BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-149A14
Chromosome4 (Build37)
Map Location 56,579,377 - 56,664,684
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneActl7b, Actl7a, Ikbkap, BC026590, Ctnnal1, D730040F13Rik, 6430704M03Rik, Epb4.1l4b, Ptpn3, LOC100041460, 1700042G15Rik, LOC100041342, LOC619973, LOC667049, Palm2, LOC100041513
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-149A14.bB6Ng01-149A14.g
ACCDH945483DH945484
length1,1061,025
definitionDH945483|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149A14, 5' end.DH945484|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149A14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,579,377 - 56,580,205)(56,663,657 - 56,664,684)
sequence
gaattctcaacagaggaatctcaaatggccaagaagcacctaaagaaatg
ttcaatgtcttttcaatgtcctttgtcatcaaagaaatgcaaatcaaaat
gactctgagattccaccttacactgatcaggatggctaagatcaaaaact
gaaaagacagcatatgctggcgaggctgtggagcaaggagaacatacctc
cactgctggtaggagtgctaacttgtacaaccactctgaagattaattca
gcagtttctcagaagattgggaatagttctacctcaacacccagctataa
cactcctgggcatatacccaaaagatgctccaccaccccacaaggacact
tgctcaactatgttcatactaactttattcatcgtaaccagaaactggaa
caacccagatgtccttcaaccaaacaatggatagagaaaatgtgttatgt
ctacacattggaatactactcaggcattaaaacaagggcattatggactt
caaaggcaaatggatggaactagaaaatgtcatcctgagtgaggtaactc
agacccaaaaaagtcatgcatacatagtgtgtattcacttaaaattggat
attagccataaagtacagagtaaacatgctataatcaacagacacaaaga
agccaaataacaaggagggcccaagggaggatgattgaatatttctcaga
agggaaaacaaaatagatattagaggtcaatggaatgagggaactgtgta
gaagaggggatagggacaggatgggggagagatcataagtttgacttttt
gattcttgataaatcaaatgtatgtatcaagttattgtgatgaaattttt
gaaacttttaagagctattctgcttattaatcagaattgctgtttggaac
cataggcctctgtttcactagcctgagagtctgtgttgtccatgctccat
tagcagctgcctgtgctatggatactggtatgtgggataatgctaactcc
cttgggctcaaagtcacttccactcaggctaaattgaaaagatcttcatt
acgaacatgacttttctggtccttatcatgccagcttgacacatccaagg
tgtata
gaattcactttttttttttttttgaagaaagaaattccatttcctctctg
gttgaatattactttgcattttacctagtacttttacacatcatttattt
tgaaatgtctatgaccctaaaagtgtaatacaattaccctcaatttatag
ctacagcagcctgaggcttgcggaagtaaaatgaaggtttttaccgaatc
ttctctctttctcctcaatcctacattttacaggtatagaattttatctg
acactatgaggcccttgtgacttgcactagctatttgtcctcttagttta
cccatctgtgaaatgggttaatgctatatcatcctgtgggatgtttgaga
gactgaaatgtggcagtggacatgaagcaccagcacagcccctcccccat
ggccatcacttgaagtcagttcttactattcttggccatctttggagtgg
acacctccctgctctgggtgtacttatcaggtgaagtgaatgggttggac
tcagtggtgatttgaaagtctgcattttaattccctagttcttcaattat
gctgtatatgaagcaaagtctttgaaaaatggagttgcaagacatagttg
tcattcactcatttctctgttctgcaaattaacaaccaactaaacctgat
gtgatagggcccacagaggtgccctcgtcagtgttttctaggcagtcatg
aagagtctgagtcccatcccagcctcagacaaacagtggggccacagtgc
atgccttggggtgcagagacaggaggatttcggagaacttgctggctcat
cagactagttgagttgatgaactgttggttatatgagagactattttaaa
acaattaggtgcagagctgatgagatgcctcactggaaagagtgcttact
gtgcaagcttggtgactggggtcaccctggaatccacttatatggaaaaa
gagatggcttattgaagttgtcctctgactgacatgtggtgcacctgtgg
ctcatgtgccacacagatccacaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_56579377_56580205
seq2: B6Ng01-149A14.b_338_1151

seq1  AGCTATAACACTCCTGGGCATATACCCAAAAGATGCTCCACCACCCCACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATAACACTCCTGGGCATATACCCAAAAGATGCTCCACCACCCCACA  50

