BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-013K14
Chromosome5 (Build37)
Map Location 19,613,350 - 19,776,884
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMagi2
Upstream gene4921504A21Rik
Downstream geneLOC100041850, Phtf2, LOC622367, Tmem60, Rsbn1l, Ptpn12, EG626903, A530088I07Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-013K14.bB6Ng01-013K14.g
ACCDH848422DH848423
length1,167719
definitionDH848422|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013K14, 5' end.DH848423|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,613,350 - 19,614,527)(19,776,167 - 19,776,884)
sequence
gaattcaagcctgtggtatgacatggctgtagggagcagagcaagccttg
aatgagtgacttactgagtgaatgtgtgtctttgacacaggtaggaccac
atcaaggatcccacaccctcagcctcagagcagtgtcaaaacctttctca
ggggactgggtgcaagcattggcagagtatgtaggaaatgtccaccaaag
ctcctctcactccaatgtttatggcccaacgactgcctctgtacaaagac
tgcttctacctacatcatctaaaccaatttccttgatccagctgtataac
ctgaaccctgccttcttgtttttctgtatgtaacaaccccacctcccttt
tcagctgtatgcaataatccaagctctctgctcaactctctataataagc
acactaagcttccattgtgatatggcttccccagtcaagtactcctacta
cctgatccctgcttttctgtttgcatctttcattccctcatcacctcact
tctctggtcagatccaagccccttggaggccatgtgacgatgaaggatag
gattcaccccagaagctgttatcctaagtgaaataagccccttcagcaca
caaatcccatgcctagaatgctcaaattcatgagaacagaaaacaaaatg
gcactcggagcaatgataggttgggaagttttgatttgaggagactaaag
tttgaagaaataaaaatgcttctaagatggtagtggtgattgcacaatag
gagagtattcacgcccctggactgcatgttttaaatgattgaatgctaaa
ttccatatcatctatgttttgttccaatgagtaaaaatggaagctcggtt
ggagggacagacataatggactccctgccttagttcagtcagccatatta
taaggctagaatttacccaagtttccttctcaagaatttgtgtcagcttc
aggtgtcagattcatagtttttttttgtgagaccaaagcatgtgtatgtg
gctgcgaggaatgggactccagagctagaccttctgggtgtgacgcagta
cttagtacttatcagagctgagtcacgacagctgggttctgagctgccta
ctgaaacaatttcaggctgcctgagaaaaggaacactaccgttctggacc
ctccatgcacacagttt
gaattctcaaaaaactgacagagtgattagctggcaatgcagcttggatg
tgaaataaggacactgcagcactctgcctggcctctgtttctccatggcc
attcatccatccattcagtcagtccttggtggtatagtgatatccaggct
atcatgagattaggaagggttggcactccgtgctttgagcgttgagccaa
aacttcacataaggagaaatacgataggaaaagaataaagtaaccaacac
agtaatgtgctgtggtgggaaaactgctgatatcaaggtcatttccaggc
atctcttggtggttacaagtaccagacctagcacaaaaacattcagagtc
gaagccagcccattgtttgctggacatgtttctgttagctaagcttttac
ccatgcctggggagttttctgatgtcaaatattgattttgtgaggaataa
ggatcaatttttatggccttctagttatttgtattcaattatgtgtgagc
tgatttttttggggggagcttctgtgaagaatgtacacttctaatgctgt
gctataaatggagatttccccttgacttcaaagattcaggagaaaaaacc
caaccagatgagaaattgtcttttaaaccacttatcaaacctttgagaat
attaaaacaatgtagtgtaggtctccaaaggatactgtaggtgggttttt
tttttgaggggtgtggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_19613350_19614527
seq2: B6Ng01-013K14.b_47_1213

seq1  GAATTCAAGCCTGTGGTATGACATGGCTGTAGGGAGCAGAGCAAGCCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGCCTGTGGTATGACATGGCTGTAGGGAGCAGAGCAAGCCTTG  50

seq1  AATGAGTGACTTACTGAGTGAATGTGTGTCTTTGACACAGGTAGGACCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGTGACTTACTGAGTGAATGTGTGTCTTTGACACAGGTAGGACCAC  100

seq1  ATCAAGGATCCCACACCCTCAGCCTCAGAGCAGTGTCAAAACCTTTCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGATCCCACACCCTCAGCCTCAGAGCAGTGTCAAAACCTTTCTCA  150

