BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130G17
Chromosome5 (Build37)
Map Location 26,589,319 - 26,722,385
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC664837
Upstream geneLOC100038949, EG272714, EG545739, Speer4a, EG664804, LOC619645, LOC100039045, 5031410I06Rik, LOC434689
Downstream gene4930584F24Rik, Dpp6, B930011P16Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130G17.bB6Ng01-130G17.g
ACCDH931739DH931740
length1,0401,138
definitionDH931739|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130G17, 5' end.DH931740|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130G17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,721,327 - 26,722,385)(26,589,319 - 26,590,461)
sequence
gaattcagagacccatgcttaccagtcaatttcactgagctgcctttcca
tcttcatgtagaattatttttaatgacatgcctgctatgtgtagatcatg
agaaccccctcatgtagaccaagtacacaatgaaagtagtgccaatggat
gtcagggttttggggttgcctctcttttcagcattagactcttctctttt
taaagtgcccagactgtacatgccattcatagtaacaaaggcaatttgtc
aacacagctttggttaattttcttctgtgtaaaccataagcctgcctgtc
tttctgaggtggttagtacattgcaaggccttttagcttggattatgcca
tcactaagtgttataggcagaattctgttcccttacccaaatgtttcaga
ccgtaaatctctaacctaagacacccatcggcttgtggctgtgctcagag
ataagatctttaaacagctgtggtgttgctgtggctcatgacttaatctg
acccaggtctgtccttacaggagaggaagcatgggcctgaggatacacct
gggaagcaggagcacttgtgtaggagacaggaggtcccaagcttgagtct
caacaccaacttttaaaatggaaatataaacataacctggtaactttcag
acagaagtttattcccggaggaaccaaatacaaagttatgaagtcagatg
tccataaatattgagtaagatacaagctatagaataagggtaagaagagg
cagctctgatgagtctatagagctatttccacgcttgggaagaagatccc
gcaaagagccagggagaaaaaccatctaccagtcatggaagaaaacctca
gagaaaagtgtccttgatcttaaaacttcaagcctcagattaatataata
aaatgggcatcctgccaaaagcaacctacagattcagtgcaatcccatca
aattccaaatcaattatttatagttagaagagcaatttgtaaatcatttg
gaaaacaaaataaaaaccaggatttctttgttttttttgc
gaattctcttactcctaacatatagcactctataacacacattcattcat
gatcccgtgaaccagatactgagtaatataatatacagccattgttctag
agctgctgcggatataaaaacactcagaaaggaatataaaataaatcagg
aaggccagagccatctgcctcagtttacttgcaatagagcatcagtgatt
gaggtgaacaatggcttccctttggttctggcctgaaagggtcagagacg
ttaactgggagaaagttcaggggtccttcctcctgaaagggagggatgtc
taaacatgactttctgtgagccagagtttttccttgttcctagtcaagag
ttaatatttaccctgagaggaagatgtccttgggtcttcagataacagtt
tcttcttctgaaattcattcttgttatgagaaaatgactccaaaatagat
aatattgtttgccagatgcaactaagtaaaaatgttattttttgagcaaa
attagcaaagtcatatcccatgtttttaagctgtagaaatcagtaaagct
ttgctacttgccaccagagcagtaatccatctgtttctttaaggcattcg
agaagctggtcttcatcaagtgttaaccacatagcagatataatgacctt
ccatggcttgctggggaaatagcttttgatagatgctgctgtccttgacc
ataaacttgctgtgtttttgctgttgctgattagacttatgtttaacatt
tatgtgaatggggtgtctttcctactgaatgtaatactgtatgtggctcc
tcctgagggacatttccttcagaggacagaaggaaccacaaccattcctg
gagatgattgttaggcaccatgtgggtcttctagagagcagcagatgctc
tacctgtgaggcatccccacacctcctgcagttggcttttgtccttccag
aagatgtgctgttttagattggacaggatcaagtccagttgagtgagaca
tctctggaagatggtgtaagtacagtgcctgacctgcgaatactcattgt
cctatgctgccagccatgatgcaaggcctctgatggtaccacctggcagt
cttgtgttcgaagccttttattggacaaatagggaaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_26721327_26722385
seq2: B6Ng01-130G17.b_43_1082 (reverse)

seq1  GCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCTGGTTTTTTATTTTGTTAT  50
                  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |
seq2  ----------GCAAAAAAAACAAAGAAATCCTGG-TTTTTATTTTGTT-T  38

seq1  TCCAAATGAATTTACAAATTGCTCTTTCTAACTATAAATAATTGATTTGG  100
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAATG-ATTTACAAATTGCTC-TTCTAACTATAAATAATTGATTTGG  86

seq1  AATTTTGATGGGGATTGCACTGAATCTGTAGGTTGCTTTTGGCAGGATGG  150
      || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AA-TTTGAT-GGGATTGCACTGAATCTGTAGGTTGCTTTTGGCAGGATGC  134