seq1  AGGACACTTGCTCAACTATGTTCATACTAACTTTATTCATCGTAACCAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACACTTGCTCAACTATGTTCATACTAACTTTATTCATCGTAACCAGA  100

seq1  AACTGGAACAACCCAGATGTCCTTCAACCAAACAATGGATAGAGAAAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGAACAACCCAGATGTCCTTCAACCAAACAATGGATAGAGAAAATG  150

seq1  TGTTATGTCTACACATTGGAATACTACTCAGGCATTAAAACAAGGGCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATGTCTACACATTGGAATACTACTCAGGCATTAAAACAAGGGCATT  200

seq1  ATGGACTTCAAAGGCAAATGGATGGAACTAGAAAATGTCATCCTGAGTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACTTCAAAGGCAAATGGATGGAACTAGAAAATGTCATCCTGAGTGA  250

seq1  GGTAACTCAGACCCAAAAAAGTCATGCATACATAGTGTGTATTCACTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACTCAGACCCAAAAAAGTCATGCATACATAGTGTGTATTCACTTAA  300

seq1  AATTGGATATTAGCCATAAAGTACAGAGTAAACATGCTATAATCAACAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGATATTAGCCATAAAGTACAGAGTAAACATGCTATAATCAACAGA  350

seq1  CACAAAGAAGCCAAATAACAAGGAGGGCCCAAGGGAGGATGATTGAATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGAAGCCAAATAACAAGGAGGGCCCAAGGGAGGATGATTGAATAT  400

seq1  TTCTCAGAAGGGAAAACAAAATAGATATTAGAGGTCAATGGAATGAGGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGAAGGGAAAACAAAATAGATATTAGAGGTCAATGGAATGAGGGA  450

seq1  ACTGTGTAGAAGAGGGGATAGGGACAGGATGGGGGAGAGATCATAAG-TT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACTGTGTAGAAGAGGGGATAGGGACAGGATGGGGGAGAGATCATAAGTTT  500

seq1  GACTTTTTGATTCTTGATAAATCAAATGTATGTATCAAGTTATTGTGATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTTTGATTCTTGATAAATCAAATGTATGTATCAAGTTATTGTGATG  550

seq1  AAATTTTTGAAACTTTTAAGAGCTATTCTGCTTATTAATCAGAATTGCTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTTGAAACTTTTAAGAGCTATTCTGCTTATTAATCAGAATTGCTG  600

seq1  TTTGGAACCATAGGCCTCTGTTTCACTAGCCTGAGAAGTCTGTGTTGTCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTTGGAACCATAGGCCTCTGTTTCACTAGCCTGAG-AGTCTGTGTTGTCC  649

seq1  ATGCTCCATTAGCAGCTGCCTGTGCTATGGATAACTGGTATGTGGGATAA  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
seq2  ATGCTCCATTAGCAGCTGCCTGTGCTATGGAT-ACTGGTATGTGGGAT-A  697

seq1  ATGCTAACTCCCTTGGGCTCAAAAAGTCACTTCCCACTCAAGCCTAAATT  749
      ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||
seq2  ATGCTAACTCCCTTGGGCTC--AAAGTCACTT-CCACTC-AGGCTAAATT  743

seq1  GAAAAAGATCCTCATTTACAGAACCATGACATTTCCTGGGTCACTAAACC  799
      | |||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||   ||||  |  | |
seq2  G-AAAAGATCTTCA-TTAC-GAA-CATGACTTTTC--TGGTCCTT--ATC  785

seq1  ATGCCCAGCTTGACACATCCCATGTGTATA  829
      ||| |||||||||||||||| | |||||||
seq2  ATG-CCAGCTTGACACATCCAAGGTGTATA  814

seq1: chr4_56663657_56664684
seq2: B6Ng01-149A14.g_67_1091 (reverse)

seq1  TGTGTGGTGTCTGTGTGGGCACATGAGCCACA-GTGCA-CACATGTCAGT  48
      |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||
seq2  TGTGTGG-ATCTGTGT-GGCACATGAGCCACAGGTGCACCACATGTCAGT  48

seq1  CAGAGGACAACTTCAATAAGCCATCTCTTTTTCCATATTAAGTGGATTCC  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAGAGGACAACTTCAATAAGCCATCTCTTTTTCCATA-TAAGTGGATTCC  97

