BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161L12.T7 (MSMg01no161_l12.b1) | MSMg01-161L12.TJ (MSMg01no161_l12.g1) |
ACC | AG361050 | AG361051 |
length | 1,271 | 1,278 |
length of high quality (start - end) | 418 (44 - 461) | 384 (471 - 854) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_l12.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_l12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_l12.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_l12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:39 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (109,574,817 - 109,575,218) | (109,437,599 - 109,437,982) |
---|
sequence | NNCCCCTCATTCGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCCAGGCCACCAGGTCTAGTGAGACTGTCTCAAAAAAGAGAGCAAAGTT
TGTAGAAGTAAAGCTAAAAGGAAAAACTGTCCCGTAAGGCTACCGAGTGT
CTTGTTTGACTTGTTTACCACACATATTCTTAGGTTTTGATAAATTCACA
TCTTCTTTTTATTTTTTCTCATTTTCCCAAAATTCAATCTTCTCTCAGTT
TACCCATGCTGTGCCTGTTCTTGAAATGAATCAAATGTGCCTCTTTAGAC
AATTTCCCCCTGACTACAATGATTACTTATTTATTTGCTTGTTTGGTTTT
TGAAACAGGCTTGTTTGTTTTGTGGCTCAGGCTGCCTACAAGTTCAGGAT
TCTTCTGCCCTGCTTCCTGGGTGCTGGGATTACAGGCATTTCTGCCCCTA
TTTTTTTTCCCCCCCCCCCCGGNCATACAGTGCCCTACAAAATAAAAGGG
GGATAGGAATATCCCCAAAATAAAATAAAATAAAGTAAAGTAAAATAAAA
TGTTCGGGTAAGTGTACAATATTTAAGAAAAGAACAAATTTTGTAATCTT
TTTAATTGATATATGGATGAGAGAAAATGTTTTCATTAACATTTCCCTAA
AGTGTCAATCAGGCTTGACATTGTGAATAATGAAAGAGCTTGAATTTTAA
GACAATGTTGTACAAGACTGTCCAAGTGGTTAAGAGCCCACACAACCTCA
TGTACCTTCAACTCCAGGAGCTACAATGCCTCTCTGGCCTTCATCAGCAC
CTGGACTCACATGTATGCAGGGCCATACTCATACACACCATTTAAAATTA
AAAAATTAAATCTTAAAAAACTAAAACAAAACCCCAAACCACCCCCCAAC
CCCCCAAAAAATTTATCCGGCTTATGGTGGCCCATGCCTTTTATCCCCAC
CACTTGTCAATTCAAAGTCTGTGGAATTTCTGAATTCAGGTCCTGCCTGT
TTTTTAAATGTGTATTTCCTGAAAATCCCATTTTATTATAAAAAACCCCG
TTTCTCAAAATCTTATCCTTTCCTTTTCTAATATTTCTTACTTACTATTT
AAATGTCTTTTTTTTTTGCGTATTTAATTCCTCTTCATTGCTCTCTCTTC
CGGTCCTTTTCTTCTCTCTCTATAAAGGTGTTTCATTTTTTTTCTTCCTA
CCTCTCTAATTAAAAAAACAATCTCTTCCTCCTCCTCCTTTATATACCAC
GTCTCTACTTTAAATCTGCTC
| NNNNTTGACATGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTATAAACATTCCACCAACAAATATCC
AGTGAAATTTGCCTATAATAAGGTGTTAATGAATTGGTATCCTTGGGGAG
AAAATATTTCAAGAAAAAAATAGAATAGGAAAAAAGCGAACAAAATTAAA
ATAAATGAAATGTAACTGCATTTTTTTTTAAATTGTAGAGAGTGAAGAAC
TGGTGTTAGAACCAGAACCTCAGTTAGTAGAAGTTGTTTGATCATGACTG
TATAGTCATTTGCTTAGCTGGAGCCTCTTCTCTGACTTAACAGAGTCAGT
GCTTGAATAAATAAATAAACGAATAATTTATTTCAGTATTAAACTATTAT
CCCTATGTCCCCAAATGTCACATACACGATTACTAAGGTTGGGTACGGCT
GCAAATTTTTTCATGCCCCTCTGTAGCACCATATTATCTTTTAAAAATTA
AGTATTCTCCAGCCATCTAGTAAGTAATATCCCATTCATTGGTCTTCCTT
TTGCAAAAACAAAGAACCAAATAAACAACAAGCAAGGATTAAAGGATTGG
TAAATGAATATAAAATGTTCATAAACACAGTGGATTAAGTCAATGTATAT
TAAGGTAATTCTAATTATAGAAAATAATTTTCATATTTATCATTCTAAGC
CAAAAATTATTTGGACCCAACCTCCTAAAATATCAAGCTATGGTATTTTT
CTTTCATCTAATATGGCATAGCACTGTGTAGTCAAAGAATTATCTTTTTG
AAACATTATCCTTTTGGTGAATGTACTTTGACGAAAATTCTGTTACTTAG
TTTGTAGTTTTATTACCCTCAATATAACCGATCTCTTCCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTTTTTTTTTTAAGAAAAAAAATAAAGGACTTTTAAAGCTTCC
AGCAAAAAGTGTATAATTGACAAATGGATTCCCTGTCTTTGGGGGCCATT
GCGGGACCCAACGGAATAAAACTGGATTTTTTCTGAAGTTTTATCGCTGG
CAGGAGAAAACACCTGTTCTTTGTAAAACCCCCTTTGTTTAATTCTGAAA
TGAAATTTCCCTTGCACTTTGGACACAACGCGGGTATAAAGTCCCCCGCC
