BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-497P07.T7 (MSMg01no497_p07.b1) | MSMg01-497P07.TJ (MSMg01no497_p07.g1) |
ACC | AG574399 | AG574400 |
length | 1,501 | 736 |
length of high quality (start - end) | --- | 315 (327 - 641) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_p07.b1 PHD_FILE: MSMg01no497_p07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:23:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_p07.g1 PHD_FILE: MSMg01no497_p07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:23:49 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCGCCACACGAACTTTTGGGCGGGCGCGGCGCGGTGAGTATAAAGGGGCG
CTTTTTTCCTCTTCCAGGGAGGGAGGGGGGTAGATTGCGGGTTTTTTTCT
CCCCTGAGTCATAGCAGAGCCGCGCGGCGAGGCACAGGACATCTCGCACA
CCCTTTCACCCCCCACCCCTACATGGAGTACCACTTTTTAATTACAGGCA
ATAGACCTACGAATGAGTGCAGAGCGTATATTAGGTTTGTGAGCATACCA
TACTCATAAGATCGAACAGTGATGTGAAGCCCTGGTCAGTGGCGCTGAGC
AGAACATCTAAGATATACGACGCGCCCAGGCCCCGTGTTGCTCGTTTTTG
GCGGCGTAGAGACCGGCTTAGTTTGCCTGTTTCTCTTGTGGTTTGCCTAC
CCGCCTGCCCGTGTGCGCTGTGATTTACTCCACGTGTAGCTAGCCCTCTC
TTTTCTCGCCGGTCACTCGACGCCCCAATGCTCCCGTCTATTCGCAGAAN
ATTTGATTTCATGTCTAGTGTGGCCAGTTTACACATCACTTAGGTCTGCC
CCGGCCTCACATCACTCCCTATTTCGATATTTACGAGGCGCGCGATGCAT
GATTATTGATCTGTGTGCATGCGCTCATGCTACCTAGTTCACTCTTTTGT
ACCCAATAATCACCCTCTCACCTCTTCCACGTTCACATGATGTTTATCTG
ATGTTGTATGACGCCCACGTTTATTTATATTAATGNCGACTCGCTCTATC
TCTGTGTTCCCCCGTACTCTCTACCCGGTATAATAACTGTATTTCAGCTC
TCTCGCCGTATCAGTGCAAGTGCCGCGTATTATATAGACCATGACTCGAC
TGCGTCGGCGCCACCGCGAGCTACTCCATTATGTTGAAGCTGTCGCCTCG
GACGGCGTGGAATGTGATACCGCCTCACTCGTCTGGTAATCTCATCGCCA
GCACTGTATACGACATGTCTATGTATATACTTATAACTTATAACGCGAAN
CACGCGCATACGCACGTCNATGCTATCGAATACGATAGTGTAATANTATG
AGCACTCTCACCGCGTCGCCNATGCTGGCGCGCTGCGCTATACNTACTCT
CCATACGGTCTCTCTCGATAATACCTGCTCACGTGCACAGAGTGGCGCTG
TAGACGCATACACGAGCGTCGGTACTCCGAGACTCGCGACGATGAGACAC
TTGTGTCAATCGCGTCTATGCGACATATATGATGCTCGGATCACTCCTGC
CGCACTCTGCTCGTATTGATATGGTGCTCGATCTGCGCGCAACCGTCTGT
CTGNCCTTGGTCTGCCGGGCCGACTGCTGCGNTNGTGACGACTGACCTGC
ACNTCACGCAGACGACNCACATATGGCAGATATGTACCTACTATCGCACT
ATATCTCTGCGACATGTATACGACGCCTCGATCCCCACGCAGGCGAAGNG
CAGTACGTCGTCTAAACCCCACTCATCGCAACGAGTCGCGCGCACACTGC
C
| NNNCCTCGATGCAGTGGGAGGTCTGGNGGNTGCCTGGTCCATATCTTGGG
GGTGAACTATAGAAGTACTAAAAAAGAGCCTATTTTGACTATGGTGTAGA
ATGCTGCACTTAACACATGAGAGCAGACAGCTCTTTGATATATACTAATA
TAATCCCCTTTGGATACACACCTAGACAGAGGATCATGTATTTTAAGTGA
CTCAGAGTCATCTGTTGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTT
TTCTTCAGTTACTCTAACAAGGAGTTTGTCTACTTTGTTTTCCTGGGAAA
TCAATTTCATTGATCCCNNATANNTGTGTTTTAGTATCTATTTCATTTAC
CCATGCTTTAATCTTTATTTTTTTTATTTAGCAATTTTGGTTTTGGAGCT
GAAGATGCATCTCAGTGGAACACCTCTTACCTATCATGTGCAAGGCTCTA
GGTTTGATCCCTATAATTGCAAAGCCAGGGGAATTGCTTCCTTCCTGGGT
TTTAGAGTTCCTTAGGTAGCACTGGTAGCCTGGTTATTTAGTTCTTTCTT
TTTTGCCCATGAAGGTTCTGATTAGTTGAAACCCCATTGATAGTGCTTTT
GTTTTAATGTGCTGTATTTCCACTTTCACTTATTTCAGAAAATGCTTTTA
TTTCCTTCTAAATTTCTTCCTTGACCATTTAGGAGAATGTTATTTGGTCT
GAGTGTATTTGTATAAATTTCAAGGTTCTTCTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 12 12 12 13 13 10 10 10 10 10 11 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 8 6 8 6 6 6 6 8 6 9 9 10 10 10 10 10 13 13 19 10 11 11
11 11 11 11 11 12 6 7 8 7 6 6 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 11 14 11 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 8 10 10 12 13 7 6 6 6
6 6 6 6 6 8 8 9 10 9 8 8 8 8 13 10 10 8 8 8 8 9 9 14 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 9 9 9 8 8 8 8
8 8 10 9 10 10 10 10 9 10 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 10 8 8 8 8 10 10 11 12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 10
10 10 11 11 9 9 9 8 8 8 10 9 9 11 11 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 11 11 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 11 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 17 15 10 10 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 10 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 13 12 13 12 10 10
10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 6 7 8 8
8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 9 9 6 8 8 8 8 8 12
12 10 11 8 8 8 10 10 10 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 15 19 13 11 11 7 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 8 7 7 3 0
3 9 9 6 10 9 7 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 6 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
