MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-169P20
Chromosome	5 (Build37)
Map Location	118,844,056 - 118,844,995
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Ksr2, Nos1, Fbxo21, Tesc, Fbxw8, Hrk, Tmem118, 2410131K14Rik
Downstream gene	LOC665162, Thrap2, LOC100039488, EG665194
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-169P20.b	B6Ng01-169P20.g
ACC	DH960818	DH960819
length	966	1,096
definition	DH960818\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169P20, 5' end.	DH960819\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169P20, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattcaccccctcggctcatttttctcctcttcttgcagttttggatgc tagccaagggaatcgtgtcctgtccagtggtgtgatgcatttcctccctg cctcagttgacctaatcaagataatccctccactggcctgcccacggacc cttctcccagacagttctagattctgtcaagttggcagttaacagcagcc atcagagaacttagtttctttgtaaaattagtttgtgtcaaattatgttc ttataccttaaaacgtttccataaatcctaaacaacttatttccataaat cctaaacaacttaagcttaattgtgaggctatagctatctagtcttcaac cacattagaggcccgagaaggaataaatattacccgagtaaacaaaaagt gcagagtgagcaagcaaatctatagaaatggcggagaccgctgatggctg ctcagtcccccaaggctcttctgtgacgttgcagcagcatcttcagcctt ctaggccggaatatctgacagagttttctgggaagcaggaatattgaagg gcatgcctgccttgtcctggcaaagcttggcagtcaacttgctccatgtc ctgcttggacggcattctgtcagcagcaagggcagtattctgccctatgg ctagctctgccacatagaagcaaactccataagaaagtttctccatcttc tttgaagtagaatgaagtgctgccaggagtagacacatctcgctgtcatg aaaagcctcgggttaacaaaacatgtttaaatgtcatattctgtacatct ttgaggtttttgaagaccatccatagtacatctatgattgcttctagcta tttactatctattcaacctaggaaacatatatatatgtgtgtatgtatat atgtgtccaggtggaatggtcgtaaatagctgtagcttcttgatgtatat ggtaggtatgtttgat	gaattcaagcaggacaggaacttggagtcaggagttgatgcagaggccat ggagggggctactgactggcttgctccttgtcttagttagggttttactg ctgtgaacagacaccatgaccaaggcaaatcttataagggacaacattta attggggctggcttacaggttcagaggctcagtccattatcatcaaggtg ggagcatggcagcatccaggcaggcatgggtctggaggagctgagaattc tacatcttcatctgaaggctgccaggagaaggctggcttctagacagcta gaatgagggtcttaaaggccacgcccacagcgacacacccactccaacaa ggccacacccactccacaaagccacacctactccaacaaagacacaccca ctccaacggggccacaccttctaatagtgccacaccctgggctgagctta ttcaaaccatcacactccttatggtttgctcagcctgctttctaatagaa cccaggaccaccagcccagggatggcccggcccattgtgggcggggcctt ccctatcaaccactaattaggaagatgccccacaggcttgcctacagccc tatcttagggaggttttttttttccccctcagttgacagtccctcctttc agagcattctagcttgtgccaagttgacacaaaactatccagcatatacc catacacacaaaattaaaagataatttctttttaaaaaagaaactgagaa tggggtaggtgtggagtgcagtgtctcagcgtctgaggcccttgccacca aacctggggttgacccccataacccacagggcagaagagggaacccactt ctcaacagctcttggtggcacaactcacccagataaaatatatatatata tatatatatattttttttaaatgctctttaaagttgaggcccacaactgt tccagccagactgaaaggcatgtattgcagataggtgcagggactgaaat gcctgatgttctctcatgacttctatcagctgattattaagtactggtag aaagtcagggatctaactcaggcgaaacactactttcaatgttctg
