BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-055L03.T7 (MSMg01no055_l03.b1) | MSMg01-055L03.TJ (MSMg01no055_l03.g1) |
ACC | AG283295 | AG283296 |
length | 693 | 825 |
length of high quality (start - end) | 464 (47 - 510) | 39 (75 - 113) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no055_l03.b1 PHD_FILE: MSMg01no055_l03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:57:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no055_l03.g1 PHD_FILE: MSMg01no055_l03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:57:10 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCTGAGAGTCACCCTTTAGGATCTCAATTTTTTTTTTTTTTTAGAT
TAATGAAGATTAATGACCCAGGTTCAGGCCTGTCTTAGTGAATGGCACAT
GTCTACTGATATTGGAGTAGTATGTTACAATGCCAGGTTATTCTCAGTGT
TTGATGGGTCAGGTTTTCTCTACCCAGACTGCCTTTTACCTCTTACTGAC
TTTGTACTGAGTGGCATGACAACCTGCGGTCCTGACTCTGAGTTTGTCTG
TTTCCCTTCTGGCTCCCCTAAGCCTTTATGTGCCTTAAAATTCTATTATT
GTGAGTCCACACGCTTAAGACAGCCATGCATCCTCTTTGTTCCTAATACT
TAGTCTAATGTCAGTACAATTAAACCAGGCTTTCTGTGGTTAGTGTTTGT
GTGTCAGCCTACCTGTGTCATTATATTTAAATAATGTTTTTTTTTATAGC
ACATGTTGTATACAGTTGATCTTTGCTTTATAAATATAAGCCCCACGGCC
TCTCTTAATTGGAGTGCTGACAATATTTACCCCTAATGTAATTATCAGTG
TGGTGAGGTTTCTATTTGCCACCTGGCAATTACGTTTCTACTGACCCCAG
GCTGCTTCCTCCAACTTGTCTCTTTCTTCTCCATGGTCTCCCC
| CAATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTCAGATAAACGTCCTCATTCCTCAA
GGAATTTTTTGGCTGCTGGTGTTTGTTTCCTTGTTTGTTTGTTTGTTTTT
TGTTTCGTTTTGTTCTGTTTTTCGCCTCCCAACACACGCCTTCTTAGCCT
ACCCCCGACAGCCCAGCAACTCACTCTCCACAACACCCCCACCCCCAACT
CACAAATCCCCCTGCCCCTGCCCCCCAACCCCTAAACATTAAACTCATGC
ACCCCCACTCCCCGCCATAACCACACCCCCACCCCCCCCCCAAAACCATA
AAACCACCCCCCCATCCCACACCCCCGCCATTACCCCCCCCAAACCAAAA
CCAACCCCCCCCCACCCCCCCCATACATCCTCCCCAACCATATTAAATCC
CCCCCTAATACCCCTCAAACCCCCACCTCACCAACCCCCCACCCCCCCAC
AACCACCCCCCCCCACCCCCCCCCTACTAAACCCACCCAAACTAACTACC
TCCCCCAACACCCCCGCCCCCCCCCCCCCATCCCCACTCATCACCTCCCC
CAACCCACCCCCTCTTCTCCCCCCCCTATCCCTACCCCTAACTACCCCCC
CCTTCACTTATCAATCCCCACACCCTCTCCCTTCCCTACCCCATTCCCCT
CCCTTCACAATACCCACTACAAACCATTCTCCCCCTCCCATCATACCTNA
CCCAACCAAAATCCCCTCATACCCTCCATACCACGCACCCCCCCCAAACC
CCCACCCACCATTATATCTCCCATT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 10 10 17 11 13 17 13 28 37 34 27 25 24 22 22 19 22 23 20 20 22 37 37 43 28 28 24 24 24 23 30 10 10 10 10 10 12 25 32 20 20 16 20 20 28 31 48 57
36 36 35 35 31 31 39 37 29 29 15 22 12 11 11 12 23 30 41 32 37 30 25 25 31 31 33 36 36 36 36 42 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 54 54 54 54 54 54
57 54 57 57 57 57 48 54 54 54 54 50 68 57 48 44 37 26 21 12 11 11 11 12 12 24 24 42 47 48 57 57 54 54 44 44 42 46 43 38 43 47 46 44 57 57 57 57 57 57
57 54 54 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 57 57 57 57 57 52 57 52 57 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 59 59 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 38 32 18 18 34 38 62 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57
52 57 57 57 57 68 59 44 38 24 15 13 13 13 13 28 27 23 23 20 38 38 42 43 43 52 52 52 52 52 52 50 50 54 54 54 59 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43
38 23 18 18 32 36 43 43 43 43 33 27 27 44 44 44 43 35 35 37 44 44 48 44 43 42 42 35 35 42 44 44 44 42 42 28 44 42 48 42 44 42 35 35 39 37 32 39 37 43
