MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-074H22
Chromosome	5 (Build37)
Map Location	84,754,183 - 84,755,351
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	Epha5
Upstream gene	Srd5a2l2, LOC100039608, LOC231368, LOC100039489
Downstream gene	none
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-074H22.b	B6Ng01-074H22.g
ACC	DH891329	DH891330
length	904	1,157
definition	DH891329\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074H22, 5' end.	DH891330\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074H22, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattcaagggtattacctactttcttttctaggttcagtgtatctggtt ttatgttgacagttgatccaagaaacaaagagaataatacaaagagaaaa tgaaactcaaagttgattctttgagaaaaccaacaagatagaccaacttt tatcaaaataaactaaaatattgggaaataatagccatattaacacgata agaaacagaaagagagatgtaacaatagacaccaaggaaaacaatatatt cataagaacatattttaaaaacctgtgttccactaaattattaaatttaa aagaaatggataattttcttgataggtaccacttaccaaaattaaattaa gattagataaatagtttatagtataacccctagttaaataggaacagtca ttaacaatctcccaaccaaagaatttgtccaatagcagatggttttagca ccgaattttaccagacattcaaagaactgttaatgccaatattcctcaaa ttatttcacaagctacagagataggaaaaattgtctgatttattttatga ggctacagttaccttgatacccaaagtatgtaaagccttaacaaaaagat aattaaagaccaatttttcttattaacacacgtacaatgttcaatgaaac acttggaaatcttatccaataacacatcaaataaatcatgtaattcaata ggcttcatctccaaagattcaagatgaatcaatattaaaaaaaaaaaaaa aagaaaagaaaaaaagaaaacacatgggtcacctgatttatatgcagaaa aagccattaaaaaaattcaacaccacttcacaataaaagtttctagagag ataagataagaaatataatagacatacatatatgtgaaaaaaataaaatg tatc	gaattcctaaggcttccactgggtgagatcaaagagcctgctaaaatcct ccctgacatctctgacccacattctcactcccatcatctcataagtatct gactaaaaacattaatgacaatgttgaaaatatggcttagaatgaaaggg aacaaaaagcaaggacaatattctgtaaaactattgtagaactccaaacc cccagtagagcatggtttaagctgaaagaaccaaaactcatctattttta ttatccttatgtgtcatacaggaaaataaacatgagggatgagctagtta attgccagttcatggtgtttcctcctatctgaagggtatgtgcacatgta tacacacacacaatcatgaacatacatacatggatacatagagcgcatac atacctgcaaacacaggtgcaaaaattcataaacacctgcatacatacat atgaatacacatgcatgcatacatgcacatatccacccatgaatatacag tcacacacacaaaaaccactttcattttatacttgtataactcctaacat tggctgaaattttaaaattaagattagtttcttattgttgaataaaatag cattcttattgttgagtaaaatagaaccaacagttcaatttctttgatgt ttttttggtaatgtgcctaattaaaaataactaggctccccaatgaataa ttacaggaacacctaatatgctatacttccagccacttttttgtgcatca aaaatatgagccagaaatatgaatgatcaccatattgtttccctgctgta tctgaactcctttcttgaatcttagctctttcctgagttgggtattttca actttttccttgctgcgccattcatctcccagtttggacaattaacaaga gcttttcctccacagcccttgaggggcaccatgctttacctgtattttag cacgcactatataccttctcactccactggttttggcagtgacccacaat ccaatctctttcccatttatagaagtgcaccatatatgtaggctaattct attactacttcatccactcacagtgatgagaatgatggcttgctctgcat cttgagtatgcagcaccagtcacgggaactcagcagtcaacatttgaatt catgtga
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr5_84754183_84755351 seq2: B6Ng01-074H22.g_71_1227 seq1 GAATTCCTAAGGCTTCCACTGGGTGAGATCAAAGAGCCTGCTAAAATCCT 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCCTAAGGCTTCCACTGGGTGAGATCAAAGAGCCTGCTAAAATCCT 50 seq1 CCCTGACATCTCTGACCCACATTCTCACTCCCATCATCTCATAAGTATCT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCTGACATCTCTGACCCACATTCTCACTCCCATCATCTCATAAGTATCT 100 seq1 GACTAAAAACATTAATGACAATGTTGAAAATATGGCTTAGAATGAAAGGG 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACTAAAAACATTAATGACAATGTTGAAAATATGGCTTAGAATGAAAGGG 150 seq1 AACAAAAAGCAAGGACAATATTCTGTAAAACTATTGTAGAACTCCAAACC 