BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-159C10
Chromosome4 (Build37)
Map Location 18,617,366 - 18,758,603
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMmp16
Downstream geneLOC667251, LOC435772, Cngb3, LOC623122, Cpne3, LOC100040306, 2410005O16Rik, Wwp1, Slc7a13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-159C10.bB6Ng01-159C10.g
ACCDH952903DH952904
length1,0901,084
definitionDH952903|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159C10, 5' end.DH952904|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159C10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(18,757,501 - 18,758,603)(18,617,366 - 18,618,467)
sequence
gaattcctatattctgtttccagtgagcaagtgaaatagcaaatgtctca
cagtcgctttaacacaggaatactctgttattagtggctcagctatcata
atcatctttgccagagaatcctgaactttagaatggtgtctattttctct
atttattcatgtgaacttcctactaactttgggcatttgttctgataaag
aacagattgacttatatccaggataaaaggacaaaaccatttctgttttg
tgtcatagaacagttattgctaaatagagggaaaacaattttcacttaga
aagtaaatgaatgattctctctcaagttgcacttgctgcacctaatatgt
tcaatcattgttagaaaaaggagagtgaagagatataataatgtttattc
agggggctgagaaatgcctcagtagttaagagcacattttgaacttgtag
agtacctgagtctaccatgtagcacccatgttaggcatcttacaaatgcc
tgtaagttttgctccatgggacttattagcttcttctagactacagaggc
atttacacatgtacaatgtttttccacatagatatgcacatatatgcata
attaaatataaatgaataaaataaattcagctttttgtttgagagatttg
agacttgatctaaaacactcaaaaactcaatgtctcttagtcccatatta
tcaatttatggaactatatttaattaactggttcctatttcttacttaaa
gatagtttatggaagattgttggaaagcattaacattattgtcatcataa
cagttgaatggttcttagtggtatcttcctgaaggaagctctagaagtct
atggaatgcagctatttcctttgagtttcaatagcagagattttttatat
ttgcttgtcaataattcattaatggtgtactactgtctaaaataagaata
aaatttattaatctttgattttatgagtacttactttggtaaatacctac
atagggacatttaaaatgattcatggaaaatatgacttatggatagaata
acagagaagaggtcatacaacatattcatatagcagctca
gaattcaacttgaagttgtgataattgtttatcattatgatgttaacatt
tgttccttgaatgcctatttaccttagaagcaattagaattttcataggg
aaatgtacaatgcaattgtcacaagttaaaatgcaggccattttatttaa
gagtcaaggtctcagattttccatctaattagactatccattcaagtaat
gtgattgataaaagctaactattaaatcatatttattaggtttcattata
tatttggctaaactctgcaaataaatgcatttatagtagcataaaataaa
atcgctattttgtttctgctgtgcagagtcctacaaggccatgaaggtga
tggtgtgacatagttcctgcccctagagcagagccaccagagtatgggcc
tccaccactgttgatggttgctaggcataaggcttgtttgtataataatg
catatattttactttatgttccttcttcgggggatttgtctgccaaggtt
aatgactctataataaacagaaacggtacaagtccagtaagcgagactat
gtctctgtgacactaagacattcaggacagcccataaggctgtggaaaag
atctgtaaagcatgatttcaagaatgcataaatcagcgtaagaactgtcc
tttataggatttgtcaactatgaaaatataagggtgcaatatgaaatgta
tgaggggattaactggtctaaaagaacagaggtagctacactaatgagcc
agcttatcagaaatatattaaggaaacagataaagaaatttagggagtgg
gaatcttatgatgaggtcccacccagctagcttattgtttgtgtttacaa
agacagggagatttccaaattatttgctatttaaaacaaacaaacaaaca
acaaaagtacttgctttctttttctagactcagaggcaaaggtcataaat
gctgattttaggaaatcaaggggaacctgaggtaatgactgatgatatgt
aaataaagactggctctgtctgcagagaacaagctgcccagaagagctat
tacaactcttttggaatttgtctgggagtttttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_18757501_18758603
seq2: B6Ng01-159C10.b_45_1134 (reverse)

seq1  TGAGCTGCTATATTGGAATATGTTTGTTTATGACCTCTCTCTTGTTTATT  50
      |||||||||||||  ||||||||   | |||||||||| |||   |||||
seq2  TGAGCTGCTATAT--GAATATGT---TGTATGACCTCT-TCTCTGTTATT  44

seq1  CTATCCATAAGTCATATTTTCCATGAATCAATTTTTAAATTGTCCCTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |
seq2  CTATCCATAAGTCATATTTTCCATGAATCA--TTTTAAA-TGTCCCTA-T  90

seq1  GTAGGTATTTACCAAAGTAAGTACTTCATAAAATCAAAGATTAATAAAAT  150
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  
seq2  GTAGGTATTTACCAAAGTAAGTAC-TCATAAAATCAAAGATTAATAAA--  137

