BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-321A07.T7 (MSMg01no321_a07.b1) | MSMg01-321A07.TJ (MSMg01no321_a07.g1) |
ACC | AG440101 | AG440102 |
length | 728 | 755 |
length of high quality (start - end) | 314 (45 - 358) | 521 (70 - 590) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no321_a07.b1 PHD_FILE: MSMg01no321_a07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:03:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no321_a07.g1 PHD_FILE: MSMg01no321_a07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:03:40 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCATCCCAGCTCTAACACCAAAGTCTCTATACGTTCCCTTAACCCAG
CCTCCCTAAAATACTAATAGACCCACCATGTACATTGAGCACTTAACCCT
GAGCACCTTGTAAGTGAGAGCACTTGATAAGGTCGCCACTGCAGCAGGTA
TTAGCCACTGCCGTACGAATGGACAGAGAACTTGGCTAGGTCATGACTCT
GAAAATCTAGCTTCTATGTTTCATAATGAGCAAACTGGGACTGCACATTT
GCCCTCCTGCCTGTTTTGTGACCACCTTACAAGGGACTATTAATTTCTAT
CATTCTTGTTTTTTCTTACCCCCCCACGCACGAACACTGCCTCTAAATAG
TAATTTCTAACCTTTTACGACCATTACAAAAAAATCAAGCAAAAGCTGCA
AAGTATATTTGAGAGTAAGTTCAGAAGTTAGAGTAGGTGTTCTCTCGGAG
GATCACTAAGACTTGGAGCACCTGGAGAAGGCTGCAGACGGAAGCCCTGG
ATGGTTATAGCTCCAGAGCTACATGTATGCTGGAGCTGAGCTCAGTTTGT
GTCTACTTTACTTTCTATTCTAGGGGCTGAGGCAGCCAGGAGTGCAGTGA
TAAATAAAGCTGTTAGCTAACGTGTCAGCACGGAGGTGGGTGGGGTAGTC
CTCTTCCTTTCTGCTTTAAATACAGCAG
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXTTTTCTCGCGGAATTCCTCCTGTCGAAAGGAAATTCAGGAAC
ATGAGTGCAGCAGAGGCTGAAGGAAAGGCCATCCAGAGTCTGCCCTACCT
AGTGATCCATCTGCAGACACCAAACCAAGACACTACTGCTGATGCCAAGA
AGTGCTTGCTGACAGGAGCCTGGTATAGATGTCCCCTGAGAGGTTCTGTC
AGAGCCTGACCAATACAGATGGGGATGCTTGCAGCCAACCACTGGACTGA
GCATGGAGTCCCCAGTGTAGGAGTTAGGGAAAGGACTGAAGAAGCGGAGG
GGTTTGTAACCCCATAGGAAGAACGATAATATCGACCAACCAGAGCCACC
CAGAGCTCCCAGGCACTAAACCACCAACCAAAGAGTATACATGGAGGGAC
CCATGGCTCCAGCTGCACATGTAGCAGAGGATGGCCTTGTCAGGCATTAC
TGAGAGAAGAGGCCCTATGAAGGCTTGATGCCCCAGTGAGGAGAATGCCA
GGGCAGGGAGACAGGAATGGGTGGGTGGGTGGGTGGCTGTACACCCTTTA
ACCGGCAGGTTTACAAGTTGAGCCCATTCTTTTTGCTCCCCCCGTTCTCT
CTTTCTTTTTCCTCCCTTTCCTTCCCGCCCCTTTTCATTTCCCCCCCTTT
CTCTTTCGACCCTCTCTTATACACCCTTATTTCTCTTTTCCTTTCCCCGC
CTCCC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 6 9 9 9 28 34 29 27 24 22 22 25 19 21 22 20 20 20 32 37 29 29 31 31 31 30 25 25 11 11 10 15 15 19 27 20 24 28 26 26 28 34 34 37 36 36
29 29 33 34 32 32 30 39 29 21 13 11 11 12 19 18 14 21 29 31 42 41 39 46 46 46 39 43 43 43 43 46 59 48 48 39 43 39 42 43 48 42 43 43 42 35 33 37 24 32
22 28 32 39 43 46 47 59 47 57 53 53 48 44 40 40 37 23 18 9 9 10 10 10 12 18 28 37 39 39 37 37 37 37 36 36 57 57 57 57 46 46 48 57 44 43 43 43 43 42
42 42 33 33 39 39 46 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 54 54 44 44 48 48 48 50 50 50 50 50 57 59 59 35 35 42 42 43 43 43 43 44 42 43 46 47 57 59 57 68 68
57 48 32 32 20 32 41 43 43 43 33 33 29 44 36 37 36 50 50 57 57 57 52 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57 52 59 59 59 59 59 59 52 52 57 57 57 52 52 52 52 43
44 44 57 57 57 52 52 52 59 52 43 50 50 50 54 57 57 68 59 57 57 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 48 48 57 59 59 68
59 57 57 57 57 57 48 59 59 48 43 46 48 48 44 44 41 41 37 37 30 30 30 29 42 43 48 44 43 48 48 57 48 48 48 48 48 48 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 36 23 24 11 12 12 18 20 22 25 15 15 13 21 18 12 12 12 12 12 10 9 8 8 8 6 6 6 8 10 19 34 41 50 59 59 48 48 48 48 43 44 43 57 59 59 59