AAAAAATTGTTTTATATTTCTCCCAATAGCGACTGTCCCCTTATTGGGCC
TTTTCTTTTTCTCAAAAGTCGCGAGGGGGTGCACTCAATCTCTTCTTCGT
TCTTGTCCATTCCAGACACCTCATGATA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 7 7 9 9 9 12 17 15 12 10 10 10 12 12 9 8 10 15 8 8 8 12 12 12 15 15 28 14 12 18 18 20 20 42 42 42 42 33 33 29 33 42 48
48 42 42 41 33 33 33 36 29 36 36 31 19 26 32 41 46 48 48 35 35 37 32 26 26 22 22 29 29 36 25 46 48 50 68 68 68 68 68 68 68 44 43 33 35 35 35 39 42 48
48 40 40 28 28 40 36 43 43 47 37 37 36 36 34 34 34 47 59 48 48 48 48 47 42 42 32 21 13 10 10 10 10 11 11 16 26 34 33 33 33 36 36 47 57 47 50 50 50 50
53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 51 51 51 47 50 50 54 54 50 50 50 50 51 50 68 68 54 54 54 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 45 45 45 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 40 24 27
15 20 20 20 15 15 19 19 37 44 48 48 54 54 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 48 48 43 43 43 43 48 48 43 59 47 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 36 28 14 14
11 12 13 26 37 31 31 17 11 11 12 14 17 26 22 17 16 11 8 10 8 3 0 3 27 27 47 39 25 24 21 21 22 16 12 12 12 12 13 19 18 13 10 8 8 8 8 10 10 21
23 30 39 40 43 43 44 48 48 48 50 50 57 57 57 48 47 47 43 47 48 59 59 59 59 47 43 43 43 43 47 43 43 43 43 43 39 39 43 43 43 43 43 39 39 39 42 44 47 48
57 57 57 57 44 42 30 30 36 44 32 39 41 43 43 43 43 43 59 59 59 59 59 44 42 33 33 35 43 43 43 43 43 44 44 57 46 48 57 57 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 37 37 42 44 37 23 23 25 28 30 44 44 47 47 47 47 47 48 48 47 47 43 46 46 54 54 48 43 43 43 42 42 47 47 37 37
37 42 42 32 43 25 25 25 27 25 22 22 31 31 27 34 31 28 22 32 34 28 24 28 22 19 11 12 11 16 22 39 28 27 23 23 14 14 14 28 28 41 31 34 41 34 32 18 12 10
15 10 10 10 10 13 18 15 25 32 32 32 33 34 20 18 11 12 12 25 19 22 24 22 20 18 21 14 14 24 23 21 12 12 9 11 8 8 8 10 17 31 32 32 28 22 15 21 13 11
11 10 10 12 8 8 12 24 14 16 22 34 34 34 21 18 15 15 10 10 10 12 13 12 9 9 9 12 14 16 19 21 19 16 16 16 13 11 12 9 9 11 11 10 9 9 9 11 13 21
16 19 9 9 10 13 17 12 10 10 10 10 15 10 10 10 12 8 10 10 9 9 9 10 10 10 10 10 10 11 17 14 12 10 10 10 9 9 11 10 12 8 8 8 13 10 12 8 8 8
8 10 10 9 9 8 8 15 10 10 10 15 16 23 12 15 15 10 10 10 8 10 10 15 19 11 11 12 11 17 12 13 10 10 11 13 17 17 14 12 16 12 14 17 30 23 15 14 14 15
15 18 13 10 10 10 9 11 21 22 22 20 19 17 10 10 8 8 6 7 6 6 8 10 17 16 18 19 15 12 11 10 9 9 9 10 11 18 15 15 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8
6 6 8 8 10 8 8 10 8 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 10 8 9 9 9 9 14 14 16 11 11 10 10 9 10 10 9 9 9 12 10 10 9 8 8 6 6 8 8
9 10 8 8 8 10 10 14 15 13 13 12 11 11 11 9 8 8 10 8 8 8 8 10 15 13 16 11 9 9 8 8 6 7 7 7 9 6 8 8 9 9 14 10 11 12 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 9 9 10 10 10 10 9 9 12 12 12 14 11 12 15 10 10 9 9 15 17 11 8 9 10 10 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 9 9 10
9 9 12 10 10 10 11 11 18 14 16 16 10 10 9 9 9 8 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 9 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8
8 6 6 6 8 9 11 15 16 9 9 9 8 8 8 8 10 11 10 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 18 10 14 14 13 12 9 8 8 8 8
