BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161L07.T7 (MSMg01no161_l07.b1) | MSMg01-161L07.TJ (MSMg01no161_l07.g1) |
ACC | AG361041 | AG361042 |
length | 1,268 | 1,262 |
length of high quality (start - end) | 359 (43 - 401) | 304 (506 - 809) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_l07.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_l07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_l07.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_l07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNGGGCATTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTTCCTTATGCAAATGAGGCACCTCCTGCACCCTGGCCCTGGCCAAGGA
TGTACACTCACCCCAAAGGTTTAAATTTAACAAGCCTTTGTCCCTCCCAT
TAAAAGACCTTCCTCCCTGAAGCCCAGAGTCTATTTTCTTCACACTGGTT
GTGACCACAAGAGTCAGGTCCCTATGAGTAGGGAAACGGTGAATATTGAA
GCGGGACTGAGAACAACAATCTGCCACAGACACTAGGTCCTAGTGACCAG
GAGATTCTGTTGTCACAGAAATACTTACCTGCTGACTGGCTTGCACTTGA
AAGTGGAGTCTGGCTTAGGTTGGTAAGTGGTTGAAGAAGATGCGTAGGGA
TGATTTGGGATGAACAGTTTGGGGAGCTCGCATATGGGGATGTGTAAGTC
CTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCAGGAGGAGGACTATGCTTAAAAAAGAGGG
TGGCTCAGACTACCATATTCTGGTGAAGTCACTGTTATTAAGGTAGGATG
GAATACATGTAATATATTTCTTTGAACACTTAGTTATCTTGATTTGGAAT
ATGTATTTAGACATTTAGTATATTGGCCTCTGCTTGTACTCTGGGGCCCT
CAAATGTTAGGTCTGTTTTTTGTGCATCGTGAATGTCATTGTCCTTTTCT
CCATCCTTTTTCTTCTCTTCCTTTCTCTTCTATTTTTCTTTTTTTTCTAT
TTCTTATTTTCTTTTCCTCCTTTCCTTTTTTTTATACTTCTTATTTATCC
TTTTCTTTTTACTTTTCTTTTTTTTTCTTATTTTCTTCTCTTCTACTTCT
TATTCTATCTCTCTTTTAATATCTATTTATCTTCTACTTTTTATCTTTTT
TCTCTTTTAATTTTTCTTTTCTTTATTTATTATTCTTTTTTTTATTTTTA
CTTGTTTTCTTTTTTTTTCTATATCTTTTCTTTTTTTTACTTTTTCTTTA
TCTATATCTTTCTTATTTTTTTTTTAATTTAATTTATCATCCACCTTATC
CCCTTCTTATTATTTCTCCTTTCTTATCTTTTCTTGTATTTTTTTATTAG
TCCTCATTTTCTGATTCTTATCTCTTTTCTTATTCTCTTCTTATTTTTAT
CTCCTTCTTTTACTTTATTCTGTCTTCTTATGTCTCTCTACTATTTCTCT
TTGTTCATTTATTCCTTCTTCTATTCCTTTCTTTTTCTCCTAATCTCATA
TCTTTACTTACTTTTTCT
| NNNCCAACAATGGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGCTCCTCCTGTGCCATGCCTGCAGG
GATACTGCCATGCTCCCACCTTGATGATAATGGACGGAACTTCTGACTGA
ACCTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGCTGTTTTTATAAGACTTGCCTTGG
TCATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAACTCTAACTAATACAGGGAGTTAA
ATAGGAAGGGATGGACGAGAAAGGTCGAGGAGGCAGTGCATAGAGAGACA
ACTAACAAAACACGCTGCTGTAGAACCTTCCTAAAATATATGACTATGCA
AAAAGAATCAAAACGGAGTTACCAAATAGGTGAAAGAATGCTCCAACCAG
ACTTGTTGTACCACAAGTAAAACCTCCAGTGCCAGGAAAGAGTTAAGCCT
TATATTGTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCATGAAAACTCCATAATATAAAAA
AGTATTGCAAAGGCTATTTGCTATTCTCCGCGACCTGATGCTCTACTACT
GAAGACAACATTAACACATGCTATCAAACATGGAAAATTGAGCTAGCACC
CTACTAGAAGCTTCACCCGATTAACTAGTGTTCAAGGTACTCAAAGGTAC
TTCTCACGCTACAAGAAAAAAAAAAAGATAATCATTGGTATTTCCCAGGT
ATGATATCTGTAGATCACTATGATCTACCTCAGTGATCTGCCTGCAAGAC
ATACTGGTACTACAGTGCCACAAATGCAGTGGGAGTAACAACCCACTTTC
TGATTGGATTTAAGTCTGGATCCCCGAGATAGAATCCATATCTAAACCTG
CTAGTTGCCAAGAACCTGAGACTAGATAAGTCTTGGGTAACCTAATATTA
TTATACTAAAGGGCCTTATTATTGTAGGAACTCATGAGGACATACATATA
CCCCCAAATAAATGCCTTGTTCCCTCTCCTCAAAAAAAATCCTTTTTTGG
TAGATGGGAATTTACACATTTTTCCCACTTGTACATGTTTTAAAAAAAAA
AATGGGGAAAATTCCCCCTAAAAATACTTTTTTCCGTTAAGGAATTTTAA
AAAATGTGGCGGAAGGATTTAAATTCCTATTTATTACTTTCTCTTATTAA
TTTTTTTTTATCTAACTGTCTTCTCTTCTCTTTCTTCATATCATTTATCT
CTATTCTTTTCTTATTAACTATTTTCCGTATTCTTCTTCTATTCCTTTTT
CTTCCTTTATCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 7 6 6 7 9 11 10 9 14 13 13 12 8 8 8 8 8 10 15 19 28 22 24 22 18 18 19 24 36 36 36 36 33 33 33 33 33 33 37 37 39 39 30 28 28 32
