BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106F17.T7 (MSMg01no106_f17.b1) | MSMg01-106F17.TJ (MSMg01no106_f17.g1) |
ACC | AG320464 | AG320465 |
length | 1,307 | 1,304 |
length of high quality (start - end) | 630 (84 - 713) | 499 (127 - 625) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_f17.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_f17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:06:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_f17.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_f17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:06:40 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NCCTATTTATGTNTTACATTGGGCGCTATGACTCCTATGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCATTATTACTTGAATGCCCTTTAAAGAGCTGGGAAGTGGTGG
CGCACACCATATTTTTCCTTAACTTGGGAAGCAGAGACAAGTGGATTTTT
GAGTTCCAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGC
TATACAGAGAAACAATGTCTTGAAAAACAACAACAAAAACAAATACAAAA
AAAATAGAAAAGTAAACAGAAAGGAAAATGAAAGGAGAAAAACAATGAAG
AAAGAAAATCAAAATGATGAAGACTAGGAGAGCATGATTTTTGACAGATA
CATTTCTCACGCTCTTTCTGAAGAGGATGACCATCACAGAAGAGTTCACA
CCAAGCCTGTGTGTGACTCAGGTCATTGTCTTGTGTTGTCTTTCATCAGG
TTGGATTGTGGAATTAGAAGAATAATTGCACATTTATTTCTAAACAACTT
CTCTTGCTTGTCAATATGAAAAATCACATTTGAGTAACTATTCAAAAAAT
AAAAAATGCATACATAATATTATAGGGTATTGATATTAGAATTATATATT
ACACTTAACAGACACTCCTGGGCAAAAATCTTAAATGTTGGGCTGGAGAT
ATGGCTCAGAGGTGAAGAGAACTGGCTGCTCTTCCAAAAGTCCTGAGTTC
AATTCCCAGCAACCATAGGGTTAGGTCACAGTCATGTATAATGAGATCAG
GAGTCCTCTCCTGACTTGCATACATTACATGCAGGCAATGCACTATATAC
ATAAAAAAATGAACTATCCTAAATTAAATATAATAACATCTTTTAAAATA
CTCTTAAATATTTACCAACCCCATTATCCCGAGCAAAAATGTGTGAAGAC
CCTAACCTGTGTTTTTTACTCAAAAGAAATTGAAATGCGTTCACTTTTTC
AACCTATTGGACTTTTTGTTTCATGAATCATTTATTGGCCATTATTTAAA
TTTCAAACCAAAATCTATTTCCGTTCGAATCTCTTAACCTCCCTTTTTAC
TTTTTTGGATCCCCCGGTGACTTTATGGGACAAAAAATTCTCTCTTTGTT
TCCCACAATAAAAAAATTTTTTTCGTGGAATTCTTTCAGGCCTGCGCGAG
TAACCTTTTTGTTTTTTTCTAATAAACCCGGGCTAACCTTGTGTGTGAAA
AAAGATTTTGAGACAATAACTCTTTCTTCTTCTCCTTTAATACTCATTCT
CATATAAAAACTTTTATATAGCAATACTATTTTNAATGGTCTATACTCTG
ATATGTC
| NCCGTTCTTTTNTATTGATGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTTAAGAGTTAACCTTAATTC
AATTTTATGTTGTCTGAATCTTGACAGTTGATTTTCCTTAGTATGCTTTT
TATATCCCTTGTGTCCCTAATGCTTTTCTTAAATTTACAGAGGTCTTCCT
CCCTTTGTGTTCTGAGTGCTGGGACTGAAGAAATGCACTTACATTTCCAG
CTTAACGCCTAAGAATTTCATGGTGCTAATATCTCTCTCTCCCTCTCTCT
GTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTGTGTCTCTCTCTTTCTGTGTGTCTGT
GCCTTTCTCTTTCCCTCCCTGTCTCCCCTAGCAAAAGAATTTAATCCTTA
TTTTATTTGTAGGAATATTTTGTCTATACGCATGGTTTTGTACAGTGTTC
ATGCCTGTTGAGCAGGAAGGCAAGGAGGTTGTGTTAAAGCCCCTGAACCT
GAGTAATATGTAGTATTGAGATGTTTTGTGTCCTGGGAATGAAACATGGA
TGCTCTTGAAGAAACTTCTTTCTGCTTAGATGCTGTGGTTTTTCCATCCC
CATTTTTTTTCTTTTTTTTTGCATAGGCTATTGGCCACCCCCAATTTTCT
ATCCTTCATGTTTTCTACCCAAGGCATTCTAGGTCACTTTGGGCATCCAG
TTTTCTTGAGGGGCTCCCTTTAGGTATCAGACCGGGAAGTTAACCTTACT
AATAAATGATACTTGTAATCTCTTGCTCTTTGAATTTGTCATCCTGGTGC
GTACTTGTGGGAATCTAATGCCTTCCAAATTATTGTCTAAATTTTTTAAA
ATGTATTACAACTTTTGTTGAAAATTTTCAGTGCTATAAATTTGGTCCAA
TCAGCCCCTTTTCTATTTGTGACAAAAATTTTTTTAGCTTTTTATTACTC
TTTAAAATCCTTTTATAAAAGTAAAAATGTTACCTCTAAAATTGGTATTC
TTTTATGTTAAAAATACCTATAAAATTCATTGGGGTTCTCCTTATCTTAT
TTTTCCAAGCTTCTATATGTTCCTTTGTGTTCTTATTTCCCCTAAGTGTA
TGTTTATAACCGTCGTTAATAAATAATATTGTGAGAAAAACATTGTCTCC
TCCTACAAATGTGACTAATAGCTCTCGGTTTCTTCCTCGTTAATAAGTGT
GTTTAAAGCTCCTTGTCTTTCTTATCTGCTAAACATTTTTTGTATGTTCT
CTTTAATAAATACACTGCGTTATCTTCTTCTTAAATAGACTGGTATTTCT
CTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 8 8 8 6 6 3 0 3 9 9 9 6 8 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 19 13 8 8 8 10 10 8 8 23 23 36 36 36 36 33 33 37 37 37
33 37 37 37 32 24 19 14 9 8 22 22 33 33 31 31 31 31 37 37 33 21 19 9 11 10 11 10 10 10 15 13 21 19 26 23 29 29 30 31 36 50 36 38 38 38 42 53 57 57
59 59 59 59 59 59 44 33 33 33 33 28 23 19 12 12 12 12 12 12 12 28 24 37 37 37 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 48 48 48 57 59 59 68 68 59
59 57 48 48 53 53 50 50 54 54 54 54 54 53 53 68 68 68 68 50 50 50 57 47 47 54 48 48 48 48 50 57 57 57 57 57 47 47 57 54 54 54 57 57 54 54 57 57 57 57
57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 57 57 52 52 52 57 52 54 52 57 52 52 52 52 43 57 43 43 31 43 35 43 43
57 59 52 52 57 57 45 45 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 43 57 39 43 57 52 57 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62
52 62 52 52 52 52 45 43 43 43 43 52 52 62 62 62 62 62 62 43 35 47 35 47 47 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 43 62 62 52 45 52 43 62 43 52 52 62 62 62 62 62 62 52
43 43 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 39 39 39 31 39 39 39 43 54 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 44 43 35 39 39 43 44 44 31 31 31 43 43 62 62 57 52 52 52 57 52 45 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 52 52 52 52 52 59 59 57 52 52 52 52 52 57 57 59 57 59 59 43 43 35 43 43 57 59
43 39 41 43 32 32 35 43 43 43 42 43 32 42 35 42 42 48 57 57 57 48 44 42 41 41 28 30 30 41 41 41 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 37 37 37 59 59 59
39 37 37 37 42 44 42 54 54 57 43 39 35 35 35 47 47 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 46 39 43 28 24 24 18 21 21 32 29 37 41 41 34 28 19 20 20 24 29
37 32 34 25 25 21 26 14 14 15 28 32 39 37 37 28 28 28 33 33 39 39 35 39 35 47 35 30 30 28 34 34 28 18 18 25 24 32 32 41 15 17 10 8 8 22 27 37 37 28
22 25 31 31 33 37 28 29 28 24 14 12 12 10 11 11 19 18 21 15 15 17 16 10 11 15 19 20 21 23 24 19 17 17 18 23 11 12 12 21 21 32 32 30 24 24 24 15 15 17
18 22 21 23 19 21 20 23 23 23 23 16 25 20 15 9 12 10 10 13 15 24 12 11 14 11 12 10 9 11 16 19 23 18 15 15 11 11 15 13 10 10 10 11 22 19 23 11 11 9
11 8 13 8 10 12 13 13 13 11 13 13 13 8 8 8 8 8 8 9 10 10 19 10 12 15 14 8 8 6 6 8 10 8 9 9 9 9 8 12 9 11 15 16 16 20 20 15 12 8
8 11 10 14 11 8 8 8 8 10 9 14 15 10 9 12 16 19 18 12 10 9 9 9 13 13 11 9 8 8 8 8 9 9 10 12 12 8 8 8 10 10 12 11 10 12 10 10 10 10
10 10 10 8 9 9 6 10 7 9 9 12 10 14 15 19 9 9 9 9 9 12 12 12 10 11 10 11 13 12 11 11 11 10 12 11 9 9 9 8 8 8 8 8 10 23 19 15 10 10
10 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 15 8 12 10 12 8 8 8 8 8 10 8 8 12 8 8 10 13 10 6 6 8 6 8 8 8 8 10 11 12 12 25 10 6 8 6
6 7 8 10 19 14 11 10 10 8 11 8 7 8 6 6 8 8 13 8 8 8 8 8 6 6 10 7 8 8 6 6 6 8 8 8 9 10 15 19 12 14 14 14 19 23 20 11 11 11
14 13 25 23 17 12 9 9 12 10 10 8 9 13 9 9 9 12 12 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 6 7 7 8 8 9 21 10 9 8 8 6 6 6 6 9 11 9 13 11 13
11 10 10 9 10 9 9 9 9 10 9 9 14 8 8 8 8 9 10 21 23 15 10 8 6 6 7 7 9 14 11 8 6 6 8 8 9 9 10 9 9 9 8 6 6 6 8 8 8 8
10 10 9 9 9 10 10 13 13 8 8 8 8 9 11 17 11 11 10 12 10 8 8 8 8 8 8 13 12 11 11 11 11 9 9 8 8 6 7 8 7 8 6 6 6 8 11 11 12 16
22 12 8 8 6 6 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 19 10 10 8 8 8 8 6 9 12 8 6 6 9 9 7 10 8 9 8 10 10 8 7 6 6 8 10 7 7
