BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129E16
Chromosome5 (Build37)
Map Location 128,208,192 - 128,314,106
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem132d
Upstream geneLOC100040327, Tmem132c, Slc15a4, Glt1d1
Downstream geneFzd10, LOC100040398, Piwil1, Rimbp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129E16.bB6Ng01-129E16.g
ACCDH930916DH930917
length1,150756
definitionDH930916|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129E16, 5' end.DH930917|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129E16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,312,944 - 128,314,106)(128,208,192 - 128,208,947)
sequence
gaattcctgccaaggctatccattggccaaaccccactgcacccagtggg
aagagattggttgttgtcattaatacagatcagcttcattttagaaggca
atggacatgagaagacagagcctgagtggggagggacagaagaggaacaa
gcagccatgccaaagctcgtgtaaaagcatcatagttgcttttgagtgta
gaaaaagaagaagtaaagtccagtgctcaaagcactcacttgctgcagag
gctttgagttggtacctgtgtctgtctcatcagctcaggaccaaacacaa
ccatatcttctattagtcgacgctcatctcttaagagcacatcttctgca
taatcagcatatccagaatctttcatccttgccctctgatgcctctccac
ataatccagaaaccctgagggcttgcaccgtccaagtgaagttaggaggc
cagtcatagaactcgatggcaaagatcccctgctgctgttgcctctttca
ggctcatgggggcgcctctgagtggccctgtgaaactcagttgccacttg
gctgatgttggctcagtaacatattgtcctaagtgttgacaagaatactc
accccatcaagtgtctactgctgtcagctctaactgccttgacaaaagtc
gcataggctaggtggcgtatgcatcattgtctagcagctctagagcctgc
aggtcctaagtgggatgggtctagggaggctctcttctgcctggctcaca
caaagataccttgccactgcatcctcacatggctgtgcgttctcacatgg
ccttttctctgtgtctagggacagtaactctctggcctttccatttctct
ctaagaacctattgggacctgaggatcccaccttctgactttcgttcact
tccttaaaagtccctaagtatgtcagcctagagaatcaacatgcaaagtg
ggaagctggtctgttggtggctcttctgccctgtgtcatgcctgacagga
acaccttgaagaatattttggctcaggtttgagggtacacctgccatgtc
ggaagcatggtggcaagacccctcttgccatgatagcaagggtgtgaagc
tgtctccacatagatcaggagcaagaatgaggaaaatggtgccctgatgg

gaattcacttgatccttctttgaacactatgaggcttgagctatgagcaa
ctatgaggttgaagtcactaaggtatgtgttaaaagcatatcttttgtct
ctggctcctttctgtttcctggattccatgaatcgagcaatatttctcta
caacatgttgcccgaatggcaatctccctcaccctatcccagaagcaata
gagtcaatgacacacattgaagttagtgaaaccatgggctattcttcctt
gggtccaggcgctagtctccaaacagtggcacaggacagtaccgtggatc
cacacatttctggaggatgcaaggtaagccctcactggaggtctaggatg
gttatgaaggctgaatgtttttcaaggtctttcatcttcctccatcccat
gtagggtgtgcagtccatatagctaacttcatggtggtgttgggcttgaa
agcccagcttccttaggtaactgggatacaggtgaatactggcattggtg
actgagttcactggtctgctcttttggagagttcccttgttcctttccat
acttggggtttcagggctgcagtcagcaaagtctgaagcatggtgcccag
gcagaaagcttgcatagctgcagcagcaagccacaggaacaggtgcatag
ccttttaccttccccagcctagacgttgctttggtacttggtccatctgg
agtggtacatggcctctggacttgtgtctggggaatggaatgtggtgggg
aaagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_128312944_128314106
seq2: B6Ng01-129E16.b_48_1197 (reverse)

seq1  CCATCAGGGCACCAATATCTCCTCATCTCTGCTTCCTGATCTGATGT-GA  49
      ||||||||||||||   | ||||||| |||   ||||||||| |||| ||
seq2  CCATCAGGGCACCA--TTTTCCTCAT-TCTTGCTCCTGATCT-ATGTGGA  46

seq1  G-CAGCCTCACACCCCTGCTATCATGGCCAAGA-GTGTCTTGCCACCATG  97
      | |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||
seq2  GACAGCTTCACACCCTTGCTATCATGG-CAAGAGGGGTCTTGCCACCATG  95

