BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-406B06.T7 (MSMg01no406_b06.b1) | MSMg01-406B06.TJ (MSMg01no406_b06.g1) |
ACC | AG504358 | AG504359 |
length | 765 | 770 |
length of high quality (start - end) | 457 (46 - 502) | 245 (73 - 317) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no406_b06.b1 PHD_FILE: MSMg01no406_b06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:21:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no406_b06.g1 PHD_FILE: MSMg01no406_b06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:21:16 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (151,629,243 - 151,629,695) | (151,800,443 - 151,800,686) |
---|
sequence | ACTCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCCGAGGATCCGCG
GAATTCAAGGCCATTTACGGTTATATAGTGAGACCCTGTCTTTAAAAAGG
TAAAATCTGTGATGTGAGGCTCCTCCCTCAGTGTCTGCCAGAGTCCTTTT
CTTTGTCCTTCTACTATACAGCCTTCTAGGTAGAGACTTCTGAAGGAGAC
ATTTAGCTCCTCCCAGAAATGATGGGAAATGATGACGTCTTGTTTGGGGC
TTGAAGGAATTGAGGCCATCCTGAAATAGCTCTTATGGAGTCTGGCCTAT
GTCTGTGTCAGTCTCCTCAGGCTTTGACACACTGTAGCCTTGCTTGTTGT
TTCTACAGAGATGTCTCCTGTGAGGTTCCTGTGTGTTGTCCTTTTACAGA
GTGTGTCCTGGAGTAGGTCTAGCGACGAGGGTCCCTCCTCATATGTCCCT
GGCTGTGTTGTCAACCCAGATGGGGTTGATTCTTCAATAGAGAGGGCTCT
GCCACCTTATATCATAAACACCAGGTTGACAAGTCTCTCCTACTCTGGAT
TGGTGGTGACACAGTCCCAAGTCATGTCTGTTATGAGGAGAGAAGATAGC
CGTAACCCTGGCTTGATGAGACTGTCGAAATCTTCTTTACCCCTGGGGTT
TTGTTGTCTTTTTAAACTTTTGTTCCTGGGAACTTTTTTTCACCTTCCTA
ACCCTACTTTTGGTCTTTGTAAAGGCTCTCTACGCGATAACCTTATGTCT
TTTCCCTTCGTAAAN
| CGATGCTGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXTCCCCCAATCAGGATCTAGACTGAGTGAGGAATGGTTCT
GGATGCATAAGCTGTGAACCTCACACTCCCAATAAGCCCACCACCTCTCC
TGCCCTATTGCAGAAGCTCCAAACTGTGTGACAGGCTGTCACGATGCACA
GAGCCCAGAGACCTCTGCTGGTGCAGCAGGATTTCCAATGCAAACCGTGC
TCAATAGGTCCCCTTTCCCTGGGCTTGAGGATAAACATGGCCTCCCAGCC
GGGCCCCTGGCTCGTGTTTTATTTTTGATGCTGTGGCAGGCGCCCACTTA
GAGCTTGCTTCCATGACAGGTGTGCCTTGTGCTTCTTCCCTGGGACGGCC
TTTTGCCTGGGTTCCCCCTGACACCCTCACGAGAGCACTATGACATGGCA
TCTCAGCCGCCGTTGGCCAGCCCCATCGTTCTTCAGCATGTTCCCCGTGC
TCCCAGCTACACCTGTGCATCTTGTTTGCCAGTGCTCCTCCCCTGCCTGC
CTTCTCATTTGTTCCGGCTCCTCTTACACTTTTTGTTATTTACCTGTTTT
GACCCTCGCTTTCCCTTCTCGTACTTTCCTATTGTATTCTATCCTCTCCT
CTCATGTCCTTCCCTTCCCTTTAATCTCTACATCTTCCTATATTACTTAC
CTCTCCTCTTCATCCTCCCTTTTCTTTTTCCATTTCACCCCTTTTATTCC
GATTCTTTCCCCCTTGCCCG
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 10 12 14 17 18 18 20 24 35 33 37 30 25 25 30 30 34 28 31 35 43 39 41 28 28 28 28 25 21 21 13 14 20 12 11 10 10 10 9 9 10 12 14 16 28 34 34
29 23 22 28 32 33 31 33 23 23 13 13 11 11 9 7 8 8 8 10 12 30 30 39 33 32 29 31 35 36 36 36 47 42 42 43 57 57 48 48 47 57 57 57 57 57 59 57 57 57
57 57 57 48 48 46 48 48 50 50 51 50 50 50 68 57 48 59 41 41 35 41 41 48 48 48 44 42 39 37 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 57 57 57 50 50 43 43 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 54 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 59 43 47 57 57 57 57 52 52 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 52 52 43 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 62 62 62 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59
59 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 44 59 43 38 28 16 14 14 16 38 38 43 42 43 43 57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59
59 57 57 57 52 43 43 52 57 44 57 50 43 52 52 52 52 43 43 44 44 57 57 57 44 44 32 43 43 44 43 59 59 48 48 48 59 59 47 43 46 46 57 57 42 42 30 37 37 57
