BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-241P18
Chromosome4 (Build37)
Map Location 15,382,320 - 15,521,074
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSlc26a7, 1700034K16Rik, Otud6b, LOC100040047, Tmem55a, OTTMUSG00000004551, Efcbp1, Tmem64
Downstream geneLOC100040095, LOC633695, Calb1, Decr1, Nbn, Osgin2, Ripk2, LOC667150, LOC383994
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-241P18.bB6Ng01-241P18.g
ACCGA051756GA051757
length8751,074
definitionB6Ng01-241P18.b B6Ng01-241P18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,520,321 - 15,521,074)(15,382,320 - 15,383,389)
sequence
gaattctattctatattctagagttgggatgctcctgacttgctgatttc
tcactttaaaacatgattgtgaagttcttatacattctacaggtgttaac
tctcccatttcataaaaaaaaattagctctcttttgttcttgtatctaca
ttatggctcagattaacaatctccttctttgtgtaccaatttcactgcat
cacaacccctatgttggttgcaattgattgcaattgaggtgtctgtctca
ctccctagactgggtgaattgggtgttaggggagctatacttaacattat
attctgaaggatggagcaggggtgggtaccacactacagtgaaagcagga
cttgtcagtcagtgatacaactcttaaagcttgctctcctggatactgaa
atctcttttctccatcactttgtgcatttacaatgcattccaaagaagta
caatggtgtaaatacctaacactcatgaatctgttatagtgtactccatt
aggaagagaactctgacccccccagctctgcttctaaggcagtgctgggc
gatgctaagtttctgggctcacatgtttcactccatatcgataacgtagt
ggtagctaaagatcatatccaggcagccgcatttctcaaacatcactcat
tttagcaatgaaaaagtatttctgctatttctcttgttaggaagcgtttt
tgtagtgcatgctgcctttggagagaagaattcaggtaaatatctttcaa
atttgagccagctactacttgagtgtaacttctggttgaaaacctttaaa
tgtcaactaaccacacctgggctacaaataattcagctttatctatgctg
aagtacttaatacaaaaactgtggg
gaattctctggggtggaaacgcatgtgcaggtcctgcaggcaaaggtgtg
agtgggaacacgtgtgcaggtcccctaggcagaagcacaggtggggtccc
agctgaggcaagggtcgatgcctcagccagagctggtgtgtgagtgtaag
tcactggctaaatgacttcttctggtgtactgactgccttataaatggaa
tagagggacttggaagacttggagacttcccacttttgttcttctcccat
aagggcaggcattattcctgaagatgaaggtgctagttaggggcaataga
aaagatctcaccaaagctggtgggttggcaaccaaatctttccataccac
aatgtagggtacttgttctagatgccctcgaaccttcagaaacactttgt
cttccactgctagatgaggagatggaaggtatcctctggtgcttatctac
tcagaagttaggccactttgagctgcaatatgtgtgcatttccttcttgt
tcatgtccactgagagattgtgagctctagttttcatttccttaaagtga
gctaaaacaatgttagggtgggagagaagagagtgagagctaacctgtcg
cgttgtgtccattatagtccagtataatatgatactaaacactatgagaa
acaccacttataaaaccacatgcatgaaatagccacgttgcaactggaaa
caaaagtaaatccaagtattagaactcgcagaccctcacctcaaaaagtg
gaagcgaggcggatacagaagcagattgtgatgaggtctctcctcgaaca
cttccaaccaatgggcatgtatctcatccaccctggacttggggtcagga
acaccttactgtcccctgtggtcatgacttcccatagtgtccactttagc
cacttctgcttccttacagcattacctcaaggtttttgtcctgatgccaa
aatatggccagaaagaacagacatgatcatacgtagaacagacatgtacg
atacagaaaccctgacacctcatcccactcggtcatcagctttaagactc
ctctggattgccagattctggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_15520321_15521074
seq2: B6Ng01-241P18.b_45_798 (reverse)

seq1  AAATTTGAAAGATATTTACCTGAATTCTTCTCTCCAAAGGCAGCATGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGAAAGATATTTACCTGAATTCTTCTCTCCAAAGGCAGCATGCAC  50

