BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-153K08.T7 (MSMg01no153_k08.b1) | MSMg01-153K08.TJ (MSMg01no153_k08.g1) |
ACC | AG355182 | AG355183 |
length | 708 | 710 |
length of high quality (start - end) | 251 (66 - 316) | 293 (71 - 363) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no153_k08.b1 PHD_FILE: MSMg01no153_k08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:18:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no153_k08.g1 PHD_FILE: MSMg01no153_k08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:18:04 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTTGCGGCGCTAAACGACTCCTATAGTCAGGACTCCGCGGAATTCCAGG
TGCGTTTCCTGAAAGACAATTTTGTTTTTTAAGCAAAACATTATTGTGTC
AGATAAAACAACAACAACCACAACAATAACAACAACAAAATTTAGTGCAT
CAGTAAGAAGAAATGCCAAATGAATTTGTCCCTATATTCAGCTGTTTTGT
TCAATTCCCACCACCCTCCCTTCCTCCCTCCCTCCATCTCTCTCATTCAT
GATTGTGCATGTTTATGCCTCAGCACACTCAGGTCAAGGATGACCCGCTG
CAGTTGGTCTTTGTCTTCCTCGTGGGTCTCAGAAATGGAACTCAGGGGTC
AGGGGTCATGTCTCACCCCCCCCGCTAGGCAGCAAGCACTTTCACCCACT
GAGCCATCTTGGCTCTTTCTTTGTCATCTGAAACAAAGTCTCACTCTAGC
TTAGGCTATCCACAGACTCATGTGTTCTTGAACACCTGACCCTTGCAGTG
CATATTTATGTGAAGGCTGGCGTAAAAGGAAGACCGTCTCGGCCTGAGGT
GGTTCACATACCTGGATCACATCAGCGTGCTTTGTTATGTGCTCTATGAC
AATGATCATGGTGGGTGTATAGATGGTTTTCCCAGATTTGCCTGTTCCTC
TCTTTTTTCTTTTTAATTCGACATACTCGATCCCATACCCTTCTTAATTC
TTTTATTC
| ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXTTCCGAAATATCTAGTGGTGACTGCTTCATTCATCTGCACCCCT
CCGTCCTCCCGAAACTTGCTTCACTAGTCAGAAGGTCGTCACCAATGAGT
CTTCTCCCTCAGGTCCTGGTCCCTCCCAGAGCCTCTGTACTCAGCCCGAG
TGTTTGCTGTGTTCAGGACCCTGACCTTCCTCTTAACAGGTGCCGCCACC
ATAGCCCTGAGCCCTCACCTCTTCTGGCTCCTGGTTTCCTGATCTATAAC
CCAAATAAAGAATGAAATGTTCTTCGGCAGCAGCTCCCCACAGGGGCGCC
ATGGGGATGAGGTCCTTCTGGGCCGCGACGCAGCTGCCCATCCTGTTACT
AAGTGGAAGCTGGTATTATTGACTGTGCCTTTCAGGCCTTGGAGAACAGT
GTGGCTCAAGAGAAAAGAAAAATGCGGGAAATGCTGGAGGCAGAAAGGAG
GAAGGCACAAGACCTGGAGAATCAGCTGACCCAGCAGAAGGAGGTAGGAG
CGCCCAGTGCCCCCTACCCCCAGCAGGACTTGCAGCCAGGTGTGCCCGGC
AGCCATGCAGTCTGAGGTCACGCCACTACCCACCGCCTCTGCTGGAAGTA
GCCAACACTTGCCTCTCATTGGTTGACCCCGGATGATCCCTGTGAGTTCA
GACCCCTGTT
|
quality values | Open.Hide.12 12 19 19 17 15 10 10 17 22 17 15 9 8 8 17 17 18 19 9 10 10 19 19 11 9 9 9 7 6 6 6 6 6 6 12 20 22 25 25 33 33 33 33 33 31 31 31 31 30
23 23 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 12 10 12 12 24 26 33 33 33 31 31 31 31 36 36 57 57 42 42 42 50 50 50 57 50 53 50 50 50 50 53 47 47 47 47 42 42 37
50 50 50 53 57 53 36 33 33 33 33 31 30 19 18 10 8 8 8 8 11 17 30 30 30 33 33 33 33 31 36 36 36 36 36 36 50 50 50 50 53 50 50 40 42 42 47 47 53 68
68 68 68 54 57 57 59 54 54 54 54 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 48 48 48 48 48 48 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 44 32 18
19 11 11 13 26 29 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 50 50 50 50 50 50 50 53 53 59 59 59 59
59 59 59 59 47 47 39 39 39 59 59 29 29 8 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 11 24 33 47 47 50 50 50 48 48 50 57 57 57 57 57 57 57 57 48 46 46 43 47 47
