BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203O22
Chromosome5 (Build37)
Map Location 4,668,007 - 4,835,184
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFzd1, LOC667678, Pftk1
Upstream gene4930511M11Rik, Ankib1, Krit1, 4932412H11Rik, LOC100041009, LOC667617, Mterf, Akap9, Cyp51, ENSMUSG00000053178, LOC100041073
Downstream gene1700015F17Rik, Cldn12, Gtpbp10, LOC667699, EG667705, A330021E22Rik, Steap2, Steap1, LOC727711, LOC546854
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203O22.bB6Ng01-203O22.g
ACCGA024013GA024014
length1,1421,109
definitionB6Ng01-203O22.b B6Ng01-203O22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,834,049 - 4,835,184)(4,668,007 - 4,669,115)
sequence
gaattcaacgttcagctgtggtctgctgcacacatgtccactttccttac
acttcctttgaacagaacacagtaaaatctattgtacagctcaccggcgt
gctattgctttgatagacaccgagtgacctaatatacacactccagtgta
ctctaatctgtggtctcccagctcccactcggcaggaattctgagatgtt
gatggaaccccgtgatttaacagagcagccaggctgccctttcacctctc
acactggttctgacagctgcctgccatgtgtagagaaagcctcacaggct
gaaaccccgccacagaggaaaggcccctggataaacagacaagcaagagc
acgctgctactttagaattaaattgtttttataaactgaatctgaggtag
gaacatttaatagctaaggatctgtaagcccccaaagtgtgccagaaacc
ttccctagttaaaaataagacaagccaggcttggaggaacattctagtca
ccccaacacttgagggtgtgtgagcctgggctacagggtaagaccccgtt
tctccaaaataaaataaaacaaaaatataaataatcaaattaaacacaat
aacacacacaggatgctggacttgtccactcaagttaccagtcttcctct
tctggattaaaccaatttaccaacacttggggattgtaggctcaaataac
agtacagagatgtgcagcgttgcctgcattggctaggaaactccatttgt
gtttaagctgtcaatttaatccacactgcctttttactcttatcaggata
ttcttcaggtagaaaagaatggaagctttaggcatgactatcgtcctaaa
tataaagttggttaagggaaaaaaaatccctcctcggcccaaatagcatt
gtgctttataattcatttcttttcaacatacagtacgggcgtgttatcat
gggctaatgttctcccgccgagctgccgtcatctttttgtggagctgtca
aggtattaattgatgcacctttccacatttggaatagaagtcattatcct
gtcgctggctgccatcgcttctgcctgagcagttaaactgcttgaggtct
ttcatctagaataaatgttcgccagcccttgctgtgtgatga
gaattccagacaaaagcaactgaaggaaagaagggttcgttttgcccagt
gatcacactttggtggagaaagcacagtgacaagaatgtaagcctggttt
catggattataagggatgataaaatccgaagactcacccttacatgacac
attacctctaatgaatctctaccctcaaacattccaaaacaagaccacca
actaggaaccaaatatttaaatatgtatgactacggagggcattttgcag
ggaagccacaacagctgggactctgaagtcaagatgttggcagagtcatt
tccttctgggattttcaacggacattgtatttcatgttctaaaggttgct
aacaaagaccagaaattccgtgtttgttggttatggcattatcccttcag
tctctacatatgtcatcccatagatatgtgtctctgtatctaaattttta
tataccttgacactcacaagcaccatggcttaattttaattaaaaataaa
aaatatggtaacccatgatgcctgtggatatgagcttatataaaaacgga
gctttgcaaatgtaatcaagtttaaataatttcctgctgccttaatccaa
tgaatgatatccttctggcatgtgagatatttagacacagaaacacacag
gaacatggaatataccattctcctacccaacacaggaaactttatgtcct
tatctaaacatacatccaacccagatgaaaaatatatctcctctatctca
aatccttagaatttatggcctattgaattaatctcatctaagtcatagct
gagtatggtattccatgtccataaatcccagcatgggacgactgaaacag
attatcaatatgaattttatagtgagttttagggcattttgggctatgta
acaaaattctgtgtcaaataaataatataatatattatattttaaaagtc
caaaatttaacctctggaattatcttgatcaggtgtttgcaacatctctg
gcatacaatggaaacaaatctcaactcctctcttgtacccagtaatgaaa
aaaaaattattattataattatacacacattatttagtaatattgtgaaa
actttgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_4834049_4835184
seq2: B6Ng01-203O22.b_48_1189 (reverse)

seq1  TCATCACACAGCAAAAGTGCTGGCGAAACATTTA-TCTAGATGAAAGACC  49
      ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||
seq2  TCATCACACAGC--AAGGGCTGGCG-AACATTTATTCTAGATGAAAGACC  47

seq1  TCAAGCAGTTAACCTGCTCA-GCAGAGGCGAT-GCAGCCCAGCGACAGGA  97
      |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||
seq2  TCAAGCAGTTTAACTGCTCAGGCAGAAGCGATGGCAG-CCAGCGACAGGA  96