seq1  GGGGACTGGGTGCAAGCATTGGCAGAGTATGTAGGAAATGTCCACCAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACTGGGTGCAAGCATTGGCAGAGTATGTAGGAAATGTCCACCAAAG  200

seq1  CTCCTCTCACTCCAATGTTTATGGCCCAACGACTGCCTCTGTACAAAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTCACTCCAATGTTTATGGCCCAACGACTGCCTCTGTACAAAGAC  250

seq1  TGCTTCTACCTACATCATCTAAACCAATTTCCTTGATCCAGCTGTATAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTACCTACATCATCTAAACCAATTTCCTTGATCCAGCTGTATAAC  300

seq1  CTGAACCCTGCCTTCTTGTTTTTCTGTATGTAACAACCCCACCTCCCTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACCCTGCCTTCTTGTTTTTCTGTATGTAACAACCCCACCTCCCTTT  350

seq1  TCAGCTGTATGCAATAATCCAAGCTCTCTGCTCAACTCTCTATAATAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTGTATGCAATAATCCAAGCTCTCTGCTCAACTCTCTATAATAAGC  400

seq1  ACACTAAGCTTCCATTGTGATATGGCTTCCCCAGTCAAGTACTCCTACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTAAGCTTCCATTGTGATATGGCTTCCCCAGTCAAGTACTCCTACTA  450

seq1  CCTGATCCCTGCTTTTCTGTTTGCATCTTTCATTCCCTCATCACCTCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATCCCTGCTTTTCTGTTTGCATCTTTCATTCCCTCATCACCTCACT  500

seq1  TCTCTGGTCAGATCCAAGCCCCTTGGAGGCCATGTGACGATGAAGGATAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGTCAGATCCAAGCCCCTTGGAGGCCATGTGACGATGAAGGATAG  550

seq1  GATTCACCCCAGAAGCTGTTATCCTAAGTGAAATAAGCCCCTTCAGCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCACCCCAGAAGCTGTTATCCTAAGTGAAATAAGCCCCTTCAGCACA  600

seq1  CAAATCCCATGCCTAGAATGCTCAAATTCATGAGAACAGAAAACAAAATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCCCATGCCTAGAATGCTCAAATTCATGAGAACAGAAAACAAAATG  650

seq1  GCACTCGGAGCAATGATAGGTTGGGAAGTTTTGATTTGAGGAGACTAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCGGAGCAATGATAGGTTGGGAAGTTTTGATTTGAGGAGACTAAAG  700

seq1  TTTGAAGAAATAAAAATGCTTCTAAGATGGTAGTGGTGATTGCACAATAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGAAATAAAAATGCTTCTAAGATGGTAGTGGTGATTGCACAATAG  750

seq1  GAGAGTATTCACGCCCCTGGACTGCATGTTTTAAAATGATTGAAATGCTA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  GAGAGTATTCACGCCCCTGGACTGCATGTTTT-AAATGATTG-AATGCTA  798

seq1  AATTCCATATCATCTATGTTTTGTTCCAATGAGTAAAAATGGAAGCTCGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCATATCATCTATGTTTTGTTCCAATGAGTAAAAATGGAAGCTCGG  848

seq1  TTGGAGGGACAGACATAATGGACTCCCTGCCTTAGTTCAGTCAGCCATA-  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTGGAGGGACAGACATAATGGACTCCCTGCCTTAGTTCAGTCAGCCATAT  898

seq1  TATAA-GCTAGAATTTACCCAAAGTTTTCCTTCTTCAAGAATTTGTTGTC  948
      ||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||
seq2  TATAAGGCTAGAATTTACCCAA--GTTTCCTTC-TCAAGAATTTG-TGTC  944

seq1  AGCTTCA-GTGTCAGATTCATAG-TTTTTTTTGTGAAGACCAAAGCATTG  996
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  AGCTTCAGGTGTCAGATTCATAGTTTTTTTTTGTG-AGACCAAAGCA-TG  992

seq1  TGTATGT-GCTGCGAGG-ATGGGAACTCAGAGCTAGACCTTCT-GGTGTG  1043
      ||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||
seq2  TGTATGTGGCTGCGAGGAATGGGACTCCAGAGCTAGACCTTCTGGGTGTG  1042

