTAGCAAAAATC  900
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTATGTGCTAAAGCAGAATTTC-AGGGACAGTAAGTAGCAAAAATC  899

seq1  TGGAATTTGAGAATACAAACATGTATAAACTAGGTAAGTGTCTGTCAAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTTGAGAATACAAACATGTATAAACTAGGTAAGTGTCTGTCAAAC  949

seq1  TGATGTAATAACTGCTAGCTCTTTTGCATTCCCGGAGAAGGCAAGCCACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTAATAACTGCTAGCTCTTTTGCATTCCCGGAGAAGGCAAGCCACA  999

seq1  CAGGTGGAAGTCATTGTACCATGACAGATCCCTGTCACAGCAGAGAGACT  1050
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGG-AGTCATTGTACCATGACAGATCCCTGTCACAGCAGAGAGACT  1048

seq1  GGAAGGGGAATCTAAGCAGTTTGTTTAGTAGGTCAG-TAGATTTGTATTG  1099
      |  | ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||
seq2  G--AAGGGCATTTAAGCAG-TTGTTTAGTAGGTCAGTTAGATTTGATTTG  1095

seq1  TACCACAAAGGCATAATAT-GTTCTTGTGAAGTCTGCACCGT-TGCCTTT  1147
      | |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||
seq2  TTCCAC-AAGGCATAATATGGTTCTTGTGGAGTCTGCACCGTGTGCCTTT  1144

seq1  AGGTTCCAGAAATACCCTGAGTTTAT-GATAAATTC  1182
      ||  | | ||||   |||| | |||| |||||||||
seq2  AG--TTCGGAAA---CCTG-GATTATGGATAAATTC  1174

seq1: chr4_95416790_95417789
seq2: B6Ng01-123K22.g_70_1071 (reverse)

seq1  GCCTGAGCTATACAG-CCAAGGGCTGGGGTCGTCATATCGCTTCATGGAG  49
      |||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||
seq2  GCCTGAGC-ATTCAGCCCAAGGGCTGGGGTCGTC-TAATGGTTCATGGAG  48

seq1  CATAACTGC-TCTGTGCCCCTGATTCTCCTTCTATCAGTGGGGATGAGAA  98
      ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||
seq2  CATAACTGCTTCTGTG-CCCTGATTTTCCTTCTATCAGTGAGGATGAGAA  97

seq1  GACTAC-TTCCTGGGGTGACGGTACAGACCCCTCTCCTAAC-ACACTGGG  146
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
seq2  GACTACTTTCCTGGGGTGACGGTACAGACCCCTCTCCTAACAACACTGAG  147

seq1  GT--GGGGGTGTGAGCAGACTTAGCCATGACAGTCTGTGGAAATGTCAGT  194
      ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGGGGTGTGAGCAGATTAAGCCATGACAGTCTGTGGAAATGTCAGT  197

seq1  CTGCATGTGG-AAAGCCTGGAATTCTGAGCCAAAGAGGTTGGATGTTAAA  243
      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||
seq2  CTGCATGTGGAAAAGCCTGGAATTTTGAGCCAAAGAGG-TGGATGTT-AA  245

seq1  ACAAACCCGAATCAGCTATTTCAGTAGTCTCCACAGTGGTGATTGTGACA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCCGAATCAGCTATTTCAGTAGTCTCCACAGTGGTGATTGTGACA  295

seq1  CAAGCGATGACGTGTGGAATGTTCTGCATGGAGTGTGTGTGTGTCTTTGG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCGATGACGTGTGGAATGTTCTGCATGGAGTGTGTGTGTGTCTTTGG  345

seq1  AGGTGCAGCTATCCATTCTAACATCAGCAATGAGGCAGTGGTTAAAGCCG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCAGCTATCCATTCTAACATCAGCAATGAGGCAGTGGTTAAAGCCG  395

seq1  TCAAGAGGATGCCATCTCATTTAACCTCAGAGCAAAATGCACTTATGTGG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAGGATGCCATCTCATTTAACCTCAGAGCAAAATGCACTTATGTGG  445

seq1  AGTAGCAGATCTGACAGGCTCTGAATGTAGGAATGACCATCCCAGCCAAT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCAGATCTGACAGGCTCTGAATGTAGGAATGACCATCCCAGCCAAT  495

seq1  GCTTAGTGCCTGAGACTTGCAGCCTCCCTGAGCTGAGGATGGTGCCTTGC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGTGCCTGAGACTTGCAGCCTCCCTGAGCTGAGGATGGTGCCTTGC  545

seq1  CAGGCTGCTCAGTGTCCATGTCTCTCACCTCAAGCACTCAACGGCCCTGT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGCTCAGTGTCCATGTCTCTCACCTCAAGCACTCAACGGCCCTGT  595

seq1  CTCTAGATGCCTCACCTGAGAGTGGGCAGTGCTGACTCTTACCACCTGCA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGATGCCTCACCTGAGAGTGGGCAGTGCTGACTCTTACCACCTGCA  645

seq1  TTGCCACACCTGACCCCACACACGGTCTCTTGGGGAAAGAACTTTCTCTG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCACACCTGACCCCACACACGGTCTCTTGGGGAAAGAACTTTCTCTG  695

seq1  TCCCATTTTCTTTCCCCTTTAGTTCCTCACCCTATTTTCTTGTACTGTTC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATTTTCTTTCCCCTTTAGTTCCTCACCCTATTTTCTTGTACTGTTC  745

seq1  TTGAAATCCAAACAGAAATGTAGAGATGGTTCATGGTTGTGTTGTGTGAG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAATCCAAACAGAAATGTAGAGATGGTTCATGGTTGTGTTGTGTGAG  795

seq1  CTGTTTCTTGACTCATACTTAGTGTTCCCATCTTCATTTTGTGGGTGACA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCTTGACTCATACTTAGTGTTCCCATCTTCATTTTGTGGGTGACA  845

seq1  ATGACAAATTACTCCCCACCTCCATCATGACTTCCTCCACCCTCTGCCTT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAAATTACTCCCCACCTCCATCATGACTTCCTCCACCCTCTGCCTT  895

seq1  ACTTAGAAATTATTATTTACTGGAGACAGAGACTGGAAAATGCCTGAAGG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGAAATTATTATTTACTGGAGACAGAGACTGGAAAATGCCTGAAGG  945

seq1  GACAGGAGGAGAATCAGTTATTTAGATAACTCCCAATTAGTCACAGTAAA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGAGGAGAATCAGTTATTTAGATAACTCCCAATTAGTCACAGTAAA  995

seq1  TGAATTC  1000
      |||||||
seq2  TGAATTC  1002