BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-344N16.T7 (MSMg01no344_n16.b1) | MSMg01-344N16.TJ (MSMg01no344_n16.g1) |
ACC | AG457817 | AG457818 |
length | 774 | 792 |
length of high quality (start - end) | 471 (70 - 540) | 283 (69 - 351) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no344_n16.b1 PHD_FILE: MSMg01no344_n16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:35:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no344_n16.g1 PHD_FILE: MSMg01no344_n16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:35:10 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCAACTCATTATTTCGCGGCGCTAAACGACTCACTATTCCGAGAGGATCC
GCGGAATTCAATTATTGCAAGCACTATAGAAATCTATATGGAAGTTACTT
GAAAGCAAAATATAGCATCTGTAATACTCCAAGGTATATTACTGTAAGTC
AAGAATCAAATCATATGGTCATCTGCTCCTCTCTGTTCCAGAGATAACTG
CATCTTCTTGAGCCACCCTTGTCCCTTAGACATAATGGTGATGGCCATCA
GATTTGCCTGTATTGGGCATCTGGTTACCAGAGCTACTGACTCATCTAGC
AAAGCAGAGCTTGTTGCCATCAGTGACCCCTTCATTGACTCCCAACTACA
TGGTCTACATGTTTCAGTATGACACTACCCATGGCAAGTTCAACATCACA
ATGAAGGCTGAGAATGGGAAGCTTGTCATCAATGGGAAGGCCAACATCAT
CTTCCAGAAGTGAGACCCCACTAACATCAAATGGGGTGATGCTGGTGCTG
AGTATACTAAAGAGTCTACTGGCATCTTTACCACAGTGGAAAAGGCCAGG
ACCCCCTTGAAGGATGAAGCCAAAAGAGGAATCATCTCTGCCCCTTATGC
TGATGTCCCCCTTGAATGTGAACGGGTATGAACCCATGAAAACTATGAAA
ACTTCTTTCTAAAATTTCACCTATGGCTTTCCTGTATTACCCACATATTT
TATATACTCCTGAACTCTTGGTTTTCCTTGAACAAATTTGTTTATTTTGG
TTATGACCTCCGAAACTACTTTTG
| CXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXAAACTCTTATTCTGATCACTGAATTCACTTTC
TGACCACTTCTTTCAGACTTCTAACATATTTTTAGTTGCTGCTTAACTGC
TGGAAGATGAGAGGGGCTGCCTTAGCCATTTCTTCATTGACTAGATAACC
AGCCAGGTTACTAAAGGACACAGCATTTCATACAAGCTGAATTAGATTTA
GATTCCCTTTGTAGGATTGAGACACTGGGAAGTCATAGCAAGGCCTGAAT
CACAGGTGTGTTATGGCCGTAGGGTGACCAGCTCTAATCAGATATCAGCT
CCCAGAGTATCCATTGTAATGAAGAGAAAATGAGCCCTGGGTTCCCCGGA
CTGGGTAACTGGTCTCTCCCAACTCTGTTCTCTACCTATATTTATTTTGC
ATCCTGCTCTCCAGAAAGAAATTATGTATCTATTCCTAATCTTGAACTTA
CGTATCTTTTTCTGGCTCATACCGGTACCCCTGTTTTCGATGTATCCTAT
ATCGTATTCTCCCGATTATTTTACATTTCTTATTTATGTTTCTCCTCTGG
CGCACTTCTTATCTAATTATTCTTCCCTTTTCTATTTACACCCCTCCCTC
TTGATAATTCTCTCCTTTTCCTCCTTTTCTCCTAATTTGCTTTTCCTCTC
TTTTACCCCACTATCTCCCTCTCTATATCAATCGATCATCCTTTGCACCT
TTCTTTCATCTTTCTTTCTTTCCCTTTTATCTTACCTTGATN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 9 10 9 6 6 8 7 7 8 8 8 8 10 22 11 14 13 17 9 9 9 17 21 33 22 19 14 12 11 8 6 6 6 6 6 6 9 11 12 12 12 14 19 25 30
34 47 37 19 11 12 19 22 23 25 19 19 8 9 9 9 11 8 8 9 15 23 37 41 41 59 59 48 59 36 38 38 42 50 50 59 57 57 57 57 57 53 50 50 50 57 57 57 68 57
59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 51 57 54 54 57 57 57 57 57 47 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 47 57 57 68 68 68 68
68 57 48 42 42 42 41 46 50 50 50 50 51 68 57 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 54 59 57 68 68 68 68 50 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 59 57 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 47 39 47 59 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 57 52 57 57 68 68 57 57 43 43 35 35 20 35 35 35 39 57 59 59 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 52 52 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 50 43 41 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57
59 59 59 57 47 47 59 59 59 59 48 48 44 57 44 42 30 33 35 44 44 48 47 57 43 47 47 57 57 57 59 59 46 43 43 46 46 46 46 43 43 37 47 39 46 46 59 59 59 57