seq1  ACGCCAGTACTTTAGTACTTATCAGAGCTGAGTTCAACGACCAAGCT-GG  1092
      ||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  |||| ||
seq2  ACG-CAGTAC-TTAGTACTTATCAGAGCTGAGT--CACGAC--AGCTGGG  1086

seq1  TTCTGAGCTGCTAACTG-AACAATTCTCAGGCTGCCCTGAGATAGAGGAC  1141
      |||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| |  | ||
seq2  TTCTGAGCTGCCTACTGAAACAATT-TCAGGCTG-CCTGAGAAAAGGAAC  1134

seq1  ACTAACGTTTCTGGACACTTCCCATGCACACATGTTT  1178
      |||| || |||||||| ||  ||||||||||| ||||
seq2  ACTACCG-TTCTGGACCCT--CCATGCACACA-GTTT  1167

seq1: chr5_19776167_19776884
seq2: B6Ng01-013K14.g_68_786 (reverse)

seq1  CCCCCACACCCCTC-AAAAAAAAACCCACCTACAGTATCCTTTGGAGACC  49
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACACCCCTCAAAAAAAAAACCCACCTACAGTATCCTTTGGAGACC  50

seq1  TACACTACATTGTTTTAATATTCTCAAAGGTTTGATAAGTGGTTTAAAAG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTACATTGTTTTAATATTCTCAAAGGTTTGATAAGTGGTTTAAAAG  100

seq1  ACAATTTCTCATCTGGTTGGGTTTTTTCTCCTGAATCTTTGAAGTCAAGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTTCTCATCTGGTTGGGTTTTTTCTCCTGAATCTTTGAAGTCAAGG  150

seq1  GGAAATCTCCATTTATAGCACAGCATTAGAAGTGTACATTCTTCACAGAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATCTCCATTTATAGCACAGCATTAGAAGTGTACATTCTTCACAGAA  200

seq1  GCTCCCCCCAAAAAAATCAGCTCACACATAATTGAATACAAATAACTAGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCCCCAAAAAAATCAGCTCACACATAATTGAATACAAATAACTAGA  250

seq1  AGGCCATAAAAATTGATCCTTATTCCTCACAAAATCAATATTTGACATCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATAAAAATTGATCCTTATTCCTCACAAAATCAATATTTGACATCA  300

seq1  GAAAACTCCCCAGGCATGGGTAAAAGCTTAGCTAACAGAAACATGTCCAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACTCCCCAGGCATGGGTAAAAGCTTAGCTAACAGAAACATGTCCAG  350

seq1  CAAACAATGGGCTGGCTTCGACTCTGAATGTTTTTGTGCTAGGTCTGGTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAATGGGCTGGCTTCGACTCTGAATGTTTTTGTGCTAGGTCTGGTA  400

seq1  CTTGTAACCACCAAGAGATGCCTGGAAATGACCTTGATATCAGCAGTTTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTAACCACCAAGAGATGCCTGGAAATGACCTTGATATCAGCAGTTTT  450

seq1  CCCACCACAGCACATTACTGTGTTGGTTACTTTATTCTTTTCCTATCGTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCACAGCACATTACTGTGTTGGTTACTTTATTCTTTTCCTATCGTA  500

seq1  TTTCTCCTTATGTGAAGTTTTGGCTCAACGCTCAAAGCACGGAGTGCCAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCTTATGTGAAGTTTTGGCTCAACGCTCAAAGCACGGAGTGCCAA  550

seq1  CCCTTCCTAATCTCATGATAGCCTGGATATCACTATACCACCAAGGACTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCTAATCTCATGATAGCCTGGATATCACTATACCACCAAGGACTG  600

seq1  ACTGAATGGATGGATGAATGGCCATGGAGAAACAGAGGCCAGGCAGAGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATGGATGGATGAATGGCCATGGAGAAACAGAGGCCAGGCAGAGTG  650

seq1  CTGCAGTGTCCTTATTTCACATCCAAGCTGCATTGCCAGCTAATCACTCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGTGTCCTTATTTCACATCCAAGCTGCATTGCCAGCTAATCACTCT  700

seq1  GTCAGTTTTTTGAGAATTC  718
      |||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTTTTTTGAGAATTC  719