BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-247B01
Chromosome4 (Build37)
Map Location 99,249,197 - 99,249,427
singlet/doubletsinglet
Overlap geneLOC638890
Upstream geneInadl, L1td1, Ankrd38, LOC100039541, Usp1, Dock7, Angptl3, LOC665193, Atg4c, LOC665212
Downstream geneLOC100042589, Foxd3, Alg6, Itgb3bp, BC020077, Pgm2, Ror1, Ube2u, LOC277707
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-247B01.bB6Ng01-247B01.g
ACCGA055505GA055506
length1,193239
definitionB6Ng01-247B01.b B6Ng01-247B01.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctttgttcagttctgagccccattttttaagggggttatttgatt
ttctgaggtccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagtccc
ctatctgatttaggataggtaaagatcctttcccagtctgttggtggtct
ttttgtcttatagacagtgtcttttgccttgcagaaactttggagtttca
ttaggtcccatttgtcaattctcgatcttacagcacaagccattgctgtt
ctgttcaggaatttttcccctgtgcccatatcttcaaggcttttccccac
tttctcctctataagtttcagtgtctctggttttatgtgaagttccttga
tccacttagatttgaccttagtacaaggagataagtatggatcgattcgc
attcttctacatgataacaaccagttgtgccagcaccaattgttgaaaat
gctgtctttcttccactggatggttttggctcccttgtcgaagatcaagt
gaccataggtgtgtgggttcatttctgggtcttcaattctattccattgg
tccacttgtctgtctctataccagtaccatgcagtttttatcacaattgc
tctgtagtaaagctttaggtcaggcatggtgattccaccagaggttcttt
tatccttgagaagagtttttgctatcctaggttttttgttattccagatg
aatttgcaaattgctccttctaattcgttgaagaattgagttggaatttt
aatggggattgcattgaatctgtagattgcttttggcaagatagccattt
ttacaatgttggtcctgccaatccatgagcatgggagatctttccatctt
ctgagatcttctttaatttctttcttcagggacttgaagtttttatcata
cagatctttcacttccttcgttagagtcacgccgagatattttatattat
ttgtggctattgagaagggtgttgtttccctaatttcctttctcagcctg
tttatctttgtgtagagaaaggccattgacttgttttgagtttaatttta
tatccagctactttcaccgaggctgtttatcagctttaggagttcctctg
ttgaaattttttaagggtcaacttaatatactatcatatcatctggcaaa
agctgaaatattttgaaactcttctcctccttctctccgcaat
attcaggagtttgtgtcctcttttagatagatagatagatagatagatag
atagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataggt
gataaataggtaaatatgataggtagatagatagatgataaataggtaaa
tatgacagatagatagatagatagatagacagatagatagattgatagat
agatagattgacagatacatagatggatggccggatgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_99249197_99249427
seq2: B6Ng01-247B01.g_74_312

seq1  ATTCAGGAGTTTGTGTCCTCTTT----TAGATAGATAGATAGATAGATAG  46
      |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGGAGTTTGTGTCCTCTTTTAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG  50

seq1  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGGT  96
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGGT  100

seq1  GATAAATAGGTAAATATGATAGGTAGATAGATAGATGATAAATAGGTAAA  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATAGGTAAATATGATAGGTAGATAGATAGATGATAAATAGGTAAA  150

seq1  TATGACAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
seq2  TATGACAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGATAGATAGATTGATAGAT  200

seq1  AGATAGAT----AGATAGATAGATGGATGGATGGATGGA  231
      ||||||||    ||||| ||||||||||||  |||||||
seq2  AGATAGATTGACAGATACATAGATGGATGGCCGGATGGA  239