BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-401F14.T7 (MSMg01no401_f14.b1) | MSMg01-401F14.TJ (MSMg01no401_f14.g1) |
ACC | AG500756 | AG500757 |
length | 739 | 740 |
length of high quality (start - end) | 219 (324 - 542) | 537 (80 - 616) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no401_f14.b1 PHD_FILE: MSMg01no401_f14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:14:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no401_f14.g1 PHD_FILE: MSMg01no401_f14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:14:57 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (54,774,305 - 54,774,523) | (54,986,255 - 54,986,791) |
---|
sequence | NTTTCTATATTTGTTACGNNAAANGAGNCACTATTCCAATACCACCGNGG
AANCANAATATTTCGGAGACCAGTCTGGCCCTTCACATGAAAGTCCCACT
TGGGATTTCTCCTGTAATGAGAGGAATTCCCCATAGACCGCCTTGATTAC
TTTTTCCTGTGGAATCAGACAAGCCTCTTCAAAATCTCCATACACACATG
GCTCCACTGTGAGTGGCTTTAACATCTGAACTGGACTTCATCCGTCTCTA
GGAGCAAAGAGTGTAAATTAATGCCTCACATAGTGTTCATAACATTCATT
CATTTGCCAAGTCAACTTTTGTCCTGACTTCACCAAGCATGTGGTGACTG
CAGGGAGCAGACAGACTTGGCACAGGCCAGAGGTGGGTGTGGCAGCAGAT
TTTCCTACAGAGTAAAGAAATGCTTTGTTTTTAAAATGGGTTTTCAATTC
TTAGGATGTTTCCGAACTTTGAGAAGAACCGACCCTTGTGAAAGAATAAC
ATGATAAGAGCCTGGGGTCGCCTTCTCTTCCTGTCTCAATGCAGAGACAG
GAAGATGGCCTTGGTGGGTCTTATTAGAGACTTGCAATCAAATACAGTCT
CTGCATGAAATATGTCACATTTTAGCCTGACCTACACTGGAAGCAGCCTG
TATGTGTTCCACTCTGAGACCAGCCATATCCTCAGACGATATGAGGAAGT
TCAGCCCCACACCTAATTAAGGTCCACTATAATATACAT
| TCCCGATGCTAGNGGNAGGNCAGGCGGNCGCCTGTTTCAACAATTTAGGN
GACCTATAGAATTTTCCGTGAAATTCAGNAGCTGGCTTATGAGAACACTC
CAGAGAAAGCAGGCAAACTAGACAGCGTGTAGGAATGGTCTCTAAGAAGA
TGGAAGGCAACAGGGAGCTGGGGAATCCTCAACAACAACGTACAAAGAGC
TCATCCTGTTAGCTGATAAAAAGCCCACGGTGAAGGCCATTACGGGTTCA
AACCACTACTTACCCTGGATAAGTCACAGGGACAAGCTATTCCCAATCAG
TTCCTGCTTCCTGATTAAATTTTTTTTTTCTCACTTTCAACCTCTGGAAG
TGGACTGTCTCCAAGAACATCAAGTGAGAAGGTGTTTAGCTAGGGAGTCA
ATCTGATTTTAAAAGGGACAACAACCGTGGGGACGTGCCACCTCCTGCCA
TTTATCTTCTCCCACCCACTCAGCCTTCTCTGCTTGATCTTTACTCCCTT
CCAACAAGCCCAGACAAAGCACAGAATCCTCCAAATGAAGCTCCAGGCAG
TCTCCACCAATCAATCAAAACTGGCATGAGCAATAGAAGCTCTCTGCCAA
CACAGTTGACGTGGAGTAAGCATGGATCACCAAGGCAGAAAAGTGCAATT
GCAGTTCCGGTTTCCCTGCCTGACTTTCCTACACTGTGGACTTTGGACCA
ATCACCTTTAAGCCTTTGCAGAGCTGTAAGCAAACTGAAG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 8 8 8 12 17 11 11 8 8 8 10 3 0 0 3 17 3 0 3 9 3 0 3 10 13 8 6 6 8 8 7 7 6 6 6 6 6 8 11 11 3 0 3 23
16 3 0 3 3 0 3 23 9 9 9 11 11 9 9 9 9 11 11 15 13 10 10 10 18 24 27 33 44 59 59 44 53 50 50 50 37 37 47 53 48 48 48 48 57 48 48 54 54 48
59 54 42 42 28 42 42 50 57 57 57 57 32 30 15 14 14 15 17 10 13 13 15 25 29 41 41 41 41 57 57 54 46 57 44 37 44 37 37 37 43 43 57 42 50 46 46 46 50 57
68 68 57 59 57 57 57 57 43 43 35 35 42 42 50 50 50 43 35 35 35 37 43 50 52 59 59 57 57 54 54 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57
68 38 38 26 15 20 38 41 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 32 32 32 18
13 13 18 26 44 48 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57
48 48 57 57 59 53 48 50 50 50 32 27 15 12 11 12 11 12 12 12 12 11 12 12 21 28 36 47 41 41 43 37 37 43 47 59 57 48 48 48 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59
