BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-195N06
Chromosome4 (Build37)
Map Location 127,532,762 - 127,677,416
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC635169
Upstream geneAU040320, Sfpq, Zmym1, LOC665245, Zmym6, LOC100039968, LOC621588, Dlgap3, BC003266, Gja4, Gjb3, Gjb4, Gjb5, LOC667296
Downstream gene4930465A12Rik, Hmgb4, 4930546G22Rik, Zscan20, Tlr12, Phc2, A3galt2, BC039093, LOC667354, Trim62, Adc, Ak2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-195N06.bB6Ng01-195N06.g
ACCGA018137GA018138
length909834
definitionB6Ng01-195N06.b B6Ng01-195N06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,532,762 - 127,533,667)(127,676,583 - 127,677,416)
sequence
gaattctcacacagggcttggtggctgtcgcagctgctgttcgctaataa
agaaactgagtcaaatgtaggagaaggagagtggcattaaggaagcagaa
gagctgaggtgtgagcccagaggatcaatcctagcagatgactccaaccc
agcagcaacagattctttggatgggtttgctggaagcatcattgggcacc
atgacagttgccctttttactaatgccagggaccattccttgtgcagatg
gtaacctgcatccatgtccccatagggacagctgttggctcagataaggt
ggtttgaataatgacagagaacttgggatggagtcacagttacctaccac
tgagctaactgcttcaccttaatgtcaaacacaactgactcatctacaga
tgaaatagagacatgacacagacaagtaattgctcatcagcacacagcaa
ggcagtggcagatgtaagacttgaaccctggtttggcgccagaggccaca
tggtaaatatggccttaactgtgtgagaagctgggaggtttgacatcttg
ccagaacagagcacatgtgtggggggttaaaggttaatctttaggagatc
ctatgcctcagccaagcagaaagtagcccaagctgctgggatatgtaaaa
gaaggggaactcatcaggggcacaggactccagttgttcctgcctgtcat
gctgagagatgaggaggaggctggagaggacagcaagaaatgcacttgtc
tgggggatgaggggagctggaagctgactctagggcatgagggcatgcag
cagctctctctgggcatcagttttatttggggcacacattaaggtggtca
gtttctcttaggacttaaaactctcccgtttttatttcctttgttctctc
atgagaatt
gaattcccaaatccagactcttcctcctcctgccagtatggacttggata
agtaagtcaatcttttgttgctttgttttggttttgtttgtttgtttgtt
ttagttttttggttttggtttggtttagagacagagtttgtcctggaact
cgctctatagtccaggctagtctcaaactcacaaagatccacctgcctct
gcctccccggtgctgggattaaaggcatgcaccaccccgcccagctaaac
tgaatcttctcatgactcagtttactcccctacaaaaagacccatctctt
cagggtgttgtaagagagaaaatgtacagcccccgacataagagttctgt
aaagaacagctttggagaagcgttacaatgcaggacagatgcagatgtaa
cggcacacaaaacagcctgctactcaaacatccagccctgtattcttggc
accaactattcacctactcatgcttgaggagtctgcaaggtgaagccagt
ctgtatggcctaccttagtccttgctttgcttggagctcccttagccctc
agtatcttacaactgtccctccaggagtgaacttggtttgaaatggcatt
tgcaactgtgttcccagctcagggcaactgcacttggttcttagttaatg
ttctagcgagccagcccttgggtcattagcagatggagcgagcaaaggtc
ttgaaaccccactagctgacagagctgctgggctggagccagacttgagg
aaaggccgtagaagggagggtcctgggtggaaacagtgaagccaagttga
ggaagagtctgtgaatgatggggaagggtgggta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_127532762_127533667
seq2: B6Ng01-195N06.b_41_949

seq1  GAATTCTCACACAGGGCTTGGTGGCTGTCGCAGCTGCTGTTCGCTAATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACACAGGGCTTGGTGGCTGTCGCAGCTGCTGTTCGCTAATAA  50

