BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-123B15
Chromosome5 (Build37)
Map Location 104,055,781 - 104,203,785
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc10a6, 1700016H13Rik, Aff1
Upstream geneArhgap24, Mapk10, LOC666563, 4930429D17Rik, LOC100041039, 1700021F02Rik, LOC100041049, Ptpn13
Downstream geneKlhl8, Hsd17b13, EG666629, Hsd17b11, Nudt9, Sparcl1, LOC100041136, Dspp, Dmp1, LOC100041145, Ibsp, Mepe, Spp1, Pkd2, BC005561, LOC100042165, LOC100041172, D930016D06Rik, 2310012P17Rik, LOC640963, LOC100041199
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-123B15.bB6Ng01-123B15.g
ACCDH926361DH926362
length1,0331,060
definitionDH926361|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-123B15, 5' end.DH926362|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-123B15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,202,745 - 104,203,785)(104,055,781 - 104,056,871)
sequence
gaattcatcataaaactgtgctggacagagaggggaagggggaaaagatg
tttgggtaagatatgatagcaaatatatacttatttttaaatcaacagac
tggggataatgtttatgtgttatgctggggtagagagagtgatctgcaca
aaaggacacttgtcagacatgaggaccctgggaagtcacatgtcggttgg
aggagagatccctgtgacctctcctcagacctccatttggtgctgtggca
tgtggcatgtgtagacctacacactatacatgatggatagatagatggat
ggatggacggacagcaaactgatagaaagacagatgaatgttatgtttag
ggctaaatggacactgggcctgggcctgggcctggggctgtctctcttct
ttctcactgctatctcacggtctagaactgcatgtggctcacctcacaag
aggctctctagctctgcaccatgcttcatctctttcagttactatccaaa
gataacttatccacggtcaccttatctactcggggatcctgtaattctca
atccagctctaactccctaggctacccagacaccggggagggcaaactgc
cacaaacctgctctgtgcttggttgaaaatgagttcgcttccatgaacac
aacacatctattttgaaaagatgcactttcacgacataattttgataaaa
caggcagtagtaaaccattcttgtactgtttaatgcatcggctgatattc
aagtaccaaacaggaaaaaagaaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaat
gtattcccaaattcattcaaatgattcaaaatcattcaactctgaactag
atagtgactggggtgaccagatgaactttttcctcacaagacatcattca
gaagcagttagtgttattgttgtttaaaaatagctctatagtccataaga
aaataacattgctaacattaagcggggtattttttggtttgtttggtttt
gttttgagacaccggtcactgatacagtccatc
gaattcaatacccttttctggcttcatttggaacctgatatgcatgtggt
gcacaaacatacatgcaagaaaaacatccacatacattaaaataagtgaa
tacttttttttttaagtttaaaactgattaagccagacaggatggcacac
acctttaatcctggcactctagaggcagaagtatctctgagttcgagcaa
agtgagcttgggaacagccaggactacacagagaaaccctgcctcaaaaa
caaaaacaaacaaacaaaaccccaaaatcccaaaacaagcacaacaaagc
ctactgaggacagagttggtgccagacatggtagtacacacctgtaatcc
cagcactagggaattggagacaacaagagcaggagttcaaagccgggctg
ggctatatgagaccttgtctcaataaaacaaaagcaaaataaacagttgg
taacaagaaacaaaaggtttcttccacacactttctgttcattagtgtgt
ttgtgacaacgaagatgaagcaggggtactggtgataaatattctcttac
gcagaagtgtttcaaaacactgctaaagacttcagatcttactccagatg
atgcagttgtgctgccaaacgtcatggggaaaactaagttacaaacagat
ataaaaccgatgcaaattccagcgtgagctctgctctattctttgcagct
attgctgagctactaaactgacttgaatcttttttttttctttcagaata
ataaaaggtcacttacaaggtgactatgagaatccgggagaaggtgaagc
ccacacctccccaggactctgaataccagtttcctttctttccagaagtc
ctcaggcctggacttcatcactgtcaggtgagtgttgatggacacttcat
tgaactccagtaaggggcattaggagtggagatacaagtatcagattcct
tttgagtctctgtagtgatgactagagtcatacatacagacaagtattac
tgtctatgtgtagcactattaaatgtaattgaatctgtcatacgaaaata
tcgtatgtgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_104202745_104203785
seq2: B6Ng01-123B15.b_49_1081 (reverse)

seq1  GATGGACTGTATCAAGTGACC-GTGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAAAC  49
      ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||
seq2  GATGGACTGTATC-AGTGACCGGTGTCTC-AAAACAAAACCAAAC-AAAC  47

seq1  CAAAAAATACCCCCGCTTAATGTTTAGCATGTTTAATTTTTCTTATGGAC  99
      ||||||||| |||||||||||| ||||||   |||  |||||||||||||
seq2  CAAAAAATA-CCCCGCTTAATG-TTAGCAATGTTA--TTTTCTTATGGAC  93

