BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095E10
Chromosome5 (Build37)
Map Location 24,667,089 - 24,795,011
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalntl5, E130116L18Rik, Galnt11, Mll3
Upstream geneNupl2, LOC434047, LOC100042244, Kcnh2, Nos3, Atg9b, Abcb8, Accn3, Cdk5, Slc4a2, Fastk, Tmub1, Centg3, Gbx1, Asb10, 4931409K22Rik, Abcf2, LOC100042348, Smarcd3, 1700022A21Rik, Nub1, 2810046M22Rik, Crygn, Rheb, Prkag2
Downstream geneGm443, Xrcc2, LOC435835, Actr3b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095E10.bB6Ng01-095E10.g
ACCDH906261DH906262
length1,097661
definitionDH906261|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095E10, 5' end.DH906262|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095E10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,793,904 - 24,795,011)(24,667,089 - 24,667,747)
sequence
gaattcctaacagctatgaggttagtaatgctccagatgttccacccatg
ggtttggtcagtagccacagagtaaacccaagtttggagtatcggcagca
tttgcttcttcgtgggcctccaccaggatctgcaaatcctcccagattag
caacctcttaccggttgaagcaacctaatgtaccatttcctccaacaagc
aatggtgagctttttgttaatcccaaatccattctctgttaaaaagttaa
gcctgctcattctaaaattttgatttactttttaacaatgtgttggtgtg
tagtctttgctaagttgacttgctctggctgttgttttctgtggtgtgat
gtgcatttctatgctctggcctatggcaacaagactgagtctaactctct
gttcaagctgttcagcttgcagacccctgagccacttgccccaactagcc
tgctccatgtggtacagatgaagccatagatagtgcattgttgttctgtt
ctgtttagctgctattgcatacactacctccggcctttgcacatcctctg
tagggcgtatttcttcccacaggaatgcctgggtgcccattctgagaatc
agcacatcttccttacacctgccatgaagttgctttccttctgctcactg
gcatcttatgtgccagccttgtacctcactgcctcctcatccctggattc
tttgccatatttttgtcttccctaagcttatactagaatctggctgtttc
tcatctttgaactctttttgaaagttgcctatattaaagttttttgccta
tattaaagtctttgtaatcttacctgttggctgcctctttcttgttctcc
tgccattttctgccttgacctccacccctctaccccagagattccctcag
tgtagacttgctcttctgagcccttgggccttgttcacagtataccttgg
ctttcacttctctctgatgctgtaatcgcataagttatttgtactcatgc
tctttatttcccatagaactgcagattcagcttacctgtcagaagtggat
ctggtgctctcttgatgcactgaaattgaggatctggtgcttgcttt
gaattctctctgtagactaggctggcctcaaactcacagagatctgactg
tctctgtctctgtctctgcctctgcctctgcctctctgcctctgcctctg
cctctgctaattccaccgcctctttcccctacccccacccccagccctgc
tcccaacccatattcctgtcccagtgccttcttcccttcttttctccctt
gtcactagtctgctgtagtttggatctagagtgtctggaatgggttgtct
gtttggggctcagtccttggcttaacactattggaaggtggaagagcttt
caggaagtggcctaagggctccactgggatagtgcttacccagcacaccc
agaagtctcagttgtatcatcagggtgatgggaagctaactaatgtaggt
ggtgagaagaagctatgttctgtgtttgcaggaagacttctgttgctctt
tcctcactgtgacttctgtaacctacctgcctgagatactcagggaagct
gaaagggctttccacttcctttctttccttttttttttttttgctgaatg
tgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtacgtgtgca
tgtgcatgtgtgttttatagtggtatgtgtacatgaatgcagatgttctc
agtggtcagat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_24793904_24795011
seq2: B6Ng01-095E10.b_47_1143 (reverse)

seq1  AAAGCAAAGCACCAAGATCCTCAAATATGTACAGTGCATCAAGAGAGCA-  49
      ||||| ||||||| ||||||||||     | |||||||||||||||||| 
seq2  AAAGC-AAGCACC-AGATCCTCAA----TTTCAGTGCATCAAGAGAGCAC  44