59 59 54 46 42 42 37 37 37 40 40 48 59 44 37 23 23 30 30 36 44 30 30 27 32 28 37 34 43 37 41 28 23 23 26 28 28 22 30 30 43 43 43 43 37 59 47 57 46 39
39 37 37 37 37 40 46 41 30 30 22 17 17 19 24 27 28 28 28 28 34 37 35 35 28 28 23 24 24 28 28 28 26 29 22 20 24 32 28 30 30 33 33 37 37 21 17 13 19 19
20 20 13 16 25 34 19 15 8 8 8 8 8 18 18 25 34 30 28 23 18 14 16 12 12 15 19 20 12 12 10 15 10 13 11 11 11 22 22 28 28 24 26 15 16 16 13 15 12 13
13 9 11 10 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 9 9 12 10 12 14 22 24 14 12 12 12 10 10 10 9 9 9 10 10 17 11 9 8 8 8 8 10 8 9 8 6 6 6 8 6
8 8 8 8 8 9 12 12 10 8 8 8 8 8 19 22 21 15 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 12 13 8 8 8 8 8 11 12 17 8 8 7 7 7 10 9 9 15 11 11 14
11 9 10 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 8 9 11 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 14 19 27 19 11 11 8 8 6 6 10 7 8 8 8 8 10
10 10 11 11 11 11 11 11 10 10 10 8 8 8 8 6 8 7 6 8 8 11 10 21 12 11 11 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 8 6 8 6 6 8 8
8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 9 9 9 9 3 0 3 14 15 25 26 21 24 20 26 27 37 37 35 35 37 39 39 25 25 9 9 9 7 7 6 6 6 6 10 11 12 16 12 12 12 9 13 13 17
27 21 42 41 39 25 25 11 9 6 6 6 6 6 6 6 8 11 8 10 13 11 20 28 28 28 23 27 30 33 14 28 28 35 32 48 48 44 44 43 33 34 42 42 28 42 43 32 42 43
42 43 48 54 54 54 54 48 48 57 43 43 34 32 32 32 37 39 39 43 43 37 37 43 42 42 39 39 39 37 37 44 44 57 57 59 43 43 42 47 47 47 47 48 48 57 57 54 54 46
57 50 50 48 57 57 57 57 57 43 43 31 44 44 57 38 44 43 43 35 47 47 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 52 52 59 59 59 52 52 52 52 57 57 57 57 54 52 52 52
44 43 35 33 28 43 28 43 38 38 19 33 33 52 52 52 52 44 57 59 52 52 43 59 43 43 43 50 50 50 50 50 50 50 57 54 54 57 57 59 59 57 57 48 47 47 36 41 19 25
22 20 20 24 30 32 36 38 30 22 36 36 57 57 57 57 48 48 39 44 39 43 43 37 42 37 37 30 37 37 48 43 48 42 48 48 43 47 39 41 32 28 32 33 29 30 18 18 18 21
21 16 16 21 23 28 34 34 30 28 28 28 32 18 16 11 11 11 11 15 16 16 10 10 12 13 15 18 28 36 34 39 28 28 28 28 26 29 19 19 25 22 28 28 37 37 43 28 28 13
24 13 28 28 43 43 46 42 47 28 28 23 23 23 40 33 39 32 43 42 39 30 37 37 57 57 57 38 23 16 11 15 15 32 32 47 47 46 47 39 28 24 12 12 12 22 16 23 28 31
37 30 30 18 14 14 15 20 28 24 24 24 23 24 33 39 43 43 42 34 34 31 29 25 33 27 28 14 14 14 23 15 17 17 17 15 15 18 22 28 37 23 23 11 11 11 12 12 12 12
12 16 12 12 9 11 12 21 17 19 21 21 23 21 10 11 11 11 11 11 11 12 18 16 16 17 16 20 11 11 11 19 14 11 9 10 10 12 21 11 11 10 8 12 10 11 13 28 26 19
19 12 12 12 12 12 11 11 11 16 15 15 10 9 9 9 13 8 8 8 10 8 18 18 13 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 13 10 9 9 10 10 12 23 19 23 18 24 12 11 11
11 11 18 12 10 9 9 10 17 17 13 10 10 9 10 8 8 8 15 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 13 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 10 11 8 8 8 8 8 9
11 10 10 13 24 19 11 10 8 8 8 8 9 9 11 19 15 13 10 10 9 8 8 8 10 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 15 13
12 12 10 10 9 9 9 9 13 10 13 12 10 10 10 8 8 8 10 10 10 12 8 8 6 7 10 10 9 10 8 8 6 6 8 8 9 10 10 9 9 12 12 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 8 8 9 10 9 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 13 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9
10 8 8 7 7 10 10 13 12 12 12 11 11 11 15 12 8 8 8 8 |