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr5_118844056_118844995 seq2: B6Ng01-169P20.g_266_1162 seq1 GGGAGCATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGGTCTGGAGGAGCTGAGAATT 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGGAGCATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGGTCTGGAGGAGCTGAGAATT 50 seq1 CTACATCTTCATCTGAAGGCTGCCAGGAGAAGGCTGGCTTCTAGACAGCT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTACATCTTCATCTGAAGGCTGCCAGGAGAAGGCTGGCTTCTAGACAGCT 100 seq1 AGAATGAGGGTCTTAAAGGCCACGCCCACAGCGACACACCCACTCCAACA 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAATGAGGGTCTTAAAGGCCACGCCCACAGCGACACACCCACTCCAACA 150 seq1 AGGCCACACCCACTCCACAAAGCCACACCTACTCCAACAAAGACACACCC 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGGCCACACCCACTCCACAAAGCCACACCTACTCCAACAAAGACACACCC 200 seq1 ACTCCAACGGGGCCACACCTTCTAATAGTGCCACACCCTGGGCTGAGCTT 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTCCAACGGGGCCACACCTTCTAATAGTGCCACACCCTGGGCTGAGCTT 250 seq1 ATTCAAACCATCACACTCCTTATGGTTTGCTCAGCCTGCTTTCTAATAGA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTCAAACCATCACACTCCTTATGGTTTGCTCAGCCTGCTTTCTAATAGA 300 seq1 ACCCAGGACCACCAGCCCAGGGATGGCCCGGCCCATTGTGGGCGGGGCCT 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCCAGGACCACCAGCCCAGGGATGGCCCGGCCCATTGTGGGCGGGGCCT 350 seq1 TCCCTATCAACCACTAATTAGGAAGATGCCCCACAGGCTTGCCTACAGCC 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCCTATCAACCACTAATTAGGAAGATGCCCCACAGGCTTGCCTACAGCC 400 seq1 CTATCTTAGGGAGGTTTTTTTTTTCCCCCTCAGTTGACAGTCCCTCCTTT 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTATCTTAGGGAGGTTTTTTTTTTCCCCCTCAGTTGACAGTCCCTCCTTT 450 seq1 CAGAGCATTCTAGCTTGTGCCAAGTTGACACAAAACTATCCAGCATATAC 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGAGCATTCTAGCTTGTGCCAAGTTGACACAAAACTATCCAGCATATAC 500 seq1 CCATACACACAAAATTAAAAGATAATTTCTTTTTAAAAAAGAAACTGAGA 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCATACACACAAAATTAAAAGATAATTTCTTTTTAAAAAAGAAACTGAGA 550 seq1 ATGGGGTAGGTGTGGAGTGCAGTGTCTCAGCGTCTGAGGCCCTTGCCACC 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGGGGTAGGTGTGGAGTGCAGTGTCTCAGCGTCTGAGGCCCTTGCCACC 600 seq1 AAACCTGGGGTTGACCCCCAGAACCCACAGGGCAGAAGAGGGAACCCACT 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAACCTGGGGTTGACCCCCATAACCCACAGGGCAGAAGAGGGAACCCACT 650 seq1 TCTCCACAGCTCTTGGTGGCACAAACTCACCCAGATAAAAATATATATAT 700 \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTCAACAGCTCTTGGTGGCAC-AACTCACCCAGAT-AAAATATATATAT 698 seq1 ATATATATATATATTTTTTTTTAAATGCTCTTTAAAGTTGAAGGCCCACA 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATATATATATATA-TTTTTTTTAAATGCTCTTTAAAGTTG-AGGCCCAC- 745 seq1 AACTGTTCCAGCCAGACTGGAAAGGGCATTGTTATTGCAAGATAGGGTGC 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| seq2 AACTGTTCCAGCCAGACTG--AAAGGCAT--GTATTGC-AGATA-GGTGC 789 seq1 AGGGGGACTGAAATTGGCCTGATGTTCTTCTCATGACTTCTAATCAGGGC 850 \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| seq2 A--GGGACTGAAAT--GCCTGATGTTC-TCTCATGACTTCT-ATCA--GC 831 seq1 TGGGATTAATTAAAGTAAAACATGTGTTAGAAAAGTCAAAGGGACCCTAA 900 \| \|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \| seq2 T--GATTA--TTAAGTA------CTGGTAG-AAAGTC--AGGGA---TCT 865 seq1 AACTCAGGGGCCAAAAAACACTACTTTGTCAAGTGTTCTG 940 \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| seq2 AACTCAGGCG-----AAACACTACTT--TCAA-TGTTCTG 897