seq1  AGAAACTGAGTCAAATGTAGGAGAAGGAGAGTGGCATTAAGGAAGCAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACTGAGTCAAATGTAGGAGAAGGAGAGTGGCATTAAGGAAGCAGAA  100

seq1  GAGCTGAGGTGTGAGCCCAGAGGATCAATCCTAGCAGATGACTCCAACCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGAGGTGTGAGCCCAGAGGATCAATCCTAGCAGATGACTCCAACCC  150

seq1  AGCAGCAACAGATTCTTTGGATGGGTTTGCTGGAAGCATCATTGGGCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCAACAGATTCTTTGGATGGGTTTGCTGGAAGCATCATTGGGCACC  200

seq1  ATGACAGTTGCCCTTTTTACTAATGCCAGGGACCATTCCTTGTGCAGATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAGTTGCCCTTTTTACTAATGCCAGGGACCATTCCTTGTGCAGATG  250

seq1  GTAACCTGCATCCATGTCCCCATAGGGACAGCTGTTGGCTCAGATAAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCTGCATCCATGTCCCCATAGGGACAGCTGTTGGCTCAGATAAGGT  300

seq1  GGTTTGAATAATGACAGAGAACTTGGGATGGAGTCACAGTTACCTACCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGAATAATGACAGAGAACTTGGGATGGAGTCACAGTTACCTACCAC  350

seq1  TGAGCTAACTGCTTCACCTTAATGTCAAACACAACTGACTCATCTACAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTAACTGCTTCACCTTAATGTCAAACACAACTGACTCATCTACAGA  400

seq1  TGAAATAGAGACATGACACAGACAAGTAATTGCTCATCAGCACACAGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATAGAGACATGACACAGACAAGTAATTGCTCATCAGCACACAGCAA  450

seq1  GGCAGTGGCAGATGTAAGACTTGAACCCTGGTTTGGCGCCAGAGGCCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTGGCAGATGTAAGACTTGAACCCTGGTTTGGCGCCAGAGGCCACA  500

seq1  TGGTAAATATGGCCTTAACTGTGTGAGAAGCTGGGAGGTTTGACATCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAAATATGGCCTTAACTGTGTGAGAAGCTGGGAGGTTTGACATCTTG  550

seq1  CCAGAACAGAGCACATGTGTGGGGGGTTAAAGGTTAATCTTTAGGAGATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAACAGAGCACATGTGTGGGGGGTTAAAGGTTAATCTTTAGGAGATC  600

seq1  CTATGCCTCAGCCAAGCAGAAAGTAGCCCAAGCTGCTGGGATATGTAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCTCAGCCAAGCAGAAAGTAGCCCAAGCTGCTGGGATATGTAAAA  650

seq1  GAAGGGGAACTCATCAGGGGCACAGGACTCCAGTTGTTCCTGCCTGTCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGGAACTCATCAGGGGCACAGGACTCCAGTTGTTCCTGCCTGTCAT  700

seq1  GCTGAGAGATGAGGAGGAGGCTGGAGAGGACAGCAAGAAATGCACTTGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGAGATGAGGAGGAGGCTGGAGAGGACAGCAAGAAATGCACTTGTC  750

seq1  TGGGGGATGAGGGGAGCTGGAAGCTGACTCTAGGGCATGAGGGCATGCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGATGAGGGGAGCTGGAAGCTGACTCTAGGGCATGAGGGCATGCAG  800

seq1  CAGCTCTCTCTGGGCATCAGTTT--ATTGGGGCACACATTAAGGTGGTCA  848
      |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCTCTCTGGGCATCAGTTTTATTTGGGGCACACATTAAGGTGGTCA  850

seq1  GTTTCTCTAAGGAC-TAAAACTCTCCCGTTTTTATTTCCTTTGTTCTCTC  897
      |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCTTAGGACTTAAAACTCTCCCGTTTTTATTTCCTTTGTTCTCTC  900