54 54 48 42 42 36 39 42 32 30 30 43 43 35 35 39 39 57 48 48 48 47 43 48 48 41 37 37 28 28 25 30 17 22 26 43 59 47 47 46 41 37 37 28 28 37 37 43 39 39
37 28 28 23 23 18 21 24 28 28 30 30 24 32 20 20 26 29 27 30 24 24 25 29 28 32 39 41 39 37 37 37 37 21 21 12 13 12 15 19 25 25 12 12 11 12 13 16 19 19
14 12 12 11 9 10 15 18 24 24 19 11 12 14 15 14 11 11 17 10 15 15 18 22 19 16 11 10 8 8 8 8 8 8 8 11 13 19 19 35 35 13 15 11 11 10 12 22 21 19
13 18 11 11 9 12 10 14 17 9 9 10 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 17 17 15 11 10 13 13 13 10 10 9 9 9 9 10 8 8 10 10 9 9 9
9 11 9 10 10 8 8 8 8 8 8 6 9 9 9 10 10 10 9 9 9 9 13 10 8 10 10 9 11 13 13 13 11 13 9 7 6 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 14 11 11
10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 9 10 9 8 8 8 10 10 9 9 8 8 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 15 10 10 12 6 6 6 8 6 8 8 10 12 11 10 10
10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 14 13 13 13 10 11 11 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 15 22 24 32 18 20 20 24 37 41 34 34 19 14 11 12 10 9 9 8 8 8 8 11 18 23 20 31 31 37 33 27 24 17 16 24 32 32 39
28 24 22 16 16 19 19 32 28 22 22 12 10 20 23 32 33 28 30 26 24 41 41 39 41 42 42 42 33 33 36 36 38 33 43 43 39 37 36 32 32 24 40 33 42 42 48 57 57 54
54 54 36 36 32 32 32 41 46 54 54 47 47 47 47 47 47 48 48 54 54 57 54 54 54 57 57 57 48 54 54 57 57 47 42 42 35 42 42 43 43 43 36 44 36 44 32 37 37 36
36 33 26 26 10 10 11 23 23 35 42 33 43 35 43 43 52 52 57 59 59 57 32 24 11 11 11 26 28 57 57 57 57 52 52 52 52 57 52 54 44 44 35 35 35 43 43 52 38 36
17 17 17 34 38 27 31 28 43 43 39 34 27 33 33 33 43 43 35 35 39 29 29 33 43 43 43 43 35 33 33 43 24 24 24 33 39 43 57 37 37 32 38 16 20 20 44 44 43 32
29 29 43 44 57 57 57 52 43 43 28 44 44 29 29 33 43 43 44 43 37 37 32 43 24 43 27 27 25 23 28 27 32 27 29 29 33 33 47 35 35 37 37 42 36 36 28 21 19 17
18 22 32 37 36 41 27 20 20 28 28 42 32 27 9 9 9 9 9 14 12 15 24 24 28 33 24 31 18 18 12 20 11 15 11 11 13 13 20 29 32 42 35 36 37 37 32 24 24 20
28 21 18 12 9 8 10 12 8 8 9 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 13 10 15 13 16 12 18 18 14 10 8 6 6 6 8 21 24 17 17 17 21 24 15 15 11 11 9 8 8
8 10 12 9 9 10 10 10 10 11 9 15 15 23 26 30 24 14 13 12 9 8 8 8 8 10 10 12 12 10 9 11 13 11 16 16 24 16 16 15 22 18 18 9 8 8 10 8 8 9
9 10 17 30 30 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 19 8 12 6 6 8 6 12 12 12 21 15 9 9 9 9 9 10 19 19 13 10 10 15 8 8 8 8 8 8 14 17 10
8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 13 8 6 9 7 10 10 10 10 10 10 10 12 13 14 19 14 14 10 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 8 8
8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 9 11 11 12 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 12 14 13 12 10 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8
6 7 8 8 9 10 12 8 8 9 9 11 12 16 16 12 11 10 8 8 8 8 9 10 11 12 12 12 19 17 10 9 9 9 9 10 10 8 9 9 9 11 13 12 12 11 10 11 11 11
8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 10 10 9 14 15 15 24 10 11 9 11 11 14 15 11 10 10 15 15 14 14 14 16 16 10 10 9 10 9 9 9 11
10 8 11 8 8 8 8 12 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 11 11 9 9 8 6 8 6 7 10 8 11 11 8 8 8 10
10 8 10 8 8 8 8 8 8 12 12 11 9 9 10 15 15 13 9 9 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 3 0 |