seq1  TTTTATTCTTATTTTAGACAGTAGTACACCATTAATGAATTATTGACAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTCTTATTTTAGACAGTAGTACACCATTAATGAATTATTGACAAG  187

seq1  CAAATATAAAAAATCTCTGCTATTGAAACTCAAAGGAAATAGCTGCATTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATATAAAAAATCTCTGCTATTGAAACTCAAAGGAAATAGCTGCATTC  237

seq1  CATAGACTTCTAGAGCTTCCTTCAGGAAGATACCACTAAGAACCATTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGACTTCTAGAGCTTCCTTCAGGAAGATACCACTAAGAACCATTCAA  287

seq1  CTGTTATGATGACAATAATGTTAATGCTTTCCAACAATCTTCCATAAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTATGATGACAATAATGTTAATGCTTTCCAACAATCTTCCATAAACT  337

seq1  ATCTTTAAGTAAGAAATAGGAACCAGTTAATTAAATATAGTTCCATAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTAAGTAAGAAATAGGAACCAGTTAATTAAATATAGTTCCATAAAT  387

seq1  TGATAATATGGGACTAAGAGACATTGAGTTTTTGAGTGTTTTAGATCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATATGGGACTAAGAGACATTGAGTTTTTGAGTGTTTTAGATCAAG  437

seq1  TCTCAAATCTCTCAAACAAAAAGCTGAATTTATTTTATTCATTTATATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAATCTCTCAAACAAAAAGCTGAATTTATTTTATTCATTTATATTT  487

seq1  AATTATGCATATATGTGCATATCTATGTGGAAAAACATTGTACATGTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATGCATATATGTGCATATCTATGTGGAAAAACATTGTACATGTGTA  537

seq1  AATGCCTCTGTAGTCTAGAAGAAGCTAATAAGTCCCATGGAGCAAAACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCTCTGTAGTCTAGAAGAAGCTAATAAGTCCCATGGAGCAAAACTT  587

seq1  ACAGGCATTTGTAAGATGCCTAACATGGGTGCTACATGGTAGACTCAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCATTTGTAAGATGCCTAACATGGGTGCTACATGGTAGACTCAGGT  637

seq1  ACTCTACAAGTTCAAAATGTGCTCTTAACTACTGAGGCATTTCTCAGCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTACAAGTTCAAAATGTGCTCTTAACTACTGAGGCATTTCTCAGCCC  687

seq1  CCTGAATAAACATTATTATATCTCTTCACTCTCCTTTTTCTAACAATGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAATAAACATTATTATATCTCTTCACTCTCCTTTTTCTAACAATGAT  737

seq1  TGAACATATTAGGTGCAGCAAGTGCAACTTGAGAGAGAATCATTCATTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACATATTAGGTGCAGCAAGTGCAACTTGAGAGAGAATCATTCATTTA  787

seq1  CTTTCTAAGTGAAAATTGTTTTCCCTCTATTTAGCAATAACTGTTCTATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTAAGTGAAAATTGTTTTCCCTCTATTTAGCAATAACTGTTCTATG  837

seq1  ACACAAAACAGAAATGGTTTTGTCCTTTTATCCTGGATATAAGTCAATCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAAACAGAAATGGTTTTGTCCTTTTATCCTGGATATAAGTCAATCT  887

seq1  GTTCTTTATCAGAACAAATGCCCAAAGTTAGTAGGAAGTTCACATGAATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTTATCAGAACAAATGCCCAAAGTTAGTAGGAAGTTCACATGAATA  937

seq1  AATAGAGAAAATAGACACCATTCTAAAGTTCAGGATTCTCTGGCAAAGAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAGAAAATAGACACCATTCTAAAGTTCAGGATTCTCTGGCAAAGAT  987

seq1  GATTATGATAGCTGAGCCACTAATAACAGAGTATTCCTGTGTTAAAGCGA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATGATAGCTGAGCCACTAATAACAGAGTATTCCTGTGTTAAAGCGA  1037

seq1  CTGTGAGACATTTGCTATTTCACTTGCTCACTGGAAACAGAATATAGGAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGACATTTGCTATTTCACTTGCTCACTGGAAACAGAATATAGGAA  1087

seq1  TTC  1103
      |||
seq2  TTC  1090

seq1: chr4_18617366_18618467
seq2: B6Ng01-159C10.g_70_1153

seq1  GAATTCAACTTGAAGTTGTGATAATTGTTTATCATTATGATGTTAACATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTTGAAGTTGTGATAATTGTTTATCATTATGATGTTAACATT  50

seq1  TGTTCCTTGAATGCCTATTTACCTTAGAAGCAATTAGAATTTTCATAGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTTGAATGCCTATTTACCTTAGAAGCAATTAGAATTTTCATAGGG  100

