BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-060B05.T7 (MSMg01no060_b05.b1) | MSMg01-060B05.TJ (MSMg01no060_b05.g1) |
ACC | AG286605 | AG286606 |
length | 709 | 720 |
length of high quality (start - end) | 567 (40 - 606) | 556 (82 - 637) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no060_b05.b1 PHD_FILE: MSMg01no060_b05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:02:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no060_b05.g1 PHD_FILE: MSMg01no060_b05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:02:44 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCT
CAACAGATACATCTCTAATAACTGGGAATAACTTAAAGAAATGCTTACAA
TCCTTAGGCCTCAGGGAAATGAAAGTCAAAACGACTTTGGATTCTATCTT
ACATTTTACAAGATGGCTAAGATAAAAAAAAACCCTCAAGGGACATCTCA
TGCTGGTGAGGATGTAGAGCAAGAAAAACACCTCTCCATGCTGATGTGAG
TGTGAAGTTGTACAACCACTTCAGAAGTCAATTTGGTGATTTCTCAGAAA
ATTGGAAATAGTTTTATTTCAAGACTCAGCTGTACCACCCCTGGATATAT
AGCCAAAAGATGTTCCACCATAAAACAAGGACACTTGCTCAACTATACTA
ATAGCAGCTTTATTCTGAATAGCCAAATCTGGAAGCAACCTAGTTGTCTG
AAGAATGGATGAAGAATGGAATAATACTCAACTATTACAATGGAATATTA
CTCAGCTATTANAAATAATGACATCATAAACTTTGCAGCAAATGGTTGGA
ACTATAAAATACTATCCCGAGTGAGGTAATACAGACTCAGAAAGAGAACC
ATTGTATGTACTTTTAAGTGAATGTTAGCCCTAAAGTATAGGATATGCAT
GCTGCAAAACACAGGACCCGAAGAAGTTATATAACCAAGAGCACTTAACG
GATGATGAT
| AAAATCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGTGATTTCAACAAGTTC
AAGTCTATCATCAGAGATTCATCAGAGATTTCTGGCATGAGGAAGGATTT
AAGTAGAAATCAAGAGTGATATACAGCTAAACAGACCATGAAATTTCAAT
GTCCTCCCTACCACTGTTGCACACCCAATTCCCCCTGCAAAGTCATCAGG
AAAGTTGTAGTGTTTTCTCCAGGAGAAGACTTTCCACTTCAGATTCAAGG
AAGACTTCTCTCTCCTGGCAGGATACTCTTGGGAGAAAATATTTTGAAGA
ATATTTTGTGTGAATGGTGTAATAGCAAAGGAGAGGGCAGTCATGCCATT
TTAGAATATCCTCATTCCTAATGCACAGGCTGATTATATTCCTTAGTCTT
TGTTTTACTCCATAATCTTGAGATGGAATATTCCTCTTTCTGAAACAATA
CCACAAACAGAATATAACCAGCAATCAAGATTAGAACACATTCAGATAGT
GTCAGATTTGGATGATAAGAGCCATTTCTCTATTATTTCTTGGCTTTTGG
AAGAACTTTCAAAAGTAACTCCTCCTTGTTGGTTTGTGATAGAGCCACTA
TAAATTTCAAGGCTGAAATCCAACATATAATAATTTTTACTTTACCCTCT
CACAACTCTGGAATTACAGA
|
quality values | Open.Hide.31 35 36 47 34 33 32 30 28 10 17 9 9 9 14 23 40 41 59 33 33 33 30 30 21 25 10 10 11 11 11 11 18 18 21 19 24 28 28 28 34 34 34 36 36 28 28 36 36 37
37 33 28 28 22 22 15 13 8 8 8 15 19 33 40 40 41 59 59 59 46 43 34 33 36 33 42 42 42 47 40 57 57 57 59 59 59 59 42 42 36 36 36 41 48 48 47 42 36 42
36 43 48 47 59 59 59 47 43 43 46 46 37 42 42 68 42 48 33 41 41 50 57 57 57 43 43 47 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 47 48 48 50 50 50 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 52 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57
57 52 43 43 41 59 59 59 68 57 57 52 57 43 57 59 52 52 57 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 52
52 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 68 62
62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 35 44 44 62 62 62 62 59 59 57 57 43 57 57 68 68 59 57 57
57 57 57 57 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59