seq1  TACAAAAACGCTTCCTAACAAAAGAAATAGCAGAAATACTTTTTCATTGC  100
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAAACGCTTCCTAACAAGAGAAATAGCAGAAATACTTTTTCATTGC  100

seq1  TAAAATGAGTGATGTTTGAGAAATGCGGCTGCCTGGATATGATCTTTAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGAGTGATGTTTGAGAAATGCGGCTGCCTGGATATGATCTTTAGC  150

seq1  TACCACTACCTTATCGATATGGAGTGAAACATGTGAGCCCAGAAACTTAG  200
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCACTACGTTATCGATATGGAGTGAAACATGTGAGCCCAGAAACTTAG  200

seq1  CATCGCCCAGCACTGCCTTAGAAGCAGAGCTGGGGGGGTCAGAGTTCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCGCCCAGCACTGCCTTAGAAGCAGAGCTGGGGGGGTCAGAGTTCTCT  250

seq1  TCCTAATGGAGTACACTATAACAGATTCATGAGTGTTAGGTATTTACACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAATGGAGTACACTATAACAGATTCATGAGTGTTAGGTATTTACACC  300

seq1  ATTGTACTTCTTTGGAATGCATTGTAAATGCACAAAGTGATGGAGAAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTACTTCTTTGGAATGCATTGTAAATGCACAAAGTGATGGAGAAAAG  350

seq1  AGATTTCAGTATCCAGGAGAGCAAGCTTTAAGAGTTGTATCACTGACTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTCAGTATCCAGGAGAGCAAGCTTTAAGAGTTGTATCACTGACTGA  400

seq1  CAAGTCCTGCTTTCACTGTAGTGTGGTACCCACCCCTGCTCCATCCTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCCTGCTTTCACTGTAGTGTGGTACCCACCCCTGCTCCATCCTTCA  450

seq1  GAATATAATGTTAAGTATAGCTCCCCTAACACCCAATTCACCCAGTCTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATAATGTTAAGTATAGCTCCCCTAACACCCAATTCACCCAGTCTAG  500

seq1  GGAGTGAGACAGACACCTCAATTGCAATCAATTGCAACCAACATAGGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGAGACAGACACCTCAATTGCAATCAATTGCAACCAACATAGGGGT  550

seq1  TGTGATGCAGTGAAATTGGTACACAAAGAAGGAGATTGTTAATCTGAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGCAGTGAAATTGGTACACAAAGAAGGAGATTGTTAATCTGAGCC  600

seq1  ATAATGTAGATACAAGAACAAAAGAGAGCTAATTTTTTTTTATGAAATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTAGATACAAGAACAAAAGAGAGCTAATTTTTTTTTATGAAATGG  650

seq1  GAGAGTTAACACCTGTAGAATGTATAAGAACTTCACAATCATGTTTTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTTAACACCTGTAGAATGTATAAGAACTTCACAATCATGTTTTAAA  700

seq1  GTGAGAAATCAGCAAGTCAGGAGCATCCCAACTCTAGAATATAGAATAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAATCAGCAAGTCAGGAGCATCCCAACTCTAGAATATAGAATAGA  750

seq1  ATTC  754
      ||||
seq2  ATTC  754

seq1: chr4_15382320_15383389
seq2: B6Ng01-241P18.g_66_1139

seq1  GAATTCTCTGGGGTGGAAACGCATGTGCAGGTCCTGCAGGCAAAGGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGGGGTGGAAACGCATGTGCAGGTCCTGCAGGCAAAGGTGTG  50

seq1  AGTGGGAACACGTGTGCAGGTCCCCTAGGCAGAAGCACAGGTGGGGTCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGAACACGTGTGCAGGTCCCCTAGGCAGAAGCACAGGTGGGGTCCC  100

seq1  AGCTGAGGCAAGGGTCGATGCCTCAGCCAGAGCTGGTGTGTGAGTGTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGGCAAGGGTCGATGCCTCAGCCAGAGCTGGTGTGTGAGTGTAAG  150

seq1  TCACTGGCTAAATGACTTCTTCTGGTGTACTGACTGCCTTATAAATGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGGCTAAATGACTTCTTCTGGTGTACTGACTGCCTTATAAATGGAA  200