seq1  AGGGTTGAACCCCAGTCACCAAGCTTGCACAGTAAGCACTCTTTCCAGTG  148
      |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGT--GACCCCAGTCACCAAGCTTGCACAGTAAGCACTCTTTCCAGTG  145

seq1  AGGCATCTCATCAGCTCTGCACCTAATTGTTTTTAAATAGTCTCTCATAT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGGCATCTCATCAGCTCTGCACCTAATTGTTTTAAAATAGTCTCTCATAT  195

seq1  AACCAACAGTTCATCAACTCAACTAGTCTGATGAGCCAGCAAGTTCTCCG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACAGTTCATCAACTCAACTAGTCTGATGAGCCAGCAAGTTCTCCG  245

seq1  AAATCCTCCTGTCTCTGCACCCCAAGGCATGCACTGTGGCCCCACTGTTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCTCCTGTCTCTGCACCCCAAGGCATGCACTGTGGCCCCACTGTTT  295

seq1  GTCTGAGGCTGGGATGGGACTCAGACTCTTCATGACTGCCTAGAAAACAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGAGGCTGGGATGGGACTCAGACTCTTCATGACTGCCTAGAAAACAC  345

seq1  TGACGAGGGCACCTCTGTGGGCCCTATCACATCAGGTTTAGTTGGTTGTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGAGGGCACCTCTGTGGGCCCTATCACATCAGGTTTAGTTGGTTGTT  395

seq1  AATTTGCAGAACAGAGAAATGAGTGAATGACAACTATGTCTTGCAACTCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGCAGAACAGAGAAATGAGTGAATGACAACTATGTCTTGCAACTCC  445

seq1  ATTTTTCAAAGACTTTGCTTCATATACAGCATAATTGAAGAACTAGGGAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCAAAGACTTTGCTTCATATACAGCATAATTGAAGAACTAGGGAA  495

seq1  TTAAAATGCAGACTTTCAAATCACCACTGAGTCCAACCCATTCACTTCAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATGCAGACTTTCAAATCACCACTGAGTCCAACCCATTCACTTCAC  545

seq1  CTGATAAGTACACCCAGAGCAGGGAGGTGTCCACTCCAAAGATGGCCAAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAAGTACACCCAGAGCAGGGAGGTGTCCACTCCAAAGATGGCCAAG  595

seq1  AATAGTAAGAACTGACTTCAAGTGATGGCCATGGGGGAGGGGCTGTGCTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTAAGAACTGACTTCAAGTGATGGCCATGGGGGAGGGGCTGTGCTG  645

seq1  GTGCTTCATGTCCACTGCCACATTTCAGTCTCTCAAACATCCCACAGGAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTCATGTCCACTGCCACATTTCAGTCTCTCAAACATCCCACAGGAT  695

seq1  GATATAGCATTAACCCATTTCACAGATGGGTAAACTAAGAGGACAAATAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATAGCATTAACCCATTTCACAGATGGGTAAACTAAGAGGACAAATAG  745

seq1  CTAGTGCAAGTCACAAGGGCCTCATAGTGTCAGATAAAATTCTATACCTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGCAAGTCACAAGGGCCTCATAGTGTCAGATAAAATTCTATACCTG  795

seq1  TAAAATGTAGGATTGAGGAGAAAGAGAGAAGATTCGGTAAAAACCTTCAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGTAGGATTGAGGAGAAAGAGAGAAGATTCGGTAAAAACCTTCAT  845

seq1  TTTACTTCCGCAAGCCTCAGGCTGCTGTAGCTATAAATTGAGGGTAATTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTCCGCAAGCCTCAGGCTGCTGTAGCTATAAATTGAGGGTAATTG  895

seq1  TATTACACTTTTAGGGTCATAGACATTTCAAAATAAATGATGTGTAAAAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACACTTTTAGGGTCATAGACATTTCAAAATAAATGATGTGTAAAAG  945

seq1  TACTAGGTAAAATGCAAAGTAATATTCAACCAGAGAGGAAATGGAATTTC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAGGTAAAATGCAAAGTAATATTCAACCAGAGAGGAAATGGAATTTC  995

seq1  TTTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAGTGAATTC  1028
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAGTGAATTC  1025