BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-193A05.T7 (MSMg01no193_a05.b1) | MSMg01-193A05.TJ (MSMg01no193_a05.g1) |
ACC | AG382496 | AG382497 |
length | 1,222 | 1,176 |
length of high quality (start - end) | 410 (46 - 455) | 380 (71 - 450) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no193_a05.b1 PHD_FILE: MSMg01no193_a05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no193_a05.g1 PHD_FILE: MSMg01no193_a05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:12 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNGCGGACACTGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAGGATATAGTTCAGAGTGAAGAATATTAATTATCACAACACTGTA
AGAATGCAGTATGATTTCCCTCTACAATGTCTGGAGAAAAAGTCACAAAG
TGATTCTCATAGAATCTTTGAAACTAGGAAGATAAGTAAAGGAAAGACAT
GTCAGACATGGTGTGCAGTGAAGCAATGAATATGTGAGCAGGCATCAGTA
GAAGTACGGACACTGTGTAAAGGGTAAAGGCTGGAGCTTGTTTACCAGTC
AAGGTTAGAGATCACTGGGATGAGGAACAAGAACAATGCATGCTAGACTC
AGCCTTATGCTTTACTCTGAAGAAATTCTTAGAAAGAGGTAATTGAGTTT
GTTTTGCCTTTATGAAGTTTGTGAACTATGGAAGCTTACCTTCTCAAAGT
TCTTTTTTTTTGCGCCCCCTCAAATATCTTTGTAGACATTTAAACAAGGG
TACCTAATAAGTCTGGTATGCATTCAGCTGAAACCCTGAGGACAGGGAAA
TGAATTTATTGTCAGGGATTTATCATGCCATTTCTAGCCTATTGTCTATG
TTTCCTTTTAAGGTCCAGCGATATAGGAAACTCTCTGTTTTCATATCTAC
TAATAACATGATTTTAGTTAGTGCCCTTCTCAGAGAAGATTTTAACCTGT
CTATAGTAAATTAAAATACTATCATCTTTCCCTTTAGGGTATAAATGAAA
TCTTCTGCTGTAATTCCTGCCTTTTGCTGTGTGTGCTTTTCTATCAGATG
CCCTCTTTCTTATAGGAATTTCAGAAAACTAATAATCCCATAATTGCCTG
TTCCTAATGAAAACAGAGGAGAGGAAACTAATATGAAAGCTAAGAAGAAA
GTGTATTTGCCCCCGCCAAAGGCCTAAGGCAATTCATAAAATGGTCTATG
GGAGTTTTGGGGACTGAAAAAGCCAGTTATACCTATTTCCTTTCTGAAAA
CATGGTAGTTTTTTTAAAGGAGCCCTTCCCTCTACCTGTTGTTATTTGAA
GAACTCTTATTTTTTCTCATATATCCTACCTCACACTTTTTTTTCTCTCT
CTCTTATACCCTAAACTTTTTACTATACTTTCTACTACCTTTTCTTCTCG
TTCTATATATTTCCTTCTTCTTTCTCTCATCTATCTCTTTTCTTTCCTCC
TTTCCTTCCTCCATATACTTTG
| NNNCCATGAGGTGTAGCTGGGGCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTGCTGCCCCTGGTATTACACTATCTCTT
TGAGTAAAAGTTAGGTCACTGCCCTTCACAGGAATTTACCATCACTAAGG
AAGAAAGAAGTTTCTGACTGTAGGAGAAACCAGAATAGATATTTAGAATT
ATAACTGAGTTACACCTATATACAGGAATTTACAATGGTTTAGGAAGTAG
ATCGGGCTGTGGTTTTAGAGTATTTCATTATTCATGAGATGGTTAGCTAG
AACAGAACTCCCTAGTTAGAACCATGACTTGGGTGTGAAAGCCCTTGCCC
TAGGAGTGAAAAGTTCTCACACCTGGCTTCTAAGACTATAGCTGACCTTA
GATAGGGCTGCCTCTGTCTCAGTTATTTTATTGCCCAGTTCCTGCCAGTC
TTTGTGTTTTCATTCCTCTGTTCTGTGTAAGAGTCATTAAGAAGGGGGTT
ACCTCATTTGTACCTTGTGGGTATGTGACCCAACTACCTTGTTGTCTTCT
GCATAAAAAGTCTGATGTTCGATTTGAAAAATTACATTCAGATTCCACAC
AAACTCTCCTGTGTGCGTCTGTCTGTCATTCATCCACGCTTTGCCCACCC
GCGTCGAGAGACCCCATTCCACGCAGACACAGGGACCCAGAGGGTCTGCG
GCACTTGGCAGTATCACGAGGATTGAACACCCCTCTTTAATATATGTTGG
TGATTTTTAAAGAATANAATTGCAGTTGTGTGAAGAATTTTATTCTATAT
TCCGTATGAAATCCGTACCTGTTAACAGTAATTAAGATTAGTTGGTGAAA
AAGGTTTCCTTCCTTGGTCTGGTTACTCCGGTTCATTTCCTAAACCTCCT