seq1  TAGAGGGACTTGGAAGACTTGGAGACTTCCCACTTTTGTTCTTCTCCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGGACTTGGAAGACTTGGAGACTTCCCACTTTTGTTCTTCTCCCAT  250

seq1  AAGGGCAGGCATTATTCCTGAAGATGAAGGTGCTAGTTAGGGGCAATAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCAGGCATTATTCCTGAAGATGAAGGTGCTAGTTAGGGGCAATAGA  300

seq1  AAAGATCTCACCAAAGCTGGTGGGTTGGCAACCAAATCTTTCCATACCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATCTCACCAAAGCTGGTGGGTTGGCAACCAAATCTTTCCATACCAC  350

seq1  AATGTAGGGTACTTGTTCTAGATGCCCTCGAACCTTCAGAAACACTTTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAGGGTACTTGTTCTAGATGCCCTCGAACCTTCAGAAACACTTTGT  400

seq1  CTTCCACTGCTAGATGAGGAGATGGAAGGTATCCTCTGGTGCTTATCTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACTGCTAGATGAGGAGATGGAAGGTATCCTCTGGTGCTTATCTAC  450

seq1  TCAGAAGTTAGGCCACTTTGAGCTGCAATATGTGTGCATTTCCTTCTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAGTTAGGCCACTTTGAGCTGCAATATGTGTGCATTTCCTTCTTGT  500

seq1  TCATGTCCACTGAGAGATTGTGAGCTCTAGTTTTCATTTCCTTAAAGTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTCCACTGAGAGATTGTGAGCTCTAGTTTTCATTTCCTTAAAGTGA  550

seq1  GCTAAAACAATGTTAGGGTGGGAGAGAAGAGAGTGAGAGCTAACCTGTCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAACAATGTTAGGGTGGGAGAGAAGAGAGTGAGAGCTAACCTGTCG  600

seq1  CGTTGTGTCCATTATAGTCCAGTATAATATGATACTAAACACTATGAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTGTGTCCATTATAGTCCAGTATAATATGATACTAAACACTATGAGAA  650

seq1  ACACCACTTATAAAACCACATGCATGAAATAGCCACGTTGCAACTGGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCACTTATAAAACCACATGCATGAAATAGCCACGTTGCAACTGGAAA  700

seq1  CAAAAGTAAATCCAAGTATTAGAACTCGCAGACCCTCACCTCAAAAAGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTAAATCCAAGTATTAGAACTCGCAGACCCTCACCTCAAAAAGTG  750

seq1  GAAGCGAGGCGGATACAGAAGCAGATTGTGATGAGGTCTCTCCTCGAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCGAGGCGGATACAGAAGCAGATTGTGATGAGGTCTCTCCTCGAACA  800

seq1  CTTCCAACCAATGGGCATGTATCTCATCCACCCTGGACTTGGGGTCAGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAACCAATGGGCATGTATCTCATCCACCCTGGACTTGGGGTCAGGA  850

seq1  ACACCTTACTGTCCCCTGTGGTCATGACTTCCCATAGTGTCCACTTTAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTACTGTCCCCTGTGGTCATGACTTCCCATAGTGTCCACTTTAGC  900

seq1  CACTTCTTGCTCCTTACACCATTACCTCAAGG-TTTTGTCCTGATGCCAA  949
      |||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CACTTCTGCTTCCTTACAGCATTACCTCAAGGTTTTTGTCCTGATGCCAA  950

seq1  AATATGGCCAGAAAGAACAGACATGAACCATACAGAGAACAGACATGAAC  999
      ||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||
seq2  AATATGGCCAGAAAGAACAGACATG-ATCATACGTAGAACAGACATGTAC  999

seq1  AATACAGAAACACTGACA-CTCATCACACTCGGTC-TCAGGCTTTAGACT  1047
       |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  || |||||
seq2  GATACAGAAACCCTGACACCTCATCCCACTCGGTCATCAGCTTTAAGACT  1049

seq1  -CTCTGGATTG-CAGATTCTGGAGA  1070
       |||||||||| |||||||||||||
seq2  CCTCTGGATTGCCAGATTCTGGAGA  1074