seq1  TATAGAGCTATTTTTAAAACAACAATAACACTAACTTGCTTCTGAATGAT  149
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TATAGAGCTATTTTT-AAACAACAATAACACTAAC-TGCTTCTGAATGAT  141

seq1  GTCTTGTGAGGAAAAATGTTCATCTGGTCA-CCCAGTCACTATCTAGTTC  198
      |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGTGAGGAAAAA-GTTCATCTGGTCACCCCAGTCACTATCTAGTTC  190

seq1  AGAGTTGAATGATTTTGAATCATTTGAATGAATTTGGGAATACATTTGTT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTGAATGATTTTGAATCATTTGAATGAATTTGGGAATACATTTGTT  240

seq1  TGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTCTTTTTTCCTGTTTGGTACTTGAATATC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTCTTTTTTCCTGTTTGGTACTTGAATATC  290

seq1  AGCCGATGCATTAAACAGTACAAGAATGGTTTACTACTGCCTGTTTTATC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGATGCATTAAACAGTACAAGAATGGTTTACTACTGCCTGTTTTATC  340

seq1  AAAATTATGTCGTGAAAGTGCATCTTTTCAAAATAGATGTGTTGTGTTCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTATGTCGTGAAAGTGCATCTTTTCAAAATAGATGTGTTGTGTTCA  390

seq1  TGGAAGCGAACTCATTTTCAACCAAGCACAGAGCAGGTTTGTGGCAGTTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGCGAACTCATTTTCAACCAAGCACAGAGCAGGTTTGTGGCAGTTT  440

seq1  GCCCTCCCCGGTGTCTGGGTAGCCTAGGGAGTTAGAGCTGGATTGAGAAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCCCCGGTGTCTGGGTAGCCTAGGGAGTTAGAGCTGGATTGAGAAT  490

seq1  TACAGGATCCCCGAGTAGATAAGGTGACCGTGGATAAGTTATCTTTGGAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGATCCCCGAGTAGATAAGGTGACCGTGGATAAGTTATCTTTGGAT  540

seq1  AGTAACTGAAAGAGATGAAGCATGGTGCAGAGCTAGAGAGCCTCTTGTGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACTGAAAGAGATGAAGCATGGTGCAGAGCTAGAGAGCCTCTTGTGA  590

seq1  GGTGAGCCACATGCAGTTCTAGACCGTGAGATAGCAGTGAGAAAGAAGAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGCCACATGCAGTTCTAGACCGTGAGATAGCAGTGAGAAAGAAGAG  640

seq1  AGACAGCCCCAGGCCCAGGCCCAGGCCCAGTGTCCATTTAGCCCTAAACA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGCCCCAGGCCCAGGCCCAGGCCCAGTGTCCATTTAGCCCTAAACA  690

seq1  TAACATTCATCTGTCTTTCTATCAGTTTGCTGTCCGTCCATCCATCCATC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATTCATCTGTCTTTCTATCAGTTTGCTGTCCGTCCATCCATCCATC  740

seq1  TATCTATCCATCATGTATAGTGTGTAGGTCTACACATGCCACATGCCACA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCCATCATGTATAGTGTGTAGGTCTACACATGCCACATGCCACA  790

seq1  GCACCAAATGGAGGTCTGAGGAGAGGTCACAGGGATCTCTCCTCCAACCG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAAATGGAGGTCTGAGGAGAGGTCACAGGGATCTCTCCTCCAACCG  840

seq1  ACATGTGACTTCCCAGGGTCCTCATGTCTGACAAGTGTCCTTTTGTGCAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGACTTCCCAGGGTCCTCATGTCTGACAAGTGTCCTTTTGTGCAG  890

seq1  ATCACTCTCTCTACCCCAGCATAACACATAAACATTATCCCCAGTCTGTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTCTCTCTACCCCAGCATAACACATAAACATTATCCCCAGTCTGTT  940

seq1  GATTTAAAAATAAGTATATATTTGCTATCATATCTTACCCAAACATCTTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTAAAAATAAGTATATATTTGCTATCATATCTTACCCAAACATCTTT  990

seq1  TCCCCCTTCCCCTCTCTGTCCAGCACAGTTTTATGATGAATTC  1041
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCTTCCCCTCTCTGTCCAGCACAGTTTTATGATGAATTC  1033

seq1: chr5_104055781_104056871
seq2: B6Ng01-123B15.g_69_1128

seq1  GAATTCAATACCCTTTTCTGGCTTCATTTGGAACCTGATATGCATGTGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATACCCTTTTCTGGCTTCATTTGGAACCTGATATGCATGTGGT  50

