| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-207P23.T7 (MSMg01no207_p23.b1) | MSMg01-207P23.TJ (MSMg01no207_p23.g1) |
|---|
| ACC | AG391028 | AG391029 |
|---|
| length | 1,207 | 1,201 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 411 (52 - 462) | 645 (83 - 727) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no207_p23.b1 PHD_FILE: MSMg01no207_p23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:31:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no207_p23.g1 PHD_FILE: MSMg01no207_p23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:31:39 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | plural | no hit data |
|---|
| sequence | GTTATTTNNNNAATTCACTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCCATGCTAATCTGTGCAGCCCTCAGATACTGTCAGAGGAA
ACTCTTCCTGCTTCAATCCGATTCATGATATTAATACCATCTAAAGCTAA
CTTCCTTATTTATTTCATTAAATACTCTCAAATTAATTCTTCTTTAAGTA
TTATTAATTCTTCTTTATGAAAATATCAAATGAAATCACATCACAATGTA
TTTGATTGTATGTCTTGTTTTTAATTTTGGGTGTAGACACTGATTTTACA
CTTCTTAACTGGTACAATAGAAAGAAAACTATTTCTTTTGAGTCATTCTT
TTTTTTTTGATTTTTTTTTTAAAGATTTATTTATTTATTTAAAGTACACT
GTAGCTGTCCTCAGATACTCCAGAAGAGGGAGTCAGATCTCCTTATGGAT
GGTTGTGAGCCTTCTTGTGGCTGCTGGGATTTGAACTCCTGACCTTTAAA
AGAGCAGTCGGGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAGCCCGTTTTT
TGTTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCATGGCTGTCCTAGAACT
CACTCTGTAGAACATTCTTCCTGTCATCTCCACATTAGGACTGACCATTC
GGGAGATGGTAACGAGGACTCGTTTCAGTAAAACTCCAGCACCAATAGCC
CAGCAAAGAACACAGAACTCAGTTACAATATTTATAAGCTGCATGCCTTG
GGCAGATATTCAACTACACTATTCTATTCTTCAGCTTTTAAAACCCTTGC
TACCTGTGGCTTCTCAGGGTCATGTGTTCTTCTCCATCATTCTTCCATCT
CTTCTTCCTCTAACTTCCCCTGCCTCCTTCATCTCCTTCTCTGCCTCTTT
CTTTTTCTGCCTTTGCCCCTTCTAAAATTTCCAGACCCCACCTTTTCCCT
TTTATTGGCCCAATCACAAGAACTGGGGAATTATTTCCAACCAGTTTAAA
ATGGAAAAGAAAGGTTTCACCTGGGGATTATCCGGAAGGAAATTTCCCCC
CTGTTCTCCTGTGGGGAACTCCCCTTCTTGTTTTTAATCCGAAATAAATC
TTTTTTTTTTTTACAAACACCTCCCTCCGCTGGATATTCCACCACATTTT
GTTTATAACCCCCCTTTTGTTTTTAAAAAATAATAAGACATCTTTCTTTT
CTTTTAC
| CATTTATTNNNNAAAATGCATGGAGGCGTGCGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCAGAGAATTCATACAG
GAGAGAGACCTCACAAATGTATTGAATGTGACAAATGCCCTACTGGAAAA
GGCAGTCTGAGAATTCATCAGAGAATGCATACAGGAGAGAAACCTTACAA
GTGTAGTGAATGTGACAAATGCTTTACCCAAAAATCCCATCTTAATATTC
ATCAGGGAATTCATACAGGAGAGAAACCTTACAAATGCAGTGAATGTGAC
AAATGCTTTACCCACAAATCCCATCTTATTAATCATCAGAAAATTCATAC
AGGAGAGAAACCTTCCAAATAGTTTACATGTGACAAATACAATACTCACA
ATGTCAGTCTGAGAAATCATGAATTTTTTCATACAGTAGAGAATATTTAT
AAATGAAGTGAACGATTCTATCCTTTACCAAGATATATCATCTTAAAATT
CATTAGAGAATAGTTAGAGAAGACAAACTTTTCAAATATATTGTAGGTAT
GAATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCCTATTTCCTAGACTGTAACAGTGA
ATACTTACAGGCTAGAAACTTAACTCATGCATTGTATGAAGAAATATCTT
TGACTTCACTTCAGGATAGAGAGAACATCTAAGAACTTTTTAGGGTAAAG
TATTTCTGTTGGGGAAAATGTGGCATATGTTTTATTCATGGTGTCCTGGC
AACACTTGAGGCTCCACACTAGAGAATTAGTGTGATTATGAAAATCTTGT
CAAAACATTCATGCCATGTTCAAATCTTAAATAATGTTAACTATTTATGC
TGTGAGAAACTCTGAAAATGTGAAAATGTACAAAGCTTTTCATGACATCT
TTTTACTTGTTCACCCTCAAATGTTACCAGATGAAAACAAAGTGGGAAGT
CAAAAAAAAGTATTGTGTAACCCTTTCCATTGAAAATGAAAAAAATCCCT
TTCCCAAGGAAAAACTATTTTAAAGGCCTTTTTAAGGCCACCCCCCCAAA
ATATCCTAAAAAAAACTGGAAAAAACTTTCTCGGTAAATATTTAATTTCA
AACGGGCTCCCCCTTTAAACAAAAAGTTTTTTTTCTTTTAAAAAAAAAGT
