BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-402P17.T7 (MSMg01no402_p17.b1) | MSMg01-402P17.TJ (MSMg01no402_p17.g1) |
ACC | AG502001 | AG502002 |
length | 747 | 774 |
length of high quality (start - end) | 244 (72 - 315) | 213 (69 - 281) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no402_p17.b1 PHD_FILE: MSMg01no402_p17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:17:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no402_p17.g1 PHD_FILE: MSMg01no402_p17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:17:05 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (138,660,891 - 138,661,133) | (138,849,738 - 138,849,935) |
---|
sequence | TATTTAAATTTGTGGCCGCTATACGACTACTAATGCGAGAGGACCGCGGA
ATTCTGTGATTTCCAAGAATGGATTCTGTCCTTACTTTGACGTATTTTCC
ATGTAGAAGATACGGAGCCTGAAAGTCATGCTGACAGTTGGAGTAGGCCA
TTCCCAATCCCACGCCAGAACCAAAGGCTAATGGCCACATTCTTCCTATG
AGCAGAAAACAAGAAATCCCAACAGGGAACTGTTAAGAGCACATAAATCC
TCCGCCCCAGATGTGTGCCCAGCAAACATTATATTGCTAACACGTGATGG
GTCAGCAGACACCATTTTTATCCAGCACATTTATTAGGTGCCTGGGCTGC
TACATTTGATGCAAAGAGCCCAGTCTGTCATTTGTGCACTGAACTATATA
GTCTTAGCCTCGTCAGAGGAACATCTATTGGTCAGGTGCCTGAATTGTTT
ATTATTAATGTCAATTTACGAATACTCACCAACTTTGGTTACTCACAGAA
CACCATGGGGCTCCCTCACACAAGTCTACATCCCTCTAGTTCCAGTCATT
GTCAGTTTTTCATGAACTGAGGTCAAGGTGACCTGTTTGGGTTTTATTCC
GAACTCATATTTTCAAGTTCTTCCCAAGAAGGCGATCCTGTTTGTTCCCC
CCTCATTATTTCAACGGAGACACATGGCCCCTTTTCTTGGCCCTCTTTGC
GCTTTACTAATCATGTATGCGTCCCTTCCCCCATGTCCACTTTTTAN
| CTCATTGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTTTCCCCCGGAATTCTTTGAGTGTGCCCATCACCAGTCTG
TCACTGCCGTTCCTTGTATGGCAGGGAAGAGGCACTACCACATAGGTATG
GCATCAAGGCTAGGGAGTGGTGTGAAGAAAAGATTGTCCTGGGCATCGAA
AGCCTGAGTCTATTCCAATTCCACCCTCTGCTGAGGCTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCCACAGGCCCTGCCTT
GAATTCCTTGGCCACTGTTTTATTGAATGAGGAACTCTTGAGTCAGGAAG
TCTAGGGAGGATCTCACAGCTTGTAGTCTCCATGTACTAGATCTGAATAT
TTTCGTTACCGGTTTATTTTAATCCTTTACATATTTCTGACCTATGCTCT
TCTGCCTACGGGTTTCCTATACCTGCCTCCTCCTTGTTTTTCTGAACGCT
ACTCCATCAATCACTATAGTTTCCGCGGTCATTTGTTATCATCCTGATTT
TTTCTCCTTTATGAACCCAATCATTCTTTTTTTCTTTTACCTCTCACTCG
CCTCTTTTTTTCCTCCCCTATCATACTCCCTTTCCCTCCCCCGTCTTCTG
TCTGCCGCTAAATATCCCTCCCTGTATTCCTCCCCGTTACCCTCCCTGCC
TTTCTCCTTTCTCCTCTCCCCTTCCCTCTCTTCTTTTTCTTATCCTTCCC
CCTATCCTTCTTCTCATTCTTTTN
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 11 10 9 10 10 12 11 12 15 10 10 10 22 23 30 28 28 28 28 28 28 37 19 19 9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 9 11 11 10 10 10 11 18 17 30 41 31 31
31 31 31 31 36 27 13 9 9 6 7 7 7 6 6 9 11 11 13 17 9 15 23 29 31 33 48 53 50 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 42 42 40
40 41 42 57 57 54 54 50 32 43 37 37 32 32 32 32 28 43 28 36 37 30 36 43 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 57
57 57 50 50 48 57 57 44 44 44 43 46 57 57 57 52 52 38 38 38 41 52 52 52 52 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57
57 50 37 37 39 59 50 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 57 50 50 48 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 59 44 42 32 27 27 20 28 28
42 44 47 59 59 54 47 46 37 37 37 46 57 46 59 59 59 59 48 47 43 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 47 48 48 43 43 30 29
17 17 17 29 29 35 35 35 28 23 18 11 11 11 11 11 17 17 9 9 9 15 12 15 19 30 34 47 48 59 48 48 48 34 36 28 28 43 43 43 44 43 43 43 47 43 43 43 59 59
59 59 57 57 48 59 46 48 43 39 39 35 35 28 28 23 23 25 28 37 37 32 30 32 29 30 17 17 17 32 32 57 57 42 42 37 37 32 42 32 42 28 28 28 37 37 47 47 44 40