seq1  CTTTCCGACCATGGCAGGTTGTACCCTCAAACCCTGAGCCAAAATAATTT  147
      | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||
seq2  C-TTCCGA-CATGGCAGG-TGTACCCTCAAA-CCTGAGCCAAAATA--TT  139

seq1  CTTTCAAGGTGTTCCTTGTCAGGCATTGACACAAGGGCAGAAGAGCCACC  197
      | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  C-TTCAAGGTGTTCC-TGTCAGGCA-TGACAC-AGGGCAGAAGAGCCACC  185

seq1  AACAGACCAGCTTCCCACTTTGCATGTTGATTCTCTAGGCTGACATACTT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACCAGCTTCCCACTTTGCATGTTGATTCTCTAGGCTGACATACTT  235

seq1  AGGGACTTTTTAAGGAAGTGAACGAAAGTCAGAAGGTGGGATCCTCAGGT  297
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAC-TTTTAAGGAAGTGAACGAAAGTCAGAAGGTGGGATCCTCAGGT  284

seq1  CCCAATAGGTTCTTAGAGAGAAATGGAAAGGCCAGAGAGTTACTGTCCCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATAGGTTCTTAGAGAGAAATGGAAAGGCCAGAGAGTTACTGTCCCT  334

seq1  AGACACAGAGAAAAGGCCATGTGAGAACGCACAGCCATGTGAGGATGCAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAGAGAAAAGGCCATGTGAGAACGCACAGCCATGTGAGGATGCAG  384

seq1  TGGCAAGGTATCTTTGTGTGAGCCAGGCAGAAGAGAGCCTCCCTAGACCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAGGTATCTTTGTGTGAGCCAGGCAGAAGAGAGCCTCCCTAGACCC  434

seq1  ATCCCACTTAGGACCTGCAGGCTCTAGAGCTGCTAGACAATGATGCATAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCACTTAGGACCTGCAGGCTCTAGAGCTGCTAGACAATGATGCATAC  484

seq1  GCCACCTAGCCTATGCGACTTTTGTCAAGGCAGTTAGAGCTGACAGCAGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTAGCCTATGCGACTTTTGTCAAGGCAGTTAGAGCTGACAGCAGT  534

seq1  AGACACTTGATGGGGTGAGTATTCTTGTCAACACTTAGGACAATATGTTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACTTGATGGGGTGAGTATTCTTGTCAACACTTAGGACAATATGTTA  584

seq1  CTGAGCCAACATCAGCCAAGTGGCAACTGAGTTTCACAGGGCCACTCAGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCCAACATCAGCCAAGTGGCAACTGAGTTTCACAGGGCCACTCAGA  634

seq1  GGCGCCCCCATGAGCCTGAAAGAGGCAACAGCAGCAGGGGATCTTTGCCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGCCCCCATGAGCCTGAAAGAGGCAACAGCAGCAGGGGATCTTTGCCA  684

seq1  TCGAGTTCTATGACTGGCCTCCTAACTTCACTTGGACGGTGCAAGCCCTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGTTCTATGACTGGCCTCCTAACTTCACTTGGACGGTGCAAGCCCTC  734

seq1  AGGGTTTCTGGATTATGTGGAGAGGCATCAGAGGGCAAGGATGAAAGATT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTTCTGGATTATGTGGAGAGGCATCAGAGGGCAAGGATGAAAGATT  784

seq1  CTGGATATGCTGATTATGCAGAAGATGTGCTCTTAAGAGATGAGCGTCGA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATATGCTGATTATGCAGAAGATGTGCTCTTAAGAGATGAGCGTCGA  834

seq1  CTAATAGAAGATATGGTTGTGTTTGGTCCTGAGCTGATGAGACAGACACA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAGAAGATATGGTTGTGTTTGGTCCTGAGCTGATGAGACAGACACA  884

seq1  GGTACCAACTCAAAGCCTCTGCAGCAAGTGAGTGCTTTGAGCACTGGACT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCAACTCAAAGCCTCTGCAGCAAGTGAGTGCTTTGAGCACTGGACT  934

seq1  TTACTTCTTCTTTTTCTACACTCAAAAGCAACTATGATGCTTTTACACGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTCTTCTTTTTCTACACTCAAAAGCAACTATGATGCTTTTACACGA  984

