BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-157G15
Chromosome5 (Build37)
Map Location 119,312,892 - 119,459,556
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039488
Upstream geneNos1, Fbxo21, Tesc, Fbxw8, Hrk, Tmem118, 2410131K14Rik, LOC665162, Thrap2
Downstream geneEG665194, LOC100039529, LOC100039542, Tbx3, EG433945, Tbx5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-157G15.bB6Ng01-157G15.g
ACCDH951653DH951654
length1,053989
definitionDH951653|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157G15, 5' end.DH951654|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157G15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,312,892 - 119,313,950)(119,458,568 - 119,459,556)
sequence
gaattccatttctcagcaacttctcatgttcggtatcctgagtcccaaag
cccctgtgtctctggatggcttgagatgctgagaaagttaccaccagaag
ggctttgttagccttcgactctgaaatgttccctcctgcttgcagggttt
ggtccctaactggcattttgaaggtatcagaaggaacctttaggaggcca
ggctggaagaaataggcctctaggagcaggctgtgagggttgcaccctct
cctcctctgctctcttgtctatggggacagagaaatcacagccacccact
cctgtgaacacttccatgccccactgtgctgaacccctgacaaccctgag
tcaaatctgtccttttaaagttgtttggttaggtatttcagtcagggtgc
ctttgtagatgtgggtgagagtctgggagacacctatgtgatgttgtcag
tttcttgtgtccctggaacacggttagacaacagaaacaggcagtctaat
tgagagaagtgcactcctgaaagccaaaggcaggcttctgagctagagaa
gatggtgctgaccctcaggccttttataactcacttacacagcaatgcac
cttctgcacctgtgtctcttggcttatggaaggctcctcttttcttgaat
ttatcctgggtgggaaagggtttccagggctttccatcagctggcttctt
tcatggcttaatcttgacgacccctcacccttcctctccctctcctcctg
ccactgtggcacaaaagcagccctaacagtcccctaaccttggatggatg
caaggtgaccggtgcctgtaggaacttctgctggcagccctgacggagac
tagaatgggcatcagattggaggagtcaggattagaggacttcagaatct
gctgccattcctccatatcttgaaccagtattatgagactggtgttatca
gaaactaaaaatttctctccagaaggccagtgtcccagggcgcagtggat
gagtctctcctctttccttaaggtcattgatgctcatgtcagtcatctac
agg
gaattctccttgaaagcctttgactccctgaagtgagatgaacgaactgc
actgatcgtagtgatgagaccacatctacccctgttcatccaggatggag
ggaggtcacatttccccgggatgaccctccctctctcaaccagcaactaa
aaaagcagccagagacactaaggcatgggcccgacctgaagacaggtgag
agacttcactaatgggtcgactcaaggcctccctcctcctccccgtggcc
ttgctgaacttcctgggtctgggtggtagtgtaggaaggacacttccacc
caacctccctccctactgccttgcctttgaatgggactctggagcaatct
gtagactctctgcctctgaccacctccagcgtctttgtatttgtcttgat
atcctttcattggcatctgcttctcacaggactaaccagaaggcagaaca
agccagacccacagtcagagggctctccccatccttagaaggtcattttc
aaaggggtcaacatgttgtttatagtgaatttgaaagcggctataagact
atactctttgaaattcagtgttctgggcctggaaagatggctcaggggtt
aagagcacttgttgttcttgcaggggacctggggtcagtttccagcacac
atacacactgtgtgattcattagtgcctgtgactccagtgccagggagat
ctaatgtcctcttctgacctctgtgggtacccaactatacatgcacatgg
acacacaaagctgacagacagacacacagacacacacacagacacagaca
cagacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cagatatgtgccatgtgttttcagatgctggcagaaaaccagatgagggc
gttggatccttgtaatgcagtcatagacagtgggagctatccatatgagt
gctaggaactgactcaggtcccctcaatgttgctctctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_119312892_119313950
seq2: B6Ng01-157G15.b_46_1098

seq1  GAATTCCATTTCTCAGCAACTTCTCATGTTCGGTATCCTGAGTCCCAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTTCTCAGCAACTTCTCATGTTCGGTATCCTGAGTCCCAAAG  50

seq1  CCCCTGTGTCTCTGGATGGCTTGAGATGCTGAGAAAGTTACCACCAGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGTGTCTCTGGATGGCTTGAGATGCTGAGAAAGTTACCACCAGAAG  100

seq1  GGCTTTGTTAGCCTTCGACTCTGAAATGTTCCCTCCTGCTTGCAGGGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTGTTAGCCTTCGACTCTGAAATGTTCCCTCCTGCTTGCAGGGTTT  150