28 28 24 32 21 12 12 12 19 28 32 33 37 46 40 40 25 25 24 33 33 42 42 42 48 48 59 46 43 34 23 23 12 10 10 15 17 10 10 12 25 24 28 34 24 24 19 19 19 33
34 39 39 39 39 35 28 28 28 22 22 31 31 26 26 19 16 16 12 10 10 19 23 33 42 43 48 39 39 24 24 20 20 20 32 27 28 22 34 34 29 26 20 11 11 11 11 10 9 9
9 10 12 12 22 24 25 21 22 23 28 28 26 31 28 28 28 28 18 16 10 10 10 13 18 28 32 37 29 30 17 24 24 28 22 28 31 34 28 28 13 14 11 12 12 12 17 19 18 24
15 10 8 8 8 10 10 27 23 22 23 23 16 18 13 13 13 16 20 11 11 12 10 6 6 6 6 8 6 8 13 19 15 13 9 9 10 10 9 9 9 9 15 15 12 11 8 8 8 8
8 8 10 9 11 11 10 10 11 19 13 15 9 9 9 9 10 24 21 11 11 12 14 19 9 9 8 8 8 12 10 10 10 11 12 12 11 11 13 13 10 17 17 8 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 6 9 10 8 14 9 9 9 6 8 6 6 10 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 13 13 14 14 18 30 28 26 15 12 12 10 14 9 10 10 10 10 6 8 6
6 8 8 11 11 8 10 10 16 15 12 10 9 9 7 7 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 10 15 15 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 10 14 11 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 11 10 6 6 8 8 10 10 9 9 9 11 23 23 59 39 39 29 26 32 32 34 27 31 32 37 23 23 9 9 9 9 9 9 9 9 11 14 14 23 23 23 16 16 25 23 11
11 11 23 23 59 41 27 23 9 12 8 8 6 8 6 8 12 15 22 17 28 33 33 39 41 50 53 48 53 50 50 50 53 53 50 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 53 48 57 59 54
54 54 54 48 50 57 57 59 68 68 68 68 59 59 57 54 47 47 47 57 57 57 57 48 47 47 50 19 19 9 9 9 9 24 24 57 57 57 48 48 48 47 47 57 59 57 57 57 57 57
54 54 43 44 35 35 35 44 44 50 47 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 54 54 59 59 59 50 50 50 50 50 50 59 59 57 57 52 59 57 57 57 57 52 50 48 57
57 57 57 54 57 57 50 50 54 57 59 59 59 57 46 43 46 46 57 57 57 44 44 43 46 57 57 59 59 59 59 38 38 22 22 22 40 38 54 54 57 57 48 48 48 48 48 48 48 59
59 43 41 41 30 30 30 41 41 39 39 43 43 43 47 40 32 30 30 32 28 28 28 32 37 30 30 30 24 24 13 13 13 15 15 11 12 12 18 18 14 13 13 13 18 18 28 28 33 30
22 10 8 8 8 8 9 12 19 18 21 15 13 13 8 10 6 6 6 6 10 15 15 18 14 14 21 18 19 12 12 14 15 19 15 19 18 18 13 11 9 9 10 11 10 13 10 13 14 15
15 21 18 17 12 12 12 12 13 13 15 11 11 11 11 11 11 12 12 13 13 15 12 12 11 11 11 11 17 13 11 11 9 12 9 11 10 15 12 12 12 11 12 10 12 11 10 10 10 10
10 15 13 11 11 11 12 12 12 12 12 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 9 10 10 10 10 10 10 10 10 9 16 11 11 11 15 10 10 10 9 9 10 10 8 8 10 10
22 15 23 14 12 15 8 9 9 9 9 12 12 13 10 11 14 10 10 9 9 9 13 8 8 8 9 9 8 15 13 13 12 15 12 12 12 22 12 15 10 17 10 8 8 8 8 8 8 10
9 9 9 10 9 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 8 8 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 9 9 10 10 10 10 10 10 11 11 11 11 10
9 9 8 8 8 8 8 8 11 10 10 13 10 9 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 10 9 8 8 9 8 11 8 9 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 9 12 17
16 16 16 21 24 33 32 32 16 13 13 10 13 11 16 15 15 15 13 8 6 8 8 10 11 10 16 15 12 10 10 19 18 10 10 8 10 15 13 8 8 6 6 6 6 8 11 13 12 11
11 10 10 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 8 8 11 8 8 8 13 13 11 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 11 14 10 8 8 6 6 10
7 10 14 10 15 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 18 12 12 12 14 19 21 9 8 10 8 8 8 8 8 10 13 11 14 12 9 9 11 11 11 11 16 11 10 10 11 13
13 11 8 8 8 10 10 8 9 9 11 6 6 6 7 10 10 6 6 6 8 6 3 0 |