| Query= MSMg01no367_p04.g1 MSMg01no367_p04.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no367_p04.g1 PHD_FILE: MSMg01no367_p04.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 23:05:15 2005
(176 letters)
>mm_chr4_28002299_28002874
Length = 576
Score = 288 bits (149), Expect = 1e-82
Identities = 158/165 (95%), Gaps = 7/165 (4%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 cacttctctgctgatgagcaatttcaaacagttttcagggtaagagacttttttcccttc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 201 cacttctctgctgatgagcaatttcaaacagttttcagggtaagagacttttttcccttc 260
Query: 61 atatgttctcatatttttcccttctttatcaccacaagcaataacttttag-------gt 113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 261 atatgttctcatatttttcccttctttatcaccacaagcaataacttttagcttttaggt 320
Query: 114 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 158
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 365
Score = 87.7 bits (45), Expect = 4e-22
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 127 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 87.7 bits (45), Expect = 4e-22
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 125 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 87.7 bits (45), Expect = 4e-22
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 123 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 167
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 87.7 bits (45), Expect = 4e-22
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 121 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 165
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 87.7 bits (45), Expect = 4e-22
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 119 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 87.7 bits (45), Expect = 4e-22
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 117 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 161
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 87.7 bits (45), Expect = 4e-22
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 115 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 159
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 85.8 bits (44), Expect = 1e-21
Identities = 44/44 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 114 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 321
Score = 85.8 bits (44), Expect = 1e-21
Identities = 44/44 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 322
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 113
Number of extensions: 50
Number of successful extensions: 50
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 35
Number of HSP's successfully gapped: 14
Length of query: 176
Length of database: 576
Length adjustment: 8
Effective length of query: 168
Effective length of database: 568
Effective search space: 95424
Effective search space used: 95424
X1: 7 (13.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 7 (14.4 bits)
S2: 7 (14.3 bits)
|