BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-352L22.T7 (MSMg01no352_l22.b1) | MSMg01-352L22.TJ (MSMg01no352_l22.g1) |
ACC | AG463796 | AG463797 |
length | 803 | 802 |
length of high quality (start - end) | 408 (48 - 455) | 373 (77 - 449) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no352_l22.b1 PHD_FILE: MSMg01no352_l22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:45:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no352_l22.g1 PHD_FILE: MSMg01no352_l22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:45:24 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | AATCAATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCCAATGTTTTCTTCGTTAAACAGTTGATGCAACCTGGCTACTGA
CAACAGTTAGGATTCTGAGGTCAGTGCTATCTGTTTAAAGGTTGAAGACT
TTTGGGAGGCTACAGCTATTAGCTTAGCCTTGGCAGATTTTTCTTGATAA
TCTTTTTTCTTTTTAATTTTCTTTTTTTTTATTATGTATTTTCCTCAATT
ACATTTCCAACGCTATCCCAAAAGTTCCCCATACCCTCCCCCCAATTCCC
CTACCCACCCATTCCCACTTTTCGGCCCTGGCGTTTCCCTGTATTGGGGC
ATATAAAGTTTGCCTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCTTACC
AGGCCATCTTTTGTTACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTATT
GGTTAGTTCATAATGTGGTTGCACCTACCGGGGTGCAGATATCTTTAGCT
CCCTGGTTACTTTCTCTAGATCCTCCCTTGTTGGCCCCGCGACCCTCCCA
TTATCTGATCGTGAGCCTCCCCTTCTCGGTTTGTAATTCCTGTCTTATTT
TTTCCCAATACTGTCTCTTTTTTTCCCCTTTCCCCTTCCCCCCTTTTTTC
TTTGTGCCCTCTCCATTTATTGTTTTCCCTCCTTTGTCCCTTCTTCCTCT
CTTTCTTTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTCCCCCCCCCCTTTTTTTTCTTCT
TCCTTCTTCTCTTCTTACCCCTTCTGTCCCCCTTCTCTACCCTTACCCTT
CCC
| NCCGATGATATGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCA
GAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCA
AATCAAAACAACCCTAAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGA
TCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGA
ACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAA
ATCCGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATC
CAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAG
AAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCATTATTTATAATAGCCAG
AAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCTTCAGAGGAATGGATACTTAAAA
TGTGGTTCCTCTACTCCATGGAGGACCACTCCCCTTACTTAAAGAAAGAA
TTCTTGTAATTTCTACACCTAACGGAGGGACCTGGAGGGGTCCTTCTCTG
ATGGGCGCCACCTTTCTTATTGGTTTTTTCTTTTTGTTTCCCCGGCTTTT
TGGCATTTATTCCCCCTTTACCGATCCTTGACTACTTATCTTCTCTTTTA
TCCTTGTTCTCGCTTCCTCACATATTTCTGGTCCTTTTCTCCCCCCCCCC
CTTTTTTTTTTATCCCCCTTTCCTTTCCTTACCCCTATTCCTCGTCTTTT
CG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 9 9 9 9 9 11 26 24 21 21 22 19 19 29 37 30 28 25 32 25 30 39 40 28 26 28 28 28 29 23 15 9 9 9 9 9 9 9 13 15 14 12 12 19 30 47
47 35 35 30 30 36 30 20 18 18 27 37 59 27 17 8 8 8 8 8 11 11 15 27 27 31 31 31 31 32 33 38 38 42 42 42 50 57 50 57 57 59 57 57 57 57 57 57 47 47
47 42 50 50 54 54 54 59 59 50 68 50 50 51 50 50 50 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 59 59 57 59 59 52 57 57 52 57 59 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 59 57 57
57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 59 59 57 57 42 44 24 34 30 24 20 28 41 44 59 59 59 59 48 48 43 43 43 57 59 59 59 59 59 57
