BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-444I20.T7 (MSMg01no444_i20.b1) | MSMg01-444I20.TJ (MSMg01no444_i20.g1) |
ACC | AG533692 | AG533693 |
length | 1,182 | 734 |
length of high quality (start - end) | --- | 506 (74 - 579) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no444_i20.b1 PHD_FILE: MSMg01no444_i20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:12:29 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no444_i20.g1 PHD_FILE: MSMg01no444_i20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:12:29 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GGTGACAGTATCATCAGACGAGTAGAGAATAGAGCGGTGGAGGCTGGAGT
GTACGCTCACGATTATGGAGCGGCGTTCTTGCATGTTGTTTAGGGCCCTG
GCGTCACATAAATCCACCCTTCCCCTAGTTTATTCACACCGGCACACGGC
CTCGTCTACGTAGTACGCTCTACATCCTTACATATCCTCACATGCGCGGA
ATTCTTGTGCGTATCCGCGATAGCCCCTCTTTACACCTGGTCCTCCCATT
TTCATTGCCCTAGCNGCTAACTGAAATATTGCGACACGTGGATAGCCTGA
ACGGTGTGTGAATGGATATCCCAATAAAGTATACATTGATAGTGACTGAC
CGTATAGGTCTACCCGTCTACNCAGCTAGCTCCAAATAACGTCTTACCAA
TCCCATCCGTCTATCATGTAATCACCACACAATAAAAAACGTGCACGTAG
GGTGCACCGCAAGCTGATATATTCTCCTATCATGAATATTAAGAGCTGCC
AACCACGAGATTGAATTCCACCTTTTATCCCTTGCTGTTGTTCTATCTCC
TGAGCTTGTATTTAGCGTCAATTCGCATCTCAAGTGATCGCAATATAGTA
ACAATGGGTGCACGAACAAAGCAATTAGAATAGATATTTAAGTTACGGCA
CGGACTATACGATATTTATATTGTAAACACGTACACCCATATATGTCTTT
TCGGACTATCGCTGTAAGTTAAGGGAGATATGCGCACGAATCGCGAACAC
CGNCGGATAATAGATTATAGACAAACAGTGGCGTAAAACGGGAAAAAGAA
ATAGAAAATAATTATGTCGAATATAGATAGCGGCCCAGCGTGGCTAATAC
TATACAGCCCAATCGGACCCGGTAACTTAGCTAATGATTCGCCCAATTCG
CCGCCGCCCGACAAACGGTAATAGAGAAAAATGGTGTGATCTGCGGTAAT
ATGCCCGCGTCGCGCGGGCGGCGCGATCTCGATACAACATAATTGCACCG
TCGCGTCCAAACCACGTGCCGCGCAGAAAGACAGGGGAAATAACAAGAGA
ATGATAGTTGCACTCCACGAGGACACAAGACAAAAGACGCCCGACTTATG
GTTCACGAAGTGGCGGGTGACACCCCATAACTGCCGCGGGGGCCCTTTAC
GGTCGTCACAATAAGACGCGGTACAAAACAAG
| NCGATGATATGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGCATTGGTGTAAAGAGATATATGCGA
AAACAGTAGCATGATGGCCTTTCTTCCCTGTGGGTCAGGTTTACTTGTGT
CTTCTCCCGTTCCCTTGCTTATCTGAAGCTTGCATTCATTTGCTCTCTTT
TGAGAAACAGGGCAATTATGAAAGAGAGAGAAAAATGACAGACATTATGA
ATTAGGCCCTCAACCACAACTTGTCCTGGCCCGCTGTACACTCCAAGAAT
ATTCCCTGACACCGGTTTTATTTTCAGAATCCCCCAAGGCACTGGAGGAC
AACAACACATTTATCTTTATCCTGGCCTCACAAAGCACAGTCTCTAATGA
AAGCTGTATCAGCAAAGAAGTGCGCTGCAGAGAATCCCAAGCGCTAAGCC
AGCTGTAGCATCAGGTCCTAGCAATGTGCCCCAGGTCTGTAGGAGCAGCA
GGGATTGCTTCTCCCTGGAGAATAGGAAGTTCACTATAAGGGCATGGTAG
CTGCACAGTAAAGCAAGAACAGGAAGGCTCACATCAAGGGAAATTAAAGC
ATGTGTGAAGAACATGAGGGAGATGAGAATCAAATCAGCAAGCTTTTTGA
TTTTGCTGTTACAGGTTTTGGCCATACCTTTGGTGACCAAGAAGGGTTAA
GCGTAATCTGTACCGCCTTTATTTACCTTTATTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 10 8 8 9 9 10 10 10 10 11 13 16 11 11 10 10 15 13 11 6 10 6 6 8
10 8 6 6 8 6 10 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 11 11 10 11 10 8 6 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 11 10 10 10 10 10
10 10 11 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 10 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 8 8 10 10 11 12
10 9 7 7 8 8 8 9 10 10 10 10 11 11 11 11 11 11 11 12 10 10 9 9 9 9 9 9 10 11 11 8 11 8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10
10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 8 10 10 8 8 8 9 8 8 8 10 8 8 10 10
10 10 7 7 8 7 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 10 9 9 11 12 11 16 11 10 9 8 8 6 6 8 8 11 11 11 9 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8
8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 11 11
11 11 8 8 6 6 8 8 10 10 9 10 9 8 8 6 6 8 6 6 3 0 3 8 6 8 10 8 8 8 9 9 10 9 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 10 10 7
6 8 8 8 6 6 10 8 7 6 10 6 8 8 10 8 10 9 8 8 7 9 9 9 9 9 8 10 8 12 9 9 9 9 9 9 12 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8