28 23 15 12 12 11 11 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 12 18 8 8 8 8 8 12 12 18 18 31 24 28 28 37 37 32 35 35 39 39 57 57 57 57 57 57 57 43 42 39
42 35 35 35 39 42 43 43 37 20 10 8 10 10 19 30 43 46 43 43 41 41 35 35 35 39 42 39 42 32 30 28 44 28 28 24 24 32 32 44 44 32 35 35 42 36 37 32 32 42
32 32 20 20 20 32 34 48 57 57 54 57 40 36 26 26 28 33 36 42 35 32 32 32 32 17 24 24 36 43 42 38 28 28 28 28 40 44 57 46 46 37 41 39 32 31 20 20 20 32
32 40 36 36 34 40 28 21 23 28 28 30 33 30 30 28 32 26 16 10 10 10 16 26 34 37 30 30 21 28 11 11 11 23 19 11 8 8 8 8 10 13 25 25 21 19 8 8 8 8
8 10 8 10 14 14 20 20 32 32 36 33 37 22 16 24 14 14 14 31 28 23 12 11 11 13 12 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 11 15 23 19 22 13 11 6 6 6 13 7 6
6 12 13 13 10 9 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 10 8 9 9 8 8 8 8 8 12 10 15 25 13 13 9 10 12 12 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 12 12 22 19 15 10 8 8 8 8 8 8 12 14 8 8 7 7 8 8 10 10 10 11 10 13 13 13 7 7 8 8 10 10 10 10 11 10 10 9 9 9 9
10 10 12 11 8 8 6 6 | Open.Hide. 6 6 8 15 12 10 11 10 15 21 29 33 33 41 41 30 30 30 25 28 30 39 30 27 12 9 6 6 7 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 8 10 10 12 26 21 33 33 37
25 21 17 11 11 11 8 6 6 6 6 7 8 8 8 10 10 11 15 19 19 23 21 31 33 36 38 53 53 53 53 42 47 40 40 40 42 40 40 37 37 51 51 51 51 68 68 68 68 68
68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 57 57 54 57 57 46 32 40 37 24 24 19 27 30 50 57 50 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54
57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 48 42
40 33 28 28 41 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 53 53 53
57 57 57 57 57 53 50 50 50 50 37 37 34 23 15 9 9 9 9 9 10 11 11 15 21 16 23 30 41 59 59 59 59 59 48 57 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 59 57 57 48 42 32 34 32 28 26 16 12 9 9 9 10 10 12 10 10 10 23 10 14 14 26 30 43 36 42 35 42 42 43 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 48 48 44
57 57 59 48 48 43 47 41 37 37 43 43 27 23 23 43 43 46 57 57 59 59 54 54 50 50 38 38 38 59 59 59 43 37 37 43 43 35 43 43 44 44 43 32 32 38 43 42 37 39
43 43 52 52 57 44 43 32 32 32 38 28 33 33 33 33 33 43 33 33 32 43 43 43 43 35 32 33 35 43 43 52 43 52 52 42 42 43 43 43 28 18 14 14 18 21 32 43 35 35
35 37 37 36 37 28 28 23 15 15 12 12 18 32 30 31 22 24 15 15 27 26 18 15 16 16 27 32 35 28 24 21 17 14 15 14 14 14 21 22 30 30 30 23 36 23 23 23 28 28
28 37 37 43 28 30 30 30 25 25 20 28 24 30 30 40 39 39 37 28 23 23 23 23 21 24 14 15 15 17 21 12 12 21 15 14 14 15 12 14 14 30 21 20 15 21 21 21 15 26
24 19 10 9 9 9 10 9 13 18 11 12 12 25 15 17 16 21 16 26 21 19 15 14 14 15 16 17 15 15 12 18 15 10 12 10 10 10 10 12 16 16 16 21 18 18 12 12 12 18
9 8 8 8 8 10 9 10 10 15 15 19 11 11 11 12 9 9 9 8 6 6 6 8 13 8 9 10 11 15 13 13 13 15 21 24 23 23 23 18 19 11 11 10 10 10 12 13 17 9
9 8 8 8 12 10 13 11 11 11 |