BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049I19.T7 (MSMg01no049_i19.b1) | MSMg01-049I19.TJ (MSMg01no049_i19.g1) |
ACC | AG278963 | AG278964 |
length | 1,254 | 1,312 |
length of high quality (start - end) | 545 (89 - 633) | 327 (87 - 413) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_i19.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_i19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_i19.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_i19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATCCCTNNNNCCATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCTTTGGAAATAAAATAGGCCTGTTACTTATATGACCCAGTGAC
CAGGGATAGCTGTGTTCACTTCTGCAATTTGTCTTTCCCTTGCGTTCACT
ACGGTCATCTGGGTTTAATATCCCAGGCTGTGGGAAATGAAAGGCAGTTC
GTATTTTTTTTTCCTTGAGATTCTCAAATTTGAATTTTCAGCTGTGTATG
TTCTTGCTGCACATCTGAAATTACAGCAGGATGAACGTGCACTGTCACCA
GCCTGGCCAAAGGCTGACTTCAAGACCTGCAGAGAAAGTTCCCTGAGGGG
GTGGGCATGAAATGTCTCTGCAGGAGAGATTAAATGGTTTAATAATGTCC
TATTAAACCATTGCTTCCAAACAAAACCGAGCCTTTCAGTAACACTTGCC
ACCACGAAGCCCTCATTTAAGTGATTTTAATCTCAGATAAAGATTTTTCT
ATTAGAAGACGAGGTGTTAGCTACAGTATCACTTCTTTGCCTTTTGCGGG
TGAGGGGTGCTAAGTTTTGACTAGATCCTCATAAAACAATGACTGCTTAT
GGTAGTGGTGGAAAGTGAATACATTTTTGTGGTTATGTGCAAATACATAA
TAAAGTAAATAATAATAAAATCTACCGAAGACATGTGCCCCATACCGCCA
ATCTGCTATGAATTGTGATCGATGACTGCTTTAATTCTCCTCTCATTATC
TAAATCTAATGCATGATAATGACCGAACCAAGTATTACCAGTTTCCATCC
CTTTCTTCCAATTTATACTCTTCTTCTGTCCCAGTGAAATAACCTTTTAT
CTATCCATTTTACCATTTCCTTGTCCGATAATTCCAATTTTATCTCTCCC
ATATAAAACTTATCTTCAATTATCCACCCCTTGTTTGTTTTATATTTCCA
ATAATATTATTTAATAATCATTTTATATCCCCTTTTCTCTTTTCTTTATG
AAGTAATTTAATTTTATTACCCCCCCCCGTTATTTTTGTTATTATTTATA
AAATCTATAATTTGTAATTATTAATACATATTTTTCAAAGTAAATAATCA
TTTGATTTCTCTAAATAAATAATTTACCTTCTAACAATAATCTTTATATA
ATTTATTCTATACTTGATTAATAACTAATAATTCTCAATTATGATTCTTT
TATACAGTATCTATCCCGATACATTACTACATCTAACACTTANTATATCN
CTTT
| CCACCCCTTTTTNTAACATGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTCAGGTAACAGGCAACATAAG
CTTCTAGTGGAAGATGCCATGAGGGGTCAGTAGGGCACCATTCTTGTTTG
ATTTCTGTTGCTCTAATAAAAACACCTTGACCCAAAGCAAATTTGGAGGA
AATGGTTTATTTGGCTTACAACTCCAGGTCACAGTATATATGGAAGAAAG
TCAAGGCAGGAGCTCAAGGCAGGAACATGAAGGCAGACACTTCTATTCCT
CAAGCATTACCCCTGACCACAGAAATGTTGGCAGTTTTATAGAAGGATAT
TTTTTTAAGAAAAAAAAAACTTGTATAAACAAGTAACACAAATACAAAAC
AGAACAAGTAGTATGTCCATATCTAGATGTATTCTAGGACAAATATCAAT
ATTAGAAGGGGTACAAAAAGAAAAAACACACAAAAGTATGATTAGTTATC
AGTCAATCAACCCATGCCTGTATATACTCATATCAAAACAAAATTCGTGA
ACAAGACAAACACCTAGAAAGATTTCTCTTTAAAACTGTATTCAGAACTG
AATATGAAATAATATCTTTAGGAAGGCGAGCCATAGCTCAAATTGTAAGA
AACTTCCTCCCAAACACAAGAATCGTAGTTCAATCCCAAGAATTTCACAG
TACAAAATAACTCCTGGATACAGTGGCAAGCACAGGTAGCGCTACTACTA
AAAAGGTAGAAAGGTGGATCAAAGGAAAACACAGGTCAGTTGCCACAGCC
AGCTTACCAAATTCCAATGCAGTGAAAGGCCTTGTCCAAGGTGGAAACTC
CAAGTTAGCATCTACCTCTCCTTTGCATGCACAATATCGGGTGCAATTGC
ACCCAACCCACTTTTTTTCTATAAGCACATCTCTGGGGGGCTTCTTATAG
GTGACTTACCATAACTCCTTTTAAATGAATTTATAAACTTGGTTTAAATC
CTTTAATTACACACTTTGCCATTGCAGAAATCACAGATAGGTGCAATATG
TTTTAAAGAATGGGTTCCTTTTCAAGTGATTTAAGTATAATTGATTAATT
TTTTTTGATTCTATATAACCTTCTTTTAAAATATTTGGGAAAATAAACAA
ATTAATATCTCTTATATTCTTTATAAATGATTGTTTATGGGNTATATTAA
TAATCCCTGTTTCCTTGGTATTCTAAACAATAATACTGTCTATATTATTA
TACCCCACATTATTTTCTGAATTAATATATTATATAATATATCCTGATAA
ATATATATTNTA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 3 7 7 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 14 15 8 8 8 12 13 18 19 19 29 26 15 21 21 24 24 37 43 48 48 42
42 36 36 40 42 37 43 43 36 34 34 28 28 29 31 31 41 39 33 33 37 25 21 11 9 11 11 11 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 13 19 34 37 41 33 28 31 31 35 35 36
