MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-027O15
Chromosome	5 (Build37)
Map Location	84,069,276 - 84,070,162
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	LOC100039434, Srd5a2l2
Downstream gene	LOC100039608, LOC231368, Epha5, LOC100039489
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-027O15.b	B6Ng01-027O15.g
ACC	DH858530	DH858531
length	879	1,182
definition	DH858530\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027O15, 5' end.	DH858531\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027O15, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcttctacttttttttttttaactctgagtgaaatcatttctgctt caaaagaagtttgctgttactgcagttctagaaattaaagcagtccttat tattataataacctgaatagttctgctggtgataatgactgctgaagaac cttgttgttaattgatatctgaactacatatttccaaggttcacatatta gaaaattcctggcagtttttatatgagagaggaaattcttctaaaataat ttgaatttccttgagacagtaataaaatgaatttatacatggtcctgaat ctacaacattacatttgaggcatgatatggatctttgttggatcttcacg tttcctaattaaaccatttggtcttgtaaagaataaggaaaatcttcaac ttattcccatgttaagaagtactatttcaaatagaatagaatagaataga atagaatagaatagatagatagatagatagatagatagatagatagatag atatagacagacagacagacagacagacaaacagatagatagatagatat acagtaagttattgactcatttccaaatgctattttatatcattaatcat ttctaagaattatcatttgttgctaagtccaaattcaatatgttgagcat tcgctgaacattctaccagtacttgtgtaggaggcatataaaatcaaaac atgggaaaacgtctctgtgggttctgcacatggaaatgggcaagtgttat taacctcatttgattgtagtgtggcccataaaaatatggggcaaacttta aatggcactatttaaatgacatgctcatgaaacgtggcaaatgaatctca aggaaggcaacttatagactgtaattttc	gaattcacaaaatacctgagatagacaaaccaatactgagaaaaaagaac aacattggaggctttgccacatacaatcccattggaccacagattcctgc taatagaacaacatggaaatggcacaaagagagacacatacactaatgga atatatatatattgagagacacatacactaatggatggaatagagaatac atatatattgagagagatctatctatctatctatatagagagctatctat ctatctatctatctatctatctatctatgtatagaacttttcacaaatga tagtgggaaactttgatatgtcaagatattgagaaatgaaactttcatcc tgcaaaaaaaaagctccaaatagataaaatatgtccaaatataatcccaa actccaatacttgcagaagaaaaggcaaaacatatgatacatggtacaat cataggtaaggactttgtaaattagattcttgttcaggaaatgaggttaa tacttgacaaacaagcagtcatagcactaaaaagcttccatatagcaaaa gaaatactcatctgggtgaagaggcagcctaaagagagtgagaaaaatct ccacaagctatgcatctaaaagaggattaatgtggagaatgcacaaagaa cccaagaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaagaaaccataatgaa aacaaacaacagagtcagtaaacaggctgcataactgaattgagttctca aagtgataaataaagtataaaaggatttaatatcctctcccagcagaaaa cacaaattaatttatttgagattccatattatttgtgtacaaattctaat tatcagaattttcatgacagcaaatgttgataagatgtaaagaaagagga atcttttattcattgacgtggggtgaaactgttcaaagagtgtggaaata ctacagagtctcccaagagctagaagactttactttattgtctcattata acccctagcattattaaaaactgtcttaatctacttaggaacttgtctgc atttttcagattattctgtaagcttaaacagtacagtcaatttctcatgc cgttgagtgtcactattattcctgatgaaaggaatcatttaaccgtatca gagaagcaaacattcttcaaaagcaagtatac
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr5_84069276_84070162 seq2: B6Ng01-027O15.b_42_920 (reverse) seq1 GAAATTTACAGTCTTATTAAGTTGCCTTCCCTTGAGATTCATTTTGCCAC 50 \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAAAATTACAGTCT--ATAAGTTGCCTT-CCTTGAGATTCA-TTTGCCAC 46 seq1 GTTTCATGAGCATGTCATTTTAAATAGGTGCCATTTAAAAGTTTGCCCCA 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTTTCATGAGCATGTCA-TTTAAATA-GTGCCATTT-AAAGTTTGCCCCA 93 seq1 TATTTTTATGGGCCACACTACAATCAAATGAGGTTAAATAACACTTGCCC 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATTTTTATGGGCCACACTACAATCAAATGAGGTT-AATAACACTTGCCC 142 seq1 ATTTCCATGTGCAGAACCCACAGAGACGTTTTCCCATGTTTTGATTTTAT 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTTCCATGTGCAGAACCCACAGAGACGTTTTCCCATGTTTTGATTTTAT 192 seq1 ATGCCTCCTACACAAGTACTGGTAGAATGTTCAGCGAATGCTCAACATAT 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGCCTCCTACACAAGTACTGGTAGAATGTTCAGCGAATGCTCAACATAT 242 seq1 TGAATTTGGACTTAGCAACAAATGATAATTCTTAGAAATGATTAATGATA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAATTTGGACTTAGCAACAAATGATAATTCTTAGAAATGATTAATGATA 292 seq1 TAAAATAGCATTTGGAAATGAGTCAATAACTTACTGTATATCTATCTATC 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAAAATAGCATTTGGAAATGAGTCAATAACTTACTGTATATCTATCTATC 342 seq1 TATCTGTTTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATATCTATCTATCTATC 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATCTGTTTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATATCTATCTATCTATC 392 seq1 TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCT 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCT 442 seq1 ATTCTATTTGAAATAGTACTTCTTAACATGGGAATAAGTTGAAGATTTTC 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTCTATTTGAAATAGTACTTCTTAACATGGGAATAAGTTGAAGATTTTC 492 seq1 CTTATTCTTTACAAGACCAAATGGTTTAATTAGGAAACGTGAAGATCCAA 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTATTCTTTACAAGACCAAATGGTTTAATTAGGAAACGTGAAGATCCAA 542 seq1 CAAAGATCCATATCATGCCTCAAATGTAATGTTGTAGATTCAGGACCATG 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAAAGATCCATATCATGCCTCAAATGTAATGTTGTAGATTCAGGACCATG 592 seq1 TATAAATTCATTTTATTACTGTCTCAAGGAAATTCAAATTATTTTAGAAG 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATAAATTCATTTTATTACTGTCTCAAGGAAATTCAAATTATTTTAGAAG 642 seq1 AATTTCCTCTCTCATATAAAAACTGCCAGGAATTTTCTAATATGTGAACC 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATTTCCTCTCTCATATAAAAACTGCCAGGAATTTTCTAATATGTGAACC 692 seq1 TTGGAAATATGTAGTTCAGATATCAATTAACAACAAGGTTCTTCAGCAGT 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGGAAATATGTAGTTCAGATATCAATTAACAACAAGGTTCTTCAGCAGT 742 seq1 CATTATCACCAGCAGAACTATTCAGGTTATTATAATAATAAGGACTGCTT 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATTATCACCAGCAGAACTATTCAGGTTATTATAATAATAAGGACTGCTT 792 seq1 TAATTTCTAGAACTGCAGTAACAGCAAACTTCTTTTGAAGCAGAAATGAT 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAATTTCTAGAACTGCAGTAACAGCAAACTTCTTTTGAAGCAGAAATGAT 842 seq1 TTCACTCAGAGTTAAAAAAAAAAAAGTAGAAGAATTC 887 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTCACTCAGAGTTAAAAAAAAAAAAGTAGAAGAATTC 879

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr5_84069276_84070162
seq2: B6Ng01-027O15.b_42_920 (reverse)

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      ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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