seq1  GGTCCCTAACTGGCATTTTGAAGGTATCAGAAGGAACCTTTAGGAGGCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCCTAACTGGCATTTTGAAGGTATCAGAAGGAACCTTTAGGAGGCCA  200

seq1  GGCTGGAAGAAATAGGCCTCTAGGAGCAGGCTGTGAGGGTTGCACCCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGAAGAAATAGGCCTCTAGGAGCAGGCTGTGAGGGTTGCACCCTCT  250

seq1  CCTCCTCTGCTCTCTTGTCTATGGGGACAGAGAAATCACAGCCACCCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTCTGCTCTCTTGTCTATGGGGACAGAGAAATCACAGCCACCCACT  300

seq1  CCTGTGAACACTTCCATGCCCCACTGTGCTGAACCCCTGACAACCCTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGAACACTTCCATGCCCCACTGTGCTGAACCCCTGACAACCCTGAG  350

seq1  TCAAATCTGTCCTTTTAAAGTTGTTTGGTTAGGTATTTCAGTCAGGGTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATCTGTCCTTTTAAAGTTGTTTGGTTAGGTATTTCAGTCAGGGTGC  400

seq1  CTTTGTAGATGTGGGTGAGAGTCTGGGAGACACCTATGTGATGTTGTCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTAGATGTGGGTGAGAGTCTGGGAGACACCTATGTGATGTTGTCAG  450

seq1  TTTCTTGTGTCCCTGGAACACGGTTAGACAACAGAAACAGGCAGTCTAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGTGTCCCTGGAACACGGTTAGACAACAGAAACAGGCAGTCTAAT  500

seq1  TGAGAGAAGTGCACTCCTGAAAGCCAAAGGCAGGCTTCTGAGCTAGAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAAGTGCACTCCTGAAAGCCAAAGGCAGGCTTCTGAGCTAGAGAA  550

seq1  GATGGTGCTGACCCTCAGGCCTTTTATAACTCACTTACACAGCAATGCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTGCTGACCCTCAGGCCTTTTATAACTCACTTACACAGCAATGCAC  600

seq1  CTTCTGCACCTGTGTCTCTTGGCTTATGGAAGGCTCCTCTTTTCTTGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGCACCTGTGTCTCTTGGCTTATGGAAGGCTCCTCTTTTCTTGAAT  650

seq1  TTATCCTGGGTGGGAAAGGGTTTCCAGGGCTTTCCATCAGCTGGCTTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCTGGGTGGGAAAGGGTTTCCAGGGCTTTCCATCAGCTGGCTTCTT  700

seq1  TCATGGCTTAATCTTGACGACCCCTCACCCTTCCTCTCCCTCTCCTCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGCTTAATCTTGACGACCCCTCACCCTTCCTCTCCCTCTCCTCCTG  750

seq1  CCACTGTGGCACAAAAGCAGCCCTAACAGTCCCCTAACCTTGGATGGATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTGGCACAAAAGCAGCCCTAACAGTCCCCTAACCTTGGATGGATG  800

seq1  CAAGGTGACCGGTGCCTGTAGGAACTTCTGCTGGCAGCCCTGACGGAGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTGACCGGTGCCTGTAGGAACTTCTGCTGGCAGCCCTGACGGAGAC  850

seq1  TAGAATGGGCATCAGGATTGGAGGAGTCAGGGATTAGAGGACTTCAGAAT  900
      |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATGGGCATCA-GATTGGAGGAGTCA-GGATTAGAGGACTTCAGAAT  898

seq1  CTGCTGCCATTCCTCCATATCTTGAACCAGTATTATGAGAACTGGTGTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CTGCTGCCATTCCTCCATATCTTGAACCAGTATTATGAG-ACTGGTGTTA  947

seq1  TCAGAGACTAAAAATTTCTCTCCAG-AGGCCAGTGTCCCAGGGGCGCAGT  999
      ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
seq2  TCAGAAACTAAAAATTTCTCTCCAGAAGGCCAGTGTCCCA-GGGCGCAGT  996

seq1  GGATGAAGGTCTCT-CTCTTTCCTTAGGGTCTATGTATGCTCATGTCAGT  1048
      ||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||
seq2  GGATGA--GTCTCTCCTCTTTCCTTAAGGTC-ATTGATGCTCATGTCAGT  1043

seq1  CCATCTACAGG  1059
       ||||||||||
seq2  -CATCTACAGG  1053

seq1: chr5_119458568_119459556
seq2: B6Ng01-157G15.g_68_1056 (reverse)