seq1  AAATGTACAATGCAATTGTCACAAGTTAAAATGCAGGCCATTTTATTTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTACAATGCAATTGTCACAAGTTAAAATGCAGGCCATTTTATTTAA  150

seq1  GAGTCAAGGTCTCAGATTTTCCATCTAATTAGACTATCCATTCAAGTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAAGGTCTCAGATTTTCCATCTAATTAGACTATCCATTCAAGTAAT  200

seq1  GTGATTGATAAAAGCTAACTATTAAATCATATTTATTAGGTTTCATTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTGATAAAAGCTAACTATTAAATCATATTTATTAGGTTTCATTATA  250

seq1  TATTTGGCTAAACTCTGCAAATAAATGCATTTATAGTAGCATAAAATAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGGCTAAACTCTGCAAATAAATGCATTTATAGTAGCATAAAATAAA  300

seq1  ATCGCTATTTTGTTTCTGCTGTGCAGAGTCCTACAAGGCCATGAAGGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGCTATTTTGTTTCTGCTGTGCAGAGTCCTACAAGGCCATGAAGGTGA  350

seq1  TGGTGTGACATAGTTCCTGCCCCTAGAGCAGAGCCACCAGAGTATGGGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTGACATAGTTCCTGCCCCTAGAGCAGAGCCACCAGAGTATGGGCC  400

seq1  TCCACCACTGTTGATGGTTGCTAGGCATAAGGCTTGTTTGTATAATAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCACTGTTGATGGTTGCTAGGCATAAGGCTTGTTTGTATAATAATG  450

seq1  CATATATTTTACTTTATGTTCCTTCTTCGGGGGATTTGTCTGCCAAGGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATATTTTACTTTATGTTCCTTCTTCGGGGGATTTGTCTGCCAAGGTT  500

seq1  AATGACTCTATAATAAACAGAAACGGTACAAGTCCAGTAAGCGAGACTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACTCTATAATAAACAGAAACGGTACAAGTCCAGTAAGCGAGACTAT  550

seq1  GTCTCTGTGACACTAAGACATTCAGGACAGCCCATAAGGCTGTGGAAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTGTGACACTAAGACATTCAGGACAGCCCATAAGGCTGTGGAAAAG  600

seq1  ATCTGTAAAGCATGATTTCAAGAATGCATAAATCAGCGTAAGAACTGTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTAAAGCATGATTTCAAGAATGCATAAATCAGCGTAAGAACTGTCC  650

seq1  TTTATAGGATTTGTCAACTATGAAAATATAAGGGTGCAATATGAAATGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGGATTTGTCAACTATGAAAATATAAGGGTGCAATATGAAATGTA  700

seq1  TGAGGGGATTAACTGGTCTAAAAGAACAGAGGTAGCTACACTAATGAGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGGATTAACTGGTCTAAAAGAACAGAGGTAGCTACACTAATGAGCC  750

seq1  AGCTTATCAGAAATATATTAAGGAAACAGATAAAGAAATTTAGGGAGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTATCAGAAATATATTAAGGAAACAGATAAAGAAATTTAGGGAGTGG  800

seq1  GAATCTTATGATGAGGTCCCACCCAGCTAGCTTATTGTTTGTGTTTACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTTATGATGAGGTCCCACCCAGCTAGCTTATTGTTTGTGTTTACAA  850

seq1  AGACAGGGAGATTTCCAAATTAATTTGCTATTTAAAAACAAACAAACAAA  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGACAGGGAGATTTCCAAATT-ATTTGCTATTT-AAAACAAACAAACAAA  898

seq1  CAAACAAAAAGTACTTGCTTTCTTTTTCTAAGACTCAAGAGGCAAAGGTC  950
      |||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
seq2  CAA--CAAAAGTACTTGCTTTCTTTTTCT-AGACTC-AGAGGCAAAGGTC  944

seq1  ATAAAATGCTGATTTTTAGGAAAATCAAAGGGGAACCTGAGGTAAATGAC  1000
      || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||
seq2  AT-AAATGCTGA-TTTTAGG-AAATC-AAGGGGAACCTGAGGT-AATGAC  989

seq1  TGAATTGATATGTAAATAAAAGACTGGGCTCCTGTCTGCAAGAG-ACAAG  1049
      |||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||
seq2  TGA--TGATATGTAAAT-AAAGACT-GGCT-CTGTCTGC-AGAGAACAAG  1033

seq1  CTGCCCAG-AGAGCTATTACAACTCTTTTTGGAATTTGTCTGGGAATGTT  1098
      |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||
seq2  CTGCCCAGAAGAGCTATTACAACTC-TTTTGGAATTTGTCTGGGA--GTT  1080

seq1  TTTG  1102
      ||||
seq2  TTTG  1084