seq1  TAATGACCTCTA-TCCAAATGTGG-AAGGTGCATCAATTTAATACCCTGA  145
      ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||
seq2  TAATGACTTCTATTCCAAATGTGGAAAGGTGCATCAA-TTAATACCTTGA  145

seq1  CAGCTCCAC-AAAAGATGACGGCAGCTCGGCGGGAGAACATTAG-CCATG  193
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CAGCTCCACAAAAAGATGACGGCAGCTCGGCGGGAGAACATTAGCCCATG  195

seq1  ATAACACG-CCGTACTGTATG-TGAAAAG-AATGAATTATAAAGCACAAT  240
      |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATAACACGCCCGTACTGTATGTTGAAAAGAAATGAATTATAAAGCACAAT  245

seq1  GCTATTTGGGCCGAGGAGGGA-TTTTTTTCCCTTAACCAACTTTATATTT  289
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTTGGGCCGAGGAGGGATTTTTTTTCCCTTAACCAACTTTATATTT  295

seq1  AGGACGATAGTCATGCCTAAAGCTTCCATTCTTTTCTACCTGAAGAATAT  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACGATAGTCATGCCTAAAGCTTCCATTCTTTTCTACCTGAAGAATAT  345

seq1  CCTGATAAGAGTAAAAAGGCAGTGTGGATTAAATTGACAGCTTAAACACA  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATAAGAGTAAAAAGGCAGTGTGGATTAAATTGACAGCTTAAACACA  395

seq1  AATGGAGTTTCCTAGCCAATGCAGGCAACGCTGCACATCTCTGTACTGTT  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAGTTTCCTAGCCAATGCAGGCAACGCTGCACATCTCTGTACTGTT  445

seq1  ATTTGAGCCTACAATCCCCAAGTGTTGGTAAATTGGTTTAATCCAGAAGA  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAGCCTACAATCCCCAAGTGTTGGTAAATTGGTTTAATCCAGAAGA  495

seq1  GGAAGACTGGTAACTTGAGTGGACAAGTCCAGCATCCTGTGTGTGTTATT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGACTGGTAACTTGAGTGGACAAGTCCAGCATCCTGTGTGTGTTATT  545

seq1  GTGTTTAATTTGATTATTTATATTTTTGTTTTATTTTATTTTGGAGAAAC  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTAATTTGATTATTTATATTTTTGTTTTATTTTATTTTGGAGAAAC  595

seq1  GGGGTCTTACCCTGTAGCCCAGGCTCACACACCCTCAAGTGTTGGGGTGA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTCTTACCCTGTAGCCCAGGCTCACACACCCTCAAGTGTTGGGGTGA  645

seq1  CTAGAATGTTCCTCCAAGCCTGGCTTGTCTTATTTTTAACTAGGGAAGGT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAATGTTCCTCCAAGCCTGGCTTGTCTTATTTTTAACTAGGGAAGGT  695

seq1  TTCTGGCACACTTTGGGGGCTTACAGATCCTTAGCTATTAAATGTTCCTA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGCACACTTTGGGGGCTTACAGATCCTTAGCTATTAAATGTTCCTA  745

seq1  CCTCAGATTCAGTTTATAAAAACAATTTAATTCTAAAGTAGCAGCGTGCT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGATTCAGTTTATAAAAACAATTTAATTCTAAAGTAGCAGCGTGCT  795

seq1  CTTGCTTGTCTGTTTATCCAGGGGCCTTTCCTCTGTGGCGGGGTTTCAGC  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTGTCTGTTTATCCAGGGGCCTTTCCTCTGTGGCGGGGTTTCAGC  845

seq1  CTGTGAGGCTTTCTCTACACATGGCAGGCAGCTGTCAGAACCAGTGTGAG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGGCTTTCTCTACACATGGCAGGCAGCTGTCAGAACCAGTGTGAG  895

seq1  AGGTGAAAGGGCAGCCTGGCTGCTCTGTTAAATCACGGGGTTCCATCAAC  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAAAGGGCAGCCTGGCTGCTCTGTTAAATCACGGGGTTCCATCAAC  945

seq1  ATCTCAGAATTCCTGCCGAGTGGGAGCTGGGAGACCACAGATTAGAGTAC  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGAATTCCTGCCGAGTGGGAGCTGGGAGACCACAGATTAGAGTAC  995

seq1  ACTGGAGTGTGTATATTAGGTCACTCGGTGTCTATCAAAGCAATAGCACG  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGTGTGTATATTAGGTCACTCGGTGTCTATCAAAGCAATAGCACG  1045

seq1  CCGGTGAGCTGTACAATAGATTTTACTGTGTTCTGTTCAAAGGAAGTGTA  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGTGAGCTGTACAATAGATTTTACTGTGTTCTGTTCAAAGGAAGTGTA  1095

seq1  AGGAAAGTGGACATGTGTGCAGCAGACCACAGCTGAACGTTGAATTC  1136
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGTGGACATGTGTGCAGCAGACCACAGCTGAACGTTGAATTC  1142

