| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-050E19.T7 (MSMg01no050_e19.b1) | MSMg01-050E19.TJ (MSMg01no050_e19.g1) |
|---|
| ACC | AG279422 | AG279423 |
|---|
| length | 1,188 | 1,391 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 391 (104 - 494) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_e19.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_e19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_e19.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_e19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:25 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TATGGGCCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTATTTTT
GTCTGAGTTCCTTTGAGCATTTTTGCTTTTCAAAGATCTCTCAAAATTCC
CCTAAAATTTTGGGAATCTCCGAGTTCATTTGGTATGTGAGAATTGGACT
TACCGACTTCATACACTTTACCTCTGAGTGACCTCCTGACCCCATATTTT
TAGTTCTAACGAGCAAAGGATTTATACTGAGTGTTGTGTATATAATGTGA
CATCCATCCTTTTTCATTTTAAATTATCTGATGGTTGAAAATTGAATTAT
TTTCCATAATATTTACACAGTTTATTGGTGAAGCTTTAGTTTAAAATTAG
TTGCTTTGATTTGTGGTTAAAAATATCAATGGCGACAGATCTTTATCTTA
CTCAGATTCTCTTGGAAATAATCTCCGTCCTGGAGCTTTGTAGGATTTCA
AGAGAGGTTAACTCAAGGCCATTTCCACGAGAAAGCGATCCTGCAGAAAA
TATCAGTCTATTTTGTGGATGAAGGATGTACTGCCCTAAAGCCCCAAATA
GCAATATCCATTAAATTCACATTTGTATCTACTATTGATAAACATTTACT
AGAACATAACACAGTCAGAAAGACTATTAAATCACACTTTTTTTTCAAGA
AAAGTCCTCATTCACATTGCCATCCTAGATGATTTGTTTCCCAACAAAAA
TAAGTGCATTTATTTAAAATTGTATTTATGGAGATAGGCATCTTTTATCC
AAACATACCCATCCCATTGTTTGGTAACCAGTTTCAACATGTTGACTCTG
TCATTTCTTCGCCCAGTGGAATGTTTAATGGCCCCTTTAAAATTTAATTT
CTACCTTTAATTTCACTTTGTTAATCATTTGATATTTAAATTTGAACCTT
GGTTAGTCTCATTTGCATTTTTGGCTATCTTAATTGTTGAATCTCCCTGG
GTAGCTTAATCTCTAATCTTAACCCGGGATAAATTTGATAAACCTCTTAC
AAATTTACCTGCTCAAAATGGGCCTATAAACTTTTTCTTTCACAAATTCC
CCTTCCCATCCTTTCCCAAAATTTTAATGGGAATTTTTTCTTCCCCCCGG
GGTCCTCTTTTTTTTACCCCCTTCCTTTGTGGTTCTTCTTCTTTTTTTTT
GGAATAATTAACCTGTTCCGCGAGATATTTAACTATTC
| NTAACAATGTAGCCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCTCCTATAAACACAACAATGTAGATTTTATGTCAC
ATAGCTTCCCCTACAAAGCAACTGTGTCCATGAGTGTGAGTGTGTGTGTG
TGTGTGTAAGTATGTATACACTTTTAAAACCTCCCTATAAACCCACTTAA
ACCAATAACATCCCAACCCCATTTCACCAACTATATTAACAATTAATAAA
ACCTACACAATATTACTACCTAATATCTAATAATACATATACATAATTAC
CACCTATTACACTTATCTCCTAAAAATCTCATAAACAATAATAACATACA
AATAATCCTCTCTTCACCTCAATCACTACAAAAATCCTTATAAATAACTT
TTTTTTTTACATCCACCAAATACATAATTAAAATTTACACTCACAATAAT
TCACTCATTCACTATATCATATTAAAATACCAAACTATAAACCATCTTCA
ATCCATTTTACATATTATTAAATAACTATTATAACCCAATTTTATAATAA
ATATTATAAAAAAATATAAATATACTTACAAAATACATATAACATTTAAT
AAAAATCAATAACAATATAAAACTTAATATAATCTAAAATAATTTAACAT
ATCCTCATAATTCACTAACAAAAATAAAAAATAAACTAAATACACATATC
TTCAATTAAATTAAAACCTATATAATATTCCAAAAATAATTTAATTATTT
CTAAATAAAAAATCTATAATTCAATTTTTAAATATAATACTTATATATAA
ACTAATAAAAATAATATAAAAATAATAAATTTATAACTCTAATCTCTCAT
TTTCCTTACTATATATTACAAAAAAAAAACAACTTATAATAATAAAAATT
TTTTTACACAAATACAACAATATTACACTCTATCATAATCAATAATTTCA
TATTATACAATTCTAAAAAAATATAACTCTAATAATAAATCTCATATTAA
CATTAAATTCTAATATTTCTAAACAAAAATTTATCCAATATATTATCAAT
TCTAAATATTCCCATTTAAAAATTTATACCAAAATATATATATTATAACA
CATATAAAAATTAATATTACAGATAATAATACACATAAACATATATACAC
CTCATATTACTAAATTTATACGCAAACACACTAAATTTAAATAAAAAATA
AATTAATATCAAAATAAATTAATAACCTTTATATATTATCATATAACAAA
TAATATAAATTATATCCCAATAATAATTATTTAAATTCTACATTACTACC
CCTCTATAACCATTAATTAAAGACCTCTATATAATTTAAAAAACTAACAT
