BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-193E11.T7 (MSMg01no193_e11.b1) | MSMg01-193E11.TJ (MSMg01no193_e11.g1) |
ACC | AG382649 | AG382650 |
length | 1,244 | 1,227 |
length of high quality (start - end) | 424 (29 - 452) | 328 (71 - 398) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no193_e11.b1 PHD_FILE: MSMg01no193_e11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no193_e11.g1 PHD_FILE: MSMg01no193_e11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGGTCAGTGGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
AAGTAAACAGACATCAGGAATGGATGGAGGGAGTAACTTGGTTGGGGATG
GGACTTTGTGCTTTATGTCCACTCTTTATGTCTTTTACATCCAGTCGAAT
ATCTTAAATCCCATATTTATTAAGAGAGAAAAGGATTATTTTAGGTTAAT
TAGATTAATTCTGATAATTTAAAATTTTTCAAATGCTACAACATTGATAC
AATTCCAATTTCCATATTTACTGAGTAGATAGAGTGCTCTTTATGAACTC
TTAACTCACAGAGTCTGAAGTTAGAACCCTTCTCCAGACAACCACCTCAG
TGAGAGATCTCTAGCATCTCTAGTATCTTCTTATGGAAAAGTTATGTTTT
TCACAACAAGGGAAATAATGAGATAGATGATACTTCTACAGTATTTTTTT
TGCCCCCCCCCTATGAAGTGCAGCCTCTGTAAAAAAAGAGGGGGGGTNCA
TCCTANATTGTGATTAATGTTAAGGCCCAATAAGGTACATATATCAATGA
AAAACATAACTTTGAAAAGTTTTAAATAGAGATTAACTATCTTAGGCTAG
TAGATTATAATAACAATGATCAAATTTTAATGCTATTAACACATTAAAAC
TATAAGCTATAATTCACACTGAATATTTTACATACAATTAAAATATAGAA
TTTTAGTTCAAATTCACAAACACTTAAATAAATATGCTGTAATAAAGTGA
TTTTAAATTAAGAAGAATTAAGACATTATAGGAAAGTTTGAAACCCTGAA
TTAAATTTGAAGTTCTTACATGTTTTTAATATCCCTCTTGAGTTTCTTTA
CTTTTTGGTTCACTTGTAGGATTATAAGCTGAATGTTCCTGGTAAGGGGA
AATTGGTCTTAATATTTCCTGCTTCCACTATGCTTATTAATGTGGTAAAT
TTTTGTATTCTTGTCTTCCTATCCCCAGATTTGTCTCACTCTAGTCTTTT
GTCTTCATTTATCAACATTTCCTTTATCATTGGTCAGGGATACAATTGTT
GTTAAGATGTACCTTATTTAGTATTTCTTTTGTCCTTACGTGCATTGCTT
TTAGGTTTTTCTATATTTTCTCTATTCTCTTCCTTCCTGATTTCCGATTT
ACCTATTTCCTATTTCTTTCCTTCTTCTGTTACCTCTTTACTTCCTATTT
CCTTTCTTTTATTTTTTATATCATTCCATTTCACTCATTACCAT
| NNCCACACACACGGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAACTGAGGAATACCAAATGGTTGAGAAA
AACCTGAAAAAATGTTCACCATCCTGAATCATCAAGAAAATGCAAATCAA
AACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCATTCACCAATGGATAAAAACAAA
AATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGAATGTGGAGAAAGAGGAACATT
CCTCCATTGTTGGTGGAATTGCAAGCATGTACAAATACTCTGGAAATCAG
TCTGGTGGTTCCTCAGAAACTTGGACATAGTACTACCGAAGGATCCCGCA
ATACCTCTCCTGGGCATATATCCAAAATATGTTCCAACCGGTAAGAAGGA
TTTTTGGTCAATTATATTCAGAGCAGCCTTATTTGTAATAGCCAGAATTT
TTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCNNAANAGACCTCCCCCCACAAAAAAAGGG
GGGGGTTTTTTTTNTTTTTTTTCTTCTCTNNTTTTTTTNTTGTTTGNTTT
TTTTTTTTTTCTNNTTCTTTTGCCTGGCCCTGCTGGCCCTCTTCCTGCTC
GCTTTCTCTCCTTCCCCTTCTCCCTCCCCTGCTTNTCCCTCCTTGCTTTC
TCTTCTCTGTTCCTTGTTCTTTCCCCCCCTTCCCCCTCTTCCCTCCTTCT
CTCTTTTTTTTGCTTCTCTCTTTTTCTCTTTCTTCCCCTCCCCTCGTCCC
CTTTTCCCCTTCTCCCTCCTCTCCCCTTTTCCCTTCTGCCCGCCTCTTCC
TCTCCCTCCTTCGCTTCTTCTTTCTCTCTCTCCTCCTCTCTTCCCTCCCC
TCTCCTTTCCTTTTCTTCCCTCGCCTTCCTTCTCTTCTTCCCCCTTTTCT
CTTCCCCTCCTCTTCCTTCCCCCCTCTCTTCTCCTTTTTTCTTTTCTCTT
TTTCTCTTTTCCCTCTTCTCCTTCTTCTTTCCCCTTCTCTTTCTTTTCTT
CCTTTCTTCTTCTCCCTTCTTCTCGCTTCTCTCTTTCTCTCTTCTTTTCC
TTCCTCTCTCTTTTTCTCTCTTCTCCTTTTCCTCTTTTTCCTTTTCCCTC
TCCTCCTTTTTTTTCCTTCTTCTTTCTCTCTCCTCCCTCTCCCTCCTCCC
CTTTCCTCCTTTTCCTTCTCTCCTTCTCCTCCTTCTTCTCTCCTCCGCTC
CTCCTTCTCCTCTTTCTCTCTCTTCCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 15 11 14 17 22 24 14 13 10 8 8 13 15 10 8 8 8 8 8 22 22 37 37 37 34 42 42 42 42 48 48 54 48 50 50 50 43 26 19 11
