BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131E15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 131,320,362 - 131,492,217
singlet/doubletdoublet
Overlap genePtpru, Mecr, Sfrs4, EG664865, EG623230, Epb4.1
Upstream genePum1, Sdc3, Laptm5, Matn1, LOC622681, LOC100041575, Gm831, EG664832, LOC100039799
Downstream geneLOC666480, LOC100039835, Oprd1, LOC664894, Ythdf2, LOC664903, Gmeb1, Rnu11, Taf12, 9530096D07Rik, LOC100039864, Trspap1, Rcc1, Snhg3, Phactr4, Med18, Sesn2, Atpif1, Dnajc8, Ptafr, Eya3, Xkr8, Smpdl3b, Rpa2, BC013712, LOC100039917, Ppp1r8, Stx12, OTTMUSG00000010099, BC008163
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131E15.bB6Ng01-131E15.g
ACCDH932383DH932384
length1,195980
definitionDH932383|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131E15, 5' end.DH932384|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131E15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(131,320,362 - 131,321,575)(131,491,228 - 131,492,217)
sequence
gaattcttttgtgtcacatggaacattcgtgaacacatacatgtgtgtga
gcacacactgttttattcaccaggaatctcggttccagagtctcttgacc
tctattatgttagaccccatcatgaattgaaactcctaagtcaaaagagc
ctttaacccactgtgatggtttgcatatgctcgccccaggggttggcact
gttagaaggtgtggccctgttggagaagatgtggccttgttgaagtagat
atgtcactgtgggtatgggctttaagaccctcaccctaactgcctggagg
cagtattctgctagcagccttcagacgcagatgtagaagtctcaactctg
cctgcaccatgcctgcctagatgctgccatgttcctgccttgatgatact
gaactgaacctctaaacctgtaagccagccccaattaaatgttgtccttt
ataagacttgccttggttatggtgtctgctcacagcagtaaaaccctaac
taagacacccacctaacctacctagtgtcacaggacccagagagtaagga
tgtcttgccctctggtcacatgaccaccacccagcatcaatataaaaggt
acactgatatatgaaaggctagtgaggtctgctagccagcaggtaaggac
agttacttccaagccgggcgacctgagctccacccccaggagccacctgg
tagagagaattgactcctgcaaattgtcctctgacctccacacacattct
gcccacatgcacacccacacatatacgaataacaaaagattgttaagttg
aactattgcaagccagggatggcctacactgtgaggtaaaatgtgtcaaa
ggacaatttgtgtcaattatcaaaggacattgtgtcaatagagactgaag
catactcagtctttttgaatattttgcctcatagccagtcctgcaaaagt
accattatattcattgttggctgtttagggacatgcgtgttcatttctgg
tgtctgatttgcgaggccaagaagaacatccttgcctggtgggttctgga
actaagctgaactcctctcagtacccagcgtggccccaattctctgaagc
gtttgtggagctcaggtgagcaaaacccacactgttctcctccctctaag
gccgaaatctggaaacttactctagacaagcacgccttgttaggc
gaattccaaggaaatgtgttccagggcttctgctgctccatatacgtttg
tacttagtggggaaatgtgcctagttttcttaattataatgtccagtcac
aaggacgaatagaagtgatttctatttggcaaataattttatattcaaat
tctgaaggttggtctgaagtgttttatatcgccggtcataaactgtctgg
cgttataattttccattaagcttatgaaagtggctgcagtaatacctctt
tccatgcccttctcaagacgtggcaccttgtcagggctttttgggaatgg
tgtcctttggagagcgactccaacctttgcttgattcaagctaatgcttt
gatcagatcagggtcagagggttcagctcgccactgcctgcaagaggatt
tgatttggccaactctgtttccttactgtccacagcctcctctggtaaag
actcaaactgtcaccatctcagatactgccaatgctgtgaaaagtgaaat
cccaaccaaagatgtccctattgtccacactgagaccaagaccatcacct
atgaagctgcccaggtaagacactgtctgctgcttcggagagatgggtaa
gacacagtggcccatgatagaatccccacactgagggtggaacaggtggt
tgggagttcgagagcctccctgggctagcctgaaagaccttgagtggaaa
aagtaacaagcaaaaatgaaaaaaggagaggaaacgacataaacacacat
cagatactaaacagttctataacaaaactcaaatggggatagagagaatt
caggagcgggggatgcagctcagtggtagacacagagcataggggcagca
ggtactctggctcaccctgagatctcttcagcagtctgcccattaccatg
agccacttgatgcttcgtcctcagaagctgggttgtggctttaaaatttg
actagacttgtctcccctgagaggagcact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_131320362_131321575
seq2: B6Ng01-131E15.b_46_1240

seq1  GAATTCTTTTGTGTCACATGGAACATTCGTGTACACATACATGTGTGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTGTGTCACATGGAACATTCGTGAACACATACATGTGTGTGA  50

seq1  GCACACACTGTTTTATTCACCAGGAATCTCGGTTCCAGAGTCTCTTGACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACACTGTTTTATTCACCAGGAATCTCGGTTCCAGAGTCTCTTGACC  100