seq1  CAGATCCACTTCCTGACAGGTAAGCTGATACTGCAAGTTCTATGGGAAAT  99
      ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||
seq2  CAGATCCACTT-CTGACAGGTAAGCTGAATCTGC-AGTTCTATGGGAAAT  92

seq1  AAAGAGCAATGAGTACAAATAACTTATGCGATTTACAGCATCAGAGAGAA  149
      ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGC-ATGAGTACAAATAACTTATGCGA-TTACAGCATCAGAGAGAA  140

seq1  GTGAAAGCCAAGGTATACTGTGAACAAGGCCCAAGGGCTCAGAAGAGCAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAGCCAAGGTATACTGTGAACAAGGCCCAAGGGCTCAGAAGAGCAA  190

seq1  GTCTACACTGAGGGAATCTCCTGGGGTAGAGGGGTGGAGGTCAAGGCAGA  249
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACACTGAGGGAATCT-CTGGGGTAGAGGGGTGGAGGTCAAGGCAGA  239

seq1  AAATGGCAGGAGAAACAAGAAAGAGGCAGCCAACAGGTAAGATTACAAAG  299
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCAGGAG-AACAAGAAAGAGGCAGCCAACAGGTAAGATTACAAAG  288

seq1  ACTTTAATATAGGCAAAAAACTTTAATATAGGCAACTTTCAAAAAGAGTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTAATATAGGCAAAAAACTTTAATATAGGCAACTTTCAAAAAGAGTT  338

seq1  CAAAGATGAGAAACAGCCAGATTCTAGTATAAGCTTAGGGAAGACAAAAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATGAGAAACAGCCAGATTCTAGTATAAGCTTAGGGAAGACAAAAA  388

seq1  TATGGCAAAGAATCCAGGGATGAGGAGGCAGTGAGGTACAAGGCTGGCAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCAAAGAATCCAGGGATGAGGAGGCAGTGAGGTACAAGGCTGGCAC  438

seq1  ATAAGATGCCAGTGAGCAGAAGGAAAGCAACTTCATGGCAGGTGTAAGGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGATGCCAGTGAGCAGAAGGAAAGCAACTTCATGGCAGGTGTAAGGA  488

seq1  AGATGTGCTGATTCTCAGAATGGGCACCCAGGCATTCCTGTGGGAAGAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGCTGATTCTCAGAATGGGCACCCAGGCATTCCTGTGGGAAGAAA  538

seq1  TACGCCCTACAGAGGATGTGCAAAGGCCGGAGGTAGTGTATGCAATAGCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGCCCTACAGAGGATGTGCAAAGGCCGGAGGTAGTGTATGCAATAGCA  588

seq1  GCTAAACAGAACAGAACAACAATGCACTATCTATGGCTTCATCTGTACCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAACAGAACAGAACAACAATGCACTATCTATGGCTTCATCTGTACCA  638

seq1  CATGGAGCAGGCTAGTTGGGGCAAGTGGCTCAGGGGTCTGCAAGCTGAAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAGCAGGCTAGTTGGGGCAAGTGGCTCAGGGGTCTGCAAGCTGAAC  688

seq1  AGCTTGAACAGAGAGTTAGACTCAGTCTTGTTGCCATAGGCCAGAGCATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGAACAGAGAGTTAGACTCAGTCTTGTTGCCATAGGCCAGAGCATA  738

seq1  GAAATGCACATCACACCACAGAAAACAACAGCCAGAGCAAGTCAACTTAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCACATCACACCACAGAAAACAACAGCCAGAGCAAGTCAACTTAG  788

seq1  CAAAGACTACACACCAACACATTGTTAAAAAGTAAATCAAAATTTTAGAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACTACACACCAACACATTGTTAAAAAGTAAATCAAAATTTTAGAA  838

seq1  TGAGCAGGCTTAACTTTTTAACAGAGAATGGATTTGGGATTAACAAAAAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGGCTTAACTTTTTAACAGAGAATGGATTTGGGATTAACAAAAAG  888