50 53 50 50 35 35 31 31 28 28 28 25 24 19 11 8 6 8 8 8 15 19 30 33 37 41 48 48 43 43 43 57 57 47 47 50 37 37 32 29 29 24 31 42 42 50 50 47 42 42
36 36 41 41 41 41 42 47 47 42 42 34 34 29 48 48 51 51 50 57 57 54 47 47 57 57 57 50 42 42 41 41 36 39 35 42 42 59 59 57 48 44 44 44 42 42 29 44 44 57
44 47 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 62 62 62 62 52 52 38 38 19
20 20 43 38 47 44 62 62 44 44 43 43 35 43 43 44 44 52 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 52 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 52 52 45 52 62 62 62 43 43 39 39 39 62 62 62 62 39 39 14 12 12 18 39 43 62 62 62 62 52 52 62 62 52 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 62 62 62 32 32 10 10 8 8 8 8 12 29 33 44 52 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 31 43 43 38 38 17 17 17 34 34 39 57 59 59 57 52 52 52
57 57 57 57 43 39 39 35 35 39 43 57 57 57 57 57 57 43 39 24 32 12 12 18 38 44 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 57 54
52 38 38 14 14 30 38 21 31 32 32 24 24 24 43 43 52 43 44 43 43 43 38 38 14 14 14 32 32 32 32 15 19 19 38 23 18 24 32 32 54 34 34 15 15 12 12 12 26 15
15 16 12 12 11 24 21 35 37 39 39 46 43 43 43 47 57 50 37 37 32 30 20 18 24 30 29 33 34 33 33 59 59 43 43 43 43 37 34 32 32 30 30 39 39 48 48 43 36 34
25 20 28 20 15 15 11 10 10 17 16 17 22 22 32 32 32 28 28 24 20 15 11 11 15 27 27 39 37 31 23 22 22 16 24 21 16 15 20 19 19 14 14 16 17 12 12 11 16 17
15 15 15 26 17 10 10 9 9 9 9 9 9 13 15 15 19 16 9 9 9 8 8 8 10 10 8 10 9 9 10 13 13 12 10 11 11 11 11 11 11 8 8 6 7 8 8 10 10 10
10 10 11 14 13 10 10 10 12 16 18 19 22 22 28 18 15 10 10 8 10 10 9 9 11 11 11 10 10 10 12 12 10 12 12 16 12 15 11 12 12 11 9 9 12 9 9 8 8 8
8 12 12 10 10 10 10 11 12 11 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 10 10 9 9 10 12 12 8 6 6 10 10 10 10 9 10 9 9 8 8 8 10 10
12 12 16 18 11 8 8 8 6 6 8 10 8 8 10 10 10 10 8 8 7 9 10 10 10 11 11 11 11 12 11 11 9 8 8 8 8 8 10 9 10 12 15 12 12 12 9 9 9 8
8 8 13 9 9 11 11 10 8 8 8 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 9 10 10 11 10 10 10 10 11 11 9 9 9 11 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9
10 8 8 8 8 10 6 12 8 8 10 15 9 9 9 9 10 10 10 12 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 12 13 8 9 9 10 11 8 10 10 10 10
8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 10 10 10 8 12 12 13 15 8 8 8 10 10 11 14 13 19 18 16 11 11 10 10 10 12 10 10 10 10 11 8 8 6
6 6 6 8 10 8 8 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 10 18 13 12 12 11 7 7 6 6 6 8 8 8 8 8 10 15 10 10 9 8 8 15 15 15 14 7 6 8 8
9 8 8 6 6 11 8 8 8 10 10 10 9 9 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10
15 11 9 9 9 15 8 8 6 6 6 6 10 8 10 10 9 9 7 7 8 8 8 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 7 7 8 8 10 8 8 8 8 10 13 12 9 9 13 13
15 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 9 10 10 9 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 6 6 6 7 12
12 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 8 6 6 11 8 8 9 9 8 8 6 6 8 6 6 6 7 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 7 8 3 0 3 6 6 6 8 3 0
3 9 12 10 | Open.Hide. 9 9 9 9 12 9 9 9 9 10 10 3 0 3 13 6 6 6 7 6 6 8 9 6 7 6 6 6 6 9 11 10 8 7 9 8 8 9 13 19 15 8 9 9 23 17 21 12 13 13
19 12 11 10 23 24 29 29 17 22 22 37 37 48 48 48 50 50 42 37 21 21 9 11 11 15 16 17 14 11 11 11 13 10 17 15 22 28 28 30 43 43 43 46 43 48 48 53 50 50
