BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095E15
Chromosome5 (Build37)
Map Location 134,223,145 - 134,403,348
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666038, LOC100039750
Upstream geneLOC100039731
Downstream geneGats, Wbscr16, Gtf2ird2, Ncf1, Gtf2i, LOC630424, Gtf2ird1, LOC100039820, Clip2, EG666071, Gm52, Rfc2, Lat2, Eif4h, LOC638081, Limk1, Eln, Wbscr28, Cldn13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095E15.bB6Ng01-095E15.g
ACCDH906271DH906272
length1,0691,058
definitionDH906271|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095E15, 5' end.DH906272|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095E15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(134,223,145 - 134,224,222)(134,402,279 - 134,403,348)
sequence
gaattccagccctcagaggctgagacaggaggatggtgaatttaaggtca
tgtgtacataaagagtttaacaaagccagctgtgctacatcacaaaagct
ggtgtccaacacgtacacatacacaaaggaaacaggagggaaggaagaga
caggaaggaggaaacggaagaggtgaagagaaaactgagtggcgattaga
ggaagaggaggaaaggaaagaagacggagaacatgaatgcagtggaagaa
atcaaaagaaagagggagaatcaaggaggaagaaggagaaggaaaagcag
gaagaagataagaagagacgggggcttcaagggcctttccacgtcatcct
tgattcaagcatcctaagagccctgtgagaccaggctccaaggaccaaag
ctggcattgggaccaaagctggttcatgtggcgtttgagctctggtgtat
aatagcctgattcagtggatctttggtgagcctgggagatttcccttgcc
ttgagctcttcaccaatattacagtccagggaccaagaggtgaggacttg
tcaaccatttctccatttggtggctggggagagtaggccaccaaaatggt
aggagattcttccaggatgacacagaataagagggtatggatctgtgcac
ctgaacttgaccccgtcagcctctgagtcgcatacatcatgggtcttgag
gaggatcctgatacatcattgcctagctcaaggatcatcttcacaccaac
agagacacacaccacccaacccatccacggtgacctgttccatacgttgg
gattgtacttggaatttggtgggaagtaaaggtttagtacaaaccatctt
tttctttacagtcatttatttatttatgtgtgtgtttgtatgtgtgtgtg
tgtcacatacacatgtgtgatatgcgatgttcacagcacatgcattgaag
ttaaaacacaatttacagagtgaatctctcctttccactcgggggtccag
gattgactcatgtcatcgaacttggatctaatcatcttttctcacgagcc
atgactcagggcccagctc
gaattccctccctcagtagctaccaattgctagtagctcatcagaaaggg
aaaggtcctagagatcacctccccatctatgctgacattttggctggctc
gatctgtacagataagcacagttgctgtgagctcacgactgggataatgg
gatagcttcatcatgtcctaaagagcagtgccaagctctctcctccccac
cctctggtgcttaccattttcattctcatgcttcttctgtgatgtttcct
gagcgttggtggggtgtgtgtgggtctgatatagagctcccatttggggc
aggcactcaatcttctattcccagcacactgacaaatgatgtaactttct
gatgactgctgtttgatgcaaaaagatcctcagagcaaggttagtgctgc
caaggtctacgggtataaacgtaaatagttagcaaccacttgaacagcat
ggccatttagaaaaataatcagagcagtttctaccccagggcccgagtct
ctgttttgattgacaggcttggcttacacaagccttcactcactgtgagt
gctcacatactttcccatgttgcatctgcttttactcacatgcgtgccca
attatgaataggcataagatgataaaaagaatgttctctctaaatgttca
cttagaggacatagtttgccttattgcacacataaccccaaaccagtcta
ggcttattatcattcccagcttccatacaattgaatacaattggatagag
tctgcttaagtttgatggttgttaaagagaagagaaacttactgcattgt
cctgagaagagcgtgcatatggcttgatgtgagtaggcatcctgaggcac
tcacaggttgcttggtgcatcattcagaaagaggtgtgtttgcacagcat
atgcagatagggtctcaagctaccaagtgcattagcagacaggtgctagt
ttgtgcatagctcatgccatgcacagtcttcagctcctaacagtctcgtc
ttgtcgcctcaattggccacagaatacttttactctaggtattaaagcag
attggagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_134223145_134224222
seq2: B6Ng01-095E15.b_48_1116

seq1  GAATTCCAGCCCTCAGAGGCTGAGACAGGAGGATGGTGAATTTAAGGTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCCCTCAGAGGCTGAGACAGGAGGATGGTGAATTTAAGGTCA  50

seq1  TGTGTACATAAAGAGTTTAACAAAGCCAGCTGTGCTACATCACAAAAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTACATAAAGAGTTTAACAAAGCCAGCTGTGCTACATCACAAAAGCT  100

seq1  GGTGTCCAACACGTACACATACACAAAGGAAACAGGAGGGAAGGAAGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCCAACACGTACACATACACAAAGGAAACAGGAGGGAAGGAAGAGA  150