10 10 9 8 8 8 6 8 6 6 8 10 11 8 8 8 8 11 11 8 8 6 6 8 8 8 13 12 14 14 13 10 10 8 6 6 8 6 6 8 8 11 11 11 11 8 8 8 8 8
6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 7 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 7 9 12 14 7 8 8 6 8 10 11 19 19 17 15 12 12 14 28 23 25 19 28 28 31 31 35 36 35
35 35 35 30 35 44 53 57 53 53 50 50 50 50 47 47 30 11 8 8 8 8 7 7 6 6 8 8 15 17 39 39 40 43 44 48 50 57 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 50
36 36 33 33 33 37 47 43 25 23 11 11 6 6 6 6 10 8 9 10 19 19 28 28 28 29 29 36 34 32 22 18 17 13 15 21 28 43 48 53 50 50 53 53 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 53 53 50 50 50 59 46 41 30 10 8 8 8 8 10 21 34 47 41 41 41 43 37 35 35 35
35 39 39 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 57 59 68 68 59 59 54 54 54 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 59 68 68 57 68 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57
57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
46 41 26 21 13 13 13 19 32 44 59 59 59 59 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 47
28 21 11 11 11 12 19 13 9 9 10 11 12 11 12 12 26 33 15 15 12 28 22 41 41 59 59 59 59 57 57 57 48 47 48 48 47 47 34 34 25 23 23 18 18 12 12 12 12 12
21 16 28 28 37 39 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 54 57 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 48 57 57 59 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 54 54 54 44 44 43 43 43 48 48 54 68 54 57 54 54 54 59 59 48 42 42 48 48 50 47 57 48 48 48 59 59 59 59 59 57 50 50 48 48 40 39 39 43 43 43
41 31 36 43 59 59 59 47 47 47 43 43 37 37 38 39 39 39 39 39 37 37 39 37 37 43 59 59 59 47 47 34 30 22 19 19 29 34 59 41 34 34 32 32 30 39 39 48 59 48
48 37 37 37 37 37 37 43 41 37 37 44 44 43 41 46 46 39 43 39 43 35 39 39 48 48 46 39 41 39 34 34 30 24 28 37 37 39 41 41 41 47 41 41 37 37 37 37 44 44
37 28 32 20 20 20 32 32 40 46 46 41 39 39 39 31 31 35 36 39 39 39 36 39 43 43 46 46 47 39 39 39 19 11 13 13 19 23 37 39 40 40 41 48 48 48 59 43 37 33
33 24 29 19 18 13 18 15 14 15 24 22 22 25 30 16 14 11 12 23 10 16 19 15 16 16 21 21 11 11 11 22 22 37 20 23 19 19 19 22 37 41 41 28 32 20 20 20 29 32
33 28 24 22 14 10 10 11 19 19 24 19 19 30 28 18 13 13 13 16 16 19 17 19 20 23 22 22 13 12 11 13 15 16 20 19 18 16 9 13 10 10 16 12 14 8 8 8 8 8
8 8 10 9 9 9 9 9 9 10 11 13 11 10 10 9 9 7 8 8 10 11 15 15 14 10 9 12 9 8 8 9 8 8 7 6 8 8 15 12 12 8 8 8 6 8 6 6 6 7
8 8 9 7 7 10 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 9 9 9 10 13 16 22 22 23 10 12 8 8 8 8 8 10 10 11 12 17 12 9 9 9 9 10 11 8 8
8 10 8 8 8 8 10 9 8 7 8 8 8 8 10 12 12 20 13 13 10 9 11 10 8 8 9 11 11 13 13 9 9 9 9 9 10 10 17 10 10 8 11 8 8 8 8 8 10 8
10 8 8 8 8 10 10 15 12 10 8 8 8 8 8 8 6 6 11 12 9 9 8 8 6 6 8 8 11 11 11 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 13
14 9 9 9 9 11 15 10 10 10 7 7 6 6 6 6 9 9 8 8 10 10 8 8 10 10 10 8 8 6 7 10 10 13 18 10 9 10 14 7 8 6 6 10 10 15 10 6 6 8
8 8 8 11 9 11 11 11 10 8 8 8 8 10 8 7 12 6 6 8 8 7 7 7 10 16 8 8 8 9 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 13 10 8 8 8 9 9 9
9 12 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 9 9 9 11 10 10 8 8 8 6 6 6 6 7 7 |