seq1  CCATTTTTATTATATTAATCCTGAGGCTTGAAGTTTTAAGATCAAGGACA  200
      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCA-TTTTATTATATTAAT-CTGAGGCTTGAAGTTTTAAGATCAAGGACA  182

seq1  CTTTTTCTCTGAGGTTTTCTTCCATGACTGGTAGATGGTTTTTCTCCCTG  250
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TTTTCTCTGAGGTTTTCTTCCATGACTGGTAGATGGTTTTTCTCCCTG  231

seq1  GCTCTTTGCGGGATCTTCTTCCCAAGCGTGGAAATAGCTCTATAGACTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTTGCGGGATCTTCTTCCCAAGCGTGGAAATAGCTCTATAGACTCA  281

seq1  TCAGAGCTGCCTCTTCTTACCCTTATTCTATAGCTTGTATCTTACTCAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGCTGCCTCTTCTTACCCTTATTCTATAGCTTGTATCTTACTCAAT  331

seq1  ATTTATGGACATCTGACTTCATAACTTTGTATTTGGTTCCTCCGGGAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGGACATCTGACTTCATAACTTTGTATTTGGTTCCTCCGGGAATA  381

seq1  AACTTCTGTCTGAAAGTTACCAGGTTATGTTTATATTTCCATTTTAAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCTGTCTGAAAGTTACCAGGTTATGTTTATATTTCCATTTTAAAAG  431

seq1  TTGGTGTTGAGACTCAAGCTTGGGACCTCCTGTCTCCTACACAAGTGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGTTGAGACTCAAGCTTGGGACCTCCTGTCTCCTACACAAGTGCTC  481

seq1  CTGCTTCCCAGGTGTATCCTCAGGCCCATGCTTCCTCTCCTGTAAGGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCCCAGGTGTATCCTCAGGCCCATGCTTCCTCTCCTGTAAGGACA  531

seq1  GACCTGGGTCAGATTAAGTCATGAGCCACAGCAACACCACAGCTGTTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGGGTCAGATTAAGTCATGAGCCACAGCAACACCACAGCTGTTTAA  581

seq1  AGATCTTATCTCTGAGCACAGCCACAAGCCGATGGGTGTCTTAGGTTAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTTATCTCTGAGCACAGCCACAAGCCGATGGGTGTCTTAGGTTAGA  631

seq1  GATTTACGGTCTGAAACATTTGGGTAAGGGAACAGAATTCTGCCTATAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTACGGTCTGAAACATTTGGGTAAGGGAACAGAATTCTGCCTATAAC  681

seq1  ACTTAGTGATGGCATAATCCAAGCTAAAAGGCCTTGCAATGTACTAACCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGTGATGGCATAATCCAAGCTAAAAGGCCTTGCAATGTACTAACCA  731

seq1  CCTCAGAAAGACAGGCAGGCTTATGGTTTACACAGAAGAAAATTAACCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGAAAGACAGGCAGGCTTATGGTTTACACAGAAGAAAATTAACCAA  781

seq1  AGCTGTGTTGACAAATTGCCTTTGTTACTATGAATGGCATGTACAGTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTGTTGACAAATTGCCTTTGTTACTATGAATGGCATGTACAGTCTG  831

seq1  GGCACTTTAAAAAGAGAAGAGTCTAATGCTGAAAAGAGAGGCAACCCCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTTTAAAAAGAGAAGAGTCTAATGCTGAAAAGAGAGGCAACCCCAA  881

seq1  AACCCTGACATCCATTGGCACTACTTTCATTGTGTACTTGGTCTACATGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGACATCCATTGGCACTACTTTCATTGTGTACTTGGTCTACATGA  931

seq1  GGGGGTTCTCATGATCTACACATAGCAGGCATGTCATTAAAAATAATTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTTCTCATGATCTACACATAGCAGGCATGTCATTAAAAATAATTCT  981

seq1  ACATGAAGATGGAAAGGCAGCTCAGTGAAATTGACTGGTAAGCATGGGTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAAGATGGAAAGGCAGCTCAGTGAAATTGACTGGTAAGCATGGGTC  1031

seq1  TCTGAATTC  1059
      |||||||||
seq2  TCTGAATTC  1040

seq1: chr5_26589319_26590461
seq2: B6Ng01-130G17.g_68_1205

seq1  GAATTCTCTTACTCCTAACATATAGCACTCTATAACACACATTCATTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTACTCCTAACATATAGCACTCTATAACACACATTCATTCAT  50

seq1  GATCCCGTGAACCAGATACTGAGTAATATAATATACAGCCATTGTTCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCGTGAACCAGATACTGAGTAATATAATATACAGCCATTGTTCTAG  100

seq1  AGCTGCTGCGGATATAAAAACACTCAGAAAGGAATATAAAATAAATCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCTGCGGATATAAAAACACTCAGAAAGGAATATAAAATAAATCAGG  150