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr5_118844056_118844995
seq2: B6Ng01-169P20.g_266_1162

seq1  GGGAGCATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGGTCTGGAGGAGCTGAGAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGGTCTGGAGGAGCTGAGAATT  50

seq1  CTACATCTTCATCTGAAGGCTGCCAGGAGAAGGCTGGCTTCTAGACAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATCTTCATCTGAAGGCTGCCAGGAGAAGGCTGGCTTCTAGACAGCT  100

seq1  AGAATGAGGGTCTTAAAGGCCACGCCCACAGCGACACACCCACTCCAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGAGGGTCTTAAAGGCCACGCCCACAGCGACACACCCACTCCAACA  150

seq1  AGGCCACACCCACTCCACAAAGCCACACCTACTCCAACAAAGACACACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCACACCCACTCCACAAAGCCACACCTACTCCAACAAAGACACACCC  200

seq1  ACTCCAACGGGGCCACACCTTCTAATAGTGCCACACCCTGGGCTGAGCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAACGGGGCCACACCTTCTAATAGTGCCACACCCTGGGCTGAGCTT  250

seq1  ATTCAAACCATCACACTCCTTATGGTTTGCTCAGCCTGCTTTCTAATAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAACCATCACACTCCTTATGGTTTGCTCAGCCTGCTTTCTAATAGA  300

seq1  ACCCAGGACCACCAGCCCAGGGATGGCCCGGCCCATTGTGGGCGGGGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGACCACCAGCCCAGGGATGGCCCGGCCCATTGTGGGCGGGGCCT  350

seq1  TCCCTATCAACCACTAATTAGGAAGATGCCCCACAGGCTTGCCTACAGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTATCAACCACTAATTAGGAAGATGCCCCACAGGCTTGCCTACAGCC  400

seq1  CTATCTTAGGGAGGTTTTTTTTTTCCCCCTCAGTTGACAGTCCCTCCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTTAGGGAGGTTTTTTTTTTCCCCCTCAGTTGACAGTCCCTCCTTT  450

seq1  CAGAGCATTCTAGCTTGTGCCAAGTTGACACAAAACTATCCAGCATATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCATTCTAGCTTGTGCCAAGTTGACACAAAACTATCCAGCATATAC  500

seq1  CCATACACACAAAATTAAAAGATAATTTCTTTTTAAAAAAGAAACTGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACACACAAAATTAAAAGATAATTTCTTTTTAAAAAAGAAACTGAGA  550

seq1  ATGGGGTAGGTGTGGAGTGCAGTGTCTCAGCGTCTGAGGCCCTTGCCACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGTAGGTGTGGAGTGCAGTGTCTCAGCGTCTGAGGCCCTTGCCACC  600

seq1  AAACCTGGGGTTGACCCCCAGAACCCACAGGGCAGAAGAGGGAACCCACT  650
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGGGGTTGACCCCCATAACCCACAGGGCAGAAGAGGGAACCCACT  650

seq1  TCTCCACAGCTCTTGGTGGCACAAACTCACCCAGATAAAAATATATATAT  700
      |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TCTCAACAGCTCTTGGTGGCAC-AACTCACCCAGAT-AAAATATATATAT  698

seq1  ATATATATATATATTTTTTTTTAAATGCTCTTTAAAGTTGAAGGCCCACA  750
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  ATATATATATATA-TTTTTTTTAAATGCTCTTTAAAGTTG-AGGCCCAC-  745

seq1  AACTGTTCCAGCCAGACTGGAAAGGGCATTGTTATTGCAAGATAGGGTGC  800
      |||||||||||||||||||  || |||||   |||||| ||||| |||||
seq2  AACTGTTCCAGCCAGACTG--AAAGGCAT--GTATTGC-AGATA-GGTGC  789

seq1  AGGGGGACTGAAATTGGCCTGATGTTCTTCTCATGACTTCTAATCAGGGC  850
      |  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||
seq2  A--GGGACTGAAAT--GCCTGATGTTC-TCTCATGACTTCT-ATCA--GC  831

seq1  TGGGATTAATTAAAGTAAAACATGTGTTAGAAAAGTCAAAGGGACCCTAA  900
      |  |||||  | |||||       || ||| ||||||  |||||   |  
seq2  T--GATTA--TTAAGTA------CTGGTAG-AAAGTC--AGGGA---TCT  865

seq1  AACTCAGGGGCCAAAAAACACTACTTTGTCAAGTGTTCTG  940
      |||||||| |     |||||||||||  |||| |||||||
seq2  AACTCAGGCG-----AAACACTACTT--TCAA-TGTTCTG  897

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