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACAAAAAGCAAGGACAATATTCTGTAAAACTATTGTAGAACTCCAAACC 200 seq1 CCCAGTAGAGCATGGTTTAAGCTGAAAGAACCAAAACTCATCTATTTTTA 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCAGTAGAGCATGGTTTAAGCTGAAAGAACCAAAACTCATCTATTTTTA 250 seq1 TTATCCTTATGTGTCATACAGGAAAATAAACATGAGGGATGAGCTAGTTA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTATCCTTATGTGTCATACAGGAAAATAAACATGAGGGATGAGCTAGTTA 300 seq1 ATTGCCAGTTCATGGTGTTTCCTCCTATCTGAAGGGTATGTGCACATGTA 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTGCCAGTTCATGGTGTTTCCTCCTATCTGAAGGGTATGTGCACATGTA 350 seq1 TACACACACACAATCATGAACATACATACATGGATACATAGAGCGCATAC 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TACACACACACAATCATGAACATACATACATGGATACATAGAGCGCATAC 400 seq1 ATACCTGCAAACACAGGTGCAAAAATTCATAAACACCTGCATACATACAT 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATACCTGCAAACACAGGTGCAAAAATTCATAAACACCTGCATACATACAT 450 seq1 ATGAATACACATGCATGCATACATGCACATATCCACCCATGAATATACAG 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGAATACACATGCATGCATACATGCACATATCCACCCATGAATATACAG 500 seq1 TCACACACACAAAAACCACTTTCATTTTATACTTGTATAACTCCTAACAT 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCACACACACAAAAACCACTTTCATTTTATACTTGTATAACTCCTAACAT 550 seq1 TGGCTGAAATTTTAAAATTAAGATTAGTTTCTTATTGTTGAATAAAATAG 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGCTGAAATTTTAAAATTAAGATTAGTTTCTTATTGTTGAATAAAATAG 600 seq1 CATTCTTATTGTTGAGTAAAATAGAACCAACAGTTCAATTTCTTTGATG- 649 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATTCTTATTGTTGAGTAAAATAGAACCAACAGTTCAATTTCTTTGATGT 650 seq1 TTTTTTGGTAATGTGCCTAATTAAAAATAACTAGGCTCCCCAATGAATAA 699 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTTTTGGTAATGTGCCTAATTAAAAATAACTAGGCTCCCCAATGAATAA 700 seq1 TTACAGGAACACCTAATATGCTATACTTCCAGCCACTTTTTTGTGCATCA 749 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTACAGGAACACCTAATATGCTATACTTCCAGCCACTTTTTTGTGCATCA 750 seq1 AAAATATGAGCCAGAAATATGAATGATCACCATATTG-TTCCCTGCTGTA 798 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAATATGAGCCAGAAATATGAATGATCACCATATTGTTTCCCTGCTGTA 800 seq1 TCTGAACT-CTTTC-TGAATCTAAGCTCTTTCCTGAGTTGGGTATTTTCA 846 \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTGAACTCCTTTCTTGAATCTTAGCTCTTTCCTGAGTTGGGTATTTTCA 850 seq1 --CTTTTCCTTGCTGCG-CAATCATCTCCCAG-TTGGACAATTAACAAGA 892 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTTTTTCCTTGCTGCGCCATTCATCTCCCAGTTTGGACAATTAACAAGA 900 seq1 GCTTTTCCTCCACAGCCCTTGAGGGGCAACATGCTTTACCCTGTATTTTA 942 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTTTTCCTCCACAGCCCTTGAGGGGCACCATGCTTTA-CCTGTATTTTA 949 seq1 GCACGCACTATATACCTTCTTCACTCCAACTGGTTTTGGCAGTGACCCAC 992 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCACGCACTATATACCTTC-TCACTCC-ACTGGTTTTGGCAGTGACCCAC 997 seq1 AATCTAAATCTCTTTTCCCCATTTAATAGAAGTGAAACCATAATTATGTA 1042 \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| seq2 AATC-CAATCTCTTT--CCCATTT-ATAGAAGTG-CACCATA--TATGTA 1040 seq1 GGGCTAATTTCAAATTACTACTTCATTCCACTCACAAGTGATGAAGATTA 1092 \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| seq2 -GGCTAATT--CTATTACTACTTCA-TCCACTCAC-AGTGATG-AGAATG 1084 seq1 GTGGTCTTGCTCTGCATC-TGAGTATGCCAGCAACACAAGCACGGGAGAA 1141 \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\| seq2 ATGG-CTTGCTCTGCATCTTGAGTATG-CAGCA--CCAGTCACGG--GAA 1128 seq1 CTCAGCAGGCAACATTTG-ATTCATGTGA 1169 \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCAGCAGTCAACATTTGAATTCATGTGA 1157