seq1  CAGGAAGGAGGAAACGGAAGAGGTGAAGAGAAAACTGAGTGGCGATTAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGGAGGAAACGGAAGAGGTGAAGAGAAAACTGAGTGGCGATTAGA  200

seq1  GGAAGAGGAGGAAAGGAAAGAAGACGGAGAACATGAATGCAGTGGAAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAGGAGGAAAGGAAAGAAGACGGAGAACATGAATGCAGTGGAAGAA  250

seq1  ATCAAAAGAAAGAGGGAGAATCAAGGAGGAAGAAGGAGAAGGAAAAGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAGAAAGAGGGAGAATCAAGGAGGAAGAAGGAGAAGGAAAAGCAG  300

seq1  GAAGAAGATAAGAAGAGACGGGGGCTTCAAGGGCCTTTCCACGTCATCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGATAAGAAGAGACGGGGGCTTCAAGGGCCTTTCCACGTCATCCT  350

seq1  TGATTCAAGCATCCTAAGAGCCCTGTGAGACCAGGCTCCAAGGACCAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCAAGCATCCTAAGAGCCCTGTGAGACCAGGCTCCAAGGACCAAAG  400

seq1  CTGGCATTGGGACCAAAGCTGGTTCATGTGGCGTTTGAGCTCTGGTGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCATTGGGACCAAAGCTGGTTCATGTGGCGTTTGAGCTCTGGTGTAT  450

seq1  AATAGCCTGATTCAGTGGATCTTTGGTGAGCCTGGGAGATTTCCCTTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCCTGATTCAGTGGATCTTTGGTGAGCCTGGGAGATTTCCCTTGCC  500

seq1  TTGAGCTCTTCACCAATATTACAGTCCAGGGACCAAGAGGTGAGGACTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCTCTTCACCAATATTACAGTCCAGGGACCAAGAGGTGAGGACTTG  550

seq1  TCAACCATTTCTCCATTTGGTGGCTGGGGAGAGTAGGCCACCAAAATGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCATTTCTCCATTTGGTGGCTGGGGAGAGTAGGCCACCAAAATGGT  600

seq1  AGGAGATTCTTCCAGGATGACACAGAATAAGAGGGTATGGATCTGTGCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATTCTTCCAGGATGACACAGAATAAGAGGGTATGGATCTGTGCAC  650

seq1  CTGAACTTGACCCCGTCAGCCTCTGAGTCGCATACATCATGGGTCTTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACTTGACCCCGTCAGCCTCTGAGTCGCATACATCATGGGTCTTGAG  700

seq1  GAGGATCCTGATACATCATTGCCTAGCTCAAGGATCATCTTCACACCAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATCCTGATACATCATTGCCTAGCTCAAGGATCATCTTCACACCAAC  750

seq1  AGAGACACACACCACCCAACCCATCCACGGTGACCTGTTCCATACGTTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACACACACCACCCAACCCATCCACGGTGACCTGTTCCATACGTTGG  800

seq1  GATTGTACTTGGAATTTGGTGGGAAGTAAAGGTTTAGTACAAAACCATCT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GATTGTACTTGGAATTTGGTGGGAAGTAAAGGTTTAGTAC-AAACCATCT  849

seq1  TTTTCTTTACAGTCATTTATTTATTTATGTGTGTGTTTGTATGTGTGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTACAGTCATTTATTTATTTATGTGTGTGTTTGTATGTGTGTGT  899

seq1  GTGTACACATACACATGTGTGTATATGCGATGTGTCACAGCACATGCATT  950
      |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTGT-CACATACACATGTGTG-ATATGCGATGT-TCACAGCACATGCATT  946

seq1  GAGGTTATACAACAATTTACAGGAGTTGATTCTCTCC-TTCCACTCTGGG  999
      || |||| |  |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||
seq2  GAAGTTAAAACACAATTTACA-GAG-TGAATCTCTCCTTTCCACTCGGGG  994

seq1  GTCCCAGGAATTGAACTCAGGTCATCAGACTTGGACTCAATCATCTTTAC  1049
      || ||||| |||| ||||| ||||||  |||||||   |||||||||| |
seq2  GT-CCAGG-ATTG-ACTCATGTCATCGAACTTGGATCTAATCATCTTTTC  1041

seq1  TCACCGAGCCATATCTCAGGCCCCAGCTC  1078
      ||| ||||||||  |||||| ||||||||
seq2  TCA-CGAGCCATGACTCAGGGCCCAGCTC  1069

seq1: chr5_134402279_134403348
seq2: B6Ng01-095E15.g_67_1124 (reverse)

seq1  ACTCCAATCTGCTTTATTACCTAGGAGTAAAAAGGTA-TCTGTGGGCCAA  49
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||
seq2  ACTCCAATCTGCTTTAATACCTA-GAGTAAAA--GTATTCTGT-GGCCAA  46