AAAATTACTATCAAATATATATAATACCAATATCTAACAAA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 7 12 10 12 11 8 8 8 8 8 8 8 19 19 11 14 14 23 23 30 34 39 36 36 31 31 28 28 28 33 33 33 37 37 37 30 18 17 16 17 12 14 16 24 28 41 48 48 48
48 46 59 59 36 23 13 9 7 7 9 9 14 11 15 12 12 13 14 26 30 47 59 47 48 48 48 47 38 47 47 50 37 37 37 37 39 36 33 33 30 28 20 23 28 34 19 19 10 9
9 9 10 16 16 24 34 39 46 47 37 40 40 43 43 27 19 8 8 8 8 10 12 19 27 37 37 40 48 43 39 33 32 32 36 36 37 37 37 39 43 43 47 40 43 25 25 25 33 33
39 42 42 42 59 59 68 48 48 42 41 41 32 32 25 28 36 36 47 47 47 47 47 47 42 42 35 35 35 42 42 57 57 57 57 68 57 57 57 59 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57
57 47 47 57 57 57 57 47 47 47 50 47 43 36 32 17 17 23 38 44 57 57 57 57 57 57 52 50 50 37 39 50 50 52 52 52 52 52 57 43 43 43 37 37 43 57 57 57 52 57
43 52 43 43 39 57 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 43 57 52 52 52 57 62 52 62 62 62 62 62
62 41 39 39 43 43 62 52 52 52 62 62 52 43 43 43 29 29 16 16 27 35 44 43 43 43 43 33 33 32 38 34 39 41 62 43 43 29 29 14 20 23 39 39 62 62 62 62 62 43
43 43 43 52 62 62 52 52 52 45 43 43 43 27 27 13 13 13 39 39 43 62 52 52 62 62 52 52 43 43 43 39 39 39 43 31 43 39 39 39 39 39 41 17 17 17 39 39 43 39
41 41 41 45 45 45 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 47 47 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 43 43 43 43 43 43 43 15 15 14 13 23 38 43 43 43 39 43
31 35 35 43 43 57 52 57 57 52 42 42 38 35 20 27 24 15 12 17 23 38 44 38 38 20 20 18 34 18 20 20 30 19 12 14 14 30 36 52 38 28 10 10 10 12 16 24 19 11
12 12 27 27 32 32 32 44 43 43 52 59 38 30 26 14 14 14 36 43 27 21 11 11 12 27 38 50 50 37 37 42 42 42 43 43 43 31 31 33 28 32 28 28 14 19 19 11 11 11
19 19 36 28 35 42 44 44 43 43 59 59 57 57 37 36 36 25 28 32 40 43 59 59 47 43 32 32 32 34 34 30 28 21 28 29 41 41 39 39 47 41 41 43 43 44 43 48 40 40
23 23 22 28 28 32 32 33 33 28 23 21 15 10 10 10 12 16 20 23 25 11 13 7 7 8 15 13 12 12 28 22 24 13 14 20 20 35 39 59 48 48 41 34 34 23 23 28 34 31
21 26 16 16 16 27 27 37 43 46 43 47 40 40 40 39 39 43 35 35 39 39 43 43 37 28 28 12 12 16 19 12 12 10 15 12 15 27 28 24 24 28 18 28 13 13 11 11 11 11
19 21 10 12 10 13 10 12 14 13 21 13 13 10 16 13 11 15 10 13 13 13 8 8 8 19 19 19 16 10 22 23 23 19 24 24 28 23 22 14 14 19 15 22 10 10 10 13 8 12
12 14 17 16 17 17 18 23 15 11 11 11 11 10 10 10 9 13 13 11 10 10 10 11 15 13 12 14 9 10 6 6 10 10 8 8 8 8 8 10 21 24 15 13 13 16 10 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 10 12 9 9 9 8 8 8 10 10 11 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 7 8 17 13 11 11 12 8 8 8 8 8 9 8 13 10
8 8 8 10 10 11 10 10 11 9 9 9 9 9 10 10 13 15 15 8 8 9 9 10 9 9 9 9 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 9 8
8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 11 15 20 23 13 8 8 8 9 9 9 9 9 14 9 9 13 9 9 9 9 10 8 8 8 8 10 10 12 12 9 9 10
12 15 8 8 8 11 16 10 10 6 6 6 6 8 11 15 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 9
9 11 10 8 7 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 13 9 14 15 17 22 30 14 14 14 14 15 11 8 7 6 10 8 8 8 15 12 12
10 8 8 8 10 8 10 9 9 9 12 15 11 8 10 10 11 16 16 15 14 14 12 9 10 8 8 8 8 9 8 9 9 9 19 19 7 7 6 6 6 8 8 9 11 12 11 8 10 8
6 7 7 6 8 7 8 13 17 32 11 10 9 7 6 6 8 6 8 8 7 6 10 8 9 9 6 8 8 6 6 13 15 10 8 8 6 6 8 10 7 9 12 9 9 11 9 14 10 8