seq1  AAGGCCAGAGCCATCTGCCTCAGTTTACTTGCAATAGAGCATCAGTGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCAGAGCCATCTGCCTCAGTTTACTTGCAATAGAGCATCAGTGATT  200

seq1  GAGGTGAACAATGGCTTCCCTTTGGTTCTGGCCTGAAAGGGTCAGAGACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGAACAATGGCTTCCCTTTGGTTCTGGCCTGAAAGGGTCAGAGACG  250

seq1  TTAACTGGGAGAAAGTTCAGGGGTCCTTCCTCCTGAAAGGGAGGGATGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTGGGAGAAAGTTCAGGGGTCCTTCCTCCTGAAAGGGAGGGATGTC  300

seq1  TAAACATGACTTTCTGTGAGCCAGAGTTTTTCCTTGTTCCTAGTCAAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACATGACTTTCTGTGAGCCAGAGTTTTTCCTTGTTCCTAGTCAAGAG  350

seq1  TTAATATTTACCCTGAGAGGAAGATGTCCTTGGGTCTTCAGATAACAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATTTACCCTGAGAGGAAGATGTCCTTGGGTCTTCAGATAACAGTT  400

seq1  TCTTCTTCTGAAATTCATTCTTGTTATGAGAAAATGACTCCAAAATAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTCTGAAATTCATTCTTGTTATGAGAAAATGACTCCAAAATAGAT  450

seq1  AATATTGTTTGCCAGATGCAACTAAGTAAAAATGTTATTTTTTGAGCAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGTTTGCCAGATGCAACTAAGTAAAAATGTTATTTTTTGAGCAAA  500

seq1  ATTAGCAAAGTCATATCCCATGTTTTTAAGCTGTAGAAATCAGTAAAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCAAAGTCATATCCCATGTTTTTAAGCTGTAGAAATCAGTAAAGCT  550

seq1  TTGCTACTTGCCACCAGAGCAGTAATCCATCTGTTTCTTTAAGGCATTCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTACTTGCCACCAGAGCAGTAATCCATCTGTTTCTTTAAGGCATTCG  600

seq1  AGAAGCTGGTCTTCATCAAGTGTTAACCACATAGCAGATATAATGACCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCTGGTCTTCATCAAGTGTTAACCACATAGCAGATATAATGACCTT  650

seq1  CCATGGCTTGCT-GGGAAATAGCTTTTGATAGATGCTGCTGTCCTTGACC  699
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGCTTGCTGGGGAAATAGCTTTTGATAGATGCTGCTGTCCTTGACC  700

seq1  ATAAACTTGCTGTGTTTTTGCTGTTGCTGATTAGACTTATGTTTAACATT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTTGCTGTGTTTTTGCTGTTGCTGATTAGACTTATGTTTAACATT  750

seq1  TATGTGAAT-GGGTGTCTTTCCTACTGAATGTAATACTGTATGTGGCTCC  798
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAATGGGGTGTCTTTCCTACTGAATGTAATACTGTATGTGGCTCC  800

seq1  TCCTGAGGGACATTTCCTTCAGAGGACAGAAGGAACCACAACCATTCCTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGGGACATTTCCTTCAGAGGACAGAAGGAACCACAACCATTCCTG  850

seq1  GAGATGATTGTTAGGCACCATGTGGGTCTTCTAGAGAGCAGCAGATGCTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGATTGTTAGGCACCATGTGGGTCTTCTAGAGAGCAGCAGATGCTC  900

seq1  TAACCTGTGAGGCATCCCCACACCTCCTGCAGTTGGCTTTTGTCCTTCCA  948
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T-ACCTGTGAGGCATCCCCACACCTCCTGCAGTTGGCTTTTGTCCTTCCA  949

seq1  GAGAATGTGCTGTTTTAGA-TGGACAGGATCAAGTCCAGTTGAGTGGAGA  997
      ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GAAGATGTGCTGTTTTAGATTGGACAGGATCAAGTCCAGTTGAGT-GAGA  998

seq1  CATCTCTGG-AGAT-GTGTAAGTACAGTGCCTGACCTGCGAATACTCATT  1045
      ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTGGAAGATGGTGTAAGTACAGTGCCTGACCTGCGAATACTCATT  1048

seq1  GTCCTATGCTGCCAGGCATGTATGC-AGGGCTCTGATGTTACCA-CTGGC  1093
      ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||
seq2  GTCCTATGCTGCCAGCCATG-ATGCAAGGCCTCTGATGGTACCACCTGGC  1097

seq1  AGTTCTGTGTTCAGAGCCTTTTAATTGGACAAAATGGGGTAGGGGGAAAG  1143
      |||  |||||||  |||||||| ||||||||||      ||  |||||||
seq2  AGTCTTGTGTTCGAAGCCTTTT-ATTGGACAAA------TA--GGGAAAG  1138