59 57 59 57 57 59 59 48 48 47 59 39 43 39 43 39 37 37 39 37 41 41 37 37 41 43 47 59 59 59 47 48 48 47 47 32 32 28 37 28 39 31 34 23 18 18 28 21 23 28
28 34 35 31 24 30 25 37 37 46 43 43 35 30 28 34 31 36 39 39 30 27 18 18 19 19 32 32 37 37 18 14 9 9 9 16 20 32 31 31 34 28 28 18 18 21 21 23 32 24
25 16 16 16 23 28 22 19 12 12 10 15 15 13 9 8 14 14 15 15 26 17 11 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 11 12 17 11 16 11 11 11 12 12 22 15 10 9 9
8 8 13 13 11 9 10 10 10 11 9 10 14 9 9 9 8 6 6 6 8 6 9 10 10 12 11 8 10 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 8 6
8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 10 8 11 10 10 10 8 7 6 10 8 9 9 14 20 9 9 8 8 8 8 9
10 13 13 14 15 11 10 10 10 7 7 7 6 6 8 8 9 10 10 16 15 24 24 25 23 22 15 18 18 30 30 37 20 15 12 9 8 8 8 10 12 22 10 10 10 17 15 13 8 10
8 8 8 8 6 7 8 10 10 19 17 16 10 8 8 8 15 8 10 8 8 8 8 8 18 21 22 24 15 17 10 10 8 10 7 6 8 8 11 8 8 8 12 12 16 21 10 8 8 8
6 6 13 6 10 10 17 12 9 8 8 13 8 10 10 15 24 19 14 14 10 12 8 8 10 13 14 30 28 27 22 21 15 15 13 10 9 9 14 16 20 25 15 12 8 10 10 13 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 21 19 16 10 8 6 6 6 8 8 9 10 10 8 8 8 9 15 9 9 9 10 8 10 7 7 10 10 10 13 15 13 10 8 8 8 8 8 9 9
9 13 10 | Open.Hide. 0 3 6 6 10 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 22 22 43 30 31 37 31 30 30 25 37 31 34 43 41 27 21 11 22 22 28 28 30 30 30 37 29 39 39 39 39 37 37
37 37 37 37 39 50 50 53 53 53 53 26 29 24 24 29 29 39 47 43 40 47 40 40 42 47 50 48 54 48 47 53 68 68 68 42 43 43 43 43 43 54 68 68 68 54 57 68 68 68
68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50
50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 57 57 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 54 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 43 47 44 57 57 57 57 57 57 57 57 40 40 39 44 40 42 28 42 42 43 42 47 43 39 39 43 41 44 30 30 30 40 40
42 32 30 30 30 30 30 42 37 42 32 32 32 42 39 43 43 48 43 43 43 36 36 40 40 40 43 36 29 36 25 25 22 35 30 43 39 39 32 31 28 34 25 32 29 22 19 12 15 15
24 18 17 17 24 16 11 12 12 15 14 20 18 18 15 19 24 26 15 17 11 10 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 21 17 17 17 15 18 17 15 18 10 12 7 6 8 8 15 9 8
8 9 10 9 9 9 9 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 13 17 17 18 21 10 10 10 8 8 8 10 19 24 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8
8 10 8 9 9 9 9 9 16 21 10 10 8 8 6 6 7 6 8 8 18 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 10 11 11 12 8 8 8 8 6 6 7 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 9 10 9 9 10 9 12 10 10 10 10 12 14 14 15 13 19 9 9 9 8 9 10 10 19
13 11 8 8 8 8 11 8 8 8 13 13 9 9 10 10 8 10 6 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 12 11 9 9 10 14 10 13 8 8
8 8 8 8 11 11 11 13 6 6 6 6 6 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 13 8 9 9 9 10 19 23 32 20 20 19 15 10 9
12 16 19 28 24 24 15 16 24 21 10 10 10 14 11 17 28 28 27 30 26 21 17 13 15 12 11 11 11 11 12 12 10 7 10 6 6 6 6 8 8 10 8 9 9 13 12 19 10 10
7 7 |