8 6 10 7 7 8 8 9 9 10 10 10 7 7 7 7 8 8 9 9 10 10 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 7 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 10 9 11 15 15 13 8 8 13 10 10 10 10 7 7 10 19 10 9 7 7 8 11 8 8 10 15 8 8 9 19 18
22 24 17 18 28 31 37 43 40 34 34 23 16 16 18 9 9 6 6 6 9 9 9 13 8 10 10 12 13 13 27 27 33 24 15 15 21 21 39 59 39 53 47 30 24 18 20 20 32 34
30 27 15 11 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 8 8 7 7 8 8 8 8 10 10 16 11 10 10 10 10 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 9 10 15 15 18 18 17 30 22 25
25 28 28 28 17 13 10 10 9 8 10 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 11 12 12 14 8 8 8 11
10 10 13 10 10 8 8 8 10 8 8 11 11 15 15 12 12 11 12 11 11 11 11 12 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 10 10 10 10 10 11 10 10 10 11 13
12 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 7 8 8 8 9 10 10 10 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 19 15 17 17 15 15 12 12 11 11 11 11 11 11 13 13 24 16 16 12 12 10
8 8 6 6 8 8 8 9 10 11 12 11 15 10 10 10 10 11 11 12 12 13 10 8 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 11 11 15 9 8 8 6 6 8 8 8 10 10 10 8 8
11 12 12 12 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 12 10 10 11 13 9 9 9 10
10 10 10 10 10 11 11 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 16 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 12 12
10 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 11 9 9 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 6 11 7 6 8 8 10 8
8 7 7 10 7 9 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8
6 8 8 9 9 9 9 13 8 8 8 11 8 8 8 11 14 10 8 10 11 12 10 9 11 15 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 10 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 8 8 9 6 10 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 10 8 10 6 6 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 10
10 10 8 8 7 7 8 8 10 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8 12 9 11 12 8 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 10 11 11 11 10 10 11 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 11 11
11 11 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 6 8 6 7 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 14 14 12 10 11 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 16 13 10 11 12 12 12 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8
6 6 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 7 10 6 6 8 8 8 10 9 9 9 9 8 10
8 8 8 8 8 12 10 8 7 8 6 8 7 6 6 8 8 8 11 11 12 12 13 11 8 11 15 10 10 7 6 8 10 10 21 10 8 8 10 10 9 6 8 8 8 8 8 8 10 10
8 8 6 6 6 6 8 8 12 11 11 11 11 9 10 9 8 8 6 7 6 6 6 6 8 8 16 19 11 10 8 8 6 6 10 10 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8
7 6 8 6 6 8 8 8 10 9 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 11 9 8 8 6 6 8 8 9 10 9 9 9 8 9 9 7 8 8 11 9 8 8 10 8 10
10 10 10 8 11 8 8 8 8 8 13 10 9 9 10 6 6 6 6 6 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 8 6 6 8 8 13
10 10 12 12 12 12 12 12 8 10 8 8 10 10 6 6 8 8 8 10 7 9 9 9 8 10 16 9 9 8 6 6 6 8 6 6 8 10 6 6 6 6 8 8 9 9 10 10 9 9
6 8 6 6 8 6 6 10 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8 9 8 6 6 6 8 8 9 9 9 10 9 10 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 8 8
8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 10 10 10 10 |
|---|