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr5_84754183_84755351
seq2: B6Ng01-074H22.g_71_1227

seq1  GAATTCCTAAGGCTTCCACTGGGTGAGATCAAAGAGCCTGCTAAAATCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAAGGCTTCCACTGGGTGAGATCAAAGAGCCTGCTAAAATCCT  50

seq1  CCCTGACATCTCTGACCCACATTCTCACTCCCATCATCTCATAAGTATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGACATCTCTGACCCACATTCTCACTCCCATCATCTCATAAGTATCT  100

seq1  GACTAAAAACATTAATGACAATGTTGAAAATATGGCTTAGAATGAAAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAAAACATTAATGACAATGTTGAAAATATGGCTTAGAATGAAAGGG  150

seq1  AACAAAAAGCAAGGACAATATTCTGTAAAACTATTGTAGAACTCCAAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAAGCAAGGACAATATTCTGTAAAACTATTGTAGAACTCCAAACC  200

seq1  CCCAGTAGAGCATGGTTTAAGCTGAAAGAACCAAAACTCATCTATTTTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTAGAGCATGGTTTAAGCTGAAAGAACCAAAACTCATCTATTTTTA  250

seq1  TTATCCTTATGTGTCATACAGGAAAATAAACATGAGGGATGAGCTAGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCTTATGTGTCATACAGGAAAATAAACATGAGGGATGAGCTAGTTA  300

seq1  ATTGCCAGTTCATGGTGTTTCCTCCTATCTGAAGGGTATGTGCACATGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCAGTTCATGGTGTTTCCTCCTATCTGAAGGGTATGTGCACATGTA  350

seq1  TACACACACACAATCATGAACATACATACATGGATACATAGAGCGCATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACACACAATCATGAACATACATACATGGATACATAGAGCGCATAC  400

seq1  ATACCTGCAAACACAGGTGCAAAAATTCATAAACACCTGCATACATACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTGCAAACACAGGTGCAAAAATTCATAAACACCTGCATACATACAT  450

seq1  ATGAATACACATGCATGCATACATGCACATATCCACCCATGAATATACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATACACATGCATGCATACATGCACATATCCACCCATGAATATACAG  500

seq1  TCACACACACAAAAACCACTTTCATTTTATACTTGTATAACTCCTAACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACACACAAAAACCACTTTCATTTTATACTTGTATAACTCCTAACAT  550

seq1  TGGCTGAAATTTTAAAATTAAGATTAGTTTCTTATTGTTGAATAAAATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGAAATTTTAAAATTAAGATTAGTTTCTTATTGTTGAATAAAATAG  600

seq1  CATTCTTATTGTTGAGTAAAATAGAACCAACAGTTCAATTTCTTTGATG-  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CATTCTTATTGTTGAGTAAAATAGAACCAACAGTTCAATTTCTTTGATGT  650

seq1  TTTTTTGGTAATGTGCCTAATTAAAAATAACTAGGCTCCCCAATGAATAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGGTAATGTGCCTAATTAAAAATAACTAGGCTCCCCAATGAATAA  700

seq1  TTACAGGAACACCTAATATGCTATACTTCCAGCCACTTTTTTGTGCATCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGGAACACCTAATATGCTATACTTCCAGCCACTTTTTTGTGCATCA  750

seq1  AAAATATGAGCCAGAAATATGAATGATCACCATATTG-TTCCCTGCTGTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAAATATGAGCCAGAAATATGAATGATCACCATATTGTTTCCCTGCTGTA  800

seq1  TCTGAACT-CTTTC-TGAATCTAAGCTCTTTCCTGAGTTGGGTATTTTCA  846
      |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAACTCCTTTCTTGAATCTTAGCTCTTTCCTGAGTTGGGTATTTTCA  850

seq1  --CTTTTCCTTGCTGCG-CAATCATCTCCCAG-TTGGACAATTAACAAGA  892
         |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTCCTTGCTGCGCCATTCATCTCCCAGTTTGGACAATTAACAAGA  900

seq1  GCTTTTCCTCCACAGCCCTTGAGGGGCAACATGCTTTACCCTGTATTTTA  942
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  GCTTTTCCTCCACAGCCCTTGAGGGGCACCATGCTTTA-CCTGTATTTTA  949

seq1  GCACGCACTATATACCTTCTTCACTCCAACTGGTTTTGGCAGTGACCCAC  992
      ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCACGCACTATATACCTTC-TCACTCC-ACTGGTTTTGGCAGTGACCCAC  997

seq1  AATCTAAATCTCTTTTCCCCATTTAATAGAAGTGAAACCATAATTATGTA  1042
      ||||  |||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||
seq2  AATC-CAATCTCTTT--CCCATTT-ATAGAAGTG-CACCATA--TATGTA  1040

seq1  GGGCTAATTTCAAATTACTACTTCATTCCACTCACAAGTGATGAAGATTA  1092
       ||||||||    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | 
seq2  -GGCTAATT--CTATTACTACTTCA-TCCACTCAC-AGTGATG-AGAATG  1084

seq1  GTGGTCTTGCTCTGCATC-TGAGTATGCCAGCAACACAAGCACGGGAGAA  1141
       ||| ||||||||||||| |||||||| |||||   ||  |||||  |||
seq2  ATGG-CTTGCTCTGCATCTTGAGTATG-CAGCA--CCAGTCACGG--GAA  1128

seq1  CTCAGCAGGCAACATTTG-ATTCATGTGA  1169
      |||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  CTCAGCAGTCAACATTTGAATTCATGTGA  1157

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