57 57 57 68 68 68 57 57 50 43 42 33 33 33 33 42 42 43 50 44 57 57 57 57 57 59 59 57 50 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 42 42 35 42 42 59 46 46
47 59 38 38 23 23 23 32 32 37 37 46 59 43 43 37 37 35 42 44 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 39 35 39 39 48 48 48 57 59 59
48 48 43 40 41 41 41 39 25 25 3 0 3 27 27 41 41 40 40 37 39 30 35 35 47 47 48 59 59 48 47 46 43 41 41 39 39 47 43 34 32 22 28 22 25 30 32 29 31 43
41 47 41 41 33 32 30 28 25 27 36 37 39 40 41 41 48 48 34 34 25 28 28 37 39 43 39 39 43 43 43 48 48 43 46 43 43 39 33 33 33 33 33 33 41 32 27 25 25 25
32 37 34 24 18 15 19 13 13 12 19 19 20 20 18 18 15 28 21 22 30 12 11 11 11 11 24 26 30 20 19 19 14 12 14 10 10 10 10 10 15 17 37 39 39 39 28 28 28 28
28 37 37 30 22 21 12 12 11 12 12 18 12 12 12 16 12 15 6 6 6 7 18 22 29 19 12 8 6 6 6 8 8 11 12 11 11 11 20 18 11 11 11 11 11 11 13 9 9 8
8 12 8 8 10 12 18 15 14 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 8 15 8 8 8 8 8 10 20 19 16 16 26 30 37 30 32 37 28 25 25 20 20 22 25 25 28 28 23 23 12 11 10 9 9 10 9 10 13 13 31 26 43
43 43 44 47 47 39 47 42 42 47 59 44 57 43 37 28 15 15 10 15 15 23 23 32 32 41 41 42 42 41 33 33 33 33 33 41 48 48 48 48 47 47 47 48 48 50 50 50 47 47
47 47 47 48 48 57 57 57 57 57 47 47 47 48 48 50 42 48 47 47 48 44 46 43 57 50 50 50 50 50 50 57 50 43 35 43 43 52 57 57 57 57 57 57 46 48 46 46 46 50
59 57 57 57 57 68 50 50 50 41 41 37 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 39 43
39 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 62 62 68 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62
62 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 57 57 54 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 52 47 42 47 59 57 57 57 57 57 43 43 38 43 43 38 30 43 44 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 59 57 57 43 44 44 48 42 44 42 36 30 40 32 39 43 47 57 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 54 46 47 59 47 47 46 46 39 47 39 39 48 57 59 59 59 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 36 30 18 11 11 11 12 21 28 34 34 36 46 50 50 50 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 59 43 43 40
43 43 47 42 54 54 54 68 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 48 37 42 35 39 44 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 48 42 42 44 44 57 54 54 54 57 44
57 43 43 43 46 46 43 43 43 47 47 57 57 57 57 48 48 47 44 46 57 41 43 43 47 43 43 43 43 46 46 46 48 48 48 57 43 59 43 43 39 42 32 32 32 39 42 43 40 30
28 25 33 36 43 48 48 48 48 48 43 43 43 43 40 39 39 39 36 36 32 29 29 37 34 39 39 36 36 39 43 48 48 37 37 37 36 28 30 29 26 17 20 26 32 32 23 24 14 15
15 28 28 35 35 28 32 29 21 12 12 19 23 31 31 23 23 14 16 19 29 31 37 39 39 36 36 35 43 30 25 19 19 19 25 24 12 8 8 8 8 10 8 10 10 11 13 12 28 21
12 9 12 12 23 23 16 20 23 15 15 13 13 11 21 13 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 17 10 10 8 9 9 8 10 14 15 15 18 25 26 27 12 12 11 8 8 8 8
8 6 9 10 8 8 8 8 8 10 12 12 12 19 19 14 10 10 10 9 |