37 37 59 59 59 33 33 33 36 36 50 53 53 53 53 53 48 48 48 48 48 48 48 50 50 57 57 54 54 54 54 68 47 47 47 51 51 51 50 50 50 43 41 41 47 48 47 50 50 57
57 57 57 57 50 50 50 50 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 50 50 50 51 50 50 57 48 30 24 12 12 13 15 15 24 34 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51
51 50 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 48 48 48 48 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57
57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 59 59 59 59 59 48 48 48 48 59 59 57 57 57 47 47 47 47 47 47 43 43 47 34 34 18 18
13 11 11 13 12 15 11 11 12 16 28 34 48 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 57 57 57 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 34 34 19 16
11 10 10 11 12 17 21 18 16 16 16 19 24 31 36 41 23 22 12 9 10 9 10 13 25 34 37 28 22 14 11 11 10 8 8 8 8 8 10 14 22 19 20 21 11 11 11 6 6 6
6 6 8 13 13 18 20 28 37 37 37 43 43 43 44 44 59 59 59 59 48 48 48 48 59 59 59 59 43 43 43 39 43 42 42 46 41 41 37 42 32 36 30 32 32 39 39 43 37 36
25 25 30 36 36 37 42 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 40 40 35 35 35 35 35 30 29 20 24 24 31 31 48 59 47 39 37 37 37 27 25 18 19 20 24 23
28 34 31 30 35 35 34 34 33 18 15 10 10 10 21 22 12 11 11 11 19 22 25 30 30 30 25 16 19 10 10 10 12 18 32 39 39 39 39 34 32 21 15 11 15 15 19 21 32 30
28 22 22 22 22 28 12 14 12 12 12 11 11 16 10 12 9 8 10 10 10 10 10 11 10 9 8 8 8 8 8 10 13 12 10 8 8 8 8 8 11 21 23 19 21 10 11 11 11 10
10 11 12 15 13 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 9 9 10 10 10 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 9 8 8 6 6
8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 8 9 10 10 11 12 12 24 24 28 24 24 16 13 9 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 11 9 9
9 10 10 9 9 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 15 13 15 17 19 18 11 11 9 9 9 10 10 12 15 13 12 13 15 10 10 10 8 8 8 8 8 9 12 8 8
8 8 8 17 15 14 11 10 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 13 10 9 9 9 9 9 10 10 10 10 12
8 8 8 8 8 12 12 9 9 10 10 10 10 10 15 18 10 10 8 8 10 8 8 8 8 11 9 9 9 11 14 18 13 10 10 11 11 13 11 10 8 13 10 10 8 9 10 15 10 12
9 12 9 9 9 16 14 11 10 10 10 10 12 12 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 16 9 9 8 8 8 8 10 8 10 6 6 6 8 11 13 10 11 11 11 8 8
6 6 8 8 10 8 10 7 7 8 8 9 9 10 13 10 15 11 15 11 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 20 15 13 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 13 13 9 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 8 11 8 11 8 11 11 8 8 14 21 15 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 13 13 9 10 9 9 9 11 11 8 8 7 6 10 9 9 10 10 13 13 10 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 9 15 11 11 11 16 17 15 12 10 11
9 7 8 8 9 9 10 7 9 9 9 10 8 9 9 11 13 10 10 11 11 11 11 12 11 13 10 10 7 7 6 6 6 6 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 11 11 10 10 10 11
11 9 9 9 8 8 6 6 10 6 6 10 7 6 8 10 7 9 12 12 11 11 8 8 7 7 10 10 10 10 15 10 10 12 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 15 11 10 10 8
8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 13 12 15 11 16 13 11 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 7 7 9 9 9 9 14 9 8 8 8 8 10 12 21 23 22 22 19 29 29 31 29 29 22 24 33 39 36 36 37 37 37
47 47 53 50 50 48 48 48 57 57 57 57 68 57 59 59 54 54 54 54 68 68 54 54 50 43 43 50 50 50 53 50 48 43 41 50 50 50 50 48 48 47 43 41 36 33 32 43 43 42