43 47 48 40 40 28 25 25 30 44 43 46 46 46 43 43 47 54 47 47 32 39 39 39 36 33 34 28 28 28 25 29 25 28 28 36 36 43 43 59 59 59 37 37 37 30 15 8 7 7
8 13 17 36 39 37 26 22 14 14 19 22 12 17 18 16 15 21 21 25 28 39 33 30 28 30 30 32 36 36 33 28 24 25 23 21 23 18 16 18 22 24 25 13 11 11 18 18 19 24
25 24 30 30 26 25 36 32 28 28 28 28 23 20 20 22 24 22 10 10 10 10 8 8 10 15 21 21 12 8 8 8 10 10 14 11 11 11 15 15 20 20 28 30 28 28 12 9 8 10
8 8 8 21 22 19 15 20 20 20 21 21 19 19 15 26 19 16 11 10 10 10 19 19 12 12 9 10 12 15 13 8 8 8 8 15 16 12 12 14 17 14 12 19 14 12 8 9 9 10
9 9 9 12 12 12 13 8 8 9 14 10 13 16 10 9 8 10 10 10 14 19 23 24 15 16 16 13 12 12 11 11 11 11 12 12 15 9 9 9 13 14 11 | Open.Hide. 8 8 7 8 8 7 13 9 9 18 18 22 11 11 14 24 28 47 39 40 41 43 43 48 37 37 37 37 41 37 37 25 23 11 11 7 7 7 8 8 11 9 10 9 20 23 25 48 37 33
36 38 50 36 36 30 30 14 14 14 24 15 16 16 15 17 15 17 12 7 7 8 12 11 19 26 29 25 31 31 39 44 50 59 48 57 41 41 24 24 30 37 37 57 57 40 40 47 42 36
36 43 42 42 33 36 39 47 41 28 23 19 12 13 8 8 8 8 12 12 12 15 24 30 28 15 13 11 10 10 11 21 12 17 22 32 30 32 21 18 13 13 15 15 12 12 28 32 23 24
24 19 19 12 10 10 10 10 18 24 23 16 10 10 10 10 13 13 31 30 23 19 11 9 9 9 10 10 14 13 23 24 24 21 8 8 8 8 10 12 12 11 8 8 6 6 8 8 9 9
9 12 15 15 14 9 9 9 8 8 8 8 15 8 8 8 8 13 22 16 30 28 37 21 23 10 10 10 13 9 11 10 22 16 12 12 18 23 16 10 10 16 17 18 22 18 15 10 11 15
9 9 9 9 9 13 12 14 24 21 23 11 12 11 16 14 15 14 23 19 22 26 28 26 32 24 21 18 14 14 16 10 11 10 11 11 12 12 12 12 12 15 15 8 8 8 8 8 10 8
7 7 14 8 13 10 17 16 19 20 15 15 10 10 10 10 9 9 9 12 11 10 10 7 7 8 8 11 15 13 12 10 10 10 12 13 14 17 19 13 11 11 11 12 10 15 13 8 8 8
13 17 18 11 11 11 11 10 13 10 8 8 8 8 9 10 13 9 9 9 14 9 14 15 13 8 8 7 8 9 8 8 10 10 11 11 13 8 8 8 10 10 8 8 16 12 15 15 26 24
26 10 10 10 11 12 19 29 37 29 23 19 19 19 24 21 20 23 20 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 13 9 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 10
13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 14 10 8 8 8 8 8 10 8 16 10 9 10 10 15 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 17 9 9 9 12 13 16 12 10 10 15 10
9 9 10 10 10 13 18 22 15 10 9 9 13 13 12 9 9 10 16 16 13 13 12 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 6 7 11 7 6 8 8 7 8 6 6 8 9
9 11 19 9 13 8 9 8 8 8 8 13 11 17 9 9 9 10 12 15 30 25 20 22 22 15 13 8 8 8 8 8 7 7 7 9 9 9 8 8 8 11 8 9 9 9 9 13 17 21
24 21 21 19 17 8 8 8 8 8 9 11 11 11 17 8 8 7 7 7 9 14 16 15 15 6 6 6 6 8 8 9 9 10 12 16 19 11 10 10 10 10 21 11 13 22 21 24 27 17
17 11 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 10 10 10 11 20 21 12 13 11 9 9 15 10 11 10 8 8 11 11 16 20 22 9 19 9 9 13 12 13 10 9 8 8 8 9 13 8 13
9 12 9 11 8 8 8 8 8 8 9 9 11 16 11 11 10 10 11 15 19 17 9 9 8 8 8 8 8 8 8 21 18 16 15 15 12 12 10 8 8 10 8 9 9 10 10 3 0 3
12 17 15 10 7 7 10 12 12 12 6 6 8 12 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 9 9 9 9 11 21 20 20 20 12 10 10 11 15 13 15 22
19 15 9 8 8 13 9 10 8 9 9 9 10 15 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 |