seq1  TTTGAGGCCGACAAGGACGAGAACTTGTTTAGGAAGCTG-AGACTGTGCA  98
       |||||| |||||| |||||| |||   ||||| ||||| ||||||||||
seq2  -TTGAGG-CGACAA-GACGAG-ACT--GTTAGG-AGCTGAAGACTGTGCA  89

seq1  TGGCATGAGCTATGCACAAACCTAGCACCTGTCTGCTAATGCACTTGGTA  148
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATGAGCTATGCACAAA-CTAGCACCTGTCTGCTAATGCACTTGGTA  138

seq1  GCCTGAGACCCTTATCTGCATATGCTGTGCAAACACACCTCTTTCTGAAT  198
      || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAGACCC-TATCTGCATATGCTGTGCAAACACACCTCTTTCTGAAT  187

seq1  GATGCACCAAGCAACCTGTGAGTGCCTCAGGATGCCTACTCACATCAAGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCACCAAGCAACCTGTGAGTGCCTCAGGATGCCTACTCACATCAAGC  237

seq1  CATATGCACGCTCTTCTCAGGACAATGCAGTAAGTTTCTCTTCTCTTTAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCACGCTCTTCTCAGGACAATGCAGTAAGTTTCTCTTCTCTTTAA  287

seq1  CAACCATCAAACTTAAGCAGACTCTATCCAATTGTATTCAATTGTATGGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATCAAACTTAAGCAGACTCTATCCAATTGTATTCAATTGTATGGA  337

seq1  AGCTGGGAATGATAATTAAGCCTAGACTGGTTTGGGGTTATGTGTGCAAT  398
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGAATGATAA-TAAGCCTAGACTGGTTTGGGGTTATGTGTGCAAT  386

seq1  AAGGCAAACTATGTCCTCTAAGTGAACATTTAGAGAGAACATTCTTTTTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAACTATGTCCTCTAAGTGAACATTTAGAGAGAACATTCTTTTTA  436

seq1  TCATCTTATGCCTATTCATAATTGGGCACGCATGTGAGTAAAAGCAGATG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTTATGCCTATTCATAATTGGGCACGCATGTGAGTAAAAGCAGATG  486

seq1  CAACATGGGAAAGTATGTGAGCACTCACAGTGAGTGAAGGCTTGTGTAAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGGGAAAGTATGTGAGCACTCACAGTGAGTGAAGGCTTGTGTAAG  536

seq1  CCAAGCCTGTCAATCAAAACAGAGACTCGGGCCCTGGGGTAGAAACTGCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCCTGTCAATCAAAACAGAGACTCGGGCCCTGGGGTAGAAACTGCT  586

seq1  CTGATTATTTTTCTAAATGGCCATGCTGTTCAAGTGGTTGCTAACTATTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTATTTTTCTAAATGGCCATGCTGTTCAAGTGGTTGCTAACTATTT  636

seq1  ACGTTTATACCCGTAGACCTTGGCAGCACTAACCTTGCTCTGAGGATCTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTTATACCCGTAGACCTTGGCAGCACTAACCTTGCTCTGAGGATCTT  686

seq1  TTTGCATCAAACAGCAGTCATCAGAAAGTTACATCATTTGTCAGTGTGCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCATCAAACAGCAGTCATCAGAAAGTTACATCATTTGTCAGTGTGCT  736

seq1  GGGAATAGAAGATTGAGTGCCTGCCCCAAATGGGAGCTCTATATCAGACC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATAGAAGATTGAGTGCCTGCCCCAAATGGGAGCTCTATATCAGACC  786

seq1  CACACACACCCCACCAACGCTCAGGAAACATCACAGAAGAAGCATGAGAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACCCCACCAACGCTCAGGAAACATCACAGAAGAAGCATGAGAA  836

seq1  TGAAAATGGTAAGCACCAGAGGGTGGGGAGGAGAGAGCTTGGCACTGCTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAATGGTAAGCACCAGAGGGTGGGGAGGAGAGAGCTTGGCACTGCTC  886

seq1  TTTAGGACATGATGAAGCTATCCCATTATCCCAGTCGTGAGCTCACAGCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGACATGATGAAGCTATCCCATTATCCCAGTCGTGAGCTCACAGCA  936

seq1  ACTGTGCTTATCTGTACAGATCGAGCCAGCCAAAATGTCAGCATAGATGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGCTTATCTGTACAGATCGAGCCAGCCAAAATGTCAGCATAGATGG  986

seq1  GGAGGTGATCTCTAGGACCTTTCCCTTTCTGATGAGCTACTAGCAATTGG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTGATCTCTAGGACCTTTCCCTTTCTGATGAGCTACTAGCAATTGG  1036

seq1  TAGCTACTGAGGGAGGGAATTC  1070
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTACTGAGGGAGGGAATTC  1058