BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-211J22.T7 (MSMg01no211_j22.b1) | MSMg01-211J22.TJ (MSMg01no211_j22.g1) |
ACC | AG393271 | AG393272 |
length | 730 | 722 |
length of high quality (start - end) | 322 (45 - 366) | 290 (75 - 364) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_j22.b1 PHD_FILE: MSMg01no211_j22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:36:55 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_j22.g1 PHD_FILE: MSMg01no211_j22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:36:55 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTATGTCCTATAAATATTTGTGATTTCTACACGTCAATTAAAATTTT
AATGGAAATAAAAGACTGATTGAGGCCCATGCAGAATTTACTTGAAAAAA
GACAACACAAAATCTCTTTTTAAAAGGGAACAAAAGTCTAACAATTTAAC
ATTCTCAGATTTAAGTACTGAATCAAAATATATTCTGCATGTATAAAATC
ATGGAATCCTGTGCATTTCAAAGAATATGAGAGAATAAACAAGGATATTA
TCTAAAGAGACAGCAGAGACTAGATCCTGAACACAGGGGCAAAGATTAGC
CTCAGATCTAACTGAATATGTTTAGGCCCGCTCCCACACCATAATGTATG
TGAAACTTCTGTGTCCTACTGGCAGCTTGATATGAAACCTGCTCCTTTGA
ACCTCACTTATAGTGGCCATTAGATCATGACCCTGGACACACAACCCTAA
GCTGTTTCTGTTCATTAGCAGGCAACCCTTTCAGTGTAATTCTGTTGTAT
TGCTCAATAATTTCATTAATTTTTAATTATGACTTGGCCAGCCCTCCAAT
AATTGGGATTTGATCCTATTGATTTATGTAATCTGCTTTAGCACAATTAC
CGAGTAACTATACCTAATATACTTTCTATGATAGACGGGTAGTTTCTCAA
CTGGGATCCCCAATTACTTGCTGTTTGAGC
| TCATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACTTGAGGAATACCGAATGGCAGA
GAAGCACCTGAAAATATGTTCAACACCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAA
TCAAAACACCCCTTAGATTCCACCTCACACCAGTTAGAATGGCTAAGATA
AAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGGAGAAAGAGGAAC
ACTCTTCCATGGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAAT
CATTCTGGCAGTTCCTCAGAAAATTGGATATAGTACTACCGGAGGATCCC
ACAATAACTCTTTGGGGTAAACCCNNAGACAATNGCCCAATCGATAAGAA
GGACACATGGTCCACTATGTTCATAAAAAAAAAAAAAATAATAGCCAGAA
GCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATG
TGGTACATTTACACAAGGAAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAGTT
TATGAAATTCCTAGGCAAATGGTTGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAATG
AGGTAACCCAATCACAAAAGAACTCGCACAACATGTACTCACTGATAAGT
GGATATTAGTCCAGAAATTTAGAATACCCAAGATATAAGATACCATTTGC
TAAACACATGAAACTTAAGCAG
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 14 11 15 23 34 30 33 32 30 27 28 37 37 33 33 33 37 33 33 48 44 35 28 28 28 28 36 57 57 48 43 43 43 43 43 43 48 48 50 48 48 48 47 47 57 42 47
42 42 50 51 57 57 54 54 59 68 68 68 68 59 57 46 43 41 41 41 48 50 50 50 50 50 50 68 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 59
57 57 57 57 57 53 57 57 57 57 57 59 59 57 53 53 41 41 37 37 34 25 21 11 11 11 11 11 23 23 41 43 50 37 41 41 47 53 47 48 50 53 50 50 57 57 57 59 59 50
50 53 53 53 53 68 68 68 68 50 42 42 42 42 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 54 57 57 57 57 54 57 57 50 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 47 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 48 46 36 36 36 36 39 43 42 37 39 39 46 48 59 57 46 46 43 46 48 59 48 53 53 53 53 50 50 50