8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8
8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 12 10 10 13 10 10 10 10 16 11 11 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 12 12 13 10
10 8 6 7 7 12 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 11 11 11 11 10 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 12 12 11
11 11 11 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 6 8 7 6 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 11 8 10 8 10 10 10 10 9 6 6 6 7 10 6 6 8 8
8 3 0 3 6 6 8 10 8 8 8 6 7 9 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 12 6 6
6 7 8 6 10 13 19 12 12 12 8 9 9 12 8 8 10 10 10 14 10 10 10 11 10 10 9 9 8 8 9 7 8 6 10 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 10 10 8 9
9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 11 12 12 10 9 10 9 9 9 13 8 8 6 6 8 8 12 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 10 10 10 12 10 9 9 15 9 10 9 9 10 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8
7 6 6 6 6 6 8 8 6 7 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 11 11 8 7 8 6 7 8 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 11 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 9 12 12 8 8 6 6 6 11 8 8 8
8 8 8 8 10 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 12 10 9 9 8 8 8 8 8 10 11 6 6 8 8
8 6 8 8 7 7 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 7 7 7 10 8 15 12 15 11 10 9 9 10 9 8
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 7 7 9 9 9 10 9 9 | Open.Hide. 0 3 8 8 15 15 10 8 6 7 8 6 6 8 11 10 29 26 32 39 37 32 32 32 28 28 37 21 17 14 9 9 9 9 9 11 12 11 11 11 11 22 21 28 22 19 26 25 22 11
11 12 26 21 37 21 17 9 11 8 8 8 8 8 13 17 16 11 11 12 14 17 19 23 28 33 39 44 44 53 53 57 57 59 59 59 59 59 44 43 39 40 40 42 43 47 57 57 57 59
57 42 36 34 33 33 36 39 50 50 50 50 42 41 39 39 39 39 32 39 37 33 33 33 33 33 44 50 53 50 57 57 57 57 57 50 50 50 53 50 50 53 53 53 53 53 53 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 50 41 50 42 42 41 39 44 37 32 32 37 37 37 59 47 50 50 50 50 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 37 37 37 37 37 37 37 41 39 39 39 47 47 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 37 33 37 37 42 42 53 57 68 68 68 57 57 43 59 43 39 36
37 32 34 43 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 29 27 11 15 11 34 34 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 53 59 50 50 50 50 37 30 21 19 12 12 12 12 12 13 12 15 28 27 42 50 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 53 50 50 50
53 54 68 68 57 46 46 43 43 43 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 48 59 59 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 50 43 43 43 57 57 57 57 57 54 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57
59 57 57 57 59 59 59 59 54 57 59 57 54 57 57 68 48 44 47 35 35 59 59 59 68 68 68 59 59 48 47 47 35 35 39 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 48 48 48 59 59
57 39 39 39 39 37 47 48 48 46 59 59 59 59 43 43 34 37 39 39 37 36 34 28 28 34 34 23 19 19 15 19 30 39 34 34 24 24 15 30 24 37 41 43 41 31 31 43 41 47
47 47 47 39 35 35 33 33 33 33 33 37 40 39 39 39 37 31 31 35 36 35 32 34 28 17 25 14 14 14 17 15 19 16 28 21 23 23 23 23 20 12 12 15 28 19 25 22 22 22
18 22 9 10 10 17 15 20 16 10 8 8 6 6 8 11 12 12 19 15 10 9 9 10 13 9 10 13 17 13 8 11 8 8 8 8 11 11 12 10 10 12 16 12 10 10 13 8 8 8
8 8 8 10 10 12 16 15 8 12 8 8 8 8 10 13 8 8 11 10 8 6 6 8 8 6 7 12 9 10 11 11 11 16 13 16 12 11 11 9 9 9 10 8 8 8 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 9 10 10 10 11 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 |