AACCCTTGGGAAAAATGAGGATCTCCCCCCCACACAAGTGATAATTTTTT
N
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 7 7 7 3 0 0 0 0 3 9 11 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 17 19 20 16 13 10 12 12 19 19 35 28 24 28 28 28 31 33 39
37 37 41 37 37 32 32 26 28 32 29 30 31 28 28 31 30 35 35 36 53 36 35 29 24 18 15 12 11 11 12 12 21 18 29 29 42 42 47 47 42 47 42 42 50 50 53 53 53 53
53 53 53 53 53 53 53 53 36 36 35 35 31 31 31 21 21 8 8 8 8 9 11 10 15 20 25 28 33 33 37 41 39 39 24 21 21 15 15 14 23 23 34 42 43 47 47 47 47 47
47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 48 48 48 50 50 50 50 68 68 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 34 26 17 10 10 10 10 14 19 15 13 13 25
32 36 43 43 43 43 44 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 52 52 52 52 59 59 68 68 59 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57
57 57 59 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57
44 42 35 32 40 36 30 39 35 39 32 31 20 28 36 44 57 68 68 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 50 53 50 53
50 48 59 47 41 28 26 19 8 8 8 8 8 8 10 13 11 12 12 12 12 13 13 19 24 18 30 30 48 50 53 53 59 59 59 48 48 57 48 48 48 43 39 37 32 28 32 23 24 24
12 12 12 15 15 30 41 59 59 59 47 47 43 47 47 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 59 59 59 68 68 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 59 59 68 59 68
59 59 54 54 57 59 59 68 59 59 59 57 57 44 42 42 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 48 57 57 59 57 43 43 43 43 43 44 44 43 43 43 57 57 57
57 47 47 47 50 50 57 57 50 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 57 57 59 54 54 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 54 54 54 44 44 43 46 43 48 48 48 59 42 41
28 27 32 30 37 37 48 41 42 48 48 48 48 48 57 48 48 57 59 59 43 43 41 59 47 47 41 47 43 39 39 39 47 37 37 37 37 37 37 37 32 28 25 30 28 28 34 34 34 28
28 23 24 24 24 25 25 24 21 25 28 31 31 37 43 43 39 39 39 33 19 19 17 17 21 30 32 32 41 59 59 59 39 32 30 26 24 27 32 39 39 41 41 39 32 29 30 32 32 27
26 29 39 34 34 22 19 15 10 10 9 14 14 30 24 29 20 20 20 31 30 32 28 28 28 37 37 47 48 43 37 37 28 28 28 34 34 24 23 16 11 11 19 11 15 19 27 37 32 32
39 39 34 31 39 28 25 19 26 28 24 27 26 16 16 10 13 12 10 11 11 22 22 30 28 20 17 17 17 18 29 39 39 37 37 39 30 21 11 8 8 8 12 9 19 17 24 24 33 33
33 30 37 28 30 28 20 19 22 12 10 10 14 15 25 29 33 33 33 21 20 20 20 19 17 15 12 15 19 20 20 18 22 14 9 10 10 17 15 16 10 10 10 18 10 9 9 16 17 8
10 8 8 8 17 17 16 16 14 9 9 8 8 8 12 10 12 14 14 19 18 22 18 22 26 23 21 14 14 13 13 12 15 10 10 10 18 13 11 11 9 10 12 11 11 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 12 10 19 10 9 8 10 11 10 8 10 8 8 8 8 10 12 12 10 10 9 9 8 7 6 6 6 10 12 9 10 10 10 12 12 11 11 8 12 12 16 12 10
9 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 6 6 6 8 8 8 10 10 12 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 7 12 9 9 12 17 14 8
8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 13 10 11 10 9 8 8 6 7 6 6 8 8 11 12 11 11 9 9 7 8 9 9 12 10 8 8 8 8 6 7 7 7 8 8 10 12
10 12 16 25 24 18 20 19 19 13 10 8 6 6 6 6 7 9 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 9 9 8 9 9 7 7 8 19 13 10