50 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 30 30 15 13 9 10 9 9 9 19 23 14 14 12 23 17 12 12 11 11 11 9 10 8 8 8 8 8 19 25 59 59 59 47 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 57 59 59 39 35 30 30 18 18 12 12 13 18 33 12 14 14 21 23 34 37 47 47 59 59 59 43 43
37 37 37 43 43 43 48 48 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59 54 59 46 46 46 57 57 57 47 43 43 47 59 57 57 57 57 68 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57
57 47 47 43 47 47 59 57 57 54 54 57 57 57 57 57 43 43 43 47 46 47 48 48 48 48 48 57 57 57 57 44 44 43 46 57 44 43 43 43 57 57 57 54 48 48 48 39 39 39
39 43 37 28 24 14 14 18 28 32 43 42 37 28 23 23 28 28 35 35 43 39 39 28 28 25 25 23 32 31 34 28 30 30 33 31 31 27 22 28 25 28 36 41 36 31 30 30 32 28
32 20 20 23 32 37 43 43 39 39 43 43 43 43 57 43 43 43 40 39 39 35 32 32 31 19 17 12 11 14 23 29 39 39 46 46 43 37 37 28 28 30 32 30 28 32 37 28 18 9
9 9 13 14 24 13 10 10 10 13 13 17 28 18 13 13 13 13 15 19 20 28 28 27 18 17 14 12 14 16 28 19 13 11 11 11 12 13 12 12 12 13 21 32 32 25 25 22 19 19
22 34 30 25 30 23 28 22 36 37 33 37 30 34 34 25 25 25 34 26 26 14 13 12 12 12 15 12 11 11 | Open.Hide. 7 7 10 15 10 8 8 8 8 13 18 27 30 32 37 32 32 44 39 44 41 40 40 40 43 43 48 48 57 50 50 50 39 39 35 37 30 19 19 10 10 11 21 19 9 9 9 15 9 11
10 23 23 41 48 48 48 48 57 35 36 36 36 37 37 59 57 48 33 33 42 42 42 47 53 54 54 54 50 57 68 68 68 42 42 50 50 50 42 50 50 50 48 48 48 57 57 57 57 54
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 68 50 50 50 57 47 47 47 30 23 11 12 12 12 34 34 68 68 68 57 57 50 50 57 57 50 50 57 50 50 50 68 57 57 57 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 57 57
57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 57 57 54 57 57 57 59 57 57 59 47 47 33 33 32 32 43 43 50 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 48 57 48 54 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57
48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 43 48 48 57 44 47 43 37 37 37 37 30 34 21 12 12 12 12 12 19 21 22 32 32 43 43 46 46 46 43 48 48 48 48 48 53 53 57 59
59 59 59 48 47 47 41 37 22 19 8 7 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 9 3 0 0 3 9 9 9 9 6 3 0 3 6 8 17 17 39 41 46 41 39 29 25 18 18 18 30
30 47 47 48 48 48 48 39 43 43 30 30 29 26 36 43 43 43 40 40 59 59 26 17 12 12 12 11 15 11 13 13 13 13 13 11 17 11 21 21 28 28 25 28 28 15 15 12 20 20
23 23 20 24 30 30 43 43 39 40 39 48 40 37 32 30 30 42 42 48 54 57 57 42 39 30 30 42 44 47 48 48 47 47 47 47 47 41 43 37 37 30 42 42 44 44 47 44 43 43
37 37 35 35 42 42 57 57 57 57 57 43 57 46 54 47 57 57 57 57 57 50 43 50 50 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 44 44 37 37 37 44 44 48 57 59
43 43 44 57 46 54 54 57 59 59 59 48 44 36 44 26 26 26 40 44 44 44 30 30 39 44 46 48 47 47 43 48 48 57 48 59 41 32 34 30 30 30 32 32 35 42 42 57 43 43
37 37 30 32 32 43 39 43 39 36 31 34 23 23 22 28 28 33 35 32 27 26 32 28 26 30 14 14 19 24 15 17 17 25 24 25 25 22 22 14 14 13 23 25 33 31 31 28 28 28
33 37 39 39 39 30 30 16 17 17 26 25 28 31 25 28 32 27 26 24 15 15 15 20 26 28 14 16 15 15 15 17 25 25 21 23 19 20 20 21 32 29 31 22 25 19 27 21 12 11
18 15 10 10 8 9 9 22 24 24 18 14 12 13 10 10 11 15 21 24 24 19 |