seq1  GAGAGAGC-ACATGGAGGGGACCTGAGTTCAGTTCCTAGCACTCATATTG  49
      |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  GAGAGAGCAACATTGAGGGGACCTGAG-TCAGTTCCTAGCACTCATA-TG  48

seq1  GGTAGCTCCCAACTGTCTATGACTGCATTTACAAGGATCCAACGCCCTCA  99
      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCTCCC-ACTGTCTATGACTGCA-TTACAAGGATCCAACGCCCTCA  96

seq1  TCTGG-TTTCTGCCAGCATCTGAAAACACATGGCACATATCTGTGTGTGT  148
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTTTTCTGCCAGCATCTGAAAACACATGGCACATATCTGTGTGTGT  146

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCTGT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCTGT  196

seq1  GTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTGTCTGTCAGC-TTGTGTGTCCATGTG  247
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTGTCTGTCAGCTTTGTGTGTCCATGTG  246

seq1  CATGTATAGTTGGGTACCCACAGAGGTCAGAAGAGGACATTAGATCT-CC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATGTATAGTTGGGTACCCACAGAGGTCAGAAGAGGACATTAGATCTCCC  296

seq1  TGGCACTGGAGTCACAGGCACTAATGAATCACACAGTGTGTATGTGTGCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACTGGAGTCACAGGCACTAATGAATCACACAGTGTGTATGTGTGCT  346

seq1  GGAAACTGACCCCAGGTCCCCTGCAAGAACAACAAGTGCTCTTAACCCCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACTGACCCCAGGTCCCCTGCAAGAACAACAAGTGCTCTTAACCCCT  396

seq1  GAGCCATCTTTCCAGGCCCAGAACACTGAATTTCAAAGAGTATAGTCTTA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATCTTTCCAGGCCCAGAACACTGAATTTCAAAGAGTATAGTCTTA  446

seq1  TAGCCGCTTTCAAATTCACTATAAACAACATGTTGACCCCTTTGAAAATG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCGCTTTCAAATTCACTATAAACAACATGTTGACCCCTTTGAAAATG  496

seq1  ACCTTCTAAGGATGGGGAGAGCCCTCTGACTGTGGGTCTGGCTTGTTCTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCTAAGGATGGGGAGAGCCCTCTGACTGTGGGTCTGGCTTGTTCTG  546

seq1  CCTTCTGGTTAGTCCTGTGAGAAGCAGATGCCAATGAAAGGATATCAAGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTGGTTAGTCCTGTGAGAAGCAGATGCCAATGAAAGGATATCAAGA  596

seq1  CAAATACAAAGACGCTGGAGGTGGTCAGAGGCAGAGAGTCTACAGATTGC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATACAAAGACGCTGGAGGTGGTCAGAGGCAGAGAGTCTACAGATTGC  646

seq1  TCCAGAGTCCCATTCAAAGGCAAGGCAGTAGGGAGGGAGGTTGGGTGGAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAGTCCCATTCAAAGGCAAGGCAGTAGGGAGGGAGGTTGGGTGGAA  696

seq1  GTGTCCTTCCTACACTACCACCCAGACCCAGGAAGTTCAGCAAGGCCACG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCTTCCTACACTACCACCCAGACCCAGGAAGTTCAGCAAGGCCACG  746

seq1  GGGAGGAGGAGGGAGGCCTTGAGTCGACCCATTAGTGAAGTCTCTCACCT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGAGGAGGGAGGCCTTGAGTCGACCCATTAGTGAAGTCTCTCACCT  796

seq1  GTCTTCAGGTCGGGCCCATGCCTTAGTGTCTCTGGCTGCTTTTTTAGTTG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCAGGTCGGGCCCATGCCTTAGTGTCTCTGGCTGCTTTTTTAGTTG  846

seq1  CTGGTTGAGAGAGGGAGGGTCATCCCGGGGAAATGTGACCTCCCTCCATC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGAGAGAGGGAGGGTCATCCCGGGGAAATGTGACCTCCCTCCATC  896

seq1  CTGGATGAACAGGGGTAGATGTGGTCTCATCACTACGATCAGTGCAGTTC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATGAACAGGGGTAGATGTGGTCTCATCACTACGATCAGTGCAGTTC  946

seq1  GTTCATCTCACTTCAGGGAGTCAAAGGCTTTCAAGGAGAATTC  989
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATCTCACTTCAGGGAGTCAAAGGCTTTCAAGGAGAATTC  989