BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-088F05.T7 (MSMg01no088_f05.b1) | MSMg01-088F05.TJ (MSMg01no088_f05.g1) |
ACC | AG307114 | AG307115 |
length | 706 | 693 |
length of high quality (start - end) | 535 (43 - 577) | 576 (56 - 631) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no088_f05.b1 PHD_FILE: MSMg01no088_f05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:40:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no088_f05.g1 PHD_FILE: MSMg01no088_f05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:40:45 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTCT
GAAGTCCACCTTCTTGACTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCCCTAT
CTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCTTTTT
GTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAACTTTGGAGTTTCATTAG
GTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTCTGT
TCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCACTTTC
TCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCCTTGATCCA
CTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAGTATGGATCGATTCGCATTC
TTCTACACGATAACAACCAGTTGTGCCAGCACCAATTGTTGAAAATGCTG
TCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCGAAGATCAAGTGACC
ATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGGTCTA
CTTGTCTGTCTCTATACCAGTACCATGCAGTTTTTATCACAATTGCTCTG
TAGTAAAGCTTTAAGTCTGGCATGGTGATTCCGCCAGAAGTTCTTTTTAT
CCTTGA
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXTTTCCTAGAGACTATGGAAATCTTGATAAAAGTAGTTTCTTTCAG
CTACTAAAGTTTGGTAATATCAAACTAAGACTAATATCAATCTCTTTACA
AACTGTGTTTTCTGAGACATACAAATATTGGGTATTAATCATAAGCATTT
AGACAAAAAAAGAGCATAAAGCAATCCCACTTCATAGTTGAATAAGTCTA
GACTCGGAGTTAGAATATCAACTCATTTTCTACAGATAAAGTGATTGTTT
GTTTAATAATAACTAAGAAGGTCAAATGCAGCCCAGTATTGCTCCCTACA
GAAAAACCCTGTAAAATCTTCAATGCTGCTTTTGCAAACTGCTCTCATCC
TTAAGAATATTGCTCAAATGATGTTACCCTAAATACAGCTTTTTAAAAAA
TTAAGAAACATACTATGTGAGTATGTTTTTATCACAAGTCCTACAGCATA
GTATATGTGTAATAAATATTTAAGTCTATTTGCAGATTATTAAAATCAAA
CAAGTAAAATTATTGTATATTTGTCTTTACAAGCTCATTTCCAGATTATT
GCATTCAACAACATATTTGAATATAAGTAGTCTTGCTTTATCTTCTTATC
TGGCTAAACAAGGAGAAAAAAAAGCAATGTTCCTTCATCCTTT
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 9 9 9 24 37 37 23 23 19 13 14 17 10 10 10 19 19 41 43 25 21 10 11 11 26 22 39 39 40 40 43 43 57 57 42 42 28 30 30 40 34 48 48 51 51 47 50
50 48 57 48 48 42 42 22 16 12 10 10 12 29 32 42 42 48 47 47 47 48 48 50 50 68 68 68 44 42 28 28 28 36 32 50 50 50 50 53 50 42 42 47 47 57 57 48 47 47
47 34 36 57 48 43 43 43 37 31 37 37 37 37 25 28 13 13 13 15 26 34 47 47 50 50 59 41 36 36 36 36 36 36 38 42 53 53 47 47 34 40 36 39 42 48 48 57 57 57
68 50 50 50 50 50 53 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 50 50 50 47 47 57 57 57 57 47 47 47 57 47 47 57 41 46 46 47 47 47 47 57 47 47 57 59 59 57 57
50 47 47 57 57 57 57 57 57 50 57 57 48 48 52 52 52 59 59 57 57 52 52 52 57 57 43 47 43 57 52 57 52 54 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52
52 43 43 57 43 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 57 52 52 52 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 39 39 39 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 52