seq1  GCTTTGGCATGGCTGCTTGTTCCTCTTCTGTCCCTCCCCACTCAGGCTCT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGCATGGCTGCTTGTTCCTCTTCTGTCCCTCCCCACTCAGGCTCT  1034

seq1  GTCTTCTCATGTCCATTGCCTTCTAAAATGAAGCTGATCTGTATTAATGA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCTCATGTCCATTGCCTTCTAAAATGAAGCTGATCTGTATTAATGA  1084

seq1  CAACAACCAATCTCTTCCCACTGGGTGCAGTGGGGTTTGGCCAATGGATA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAACCAATCTCTTCCCACTGGGTGCAGTGGGGTTTGGCCAATGGATA  1134

seq1  GCCTTGGCAGGAATTC  1163
      ||||||||||||||||
seq2  GCCTTGGCAGGAATTC  1150

seq1: chr5_128208192_128208947
seq2: B6Ng01-129E16.g_69_824

seq1  GAATTCACTTGATCCTTCTTTGAACACTATGAGGCTTGAGCTATGAGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTGATCCTTCTTTGAACACTATGAGGCTTGAGCTATGAGCAA  50

seq1  CTATGAGGTTGAAGTCACTAAGGTATGTGTTAAAAGCATATCTTTTGTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAGGTTGAAGTCACTAAGGTATGTGTTAAAAGCATATCTTTTGTCT  100

seq1  CTGGCTCCTTTCTGTTTCCTGGATTCCATGAATCGAGCAATATTTCTCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCCTTTCTGTTTCCTGGATTCCATGAATCGAGCAATATTTCTCTA  150

seq1  CAACATGTTGCCCGAATGGCAATCTCCCTCACCCTATCCCAGAAGCAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGTTGCCCGAATGGCAATCTCCCTCACCCTATCCCAGAAGCAATA  200

seq1  GAGTCAATGACACACATTGAAGTTAGTGAAACCATGGGCTATTCTTCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAATGACACACATTGAAGTTAGTGAAACCATGGGCTATTCTTCCTT  250

seq1  GGGTCCAGGCGCTAGTCTCCAAACAGTGGCACAGGACAGTACCGTGGATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCAGGCGCTAGTCTCCAAACAGTGGCACAGGACAGTACCGTGGATC  300

seq1  CACACATTTCTGGAGGATGCAAGGTAAGCCCTCACTGGAGGTCTAGGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATTTCTGGAGGATGCAAGGTAAGCCCTCACTGGAGGTCTAGGATG  350

seq1  GTTATGAAGGCTGAATGTTTTTCAAGGTCTTTCATCTTCCTCCATCCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGAAGGCTGAATGTTTTTCAAGGTCTTTCATCTTCCTCCATCCCAT  400

seq1  GTAGGGTGTGCAGTCCATATAGCTAACTTCATGGTGGTGTTGGGCTTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGTGTGCAGTCCATATAGCTAACTTCATGGTGGTGTTGGGCTTGAA  450

seq1  AGCCCAGCTTCCTTAGGTAACTGGGATACAGGTGAATACTGGCATTGGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGCTTCCTTAGGTAACTGGGATACAGGTGAATACTGGCATTGGTG  500

seq1  ACTGAGTTCACTGGTCTGCTCTTTTGGAGAGTTCCCTTGTTCCTTTCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGTTCACTGGTCTGCTCTTTTGGAGAGTTCCCTTGTTCCTTTCCAT  550

seq1  ACTTGGGGTTTCAGGGCTGCAGTCAGCAAAGTCTGAAGCATGGTGCCCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGGTTTCAGGGCTGCAGTCAGCAAAGTCTGAAGCATGGTGCCCAG  600

seq1  GCAGAAAGCTTGCATAGCTGCAGCAGCAAGCCACAGGAACAGGTGCATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAAGCTTGCATAGCTGCAGCAGCAAGCCACAGGAACAGGTGCATAG  650

seq1  CCTTTTACCTTCCCCAGCCTAGACGTTGCTTTGGTACTTGGTCCATCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTACCTTCCCCAGCCTAGACGTTGCTTTGGTACTTGGTCCATCTGG  700

seq1  AGTGGTACATGGCCTCTGGACTTGTGTCTGGGGAATGGAATGTGGTGGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTACATGGCCTCTGGACTTGTGTCTGGGGAATGGAATGTGGTGGGG  750

seq1  AAAGTA  756
      ||||||
seq2  AAAGTA  756