BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-233J17.T7 (MSMg01no233_j17.b1) | MSMg01-233J17.TJ (MSMg01no233_j17.g1) |
ACC | AG399757 | AG399758 |
length | 717 | 720 |
length of high quality (start - end) | 669 (46 - 714) | 292 (429 - 720) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no233_j17.b1 PHD_FILE: MSMg01no233_j17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:50:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no233_j17.g1 PHD_FILE: MSMg01no233_j17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:50:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCCTAGACCTGATAAGCAGCTTCAATGCAGTTGCTGAATATAAAATT
AACTCAAACAAATCAGTGGCATTTCTCTACACAAAGGACAAACAGGCTGA
GAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCTCAATAGTCACAAATAATATAA
AATACCTTGGTGTGACTCTAACTAAGGAAGTCAAAGTGCAGTATGATAAG
AACTTCAAGTCTTTGAAGAAAGAAATCAAATTAGTTCACAGAAGATGGAA
AGATCTCCCATGCTAATGGATTGGCAGGATTAATATAGTAAACATGACTA
TCTTGCTGAAAGAAATCTACAGAGTCATCAAAATTCCACTCAATACTTAG
AGTAAAAAGGGTAATTTGCATAGGCAGCTGGCGCCTAAAAGATGGCGCCA
GTCTCTGGTACACCATCTCCATAAACAACATCACTGAGCAGGTGCTAGCC
CGTATCTGGCGCCAACCCCTCCTGAGCAGGTGCTTGCTAATTAAAGTACC
AGCAGACTGACCAATCCCAGGAGGACACATAGCCCTCCCCAGTACTGGGG
TGTATATAAGTAGTCCTCCCTGGGTTCCCGGGGTTCCCGTAGCATCGAGG
AGTTCCTGGAGTAAAGCTGTTGAGAAGAATCTGACCGTGTTGCATTTTTC
CTTACCGGACAAGGTGG
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATGATGAGCAAATATAAATATGA
ATAGTTAGGATCTCAAATAGTCTTAATAAACTAAAAGGAAAAAGAAACTT
TGGAAAAGGAAATATAATTTCCATGTTTTCTGATGTAGAAGAGTATTAGT
CTCAGCAATTATAAGTGATCGGTAAGAAGGGCTTAAGAAATGTCACCATC
ATATTACTTAGAAATGCTGGGTACAATACTCAATGACTAACCAAAATCAA
AACGATAGCAGCAACGTTTAAGTAAGGCGTGGAATCTGAGGATCTTCATA
TTGTATGGNCTAACTTGCCCATGCTAGCCTTATGTAAAGAATGCTCATTC
AGAAATAAAGCCTTAATAATCATTGAAATAAATTACAGTAGATCTTTGGA
AACCCTGTTGCATTTCATGTAATGTGGTTGATTAAATAGCTAAGATGGCT
TCTATATTTCATTTTGGTGCATTGTTTTATCAATATCTTACAACGTACGG
CTCATGTAAAGTAGAAATACAATTTATTCACTTGAGAGATGGCTTAGTGC
TTTTTCAGAGGAAGTGAGTTTGCTTGTCAGTATCTCTGTTGGGGATAGCT
TAGATATACCTATTAACTCCATATCTAAAGGATCTGCTCTCTCTTCTGGC
CTGCAAGATCAATCTCACAN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 12 10 11 23 39 37 23 23 21 18 18 32 37 33 33 33 37 33 33 43 48 35 32 32 34 34 35 48 53 53 50 50 57 57 57 57 42 42 32 32 29 42 59 68 68 42
42 42 42 50 50 54 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 57 43 43 35 38 43 43 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 43 39 23 14 13 14 15 16 19 29 43 39 44 39 27 23 39 14 14 14 20 20 27 27 27 35 43 44 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 54 52 52 62 62 62 62 52 52 52 52 62 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57
59 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 57 57 57 54 57 54 54 54 54 48 50 57 59 59 59 59
59 59 59 59 57 50 50 50 50 50 48 48 48 48 41 41 59 47 39 39 39 37 37 37 37 37 37 37 37 59 59 59 43 39 36 41 43 59 47 47 47 46 48 48 48 48 48 48 43 37
37 36 36 37 37 39 39 37 30 37 37 37 37 37 37 41 37 37 30 25 24 34 28 28 28 34 34 31 31 35 37 25 23 13 11 11 25 30 47 59 59 41 41 48 40 41 37 37 37 37
37 29 37 41 37 37 39 37 32 30 25 20 20 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 14 15 8 8 8 8 7 7 9 9 16 19 41 41 47 37 39 44 44 47 47 50 50 50 50 47 41 39 39 39 35 37 37 32 33 33 33 33 33 37 37 39 39 39 50 53 36
36 37 37 37 47 53 53 53 53 53 57 42 42 36 36 36 42 59 57 57 42 42 42 42 50 50 50 47 47 50 50 50 43 47 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 53 53 53 53 53
53 53 53 50 57 57 57 50 53 47 53 41 37 34 32 24 24 25 25 12 12 11 16 16 18 26 34 41 50 50 50 53 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 50
50 57 57 57 68 68 68 68 68 47 43 43 43 43 43 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 59 54
57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 50 51 50 50 50 50 57 57 59 59 59 59 57
57 59 59 59 68 68 68 59 59 54 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 41 32 30 22 21 10 10 10 10 13 19 30 30 47 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 57 50 53 50 50 50 53 59 59 59 59 59
59 30 31 12 12 9 9 3 0 3 9 9 9 9 9 13 11 8 8 7 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 12 16 22 30 41 59 59 59 48 48 48 57 48 57 59 59 59 57 53 53
53 53 53 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 34 30 24 16 16 12 12 12 12 12 12 12 12 13 33 28 41 34 34 34 41 48 43 43 46 43 57 47 48 57 57 48 57 48
53 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 57 59 43 43 43 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 59 68 57 68 68 68 57 57 59 57 57 48 48 48 57 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
57 54 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 54 54 47 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 54 57 57 57 43 43 43 57 57 57 57 57 57 39 47 35 39 39 39 42
47 54 57 57 46 46 43 43 43 47 47 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 57 48 48 48 48 43 59 47 47 47 59 47 44 41 41 41 34 37 30 37 37 37 47 34
36 19 16 15 24 27 37 41 47 47 59 59 59 37 30 30 32 37 37 39 40 41 41 41 44 41 41 37 37 29 30 32 37 37 37 35 36 36 43 43 47 47 47 47 47 41 15 9 8 8
8 17 18 33 28 22 30 22 25 28 33 33 33 40 41 22 15 15 3 0 |