seq1  ATGAGAATT  906
      |||||||||
seq2  ATGAGAATT  909

seq1: chr4_127676583_127677416
seq2: B6Ng01-195N06.g_63_896 (reverse)

seq1  TACCCACCCCTCCCCATCATTCACAGACTCTTCCTCAACTTGGCTTCACT  50
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCACCCTTCCCCATCATTCACAGACTCTTCCTCAACTTGGCTTCACT  50

seq1  GTTTCCACCCAGGACCCTCCCTTCTACGGCCTTTCCTCAAGTCTGGCTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCACCCAGGACCCTCCCTTCTACGGCCTTTCCTCAAGTCTGGCTCC  100

seq1  AGCCCAGCAGCTCTGTCAGCTAGTGGGGTTTCAAGACCTTTGCTCGCTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGCAGCTCTGTCAGCTAGTGGGGTTTCAAGACCTTTGCTCGCTCC  150

seq1  ATCTGCTAATGACCCAAGGGCTGGCTCGCTAGAACATTAACTAAGAACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTAATGACCCAAGGGCTGGCTCGCTAGAACATTAACTAAGAACCA  200

seq1  AGTGCAGTTGCCCTGAGCTGGGAACACAGTTGCAAATGCCATTTCAAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCAGTTGCCCTGAGCTGGGAACACAGTTGCAAATGCCATTTCAAACC  250

seq1  AAGTTCACTCCTGGAGGGACAGTTGTAAGATACTGAGGGCTAAGGGAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCACTCCTGGAGGGACAGTTGTAAGATACTGAGGGCTAAGGGAGCT  300

seq1  CCAAGCAAAGCAAGGACTAAGGTAGGCCATACAGACTGGCTTCACCTTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCAAAGCAAGGACTAAGGTAGGCCATACAGACTGGCTTCACCTTGC  350

seq1  AGACTCCTCAAGCATGAGTAGGTGAATAGTTGGTGCCAAGAATACAGGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCCTCAAGCATGAGTAGGTGAATAGTTGGTGCCAAGAATACAGGGC  400

seq1  TGGATGTTTGAGTAGCAGGCTGTTTTGTGTGCCGTTACATCTGCATCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTTTGAGTAGCAGGCTGTTTTGTGTGCCGTTACATCTGCATCTGT  450

seq1  CCTGCATTGTAACGCTTCTCCAAAGCTGTTCTTTACAGAACTCTTATGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCATTGTAACGCTTCTCCAAAGCTGTTCTTTACAGAACTCTTATGTC  500

seq1  GGGGGCTGTACATTTTCTCTCTTACAACACCCTGAAGAGATGGGTCTTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGCTGTACATTTTCTCTCTTACAACACCCTGAAGAGATGGGTCTTTT  550

seq1  TGTAGGGGAGTAAACTGAGTCATGAGAAGATTCAGTTTAGCTGGGCGGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGGGAGTAAACTGAGTCATGAGAAGATTCAGTTTAGCTGGGCGGGG  600

seq1  TGGTGCATGCCTTTAATCCCAGCACCGGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCATGCCTTTAATCCCAGCACCGGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCT  650

seq1  TTGTGAGTTTGAGACTAGCCTGGACTATAGAGCGAGTTCCAGGACAAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAGTTTGAGACTAGCCTGGACTATAGAGCGAGTTCCAGGACAAACT  700

seq1  CTGTCTCTAAACCAAACCAAAACCAAAAAACTAAAACAAACAAACAAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCTAAACCAAACCAAAACCAAAAAACTAAAACAAACAAACAAACA  750

seq1  AAACCAAAACAAAGCAACAAAAGATTGACTTACTTATCCAAGTCCATACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAAAACAAAGCAACAAAAGATTGACTTACTTATCCAAGTCCATACT  800

seq1  GGCAGGAGGAGGAAGAGTCTGGATTTGGGAATTC  834
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAGGAGGAAGAGTCTGGATTTGGGAATTC  834