seq1  GCACAAACATACATGCAAGAAAAACATCCACATACATTAAAATAAGTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAACATACATGCAAGAAAAACATCCACATACATTAAAATAAGTGAA  100

seq1  TACTTTTTTTTTTAAGTTTAAAACTGATTAAGCCAGACAGGATGGCACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTTTTTTTTAAGTTTAAAACTGATTAAGCCAGACAGGATGGCACAC  150

seq1  ACCTTTAATCCTGGCACTCTAGAGGCAGAAGTATCTCTGAGTTCGAGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTAATCCTGGCACTCTAGAGGCAGAAGTATCTCTGAGTTCGAGCAA  200

seq1  AGTGAGCTTGGGAACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGCCTCAAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCTTGGGAACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGCCTCAAAAA  250

seq1  CAAAAACAAACAAACAAAACCCCAAAATCCCAAAACAAGCACAACAAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAACAAACAAACAAAACCCCAAAATCCCAAAACAAGCACAACAAAGC  300

seq1  CTACTGAGGACAGAGTTGGTGCCAGACATGGTAGTACACACCTGTAATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGAGGACAGAGTTGGTGCCAGACATGGTAGTACACACCTGTAATCC  350

seq1  CAGCACTAGGGAATTGGAGACAACAAGAGCAGGAGTTCAAAGCCGGGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACTAGGGAATTGGAGACAACAAGAGCAGGAGTTCAAAGCCGGGCTG  400

seq1  GGCTATATGAGACCTTGTCTCAATAAAACAAAAGCAAAATAAACAGTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATATGAGACCTTGTCTCAATAAAACAAAAGCAAAATAAACAGTTGG  450

seq1  TAACAAGAAACAAAAGGTTTCTTCCACACACTTTCTGTTCATTAGTGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAGAAACAAAAGGTTTCTTCCACACACTTTCTGTTCATTAGTGTGT  500

seq1  TTGTGACAACGAAGATGAAGCAGGGGTACTGGTGATAAATATTCTCTTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGACAACGAAGATGAAGCAGGGGTACTGGTGATAAATATTCTCTTAC  550

seq1  GCAGAAGTGTTTCAAAACACTGCTAAAGACTTCAGATCTTACTCCAGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAGTGTTTCAAAACACTGCTAAAGACTTCAGATCTTACTCCAGATG  600

seq1  ATGCAGTTGTGCTGCCAAACGTCATGGGGAAAACTAAGTTACAAACAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTTGTGCTGCCAAACGTCATGGGGAAAACTAAGTTACAAACAGAT  650

seq1  ATAAAACCGATGCAAATTCCAGCGTGAGCTCTGCTCTATTCTTTGCAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAACCGATGCAAATTCCAGCGTGAGCTCTGCTCTATTCTTTGCAGCT  700

seq1  ATTGCTGAGCTACTAAACTGACTTGAATCTTTTTTTTTTCTTTCAGAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGAGCTACTAAACTGACTTGAATCTTTTTTTTTTCTTTCAGAATA  750

seq1  ATAAAAGGTCACTTACAAGGTGACTATGAGAATCCGGGAGAAGGTGAAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGGTCACTTACAAGGTGACTATGAGAATCCGGGAGAAGGTGAAGC  800

seq1  CCACACCTCCCCAGGACCTCTGAATACCAGTTTCCTTTCTTTCCAGAAGT  850
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACCTCCCCAGGA-CTCTGAATACCAGTTTCCTTTCTTTCCAGAAGT  849

seq1  CCTCAGGGCCTGGACTTCATCACTGTCAGGTGAGTGTTGATGGACAACTT  900
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCTCA-GGCCTGGACTTCATCACTGTCAGGTGAGTGTTGATGGAC-ACTT  897

seq1  CATTGAACTTCAAGTAAGGGGCATTAGGAGTGGAGATACAAGGTAATCAA  950
      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |
seq2  CATTGAAC-TCCAGTAAGGGGCATTAGGAGTGGAGATACAAG--TATC-A  943

seq1  GAATTTCCTTTTGAGTCTCTTGTAAGTGAGTGACTAAGAGTCATTACCAT  1000
      ||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||   |||
seq2  GA--TTCCTTTTGAGTCTC-TGT-AGTGA-TGACT-AGAGTCAT--ACAT  985

seq1  ACAAGACAGGTTAATTACCTGTCTATGTGGTATGCACCTATTAAAATGTA  1050
      || ||||| ||  |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||   | 
seq2  AC-AGACAAGT--ATTA-CTGTCTATGT-GTA-GCA-CTATTAAA---TG  1025

seq1  TAAGTGAAATCTGTTCCATATACGAAATATTCAGTATGTGC  1091
      ||| || |||||||     |||||||| ||   ||||||||
seq2  TAATTG-AATCTGT----CATACGAAA-ATATCGTATGTGC  1060