BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-099F07.T7 (MSMg01no099_f07.b1) | MSMg01-099F07.TJ (MSMg01no099_f07.g1) |
ACC | AG315292 | AG315293 |
length | 699 | 2,103 |
length of high quality (start - end) | 568 (50 - 617) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no099_f07.b1 PHD_FILE: MSMg01no099_f07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:56:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no099_f07.g1 PHD_FILE: MSMg01no099_f07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:56:45 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCCTCAATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCCTCAAGCCCACCCCATTGCCCTCCAATCTGGACCTAAGTCA
ACAATCTACTGGGATGGGAACCCAGTTCCCACCCAGAACCACTTAATGAA
AAATTTCTATCTAACTAGAATCCCTCCAGCTGCAACCTAAGTCCGTTTGT
TTATTTTTACTCAAATAGCTAACAGCTGGCACCACCTTCCATGTAAAAGC
ACTTCATGTGTTTGGAAACAGTGATTAACTCATACCTTGCTTTTCGAATC
TCTAGGCCACAGAACGAAGACCATTTCTGAGCATTTTTAAACATTTTCTA
CTTTTACCTTCAGGCTCACGTCCTGTTTAGTTTGGAATCATTAAGTTATC
AATAATGGGCGTATTGCAGTATGGTAATTAGAGGGGGAACATTTCTATGC
TCACCTTAAAAATCAAATGTAACCTCTAAGGTGGGCTCTGGCAGAGGCTG
GCTGAAGGCTGTTCTTACACAAATTTGTACTGGTAAAAACAATTCCCTCG
TCCAGTTTTACAAAATAAAGTCGGGTTCAGTTGGAGAGAAAAGACCTCAC
AATTCTGAGAAGCTTAATCATTTTATAAGCCATTGTTAGAGACAAAAGTT
GGGAGAACAGTTTAATGCTGGCAAGCTAGCATCTGGCCATCTTACATTT
| TTGTTTTTTCTTGGCGTCGCGCGGCTGTGTTGTTTTTNCGCTTTCTNNCC
CNTATGTCTTCGCCGTTTCTCTCNCCGCGCGCGCTCTTNTNCGGCCGCCT
CTTCTTCTTTCGCGCCGGCGGNCGTCTGCTTGTTTTATCGTCGCGTNTCT
TTTGTNGTGGCCCGCGGCGCNGGCGACGAGGAGGCGGAGCNGTGGGGAAA
TTACATTACGCGTGGTGGTTATGTTGTGCGTCTCGCTTCTTATCTCATAT
AACGCGTCGCCCATCGACATNATATACTACACTCGCTTATTCCTTTATTA
TATTTCATCTATATTTCATTATATTATACTCACTCTGCGTCTCCGCCGCT
ATATTACATATATATACACCGCGCACTCGTTTGANCTCACATACTACATA
ATATATCACTGCGTTCGCGAGTCGCTGTATATCTATAACACATATTGCTA
TCGCGCGCAGTATATCAGTATGAATGNCTCATCACGTGCTCTACTCTACG
ACTCGTACTTAACACAACTGTGTACGTTAGTCGATGTACGATCGCGTATA
TTCTGACGGCGGGTGGCGGNTCATATCTATCATNCATTGATAGTCTCGTG
TCGCGCGTTCGCGCTGTCTGTTTATACTCTCTGTGGTTATGTCTGATCGC
ACTCNGCGCGCGCGTTCGTCGTCTATCGTCGCTCGTCGATATCATACTAT
CTCTNTATATTATTACTCGACACGCGCGNCCCTCCATCAACGATAATATG
TAATCANGACCTANCTAGAGTCGTATACATTACTACGCTTAGCAGTATAT
TAATAGACGACTACGGCTCGACCGACGAGTCGTCGTCTACTCGTTCGATA
TGTCATACTTATATATGATTATATTNCGATTNATNTAATAGTATAACCAC
TCACGTTACTCGCATCGACTCTGCTGCTTGTCTGCGTCTGCTGTCTCAGA
TATAGCTGCATGTGACGATCTGGATACATGATAATATTATCAGTCATANC
ACGCGCTGCTCCTGTCGATCGTCTCGTCGCTGCTANAATTATATCATCGA
GACTACCACGAGAAATATATACTAAATATGTGCGTCGACGCACGAGCGCG
TCGGAGAGAGTGGTGAGTATATTACTAGTGTGAGTGAGTAATAGCGATAT
GCTCNGGGATTGTCTGAGTTCTCACAGCACACTGTAGTGCGATCTAATGT
ACTATGACCGATGTGCTCCTAAGTATGATATTCGCATCGTCTCATATCGT
NCGCGCCGCGTCTTCGCTNCCTCTCTATTAATCATTACTATATATAGTTA
TGTGCGCCGCGCTCGGCGTCGCAAGGACTATACACGACTATACCACCTCT
GTTATNTCGANCGCATGAGAGTACTATAATTGAGATTGAGGATNATGAGT
GTTAATCTATTTCATGCTCTNTGGAGCGTACATCGACGGCTCGTGCGTAT
AGTCTAGATGTGATGACATGTAGTACACGTGCTTGCGCGAGAGTTGCTGC
GCACTCATCATCTCTAATCTCATCGTATNATCACTACATATATCANACAC
CGCTTGAGTATTATGATTTATACTACTATGCCATCTATATAGACTGTCTA
TCGTATATNCNACCTCCGCGCACACCGCTCACATANACATATCATACCGT
CACTACTCGCCAGTTCGCGTATATGTGCGTGAGTTATCGNCCGCTCGACG
CAGTATGCTGACTGTATATATCTGCGACGCGCGTTACGCTCGCGCTANTA
AGATATATAGATTCANTACGACTCTCGACACTCGCATATCTCGACGCCAT
ACACGAATCATATCTAGGTATATAGATATTACGATATCGATGATGGGGAC
GNCGAGCAACGCNCTGTCACTCTTTTATGATCGTATACGCTCATGATGTC
ATTATCATCGCGATGCTCTCGACGGTCGCGTACGNTGATCACGCTAAGCG
TATCACCGTCGTCAGACACCGTCGCAACGTAGTATATAATTTACGTCGAT
ATCACGAATACACGTACTNGACGACGACGCGAGCGAGCGTCATAGTATAT
CGACACGATACGCTGCGTTGAGCTGTCTCGTCTCGACTATGCGTATACTC
TGN
|