11 6 8 8 8 8 8 12 10 9 9 10 11 10 10 13 10 10 10 14 13 18 12 12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 7 9 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 8 6 7 8 8 8 8 10 9 12 10 15 11 10 13 10 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6 7 7 6 10 15 17 10 6 6 6 8
6 9 12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 10 6 6 8 8 18 11 9 9 9 8 8 14 11 7 10 6 6 8 10 8 8 8 10 10 10 6 6 6 13 6 7 7 8 8 8
6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 10 11 10 10 9 10 10 10 12 10 11 8 10 8 8 8 10 10 10 10 8 8 3 0 3 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 6 6 7
13 15 13 11 9 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 7 10 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10 8 7 8 10 10 9 8
10 8 8 7 7 7 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 12 12 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 10 8 8 9 9 10 12 12 11 8 8 8 8 8
10 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8
8 11 8 10 8 8 8 6 8 7 7 8 7 8 10 10 10 11 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7
7 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 6 6 8 8 8 6 6 6 6 7 10 10 8 8 10 10 8 10 9 9 9 9 9 9 10 10 3 0
3 8 6 8 9 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 10 11 10 6 6 8 6 8 8 8 9 3 0 3 6 6 8
6 8 10 9 9 9 9 11 9 9 9 6 8 6 6 6 6 8 7 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 11 10 8 8 8 8 10 8 9 10 6 8 7 3 0 3 8 8 8 7 6
6 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6
6 8 8 8 11 11 11 9 8 8 8 8 8 10 12 8 6 6 6 10 10 8 8 8 9 7 7 10 8 6 6 7 10 10 15 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 11 12 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 12 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 6 6 6 9 9 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 11 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 13 13 15 10
8 6 3 0 3 8 6 9 6 6 6 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 10 6 6 8 6 9 3 0 3 0 3 7 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
6 3 0 3 8 6 8 9 10 9 6 7 6 6 6 3 0 3 8 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 7 10 6 9 9 10 12 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 9 12 9 9 10 9 13 9 12 8 8 8 8 8 8 13 9 9 9 10 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 10 6 6 8 7 8 10 9 9 8 6 6 6 6 8 8 13 15 10 6 6 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 8 8 9 10 9 9 23 12 18 9 10 8 8 11 10 21 23 3 0 3 3 0 3 12 23 23 9 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8
12 23 21 14 14 14 26 26 47 25 24 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 12 14 7 6 6 6 8 8 10 19 23 32 59 59 50 53 53 53 57 53 53 53 57 57 57 59 59 50 50
48 48 50 50 50 54 54 68 68 68 68 51 48 42 25 23 10 12 12 12 22 18 31 31 28 28 37 44 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 50 50 50 50 50 47 48 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 52 57 57 57 52 54 57 57 57 57 59 57 54 54 54 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 57 50 59 48 48 48 57 59 57 54 54 59 57 47 47 47 57 57 34
41 20 16 15 26 24 37 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 54 57 59 59 57 57 57 59 57 57 57 50 50 53
57 57 57 57 57 59 59 59 59 46 40 32 25 20 12 11 3 0 0 3 9 3 0 0 3 12 12 23 27 41 50 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 48 48 48 59 57 57 57 37 41 23 41 36 44 44 43 43 39 39 41 41 41 41 48 59 57 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 59 41 30 28 18 15 12 12 12 19 22 33 47 47 46 46 48 48 47 43 46 46 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 54 44 44 43 43 43 43 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 59 59 68 68 68 68 59 59 57
57 57 57 48 48 48 48 54 57 57 57 48 48 47 47 48 48 48 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 43 48 48 50 50 50 50 53 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 57
48 53 48 48 40 47 47 47 41 39 20 19 19 19 17 28 43 47 41 41 40 31 31 31 31 43 44 44 43 48 48 48 43 43 46 48 48 43 48 43 42 42 39 39 39 48 48 57 57 57
54 54 54 54 48 54 32 32 23 23 23 30 30 23 23 23 34 37 48 43 43 40 39 39 34 33 33 33 36 37 37 36 36 39 30 37 36 27 17 21 12 12 17 12 12 12 25 14 10 10
10 21 15 25 22 26 22 22 21 22 22 23 32 32 32 32 34 34 39 39 39 19 19 9 9 9 15 27 34 34 25 15 15 15 15 20 31 31 39 39 39 40 40 39 25 23 11 11 11 19
11 12 12 17 11 11 11 19 21 30 22 22 22 22 28 24 28 28 14 19 10 10 10 13 24 25 19 19 10 10 10 30 25 25 22 17 |