BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-489O10.T7 (MSMg01no489_o10.b1) | MSMg01-489O10.TJ (MSMg01no489_o10.g1) |
ACC | AG568267 | AG568268 |
length | 734 | 729 |
length of high quality (start - end) | 407 (326 - 732) | 316 (328 - 643) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_o10.b1 PHD_FILE: MSMg01no489_o10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:13:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_o10.g1 PHD_FILE: MSMg01no489_o10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:13:19 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (139,171,956 - 139,172,362) | (139,010,320 - 139,010,635) |
---|
sequence | AAAACCCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATCAAAAGAGGA
GCNCGCGGAATCTTTGTACCTCAAAGTGGCTCAGCTTAAGGGAGAAGGCA
CAGTTGCACTGCATCGACGCTCAAAAGTCTGCGTTTGTGGTGTGTGTGGG
GACAATAGAAAAATCGACAGCACCATTCCATGGGTCGGTGGTGGAGGAAG
GAAGGAAGCAGCGGTCCCGCTGGGCCTCCGGAGAAGGGAGGACAGAAGTC
TGTGTCGAGGAGTGGAGCCCACACGGCTCAGTGGGGAGAGGAGGCTGGAC
CCCATCACCAAGACCATCCATGGTGTCGGGCCTCCGTCATCAGCTGACCA
TGGGCTCCACATCCGCCTCCCGCTCCAGGTCTTCCTGGATTTCGTCTGTA
CTTCCTGAGTCACTGCTGCCCACGGAGCTGGGGGACGGTGAATTCCTGCA
TTAGAAACCAAAGCCTTTCAGAGAGCAGCCTGGGGGACCCTAACGGCCCA
GGGCCCGGAGCTCTGGCCGGTCACACCTGTTAAAAAACCTACCCGAAGGG
TCTGGGGTGAGCAAAACTTTTGCCTAGTATGCACAAGGCTCTGGGTTCCA
CTCTCAGCAACAACACAGTGGCGGCTACCCTGAGGGGCTCCTGCTGTGAG
ATCCCTGCAAGGCGCACTTTCTCCCAGTCCCTGTAGGTTCCATAAGCTGC
CTAGGGCTCTTGGCATTCCTTGGGACCTCTACCC
| NNNNCCCCGATGAAGTGGGAGTCCTGGNGGTCGCCTGGTCANTACTATGG
GGNNGAACNANAGAATGCCACAAAAGAGGGCNGNGACACTTTAGGGGTCA
CCCAGCCAGTTGACCTGAAGCTTTCTCTGGTGGAGCCAAGGACTTCGGGC
TCTGGCAGTTAAACATCTGTGATTGCCAAGTGCAGAGTGGTGACCAGAGG
CTGTGGGAGGGCTGATCTCAGACCTTAACCTGACCAGATAAAGCAAGTCT
TTTTACGTCTTCTTCTTTTATTAGAAGAAAAGGGGCTCCTGTGTGTGCGC
TTGTGGTATTTAGGGGTTTGTANGTTTGTGCATACATGTGGAGGTCTGGA
GTCAGTTCCCTCCCTTCCCCTTTCTGTGGGTCCCAGGGATTGAACTCAGA
TGAACACACTTGCTCAGCAAGCCCCCTTCTCCCATCTTGTTGGCCCGGGG
GCAGGGAAACGGTTAAATGAGGACATTGCTTAACTTTGTGGTTTCTCATG
TGCATTTGTGTACAGCATGTGGAAGCCCCGGGCTCTTAGATAATCTCCAT
CTTCCCTGATGTGATGAGGCAGGGCCTCCCAGGTGAACCCAGCACTCGCT
GATGTGTTGCCAGTGTGCTTTAGCTCCCTGGTCTCTGCTCCCCAATTGCT
GGATTGTAGAGGAGGTGCTGTGCACATCCAACTTAGATGTTGGACCTAGG
GATCTAACTCATGCCTACATGGCAAGTGT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 7 7 6 6 6 10 10 12 14 14 19 19 20 34 30 28 23 15 12 12 21 26 18 11 11 3 0 3 17 19 9 8 8 6 6 6 6 6 9 9 14 11 11 11 12 11 11
6 3 0 3 8 15 34 30 30 30 30 24 7 7 6 6 6 7 9 9 11 12 16 25 11 11 11 12 15 15 15 23 22 34 44 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 53 53 57 57 47
47 47 47 53 57 57 57 57 50 53 41 41 37 37 37 34 28 12 8 6 6 8 8 17 26 37 40 40 44 48 50 50 59 59 57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 57
54 54 54 54 48 48 57 68 68 68 42 42 36 21 17 16 25 30 30 42 59 54 54 54 57 57 57 57 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 57 54 57 57 54 57 59 59 57 59 59 68 59 59 59 59 50 50 48 50 50 57 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 32 32 12 24