59 59 59 41 59 48 48 46 59 47 48 47 59 34 24 10 10 8 8 8 8 10 10 12 12 10 10 9 9 10 16 30 37 39 39 36 37 39 37 37 30 28 24 30 24 30 24 25 24 24
30 32 39 47 43 47 43 54 54 47 47 43 43 43 43 43 48 48 42 42 28 28 23 36 36 43 43 39 42 32 32 30 37 37 37 42 42 42 42 48 57 59 59 59 59 57 54 47 47 47
40 40 35 32 32 42 32 47 42 42 42 43 32 43 35 35 35 43 32 43 32 32 32 32 32 27 32 20 27 23 32 43 43 43 43 35 43 43 57 57 57 57 46 43 43 47 44 44 39 40
44 57 57 39 39 32 36 36 37 37 37 37 44 42 35 35 35 42 42 36 36 23 23 28 37 47 57 46 46 43 43 43 37 37 30 30 23 34 31 23 23 29 29 17 28 32 34 32 23 23
23 37 34 35 17 24 24 37 37 48 43 43 32 32 30 30 30 37 37 37 37 30 25 28 34 30 17 11 8 8 8 10 10 22 20 18 15 13 11 11 18 22 22 24 24 16 16 15 19 23
31 34 34 35 36 35 35 40 39 35 35 35 37 37 35 23 23 15 16 15 15 14 9 15 15 9 9 11 12 19 19 14 14 9 9 9 10 12 18 12 11 11 11 11 11 11 15 11 13 13
21 21 28 28 28 37 37 37 30 24 16 16 15 21 13 13 12 9 9 8 11 11 11 16 12 12 12 12 | Open.Hide. 7 7 8 8 10 8 8 7 7 9 9 13 13 25 25 32 34 32 32 32 41 41 41 43 34 19 10 6 6 6 7 6 8 8 8 10 9 9 10 10 11 11 15 9 15 27 34 36 33 33
28 28 33 27 23 16 9 9 10 12 12 10 9 9 12 15 15 12 10 10 23 27 33 33 46 48 48 37 37 41 34 35 35 39 59 59 59 59 50 53 42 36 23 18 14 29 29 42 36 41
41 42 42 59 59 43 43 40 39 29 29 25 40 32 41 30 41 41 42 32 32 32 44 44 57 57 59 46 43 37 43 43 40 36 28 44 44 44 32 42 42 42 43 43 44 44 50 44 43 43
44 44 50 50 50 50 50 42 43 37 43 43 44 43 43 59 35 43 43 52 52 52 59 57 52 52 52 57 57 52 52 52 43 50 43 52 52 52 52 47 57 57 57 57 57 43 39 57 57 68
57 44 44 42 43 52 59 57 57 57 57 57 52 52 57 57 44 42 35 43 43 44 44 59 59 59 57 57 57 38 38 35 35 43 43 52 43 43 43 62 62 62 38 47 35 43 43 43 30 35
27 43 35 43 35 43 43 62 62 62 52 52 62 62 62 52 52 62 62 68 62 62 62 62 44 44 43 62 62 62 43 43 39 39 31 39 41 43 43 43 39 39 43 44 44 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 39 43 43 39 39 14 13 13 13 13 15 15 28 39 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 47 62 62 43 43 35 35 39 43 43 62 62
62 62 62 62 43 62 43 43 43 43 43 43 35 35 41 27 20 20 35 38 39 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 43 43 57 43 39 43 31 43 43 43 35 35 35 43 38
43 35 43 59 43 43 52 57 38 36 16 15 13 13 13 28 28 43 39 27 27 41 39 43 43 42 52 43 52 52 57 57 57 52 52 52 59 44 43 33 33 43 44 57 57 57 57 57 57 57
57 54 59 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 50 48 48 48 59 59 59 50 43 43 37 37 37 44 44 57 57 44 44 35 35 42 44 44 48 44 44 43 43 43 43 43 47 46 48
28 32 21 21 28 32 32 28 28 23 24 24 28 28 32 44 44 57 57 57 34 34 17 19 19 37 37 46 46 42 42 35 34 28 25 36 37 43 43 39 39 35 33 33 37 37 43 37 37 35
35 35 37 43 37 35 25 25 30 32 32 39 32 28 31 28 32 28 32 32 37 29 32 20 20 20 28 20 26 26 34 30 30 28 30 18 8 8 6 6 8 10 12 9 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 13 10 9 9 9 15 15 10 10 8 8 8 10 8 8 8 9 11 13
8 8 8 8 8 8 8 13 13 14 12 12 10 15 10 15 11 11 11 12 21 22 28 22 22 14 11 12 23 22 20 15 10 8 8 8 8 8 8 9 10 14 19 21 21 13 14 11 14 9
9 9 9 16 6 6 6 6 6 10 8 10 10 9 10 10 18 13 8 8 6 6 8 10 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 10 10 8 8 8 11 17 13 9 10 10
12 14 14 12 9 |