50 50 38 36 35 35 35 31 31 28 37 47 25 25 12 12 13 12 11 11 12 15 24 21 28 37 37 33 33 33 33 33 22 17 8 6 6 13 21 31 33 33 33 33 33 33 47 47 57 59
59 57 53 53 47 47 47 50 43 43 42 36 37 42 42 42 47 47 47 47 68 68 57 57 57 54 50 50 50 48 48 46 43 43 43 48 59 57 57 48 48 57 59 59 54 54 59 59 59 59
54 48 57 48 48 54 57 57 57 57 57 59 54 48 48 48 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 59 59 59
47 47 47 46 57 44 47 43 50 50 57 54 54 47 57 47 47 47 47 47 44 44 44 48 48 57 57 57 57 57 47 43 43 47 57 59 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 57 57
57 48 48 48 59 57 68 68 68 68 68 68 68 54 54 50 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 40 32 32 23 23 23 41 41 59 59 59 30 27 12 11 11 21 27 39 47 47
50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 39 43 37 28 28 37 40 47 43 47 59 43 43 43 43 43 43 43 43 43 47 43 46 47 47 35 35 35 39 39 48
48 48 48 48 50 48 50 46 46 23 23 9 9 9 9 9 12 16 19 30 19 19 13 28 28 59 48 59 57 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 43 47 43
43 40 43 40 50 32 32 26 25 20 28 20 20 20 36 36 44 39 43 43 43 43 46 46 44 43 42 42 43 42 37 37 39 39 57 57 47 48 57 34 38 18 18 12 24 24 59 59 50 50
39 39 39 43 43 48 59 59 57 50 47 52 52 52 57 52 54 54 57 54 50 46 41 41 41 46 50 50 48 48 50 57 57 38 34 14 14 15 32 32 50 41 48 48 41 41 41 44 46 47
32 32 17 15 15 26 26 44 44 57 44 44 37 32 32 24 28 32 32 27 28 30 30 44 44 57 57 57 68 57 59 57 48 30 28 14 17 17 41 41 54 43 42 37 37 37 42 42 43 50
50 50 48 50 48 48 48 48 32 31 20 20 20 30 32 41 34 19 21 13 25 25 31 31 35 36 37 39 35 28 28 28 24 24 28 23 28 32 37 27 23 14 16 16 19 21 31 22 25 25
40 40 32 23 22 12 12 12 23 23 35 30 34 25 25 25 24 32 30 32 30 37 37 37 26 28 13 13 13 17 21 22 28 27 28 24 28 24 24 28 24 29 29 30 33 32 32 24 23 20
20 28 28 37 37 32 32 16 15 9 9 9 14 22 26 17 17 23 26 17 10 9 9 9 9 9 13 21 15 17 19 22 28 28 22 21 19 18 18 23 26 32 24 32 26 30 17 17 10 18
15 24 25 15 15 10 10 9 9 9 9 9 11 8 10 8 8 8 10 13 14 19 19 19 15 15 15 13 10 10 10 10 10 24 24 28 24 24 12 12 12 11 12 11 11 11 19 17 24 21
21 14 10 12 22 18 19 13 14 10 10 10 12 15 17 18 17 17 11 11 11 11 10 10 16 16 13 11 8 8 8 6 7 8 13 10 10 10 8 10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 10
10 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 13 6 6 8 8 8 8 15 8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 8 8 15 13 9 9 9 8 8 8 8 8 10 14 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 17 15 15 22 21 14 12 11 10 10 10 10 10 13 10 9 9 9 8 8 9 10 9 13 8 9 8 8 8 9 8 6 6 8 8 6 9 9 8 8
6 6 6 8 8 9 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 19 19 9 8 8 8 8 8 10 10 8 6 7 7 7 6 6 10 8 9 9 10 12 10 10 8 8 8 8 10 10
6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 10 8 8 8 8 11 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8
10 9 14 12 9 9 11 11 9 9 9 8 8 8 9 6 8 6 6 10 15 13 9 6 6 6 6 8 8 9 12 10 9 8 8 8 9 7 7 8 8 8 8 6 6 8 13 10 10 20
28 26 15 12 12 11 11 11 8 8 11 10 8 12 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 15 18 16 9 8 8 8 8 11 11 11 9 9 11 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 9 12 11 8 6 8 6 6 11 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 7 6 8 6 6
8 8 12 12 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 10 8 8 6 6 8 6 7 6 6 8 8 7 7 8 6 6 7 10 10
10 10 11 13 10 8 8 6 7 11 6 9 9 10 10 10 12 10 10 10 8 6 6 6 8 7 7 15 8 8 8 13 13 10 11 13 12 9 9 9 9 8 10 11 8 8 7 8 8 8
8 8 8 8 8 8 9 10 3 0 3 3 |