TCCTGGGAAAAAAGACACCCCCTTTGAAAAAATGTTTCTTTCTCCCTCAT
TGTTTCCCCTTTTTATTTCTGTTCATGCCCTCCCCACGATTACTTTTTAT
CCCTCCTTACCTTTTCCATTAATTAACCCTTTATTTATTTCTTTTCTCCC
TAATCATTTCTTCCCTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTCTCCCTCCACTAA
CATTGCTTTTTTTCTCTCTCCATCTCTCCAATACTGTTTTTTCTCTTTTA
AATTCTCCCTTTCTCTTATTTCTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 10 6 15 14 13 12 10 11 14 12 11 12 14 16 16 16 15 17 17 21 20 29 29 42 30 23 30 30 36 36 48 48 42 42 43 42 46 46
48 48 42 50 47 47 47 47 50 50 50 50 47 47 47 50 50 68 50 50 50 50 50 50 57 57 48 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50
47 48 48 50 57 50 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 46 37 41 41 50 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68
59 59 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59
59 59 59 59 57 43 43 47 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 41 30 30
23 21 21 12 13 15 32 20 22 23 10 10 8 8 8 9 10 10 9 12 11 28 28 59 59 59 59 59 59 59 43 32 32 20 20 18 22 20 12 11 11 9 9 9 9 9 8 11 12 11
11 11 12 16 24 28 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 54 59 57 48 48 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 68 59 59 59 59 59 59 57 57 48 57 48 48 57 54 48 42 42 39 47 35 39 39 40 40 30 37 37 44 44 57 57 57 48 48 48 48
47 47 47 41 41 37 37 32 32 37 37 39 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 37 37 36 37 37 37 37 37 37 32 41 41
41 41 37 37 41 41 47 36 59 35 31 31 39 39 41 37 37 44 43 59 41 44 41 37 43 41 41 41 40 40 39 39 39 43 43 59 43 57 57 36 33 33 28 23 23 21 21 12 13 10
10 10 14 23 41 34 34 28 28 18 17 25 28 37 37 40 32 27 25 23 24 19 15 30 16 15 17 9 9 9 13 15 25 18 10 9 9 11 14 15 15 12 10 10 19 19 22 15 15 9
9 9 15 17 29 11 11 11 12 14 17 17 19 20 29 25 25 22 22 15 10 9 8 8 8 8 10 13 13 22 22 10 10 10 15 17 18 18 15 15 10 10 9 10 10 9 9 9 9 9
10 17 12 10 11 11 16 19 34 21 17 8 8 8 7 9 9 10 21 22 24 18 18 12 10 8 8 8 8 13 10 10 10 17 13 13 9 8 10 8 11 11 8 8 8 8 10 11 13 11
6 7 6 6 6 6 12 12 10 12 13 10 10 10 9 13 13 21 16 19 10 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 12 10 10 8 13 10 10 10 8 7 6 6 8 8 9 15 15 12
11 10 12 12 10 9 9 9 9 9 10 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 10 11 18 11 11 11 12 12 12 14 11 13 13 8 8 8 10 9 9 9 9 9 8
7 8 8 8 8 9 8 8 8 8 15 12 10 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12 12 13 10 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 12 15 8 8 6 6 8 6 7 8 8
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 6 6 6 8 8 11 6 6 6 6 8 6 6 8 10 9 9 10 10 15 10 10 9 9 10 10 10 12 8 6 6 8 8 10 10 10
10 10 12 10 9 8 7 7 8 8 8 8 8 8 10 11 12 8 8 6 6 8 8 11 10 10 10 9 11 10 10 10 11 8 8 10 8 8 8 11 7 8 8 8 9 9 9 11 10 10