seq1  CTCACCATTGCTTGTTGGAGGAAATGGTACATTAGGTTGCTTCAACCGGT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCATTGCTTGTTGGAGGAAATGGTACATTAGGTTGCTTCAACCGGT  938

seq1  AAGAGGTTGCTAATCTGGGAGGATTTGCAGATCCTGGTGGAGGCCCACGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGTTGCTAATCTGGGAGGATTTGCAGATCCTGGTGGAGGCCCACGA  988

seq1  AGAAGCAAATGCTGCCGATACTCCAAACTTGGGTTTACTCTGTGGCTACT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCAAATGCTGCCGATACTCCAAACTTGGGTTTACTCTGTGGCTACT  1038

seq1  GACCAAACCCATGGGTGGAACATCTGGAGCATTACTAACCTCATAGCTGT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAACCCATGGGTGGAACATCTGGAGCATTACTAACCTCATAGCTGT  1088

seq1  TAGGAATTC  1108
      |||||||||
seq2  TAGGAATTC  1097

seq1: chr5_24667089_24667747
seq2: B6Ng01-095E10.g_71_730

seq1  GAATTCTCTCTGTAGACTAGGCTGGCCTCAAACTCACAGAGATCTGACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCTGTAGACTAGGCTGGCCTCAAACTCACAGAGATCTGACTG  50

seq1  TCTCTGTCTCTGTCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTCTGCCTCTGCCTCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTCTCTGTCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCTCTGCCTCTGCCTCTG  100

seq1  CCTCTGCTAATTCCACCGCCTCTTTCCCCTACCCCCACCCCCAGCCCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCTAATTCCACCGCCTCTTTCCCCTACCCCCACCCCCAGCCCTGC  150

seq1  TCCCAACCCATATTCCTGTCCCAGTGCCTTCTTCCCTTCTTTTCTCCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAACCCATATTCCTGTCCCAGTGCCTTCTTCCCTTCTTTTCTCCCTT  200

seq1  GTCACTAGTCTGCTGTAGTTTGGATCTAGAGTGTCTGGAATGGGTTGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTAGTCTGCTGTAGTTTGGATCTAGAGTGTCTGGAATGGGTTGTCT  250

seq1  GTTTGGGGCTCAGTCCTTGGCTTAACACTATTGGAAGGTGGAAGAGCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGGCTCAGTCCTTGGCTTAACACTATTGGAAGGTGGAAGAGCTTT  300

seq1  CAGGAAGTGGCCTAAGGGCTCCACTGGGATAGTGCTTACCCAGCACACCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGTGGCCTAAGGGCTCCACTGGGATAGTGCTTACCCAGCACACCC  350

seq1  AGAAGTCTCAGTTGTATCATCAGGGTGATGGGAAGCTAACTAATGTAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTCTCAGTTGTATCATCAGGGTGATGGGAAGCTAACTAATGTAGGT  400

seq1  GGTGAGAAGAAGCTATGTTCTGTGTTTGCAGGAAGACTTCTGTTGCTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGAAGAAGCTATGTTCTGTGTTTGCAGGAAGACTTCTGTTGCTCTT  450

seq1  TCCTCACTGTGACTTCTGTAACCTACCTGCCTGAGATACTCAGGGAAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCACTGTGACTTCTGTAACCTACCTGCCTGAGATACTCAGGGAAGCT  500

seq1  GAAAGGGCTTTCCACTTCCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTGCTGAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGCTTTCCACTTCCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTGCTGAATG  550

seq1  TGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTACGTGTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTACGTGTGCA  600

seq1  TGTGCATGTGTG-TTTATAGTGGTATGTGTACATGAGTGCAGATGTTCCC  649
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
seq2  TGTGCATGTGTGTTTTATAGTGGTATGTGTACATGAATGCAGATGTTCTC  650

seq1  AGTGGTCAGA  659
      ||||||||||
seq2  AGTGGTCAGA  660