seq1: chr5_4668007_4669115
seq2: B6Ng01-203O22.g_63_1171

seq1  GAATTCCAGACAAAAGCAACTGAAGGAAAGAAGGGTTCGTTTTGCCCAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGACAAAAGCAACTGAAGGAAAGAAGGGTTCGTTTTGCCCAGT  50

seq1  GATCACACTTTGGTGGAGAAAGCACAGTGACAAGAATGTAAGCCTGGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACACTTTGGTGGAGAAAGCACAGTGACAAGAATGTAAGCCTGGTTT  100

seq1  CATGGATTATAAGGGATGATAAAATCCGAAGACTCACCCTTACATGACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGATTATAAGGGATGATAAAATCCGAAGACTCACCCTTACATGACAC  150

seq1  ATTACCTCTAATGAATCTCTACCCTCAAACATTCCAAAACAAGACCACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCTCTAATGAATCTCTACCCTCAAACATTCCAAAACAAGACCACCA  200

seq1  ACTAGGAACCAAATATTTAAATATGTATGACTACGGAGGGCATTTTGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGAACCAAATATTTAAATATGTATGACTACGGAGGGCATTTTGCAG  250

seq1  GGAAGCCACAACAGCTGGGACTCTGAAGTCAAGATGTTGGCAGAGTCATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCCACAACAGCTGGGACTCTGAAGTCAAGATGTTGGCAGAGTCATT  300

seq1  TCCTTCTGGGATTTTCAACGGACATTGTATTTCATGTTCTAAAGGTTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCTGGGATTTTCAACGGACATTGTATTTCATGTTCTAAAGGTTGCT  350

seq1  AACAAAGACCAGAAATTCCGTGTTTGTTGGTTATGGCATTATCCCTTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGACCAGAAATTCCGTGTTTGTTGGTTATGGCATTATCCCTTCAG  400

seq1  TCTCTACATATGTCATCCCATAGATATGTGTCTCTGTATCTAAATTTTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTACATATGTCATCCCATAGATATGTGTCTCTGTATCTAAATTTTTA  450

seq1  TATACCTTGACACTCACAAGCACCATGGCTTAATTTTAATTAAAAATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCTTGACACTCACAAGCACCATGGCTTAATTTTAATTAAAAATAAA  500

seq1  AAATATGGTAACCCATGATGCCTGTGGATATGAGCTTATATAAAAACGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGGTAACCCATGATGCCTGTGGATATGAGCTTATATAAAAACGGA  550

seq1  GCTTTGCAAATGTAATCAAGTTTAAATAATTTCCTGCTGCCTTAATCCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGCAAATGTAATCAAGTTTAAATAATTTCCTGCTGCCTTAATCCAA  600

seq1  TGAATGATATCCTTCTGGCATGTGAGATATTTAGACACAGAAACACACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGATATCCTTCTGGCATGTGAGATATTTAGACACAGAAACACACAG  650

seq1  GAACATGGAATATACCATTCTCCTACCCAACACAGGAAACTTTATGTCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATGGAATATACCATTCTCCTACCCAACACAGGAAACTTTATGTCCT  700

seq1  TATCTAAACATACATCCAACCCAGATGAAAAATATATCTCCTCTATCTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAAACATACATCCAACCCAGATGAAAAATATATCTCCTCTATCTCA  750

seq1  AATCCTTAGAATTTATGGCCTATTGAATTAATCTCATCTAAGTCATAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTTAGAATTTATGGCCTATTGAATTAATCTCATCTAAGTCATAGCT  800

seq1  GAGTATGGTATTCCATGTCCATAAATCCCAGCATGGGACGACTGAAACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGGTATTCCATGTCCATAAATCCCAGCATGGGACGACTGAAACAG  850

seq1  ATTATCAATATGAATTTTATAGTGAGTTTTAGGGCATTTTGGGCTATGTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCAATATGAATTTTATAGTGAGTTTTAGGGCATTTTGGGCTATGTA  900

seq1  ACAAAATTCTGTGTCAAAATAAATAATATAATATATTATATTTTAAAAGT  950
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATTCTGTGTC-AAATAAATAATATAATATATTATATTTTAAAAGT  949

seq1  CCAAAATTTAACCTCTGGAATTATCTTGATCAGGTGTTTGCAACATCTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAATTTAACCTCTGGAATTATCTTGATCAGGTGTTTGCAACATCTCT  999

seq1  GGGCATACAAATGGAAACAAATCTCAACTCCTCTCCTTTGTACCCAGGTA  1050
       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||
seq2  -GGCATAC-AATGGAAACAAATCTCAACTCCTCTC--TTGTACCCA-GTA  1044

seq1  ATGAAAAAAAATATA----TATATATATACACACA-TATATAGTAAATAT  1095
      |||||||||||  ||    ||||  |||||||||| ||| ||||||   |
seq2  ATGAAAAAAAAATTATTATTATAATTATACACACATTATTTAGTAATATT  1094

seq1  GTGAAAA-TTTGTGA  1109
      ||||||| |||||||
seq2  GTGAAAACTTTGTGA  1109