quality values | Open.Hide. 9 10 9 9 13 10 10 16 16 19 20 24 33 39 33 32 30 28 28 27 30 30 30 33 33 37 37 43 44 30 28 28 28 22 19 22 11 13 11 11 19 18 28 28 28 28 28 28 28 36
59 57 48 36 36 36 35 36 33 37 37 37 37 34 30 17 17 11 11 11 25 25 37 37 37 37 59 59 48 59 36 36 36 36 50 50 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 48 48 50 42
47 50 47 47 42 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 48 57 54 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
50 50 50 48 46 48 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 27 27 12 12 12 38 27 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 62 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 54 54 54 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 57 57 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57
52 59 59 59 59 57 57 52 59 52 43 43 35 43 43 44 43 29 21 21 14 27 24 32 32 43 43 43 43 42 42 52 44 43 43 43 43 46 50 50 54 57 59 59 57 57 57 59 59 48
48 48 57 57 57 57 44 42 35 35 42 44 48 42 37 37 42 44 48 57 57 57 57 59 59 59 59 44 36 26 26 28 36 28 39 39 43 44 44 43 37 37 39 28 28 21 21 29 28 16
14 14 26 26 42 46 46 46 43 43 40 47 43 43 39 48 48 39 39 39 39 39 33 41 37 37 36 36 36 39 37 31 31 37 37 41 41 47 47 41 37 37 47 47 47 48 47 37 33 28
28 37 32 39 30 39 33 36 36 34 33 31 28 28 32 36 39 37 37 36 37 26 24 13 14 14 22 22 30 30 27 24 28 28 28 34 33 37 33 28 28 19 19 14 18 18 23 21 22 22
24 24 33 39 43 43 47 32 28 28 28 28 24 26 20 18 18 19 19 23 29 25 20 22 23 21 16 15 16 21 20 28 28 30 28 23 23 23 31 24 22 22 12 12 12 19 24 31 34 25
19 18 24 19 17 13 11 9 8 8 8 8 11 11 25 30 37 37 33 24 20 23 18 23 15 20 15 21 15 12 11 12 12 19 15 13 13 12 13 13 23 22 26 28 30 25 27 26 26 | Open.Hide. 6 6 6 6 7 10 8 8 8 9 9 7 7 7 8 6 6 6 6 6 9 9 9 9 6 6 6 8 11 8 10 6 6 8 7 7 3 0 3 7 15 17 16 12 9 3 0 0 3 11
3 0 3 7 7 7 7 7 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 3 0 3 6 6 6 6 6 8 6 10 9 10 13 12 3 0 3 0 3 6 6 6 7 7 9 6 6
6 6 6 7 7 6 6 6 7 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 6 9 10 10 9 7 7 6 6 6 6 6 6 9 9 9 10 3 0 3 8 8
8 9 8 8 3 0 3 9 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 8 9 6 8 6 6 6 6 8 11 8 8 3 0 3 10 8 6 6 6 6 8 6
8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 9 9 9 15 9 9 9 7 7 8 8 8
11 11 11 10 6 6 6 6 6 10 10 10 10 11 13 17 11 10 10 3 0 3 11 17 21 25 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 6 8 6 6
6 6 8 8 9 6 8 6 6 6 8 8 7 7 8 8 10 11 8 8 8 8 10 10 11 10 10 10 11 13 10 10 10 10 11 11 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 10 10
10 18 23 9 9 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 17 3 0 3 9 9 11 9 10 8 8 8 8 9 9 9 10 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 13 11 11 11 10 11 12 18 22 12 12 7 7 8 6 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 8 8 8 10 16 8 9 9 9 8 8
10 12 10 10 11 15 18 12 9 6 6 7 6 6 6 6 6 7 6 10 6 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 9 11 8 8 10 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6
6 8 8 8 8 8 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 10 9 8 6 6 6 6 6 6 10 6 8 8 8 8 11 6 6 6 7 8 6 10 8 8 10 10 14 14 15
11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 3 0 3 6 6 6 6 6 13 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 7 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 7
8 8 8 8 9 10 14 11 12 10 11 11 11 8 8 8 6 6 6 7 7 11 8 8 9 7 6 6 6 6 6 6 6 13 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 12 11 12 12
14 10 10 3 0 3 6 6 6 12 10 8 8 6 6 8 13 8 6 6 6 6 6 6 10 22 25 15 11 8 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 7 6