52 44 59 50 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 43 43 32 43 43 50 57 57 57 57 54 54 57 59 57 59 59 59 59 59 48 48 57 59 59 59 59 42 35 35 42 42 44 47 44
47 47 43 36 36 23 25 36 37 57 57 57 57 54 54 54 48 48 48 48 47 48 48 44 37 30 25 25 31 31 37 37 43 47 59 48 57 48 59 48 57 48 59 59 43 43 43 59 37 37
28 28 37 41 59 59 59 34 34 28 34 28 31 20 27 28 34 32 28 34 37 43 43 48 43 37 37 37 39 41 34 37 30 39 35 32 40 28 28 28 40 37 43 43 48 43 48 42 42 42
46 43 43 37 37 41 39 39 46 40 33 25 25 23 41 41 43 43 59 43 39 30 30 21 28 14 18 26 32 14 12 10 17 10 12 23 33 33 37 37 36 27 25 23 16 14 16 15 24 24
37 41 59 47 47 27 17 10 10 10 19 27 41 41 41 40 37 37 30 24 24 19 19 14 19 20 17 10 9 10 13 13 14 27 34 30 24 14 10 12 17 18 16 21 23 23 22 24 24 18
24 24 30 30 22 22 23 28 28 37 32 36 28 28 24 18 18 17 14 11 11 11 13 11 11 10 10 18 18 24 19 17 15 13 10 10 10 11 11 8 8 8 10 19 19 30 33 24 21 14
14 14 22 30 28 22 | Open.Hide.26 30 30 30 30 33 33 33 39 41 39 14 9 9 9 8 6 6 7 7 9 7 12 13 14 9 13 22 22 22 10 10 12 29 21 30 21 21 9 9 9 9 9 9 10 10 10 11 11 10
15 20 25 33 33 59 59 59 33 35 35 35 35 35 36 50 50 50 50 50 50 53 47 42 42 42 40 40 47 47 47 47 68 68 42 42 32 32 32 40 42 42 42 46 48 48 42 37 32 36
26 32 37 41 41 34 57 57 57 57 47 57 47 57 57 68 68 57 50 41 41 41 50 47 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 50 50 54 57 57 50 50 50 50
50 50 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 43 44 43 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 52 57 50 50 50 50 50 50 50 47 47 47 50 50 59 54 54 57 57 57 57
59 57 52 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 48 48 44 57 44 47 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 57 57 41 47 57 57
57 48 57 47 47 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 43 43 43 43 48 48 57 59 48 48 43 43 43 57 57 57 59 59 47 39 35 35 35 39 37 48 41 28 26 15
13 13 10 10 10 10 11 12 23 28 41 47 50 41 48 48 50 59 57 37 43 39 37 43 59 48 48 47 47 47 48 48 48 57 57 57 57 59 47 47 43 43 43 43 43 43 37 44 44 48
48 48 59 50 57 48 46 47 42 43 37 44 48 57 48 57 44 48 43 48 43 43 39 43 43 46 46 43 43 43 57 57 57 43 43 43 44 44 44 44 43 57 44 50 50 54 57 57 57 57
57 59 50 39 39 43 50 50 57 57 57 52 57 43 43 32 44 44 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68
68 57 57 44 43 33 43 43 52 52 52 52 52 52 59 59 52 52 52 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 50 43 37 37 37 43 44 59 59 59 59 46 43 43 43 43 42 42 44
41 23 23 37 44 57 44 42 32 32 30 39 39 48 48 54 54 54 57 57 59 59 43 43 43 43 48 57 57 57 48 43 43 36 36 36 43 43 48 43 43 39 36 33 37 32 30 30 37 28
30 28 33 28 35 37 30 35 37 37 37 37 34 30 32 32 41 59 59 47 41 34 23 23 23 28 28 28 28 22 18 18 28 21 25 30 33 33 33 40 40 43 43 37 37 32 35 41 43 37
36 36 39 30 32 22 22 20 31 24 28 30 32 20 28 28 37 37 24 19 15 30 30 41 41 40 32 28 15 12 12 11 16 16 18 18 14 18 18 22 24 24 37 33 33 33 33 27 34 22
22 18 20 20 20 23 22 22 30 25 25 25 25 32 36 37 30 18 17 17 19 19 22 22 19 11 11 15 30 32 23 28 23 12 12 10 10 14 23 25 25 21 16 |