15 28 20 24 19 32 32 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 48 54 54 48 48 48 43 43 44 44 29 40 28 37 43 59 68 68 54 54 48 48 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 53 48 48 48 41 41 41 31 23 17 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 8 10 18 21 59 59 59 59 59 50 53 53 57 57 53 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 53
57 57 59 68 59 57 43 47 35 28 28 23 30 28 32 40 47 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 27 24 20 20 20 38 38 52 57 57 57 57 57 57 59 54 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 52 57 57 57 68
59 59 57 57 57 50 50 57 54 54 57 57 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 43 43 37 39 39 39 43 57 57 68 59 59 43 32 39 30
39 44 44 31 39 43 43 46 48 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 42 39 37 43 43 43 59 59 59 48 48 48 59 57 57 48 48 48 48 47 47 47 41 37 37 32 29 29 37
59 59 59 59 59 47 47 43 43 43 59 47 48 48 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 59 59 59 43 47 47 41 41 41 44 39 37 37 41 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48
48 48 57 43 43 43 43 57 43 48 48 48 39 39 36 36 36 43 35 31 31 39 39 41 41 41 40 40 42 37 30 30 22 20 20 32 37 36 33 33 33 37 32 32 28 33 23 28 15 21
20 27 20 25 43 34 41 32 29 29 29 29 32 37 37 39 41 41 41 37 43 39 28 26 24 19 28 30 25 29 30 37 37 37 32 26 28 31 29 43 32 32 21 23 14 26 28 37 35 29
29 37 32 29 31 37 37 35 37 37 29 24 25 27 28 41 40 36 37 37 34 35 36 40 32 24 24 28 28 23 24 19 18 18 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 7 6 6 7 8 8 10 10 9 10 19 19 16 8 8 8 8 10 9 17 21 3 0 3 17 15 20 20 19 37 19 12 9 9 9 3 0 3 6 6 8 8 8 8 10
10 3 0 0 3 8 8 3 0 3 0 3 9 9 9 7 6 6 6 6 6 7 7 7 10 11 9 12 11 12 3 0 3 0 3 21 21 33 37 42 50 50 50 59 59 59 53 53 50 50
50 53 53 53 53 47 47 47 53 53 57 57 57 68 68 48 42 33 30 30 30 37 37 44 43 43 39 43 43 57 57 68 68 54 54 57 54 48 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57
57 57 57 57 53 53 50 59 59 59 41 34 24 19 13 13 13 14 30 27 33 33 33 33 44 50 50 50 57 57 59 59 57 57 57 57 57 53 53 50 53 53 53 50 50 50 54 54 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 50 53 53 53 53 53 53 50 50 53 47 50 59 59 59 59 33 27 16 11 11
11 8 8 8 8 8 12 30 37 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 47 36 29 18 11 8 6 7 6 6 6 3 0 3 9 11 11 11 11 25 31 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 43 27 27 15 13 13 13 15 28 28 35 47 35 39 37 37 30 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 50 50 50 50 57 68 59 59 32 32 20 32 41
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 42 37 43 44 59 57 57 57 59 37 36 30 27 23 23 23 28 44 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 48 43 48 48 57 57 68 57 57 48 48 48
50 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 59 59 59 47 47 44 43 37 37 43 41 59 47 46 46 59 59 48 50 50 57 57 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 37
37 37 37 37 37 37 41 41 41 37 37 43 43 59 59 59 59 59 50 48 48 43 43 43 57 59 59 59 59 59 48 48 46 47 47 47 39 39 34 29 16 21 11 11 11 11 12 11 11 12
12 12 21 23 25 26 37 32 30 24 34 34 41 32 31 32 32 37 39 40 46 41 46 43 39 37 28 31 25 25 28 32 32 31 20 20 19 30 26 37 41 40 40 41 31 29 37 33 31 31
35 39 39 39 41 37 37 43 59 41 41 32 32 18 18 15 25 21 30 28 30 32 41 32 28 26 22 22 18 |