seq1  TCTATTATGTTAGACCCCATCATGAATTGAAACTCCTAAGTCAAAAGAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTATGTTAGACCCCATCATGAATTGAAACTCCTAAGTCAAAAGAGC  150

seq1  CTTTAACCCACTGTGATGGTTTGCATATGCTCGCCCCAGGGGTTGGCACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAACCCACTGTGATGGTTTGCATATGCTCGCCCCAGGGGTTGGCACT  200

seq1  GTTAGAAGGTGTGGCCCTGTTGGAGAAGATGTGGCCTTGTTGAAGTAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGAAGGTGTGGCCCTGTTGGAGAAGATGTGGCCTTGTTGAAGTAGAT  250

seq1  ATGTCACTGTGGGTATGGGCTTTAAGACCCTCACCCTAACTGCCTGGAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCACTGTGGGTATGGGCTTTAAGACCCTCACCCTAACTGCCTGGAGG  300

seq1  CAGTATTCTGCTAGCAGCCTTCAGACGCAGATGTAGAAGTCTCAACTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATTCTGCTAGCAGCCTTCAGACGCAGATGTAGAAGTCTCAACTCTG  350

seq1  CCTGCACCATGCCTGCCTAGATGCTGCCATGTTCCTGCCTTGATGATACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCACCATGCCTGCCTAGATGCTGCCATGTTCCTGCCTTGATGATACT  400

seq1  GAACTGAACCTCTAAACCTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGAACCTCTAAACCTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTT  450

seq1  ATAAGACTTGCCTTGGTTATGGTGTCTGCTCACAGCAGTAAAACCCTAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACTTGCCTTGGTTATGGTGTCTGCTCACAGCAGTAAAACCCTAAC  500

seq1  TAAGACACCCACCTAACCTACCTAGTGTCACAGGACCCAGAGAGTAAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACACCCACCTAACCTACCTAGTGTCACAGGACCCAGAGAGTAAGGA  550

seq1  TGTCTTGCCCTCTGGTCACATGACCACCACCCAGCATCAATATAAAAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTGCCCTCTGGTCACATGACCACCACCCAGCATCAATATAAAAGGT  600

seq1  ACACTGATATATGAAAGGCTAGTGAGGTCTGCTAGCCAGCAGGTAAGGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGATATATGAAAGGCTAGTGAGGTCTGCTAGCCAGCAGGTAAGGAC  650

seq1  AGTTACTTCCAAGCCGGGCGACCTGAGCTCCACCCCCAGGAGCCACCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACTTCCAAGCCGGGCGACCTGAGCTCCACCCCCAGGAGCCACCTGG  700

seq1  TAGAGAGAATTGACTCCTGCAAATTGTCCTCTGACCTCCACACACATTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGAATTGACTCCTGCAAATTGTCCTCTGACCTCCACACACATTCT  750

seq1  GCCCACATGCACACCCACACATATACGAATAACAAAAGATTGTTAAGTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACATGCACACCCACACATATACGAATAACAAAAGATTGTTAAGTTG  800

seq1  AACTATTGCAAGCCAGGGATGGCCTACACTGTGAGGTAAAATGTGTCAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTGCAAGCCAGGGATGGCCTACACTGTGAGGTAAAATGTGTCAAA  850

seq1  GGACAATTTGTGTCAATTATCAAAGGACAATTGTGTCAATAGAGACTGAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGACAATTTGTGTCAATTATCAAAGGAC-ATTGTGTCAATAGAGACTGAA  899

seq1  GCATACTCAGTCTTTTTGAATATTTTGCCTCATAGCCAGTCCTGCAAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCATACTCAGTCTTTTTGAATATTTTGCCTCATAGCCAGTCCTGCAAAA-  948

seq1  GGTACCATTATATTCATTGTGGGCTGTTTAGGGGACCATGCGTGGTCATT  1000
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||
seq2  -GTACCATTATATTCATTGTTGGCTGTTTAGGG--ACATGCGTGTTCATT  995

seq1  TCCTGGTGTCTGATTTGCGAGGCCAAGAAGAACATCCTTGGCTTGTTGGT  1050
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||
seq2  T-CTGGTGTCTGATTTGCGAGGCCAAGAAGAACATCCTTGCCTGGTGGGT  1044

seq1  TCTGGAACTAAGCTGGAACTCCTCTCAGTACCCAGCTGGGCCCCAACTCC  1100
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |
seq2  TCTGGAACTAAGCT-GAACTCCTCTCAGTACCCAGCGTGGCCCCAA-TTC  1092

seq1  TCTGAAACGCTTTGT-GAGCTCAGGTGAGC-AGACCCACACTCTGTCCCC  1148
      |||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | || ||
seq2  TCTGAAGCG-TTTGTGGAGCTCAGGTGAGCAAAACCCACACTGT-TCTCC  1140

seq1  TCCTTCCCTCCAAATGCCAAAAATTCTGGAACACTAGCTTCAAGACAAGC  1198
      ||| |     | || ||| |||  ||||||| |||  | || ||||||||
seq2  TCCCT-----CTAAGGCCGAAA--TCTGGAA-ACTTAC-TCTAGACAAGC  1181