11 11 15 8 8 6 8 6 6 8 7 11 14 13 13 15 10 8 8 8 9 11 13 12 9 9 9 9 10 10 8 10 9 8 9 6 6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 8 11 8 8
8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 9 3 0 0 0 0 3 9 11 8 7 6 6 7 7 7 6 6 6 6 15 6 6 6 6 8 10 8 11 8 8 9 8 8 8 10 10 16 20 17 18 16 26 15
15 8 10 10 18 18 24 29 37 37 32 30 29 35 35 35 36 31 44 39 37 37 37 19 15 10 10 10 10 14 21 16 21 15 25 24 33 37 44 53 50 50 53 53 53 53 53 57 50 47
47 47 42 37 37 36 50 38 36 36 36 36 33 48 41 33 20 19 16 16 10 12 12 21 21 26 28 37 40 37 37 30 28 28 33 23 25 15 15 12 12 13 17 26 27 47 53 59 59 59
59 59 57 54 48 48 48 57 57 48 48 59 57 50 50 47 47 46 48 43 43 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 32 26 15 12 12 16 12 18 24 32 42
42 36 24 21 14 14 14 18 27 32 44 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 34 34 12 11 13 34
27 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 43 44 44 48 44 44 44 28 23 23 32 32 37 39 39 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 44 44 43 43 43 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 30 32 32 30 24 17 13 10 10 11 12 12 12 28 26 36 36 36 32 30 25 25 25 28 34 39 53 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 43 39 39 47 47
47 37 24 23 11 11 11 21 21 34 32 39 36 43 43 48 48 48 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 57 57 59 48 48 48 48 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 47 47 39 43 43 47 47 46 46 30 30 14 14 14 32 32 35 35 35 47 42 43 35 43 43 57
50 54 54 57 57 50 43 37 42 42 57 44 44 33 33 33 44 44 52 52 52 52 52 59 43 43 43 43 43 33 33 33 44 37 37 37 50 43 43 35 33 32 43 43 44 43 37 37 50 46
57 57 54 47 40 40 25 25 21 32 32 14 14 24 32 44 48 44 42 30 32 32 43 43 47 38 38 28 28 21 25 22 32 39 46 44 54 57 57 57 57 47 47 48 59 46 43 43 21 17
10 10 13 21 30 24 24 28 28 29 33 28 33 39 43 43 32 37 32 28 22 30 24 17 17 28 29 22 20 11 11 11 18 12 12 12 21 21 24 24 19 28 28 26 26 31 24 19 18 27
25 18 13 12 9 9 9 19 18 24 19 23 23 28 19 31 17 13 13 15 10 10 10 13 15 26 26 31 23 22 22 28 29 39 25 23 13 15 13 22 22 33 28 24 20 22 16 11 8 8
8 8 8 16 18 22 21 26 26 12 10 10 8 8 10 8 9 9 15 15 18 23 19 22 24 18 17 16 16 15 14 15 13 12 12 13 16 15 25 23 28 18 23 28 34 22 24 16 13 11
11 15 15 12 10 10 10 12 17 20 17 19 19 19 10 9 9 11 9 10 10 22 18 15 10 10 12 17 13 7 6 6 10 8 19 19 17 22 14 24 15 19 21 18 13 12 11 11 11 19
23 29 26 17 21 13 11 10 12 12 16 10 14 9 9 10 10 8 9 11 9 9 9 9 9 12 12 13 10 10 10 10 10 11 9 9 9 9 8 6 6 6 8 6 8 9 13 10 9 8
8 8 8 10 8 10 9 9 9 9 10 10 15 13 9 8 9 10 11 11 10 9 11 11 9 9 9 9 10 10 11 13 12 14 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 12 13 18 9 9 10
13 8 11 9 9 9 12 14 13 10 12 8 8 8 10 10 8 8 8 15 6 6 6 8 12 9 10 10 10 10 19 8 6 6 8 6 9 9 9 9 11 12 16 13 12 11 10 13 9 9
9 9 10 8 8 6 6 8 8 12 9 17 21 16 15 15 11 12 12 10 10 12 10 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 15 27 19 20 11 10 9
8 8 8 8 8 9 10 10 11 14 23 22 28 21 13 11 8 8 6 6 6 10 8 9 9 10 8 8 8 9 10 10 12 10 11 11 11 12 11 13 14 15 16 14 14 13 7 6 6 6
6 8 8 8 6 8 6 6 7 6 10 10 10 9 9 8 9 9 9 10 12 8 8 8 8 13 17 39 28 20 8 9 9 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 17 18 3
0 |
|---|