11 22 21 24 33 33 37 40 68 68 68 68 48 57 48 48 48 48 44 44 48 48 48 48 57 57 68 68 68 68 68 50 50 50 51 51 47 57 57 57 57 42 39 39 43 43 43 44 59 57
57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 37 37 37 50 50 46 46 46 50 50 36 35 35 37 37 50 50 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 33 33 11 11 11 33 33 44 62 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 50 43 35 35 42 43 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59
59 59 59 68 68 57 57 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 28 29 12 12 11 12 12 19 25 33
47 47 50 50 50 48 59 48 48 48 57 57 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 42 27 27 12 12 12 21 25 35 32 25 25
15 17 15 22 20 31 16 18 10 10 9 11 11 19 27 28 46 41 34 24 18 15 12 12 12 12 11 11 11 11 11 15 15 18 15 14 11 10 10 10 11 11 12 12 9 9 3 0 3 21
27 59 27 27 3 0 3 27 29 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 43 47 47 48 48 57 57 47 46 43 43 46 48 48 59 57 57 57 48 48 48 48 48 43
43 39 43 43 43 48 48 48 54 54 59 59 57 57 48 48 46 46 44 44 43 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 47 48 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 54 50 57 48
48 48 50 57 57 57 57 57 48 44 44 47 47 54 59 57 57 48 57 57 48 48 48 48 48 48 32 32 20 18 17 34 32 54 57 48 47 43 43 28 28 15 15 15 32 27 43 43 43 43
43 59 47 48 42 42 42 42 48 57 57 57 57 59 48 48 48 48 48 57 57 43 39 36 37 37 37 37 40 40 40 41 37 39 35 28 28 39 37 25 25 22 22 29 37 47 43 43 43 46
28 32 19 18 13 15 15 21 27 32 29 31 32 32 20 20 20 32 32 32 25 25 25 32 32 22 22 28 31 31 28 30 37 37 33 33 30 30 28 23 21 23 27 26 26 32 37 37 37 31
31 30 29 26 25 25 19 24 24 14 15 20 17 16 10 9 10 15 10 9 11 12 11 11 13 15 19 21 28 28 28 24 28 24 24 24 22 22 17 13 9 9 10 9 12 18 18 13 10 8
6 6 6 8 13 13 18 17 13 8 8 8 8 9 12 21 30 25 23 23 14 12 10 8 11 10 10 8 8 13 15 15 9 9 9 11 12 9 10 10 13 13 14 11 15 9 9 9 13 17
22 28 33 33 19 15 9 8 10 11 12 10 8 8 8 6 10 10 11 10 11 12 22 22 28 28 10 10 8 8 8 11 13 10 10 9 9 9 9 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8
14 21 28 27 17 15 11 12 10 8 8 8 8 8 10 15 13 9 9 9 10 6 11 7 6 8 8 9 9 9 10 9 9 9 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8
8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 13 15 8 8 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 8 6 6 7 6 6 6 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 12 21 15
10 8 8 8 8 8 10 10 15 9 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 7 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 10 12 7 6 8 8 8 8 10 15 10 11 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 7 8 8 8 6 6 8 8 8 12 12 8 8 10 10 10
10 10 12 12 11 11 13 8 10 10 12 11 7 6 8 8 10 10 10 10 8 8 7 7 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 7 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 10 8 8
9 8 8 6 6 8 12 11 10 8 8 6 6 8 8 13 13 8 12 10 10 8 10 8 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6
6 8 8 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 9 8 8 8 8 8 8 13 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 7 8 8 8 13 7 7 7 7 7 7 15 7 8 8 9 10 21 19 37 19 17 9 9 9 9 9 9 22 21
37 42 21 13 15 12 17 22 28 28 36 28 30 34 37 48 39 26 39 37 20 15 8 8 8 10 10 11 23 23 33 33 41 41 47 47 50 50 48 34 30 19 13 13 21 12 15 12 16 13