seq1  ACGCCCTTTGTTAGGC  1214
      |||||  |||||||||
seq2  ACGCC--TTGTTAGGC  1195

seq1: chr4_131491228_131492217
seq2: B6Ng01-131E15.g_69_1048 (reverse)

seq1  AGTGCTCCTCTCAGGGGAGACAATGCTATGTCAAATTGTAAAGCACACAA  50
      |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||
seq2  AGTGCTCCTCTCAGGGGAGACAAGTCTA-GTCAAATTTTAAAGC-CACAA  48

seq1  CCCAAGCTTCCTGAGGACGAAGCATCAAGTGGCTCATGGTGATGGGCAGA  100
      ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CCC-AGCTT-CTGAGGACGAAGCATCAAGTGGCTCATGGTAATGGGCAGA  96

seq1  CTGCCTGAAGAGATCTTCAGGGCTGAGCCAGAGCTACCCTGCTGCCCCTA  150
      ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||
seq2  CTG-CTGAAGAGATC-TCAGGG-TGAGCCAGAG-TA-CCTGCTGCCCCTA  141

seq1  TGCTCTGTGTTCTACCACTGAGCTGCATCCCCCGCTCCTTGAATTCTCTC  200
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGCTCTGTG-TCTACCACTGAGCTGCATCCCCCGCTCC-TGAATTCTCTC  189

seq1  TAT-CCCATTTGAGTTTTGTTATAGAACTGTTTAGTATCTGATGTGTGTT  249
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCCATTTGAGTTTTGTTATAGAACTGTTTAGTATCTGATGTGTGTT  239

seq1  TATGTCGTTTCCTCTCCTTTTTTCATTTTTGCTTGTTACTTTTTCCACTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCGTTTCCTCTCCTTTTTTCATTTTTGCTTGTTACTTTTTCCACTC  289

seq1  AAGGTCTTTCAGGCTAGCCCAGGGAGGCTCTCGAACTCCCAACCACCTGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTTTCAGGCTAGCCCAGGGAGGCTCTCGAACTCCCAACCACCTGT  339

seq1  TCCACCCTCAGTGTGGGGATTCTATCATGGGCCACTGTGTCTTACCCATC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCCTCAGTGTGGGGATTCTATCATGGGCCACTGTGTCTTACCCATC  389

seq1  TCTCCGAAGCAGCAGACAGTGTCTTACCTGGGCAGCTTCATAGGTGATGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCGAAGCAGCAGACAGTGTCTTACCTGGGCAGCTTCATAGGTGATGG  439

seq1  TCTTGGTCTCAGTGTGGACAATAGGGACATCTTTGGTTGGGATTTCACTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTCTCAGTGTGGACAATAGGGACATCTTTGGTTGGGATTTCACTT  489

seq1  TTCACAGCATTGGCAGTATCTGAGATGGTGACAGTTTGAGTCTTTACCAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGCATTGGCAGTATCTGAGATGGTGACAGTTTGAGTCTTTACCAG  539

seq1  AGGAGGCTGTGGACAGTAAGGAAACAGAGTTGGCCAAATCAAATCCTCTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGCTGTGGACAGTAAGGAAACAGAGTTGGCCAAATCAAATCCTCTT  589

seq1  GCAGGCAGTGGCGAGCTGAACCCTCTGACCCTGATCTGATCAAAGCATTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCAGTGGCGAGCTGAACCCTCTGACCCTGATCTGATCAAAGCATTA  639

seq1  GCTTGAATCAAGCAAAGGTTGGAGTCGCTCTCCAAAGGACACCATTCCCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAATCAAGCAAAGGTTGGAGTCGCTCTCCAAAGGACACCATTCCCA  689

seq1  AAAAGCCCTGACAAGGTGCCACGTCTTGAGAAGGGCATGGAAAGAGGTAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCCTGACAAGGTGCCACGTCTTGAGAAGGGCATGGAAAGAGGTAT  739

seq1  TACTGCAGCCACTTTCATAAGCTTAATGGAAAATTATAACGCCAGACAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGCAGCCACTTTCATAAGCTTAATGGAAAATTATAACGCCAGACAGT  789

seq1  TTATGACCGGCGATATAAAACACTTCAGACCAACCTTCAGAATTTGAATA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGACCGGCGATATAAAACACTTCAGACCAACCTTCAGAATTTGAATA  839

seq1  TAAAATTATTTGCCAAATAGAAATCACTTCTATTCGTCCTTGTGACTGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTATTTGCCAAATAGAAATCACTTCTATTCGTCCTTGTGACTGGA  889

seq1  CATTATAATTAAGAAAACTAGGCACATTTCCCCACTAAGTACAAACGTAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATAATTAAGAAAACTAGGCACATTTCCCCACTAAGTACAAACGTAT  939

seq1  ATGGAGCAGCAGAAGCCCTGGAACACATTTCCTTGGAATTC  990
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGCAGCAGAAGCCCTGGAACACATTTCCTTGGAATTC  980