8 8 8 8 8 14 18 15 9 12 9 9 12 13 6 6 6 6 8 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 8 6 9 3 0 3 8 8 6 6 7 7 10 8 8 6 6 6 7 8 8
6 6 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 0 3 11 11 11 11 9 11 18 15 3 0 3 9 9 9 9 6 6 8 6 6 6 6 7 8 6 6 8 6 8 8 15 8 8 9 9 12 11 19 23 23 25 21 30 25 28 21 21 10
17 17 28 28 32 37 37 37 37 37 36 36 42 38 53 53 50 50 50 50 50 47 36 21 13 9 10 9 10 10 10 6 6 8 8 9 10 15 17 28 28 31 36 36 36 36 50 50 50 53
53 53 53 42 42 38 38 36 36 33 32 27 16 15 21 18 13 9 9 9 10 9 13 12 16 16 19 19 30 36 48 50 50 53 42 42 43 43 50 47 47 47 40 47 47 53 53 57 47 68
68 68 68 68 68 68 57 53 50 50 48 50 50 50 68 50 50 50 50 50 36 44 24 18 21 21 28 32 27 38 47 47 57 57 57 57 57 57 42 42 33 33 33 33 32 44 44 57 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 52 52 52 52 57 57 54 54 57 57 57 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 43 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 62 36 27 16 12 11 15 18 38 38 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 52 52 52 62 57 52 52 59 52 52 52 57 57 59 57 57
57 59 57 57 57 57 52 52 43 38 35 16 16 14 14 14 22 18 20 23 23 23 23 33 43 36 43 52 43 43 33 29 29 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 43
43 33 38 35 37 37 37 37 50 38 43 32 32 20 38 38 44 43 37 37 43 43 43 43 57 59 59 50 48 48 48 48 47 47 28 28 11 11 15 24 34 42 38 38 32 21 21 16 25 25
37 44 48 48 48 48 46 44 42 30 30 30 42 42 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 34 28 12 12 12 25 25 29 37 28 29 22 22 22 33 32 43 34 39 36 39 39 36 32 32
30 37 37 59 59 59 47 30 25 12 12 12 25 25 44 44 39 34 30 22 22 20 20 16 11 11 13 24 19 32 28 15 10 8 8 8 11 12 30 26 26 17 18 18 27 25 34 30 30 30
37 37 37 39 37 27 27 14 14 14 23 30 59 43 34 24 24 26 26 20 20 24 28 22 22 18 24 18 15 15 11 10 10 12 10 10 10 23 21 10 9 9 11 11 11 12 15 14 18 15
11 9 9 13 17 27 23 24 15 16 15 15 12 11 11 11 20 23 32 23 16 10 10 11 10 10 10 10 9 10 11 12 12 11 12 11 11 11 9 9 10 10 10 10 10 12 13 13 13 10
11 9 9 10 11 14 16 24 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 17 10 9 9 11 11 8 8 8 8 8 11 9 11 10 10 15 17 12 11 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10
8 9 9 9 10 14 10 8 9 8 8 7 8 8 8 9 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 11 9 8 8 8 8 8 15 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 15 10 13 12 13 13
16 10 9 9 9 9 10 11 11 12 10 11 13 19 11 10 8 8 8 10 9 9 9 9 10 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 10 8 8 11 10 11 8 7 6 6 8 8 10 12 6 6 6 6 10 14 11 11 8 8 6 6 6 6 13 10 8 8 8 10 8 10 10 10 10
10 10 10 12 12 10 8 7 7 12 15 15 9 6 6 6 7 8 13 10 10 10 15 13 15 11 11 9 8 8 10 6 7 6 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 6 8 13 6 7 6
6 8 8 8 13 8 8 8 8 12 19 18 24 17 17 12 16 11 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 12 9 8 8 8 8 8 10 9 9 12 9 9 9 9 9 10 10 6 8 6 6
8 8 10 11 9 9 9 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 10 9 10 9 14 16 17 14 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 9 10 12 21 15 15 12 9 9 8 6 8 8 8
8 8 11 13 9 9 9 9 9 9 8 6 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 10 7 8 8 8 6 8 8 8 8 6 6 13 6
6 8 8 8 6 6 8 6 12 11 10 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 7 9 7 10 8 8 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 12 13 18 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6
6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 9 6 8 6 8 8 11 8 8 8 11 9 9 9 8 8 8 8 6 7 6 12 7 7 6
8 9 18 17 |