9 12 9 9 10 12 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 10 13 6 6 6 7 8 8 10 8 8 8 8 10 12 19 19 19 9 9 12 23 22 28 28 28 30 36 36 36 50 50 37 37 47
47 47 47 53 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 68 68 43 57 47 47 47 47 48 50 50 50 53 53 50 50 41 41 48 48 48 48 57 68 50 50 41 50 42 50 47 57 57 57 57
57 57 50 51 51 51 51 50 68 50 50 50 50 50 51 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 51 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 59 52 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 54 48 44 44 30
30 32 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 28 28 13 15
19 33 18 13 12 19 19 15 12 12 11 12 12 18 19 32 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 43 39 35 35 22 22 12 12 12 12 12 12 12 12 12 13 12 12 16 16 23
34 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 57 57 59 59 57 57
59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57 57 57 44 57 48 48 48 48 48 59 54
57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 43 43 43 43 43 59 47 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 59 59 47 59 47 44 44 44 39 39 37 37 37 37 37
47 47 48 48 39 39 32 37 37 39 39 39 39 47 48 57 57 28 23 11 11 11 21 22 43 40 37 37 32 35 35 39 29 29 32 37 37 37 39 39 30 37 30 39 39 43 43 59 47 47
37 37 37 37 31 31 37 37 39 39 41 37 39 39 39 36 41 41 37 22 15 9 9 12 23 31 47 41 41 41 39 36 34 39 39 41 34 36 36 31 41 41 41 39 41 37 37 34 25 22
21 21 24 24 22 22 30 37 37 37 37 39 31 14 20 3 0 3 10 10 10 17 12 13 13 26 28 31 31 28 34 26 33 30 27 25 27 27 30 37 41 39 30 29 15 14 12 12 12 12
23 21 15 8 8 8 11 15 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 9 11 12 10 10 11 18 16 19 16 19 8 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 9 11 11 10 10 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 14 9 8 8 8 8 9 10 10 10 10 11 10 10 10 9 9 9 8 8 10 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 6 8 6 7 8 10 10
8 8 10 8 9 9 10 10 8 8 8 11 11 9 8 8 10 10 15 12 9 9 8 8 8 8 8 8 14 10 7 8 6 6 6 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 10 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 16 11 11 11 10 10 10 10 8 8 6 7 12 8 8 8 10 10 8 13 8 8 8 10 8 8 9 9 10 13 10 13 12 12 11 9 11 16
10 10 10 19 15 8 8 8 8 8 10 19 12 11 10 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 13 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 9
10 10 10 10 13 10 12 8 8 8 8 8 8 13 11 11 10 11 16 17 13 10 8 6 7 10 11 11 11 17 17 15 12 10 9 7 10 8 8 8 8 8 10 10 13 12 10 8 8 8
9 9 13 12 7 6 10 10 18 13 8 8 8 6 8 10 8 6 6 8 8 13 14 9 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 11 11 11 13 8 8 6 6 6 6 8 8 9 12
15 9 9 8 8 8 10 10 8 7 6 8 8 8 6 6 8 10 10 8 13 6 6 8 8 8 |