7 7 7 3 0 3 10 9 7 7 8 9 10 13 12 9 9 9 15 10 12 12 11 12 9 7 6 3 0 3 6 6 9 6 6 6 6 6 6 7 8 10 10 10 8 8 8 6 8 6
6 6 8 6 6 3 0 3 6 6 6 8 3 0 3 11 12 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 11 11 11 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 6 8
8 8 10 9 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 13 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 6 8 6 6 8 8 6 6 8 6
8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 8 6 3 0 3 3 0 3 6 6 6 8 6 11 11 10 11 11 10 10 9 9
9 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 13 10 10 10 10 9 9 6 6 6 6 8 8 6 6 11 12 10 8 8 6 6 6 7 9 9 9 9 9 9 11
11 14 8 8 6 6 8 8 10 11 12 11 6 6 6 7 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 8 6 6 6 8 8 6 6 6 7 8 8 6 6 8 8 10 10 3 0 3
6 6 8 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 10 9 7 8 7 7 8 11 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 8 9 10 9 6 6 6 6
6 6 6 10 6 8 8 8 10 16 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 7
6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 8 8 11 10 8 6 6 6 8 6 6 7 7 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 11
9 6 6 3 0 3 6 6 6 7 8 13 13 15 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 6 8 6 6 6 6 7 10 8 13 9 9 8 8 8 8 21 10 9 8 11 13 10 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 10 9 8 10 7 6 6 6 3
0 3 6 7 8 9 12 12 10 8 10 10 10 8 8 7 7 3 0 3 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 9 9 9 12 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 7 6 6 6 6 7 8 8 9 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 6 6 6 11 6 6 6
6 8 8 8 3 0 3 9 9 3 0 3 6 6 6 8 7 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 16 9 6 6 3 0 3 6 6 8 6 6
8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 6 6 6 7 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 12 6 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 10
9 8 8 8 6 6 6 6 10 7 13 13 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 6 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 8 10 15 14 13 10 10 3 0 3 6 8 8
6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 10 8 10 10 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 10 8 8 7 8 8 9 9 9 9 11 10 12 8
8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0 3 7 6 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 13 10 10 11 9 9 3 0 3 8 6 6 6 7 10 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 8 6 6 10 10 10 6 6 6 6 8 7 11 11 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 6 8 10 8 8 10 10 10 8 10 10 10 9 3 0 3 6
6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 6 6 10 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 13 6 7 7 7 6 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 8 6
6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 11 9 9 6 8 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9
3 0 3 7 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 10 10 10 12 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 7 6 6 8
6 6 7 6 6 6 6 12 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 16 15 9 9 9 9 9 13 8 8 6 8 8 6 7 3 0 3 6 6 6 6 6 11 8 8 10 9 9 9 6 8
6 6 6 8 7 7 8 7 7 10 10 11 16 9 9 9 10 10 11 9 8 8 8 8 8 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6
6 6 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 3 0 3 9 10 11 8 8 8 13 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 17 9
10 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 10 8 7 7 7 9 9 9 9 12 10 6 6 6 6 8 8 8 15 10 10 8 8 8 8 8 8
10 3 0 |