15 15 26 25 33 37 37 39 41 59 53 53 53 53 53 53 50 57 50 50 50 34 35 23 23 23 21 30 30 22 22 13 15 10 10 10 10 16 25 30 43 46 46 48 37 47 47 50 47 57
57 57 57 57 57 47 48 57 43 43 43 48 48 57 43 54 54 42 42 48 57 54 57 59 68 68 68 68 43 42 21 18 19 13 13 15 23 24 28 30 28 32 24 24 12 11 11 18 26 44
57 59 59 57 47 47 47 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 50 57 57 48 50 50 59 59 59 57 59 59 57 57 52 52 52 52 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 57
57 54 52 52 52 43 43 43 28 22 38 38 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 44 42 35 35 35 42 38 38 23 23 28 43 38 38 27 32 16 16 14 14 16 32 38 32 30 32 33
37 57 57 50 50 50 50 50 57 59 59 59 34 32 14 14 30 34 44 54 47 47 47 44 44 32 32 31 20 20 20 28 32 59 59 57 57 57 57 48 54 54 44 44 44 46 43 43 43 43
46 43 46 48 54 59 59 59 48 40 32 32 28 35 35 39 42 57 57 57 57 57 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 32 34 23 23 23 32 28 43 43 35 35 30 30 20 23 12 9 9
11 14 18 16 12 9 9 11 20 21 37 37 37 41 41 41 37 30 34 28 28 23 32 28 18 17 17 29 32 47 48 59 47 47 35 37 37 47 47 43 40 34 34 23 19 10 10 8 8 8
10 21 28 28 35 32 21 21 11 11 10 12 16 19 19 19 32 36 19 19 3 0 0 3 3 0 3 9 9 8 7 6 6 8 7 11 12 11 9 9 9 10 10 12 16 19 17 12 10 11
10 12 15 15 11 10 10 9 9 9 9 10 3 0 3 14 15 25 19 19 8 10 10 9 9 15 18 10 3 0 0 3 6 6 9 9 9 3 0 3 9 6 6 6 7 3 0 3 9 15
10 10 9 9 9 9 9 9 19 22 16 3 0 0 3 8 8 11 10 11 19 11 11 11 12 18 11 11 11 17 14 12 10 12 10 13 11 11 11 11 10 17 13 19 14 10 8 8 10 8
9 11 11 11 9 7 7 9 8 8 10 10 8 8 8 10 7 7 9 9 9 9 9 10 15 11 6 10 8 8 8 8 9 3 0 3 8 11 10 10 11 11 11 10 10 13 10 10 10 8
10 8 8 8 8 8 10 8 9 8 7 7 7 8 8 8 8 8 13 26 25 22 10 10 10 11 12 15 12 12 12 11 11 11 11 12 12 14 12 15 9 9 10 12 11 12 10 8 10 7
9 12 12 8 8 7 7 9 12 12 12 11 11 12 12 11 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 11 9 9 11 10 11 11 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
11 11 11 10 13 10 10 10 10 8 8 10 10 8 8 10 12 11 11 8 8 6 6 8 8 8 11 12 10 10 8 10 8 7 7 8 10 10 12 12 9 9 9 10 8 8 11 11 13 13
18 18 11 11 10 10 10 13 15 15 15 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 12 10 10 8 8 10 10 12 12 18 11 10 10 10 10 8 10 6 6 8 8 8
8 8 8 8 10 8 10 6 6 6 6 8 10 12 6 6 8 8 15 13 11 9 9 8 8 15 15 8 8 8 10 10 11 12 18 12 9 9 10 10 10 10 8 12 15 15 10 8 6 6
8 10 11 10 10 8 7 6 8 6 7 8 8 10 10 8 8 7 7 12 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 13 10 10 8 8 8 8 13 15 10 8 8 8 8 10
8 10 10 12 12 9 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 11 8 8 6 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 10 10 8 10 10 10 11 11 11 11 12 16 23 12 11 8
8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 9 11 12 8 8 8 7 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 7 7 10 8 9 9 11 11 11 11 10 10 10 10 6
6 8 8 8 8 9 9 10 10 6 6 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 11 10
10 8 8 6 6 6 6 8 8 11 13 8 10 6 6 8 8 7 6 8 10 8 10 8 10 10 10 19 15 19 10 10 11 10 13 8 8 7 6 8 8 13 8 7 7 7 7 8 8 8
8 8 8 8 12 12 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 10 15 12 10 10 9 11 10 10 16 19 18 19 17 11 11 8 8 8 8 8 6 6 6 8
8 10 10 10 10 6 6 8 8 21 8 6 6 8 10 23 13 13 12 8 7 6 8 8 9 9 9 |