59 59 43 43 32 30 28 24 20 20 20 32 37 48 59 59 57 57 48 48 47 47 47 46 43 43 37 32 30 25 25 36 36 32 42 39 43 44 42 42 43 43 44 44 44 44 44 48 47 59
44 57 48 48 50 50 50 57 48 43 43 35 35 35 43 43 47 44 50 47 47 47 50 50 50 50 43 43 43 57 57 59 48 48 48 47 44 44 44 44 48 57 57 57 54 54 54 54 54 59
59 59 44 44 25 32 36 32 32 37 59 59 43 43 43 47 48 59 48 42 39 30 30 37 41 43 39 42 39 39 42 39 39 33 33 33 33 40 33 43 43 43 39 39 40 43 43 43 43 40
40 43 43 36 37 37 35 33 28 27 22 25 29 31 26 30 30 23 28 23 23 28 32 39 43 43 35 35 30 37 32 32 31 31 34 28 28 24 24 24 23 18 11 11 12 18 19 20 20 22
23 30 28 21 24 24 16 22 18 20 28 22 15 15 10 10 10 12 21 30 32 39 41 23 23 11 11 11 16 14 20 22 22 20 16 10 8 8 8 11 11 30 25 28 21 22 14 14 19 24
28 28 33 39 34 32 34 24 28 36 37 33 33 24 24 15 15 15 23 21 29 25 19 9 9 9 14 16 27 28 24 22 30 28 23 23 19 24 15 15 14 14 19 12 10 10 9 9 13 19
11 11 8 8 8 8 8 8 10 15 13 19 14 14 15 20 11 11 11 11 11 11 18 12 12 10 8 8 8 8 8 8 9 9 11 13 12 11 8 10 8 8 8 8 16 13 14 12 11 10
10 9 9 9 11 10 9 10 10 10 10 10 11 11 11 12 10 10 10 10 9 8 10 10 9 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 12 3 0 3 10 12 18 18 17 3 0 3 23 16 13 15 10 11 15 11 9 7 7 7 8 8 10 12 14 11 11 3 0
3 12 12 14 25 22 37 23 21 9 9 9 12 12 14 14 9 9 9 9 8 8 9 11 14 14 15 3 0 3 25 25 44 47 47 50 50 50 50 53 53 57 59 36 36 36 30 28 29 28
28 26 30 29 59 44 37 37 41 41 41 41 41 37 30 25 22 23 24 15 15 23 17 17 25 28 34 36 59 59 47 48 31 35 35 35 35 35 48 48 50 50 48 57 59 59 59 27 27 22
31 22 42 43 54 57 54 48 43 47 39 39 39 35 37 42 42 54 57 57 48 48 29 29 30 41 41 40 59 57 54 57 57 57 46 48 48 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 47 47 57 57 50 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 43 38 30
24 18 21 20 23 23 32 44 59 59 59 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 59 48 48 48 59 59 54 50 50 50 50 50 54 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57
57 57 57 59 59 59 59 50 59 59 50 50 50 42 34 28 13 10 9 9 10 18 11 10 10 11 14 24 36 47 59 50 50 50 50 53 53 50 50 50 47 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 68 57 57 48 47 43 43 36 36 43 43 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 48 48 48
57 57 57 57 57 57 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 59 57 52 52 52 50 50 59 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 59 59 68 59 59 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 48
50 48 48 48 48 57 47 47 47 47 47 47 42 43 36 36 37 59 59 54 54 54 54 54 43 48 43 48 48 47 43 43 40 40 43 43 50 57 57 57 43 39 39 35 35 35 39 41 59 47
47 37 43 43 41 41 31 36 41 41 41 41 46 41 41 48 48 48 48 48 48 47 59 43 43 43 43 47 43 43 43 43 42 37 37 18 18 21 20 21 13 19 19 28 28 28 28 28 25 28
34 39 43 47 37 37 30 37 37 33 28 22 22 14 16 18 17 18 20 28 28 19 18 14 11 10 12 13 13 21 15 18 18 32 30 25 13 13 10 19 18 16 13 13 12 19 13 18 18 22
30 25 25 12 15 10 14 14 15 14 14 15 12 12 20 15 15 10 10 10 18 23 30 27 25 25 29 31 24 24 21 14 14 14 30 15 20 18 28 28 35 35 37 28 7 7 6 6 6 10
14 18 15 14 9 15 10 23 18 20 18 19 24 23 21 19 12 10 8 10 8 9 12 10 8 8 10 8 12 8 8 8 9 8 10 10 14 17 18 18 |