42 42 48 48 48 48 48 53 47 47 47 47 37 37 50 50 57 38 36 35 35 35 31 33 33 33 37 30 26 15 12 12 12 12 19 28 30 41 46 46 46 48 48 48 48 48 48 48 57 48
57 57 57 47 47 47 47 50 57 59 59 48 54 54 57 57 51 50 42 42 42 42 50 41 54 54 57 57 57 57 57 53 57 54 57 43 43 35 35 35 44 44 57 57 57 57 57 57 37 57
57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 43 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
57 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59 57 59 59 57 57 52 57 57 57 57 44 38 20 17 17 32 38 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57
54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 43 43 43 59 59 59 59 59 54 54 47 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 54 54 54 57 57 57 54 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 48 59 59 48 48 48 57 57 48 57 48 59 59 59 59 59 43 30 23
12 12 12 11 15 15 19 19 25 30 30 48 48 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 59 57 48 48 48 48 48 57 59 57 48 48 43 43 43 48 48 48 48 48 59 59 59 46 47 59
29 29 11 11 9 9 9 9 19 27 28 20 18 19 28 34 31 41 36 32 24 19 15 22 27 33 59 42 42 42 41 41 34 34 28 26 25 12 12 11 11 15 15 11 11 11 16 20 17 16
11 11 11 13 21 23 15 30 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 54 54 57 57 50 50 50 50 48 54 57 57 57 68 59 59 59 57 57
57 57 48 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 44 44 46 57 59 68 57 68 68 57 57 57 44 44 57 44 48 59 59 57 57
57 57 57 44 44 35 35 35 47 47 54 59 57 54 54 48 57 46 48 48 48 48 59 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 54 54 54 54 57 48 57 48 42
42 48 48 46 47 47 48 54 48 57 59 47 57 57 37 41 28 28 35 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43 41 47 47 41 41 41 43 32 34 35 36 39 59 47 47 39 37 37 30 30 30
39 39 39 39 39 39 47 40 46 30 30 17 17 15 28 24 35 35 40 40 48 48 57 48 48 48 59 59 48 47 43 35 35 39 39 41 39 39 39 39 37 37 41 41 34 30 19 19 17 19
23 34 34 34 34 22 22 25 31 34 59 47 37 37 31 35 33 32 24 28 28 34 34 47 47 47 32 19 14 14 12 16 17 16 18 16 22 25 39 43 39 39 31 25 30 30 59 59 40 37
37 37 32 27 24 22 26 22 26 26 19 12 11 13 13 23 27 18 18 12 12 9 8 8 8 13 9 10 11 19 11 12 12 12 13 9 9 9 9 15 18 25 17 9 8 8 8 8 10 10
10 10 10 13 12 12 12 12 12 12 11 14 12 12 11 14 13 18 11 12 10 17 11 8 8 8 11 8 9 10 10 10 10 10 14 14 9 8 8 6 8 8 10 8 8 8 8 15 15 19
15 17 17 13 14 14 15 15 12 21 11 9 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9 10 9 9 9 13 15 9 9 9 9 9 9 9 15 12 14 14 15 10 10 10 10 10 10 9 10 10 10
10 17 17 22 19 15 12 11 11 10 12 10 11 11 11 11 10 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 9 10 10 10 11 11 16 16 16 10 10 10 8 8 8 10 14 21 11 11 8 8 8
8 8 8 12 12 11 23 26 25 19 10 8 6 6 6 6 8 8 9 12 11 10 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 11 10 11 11 10 10 10 11 12 15 22 28 23 23 23 32 32
28 21 16 13 13 12 11 11 10 10 8 8 6 6 8 6 10 10 12 12 12 11 8 6 6 6 8 8 10 9 9 9 11 8 8 8 10 10 10 11 13 13 11 9 9 9 9 9 9 11
17 14 10 9 9 9 9 9 9 11 12 21 13 9 9 8 8 10 10 10 8 8 8 8 11 10 9 9 11 8 8 9 9 9 11 10 10 11 19 10 10 8 10 8 8 7 6 8 8 10
12 11 12 13 12 9 9 12 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 13 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 11 13 10 7
6 8 6 6 7 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 15 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 10 11 8 8 8 10 9 9 9 8 10 8 8
8 8 6 6 8 8 12 6 7 8 8 7 |